MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 6557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021014	AT	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021014	TA	3	6	809	814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021014	AC	3	6	1320	1325	50 %	0 %	0 %	50 %	479152297
4	NC_021014	CA	3	6	1617	1622	50 %	0 %	0 %	50 %	479152297
5	NC_021014	TA	3	6	2982	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	479152298
6	NC_021014	GT	3	6	4014	4019	0 %	50 %	50 %	0 %	479152298
7	NC_021014	GA	3	6	4396	4401	50 %	0 %	50 %	0 %	479152299
8	NC_021014	TA	3	6	4907	4912	50 %	50 %	0 %	0 %	479152299
9	NC_021014	AT	3	6	5728	5733	50 %	50 %	0 %	0 %	479152300
10	NC_021014	CT	3	6	5862	5867	0 %	50 %	0 %	50 %	479152300
11	NC_021014	AG	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	479152300
12	NC_021014	CT	3	6	6445	6450	0 %	50 %	0 %	50 %	479152301
13	NC_021014	TC	3	6	6711	6716	0 %	50 %	0 %	50 %	479152301
14	NC_021014	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	479152301
15	NC_021014	TG	3	6	7146	7151	0 %	50 %	50 %	0 %	479152301
16	NC_021014	GA	3	6	8327	8332	50 %	0 %	50 %	0 %	479152302
17	NC_021014	TC	3	6	9075	9080	0 %	50 %	0 %	50 %	479152304
18	NC_021014	GT	3	6	9217	9222	0 %	50 %	50 %	0 %	479152304
19	NC_021014	AT	3	6	10253	10258	50 %	50 %	0 %	0 %	479152305
20	NC_021014	TG	3	6	10618	10623	0 %	50 %	50 %	0 %	479152305
21	NC_021014	GT	3	6	10624	10629	0 %	50 %	50 %	0 %	479152305
22	NC_021014	AT	3	6	11318	11323	50 %	50 %	0 %	0 %	479152306
23	NC_021014	CA	3	6	11753	11758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021014	GA	3	6	12269	12274	50 %	0 %	50 %	0 %	479152307
25	NC_021014	CA	3	6	13262	13267	50 %	0 %	0 %	50 %	479152308
26	NC_021014	GA	3	6	13837	13842	50 %	0 %	50 %	0 %	479152309
27	NC_021014	GA	3	6	14236	14241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021014	CG	3	6	15172	15177	0 %	0 %	50 %	50 %	479152310
29	NC_021014	GA	3	6	15451	15456	50 %	0 %	50 %	0 %	479152310
30	NC_021014	TA	3	6	15656	15661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021014	CG	3	6	15810	15815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021014	CG	3	6	15992	15997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021014	TA	3	6	16382	16387	50 %	50 %	0 %	0 %	479152312
34	NC_021014	AT	3	6	17317	17322	50 %	50 %	0 %	0 %	479152313
35	NC_021014	AT	3	6	17973	17978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021014	AT	3	6	18141	18146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021014	AT	3	6	18159	18164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021014	CT	3	6	18339	18344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021014	AT	3	6	18880	18885	50 %	50 %	0 %	0 %	479152316
40	NC_021014	AT	3	6	18890	18895	50 %	50 %	0 %	0 %	479152316
41	NC_021014	TG	3	6	20330	20335	0 %	50 %	50 %	0 %	479152317
42	NC_021014	CA	3	6	21347	21352	50 %	0 %	0 %	50 %	479152319
43	NC_021014	GA	3	6	21758	21763	50 %	0 %	50 %	0 %	479152320
44	NC_021014	TG	3	6	21992	21997	0 %	50 %	50 %	0 %	479152321
45	NC_021014	TG	3	6	22487	22492	0 %	50 %	50 %	0 %	479152321
46	NC_021014	GA	3	6	23255	23260	50 %	0 %	50 %	0 %	479152322
47	NC_021014	GT	3	6	23480	23485	0 %	50 %	50 %	0 %	479152323
48	NC_021014	GA	3	6	23573	23578	50 %	0 %	50 %	0 %	479152323
49	NC_021014	TG	3	6	25027	25032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021014	AT	3	6	25106	25111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021014	CT	3	6	26714	26719	0 %	50 %	0 %	50 %	479152326
52	NC_021014	AG	3	6	27456	27461	50 %	0 %	50 %	0 %	479152327
53	NC_021014	GC	3	6	27836	27841	0 %	0 %	50 %	50 %	479152327
54	NC_021014	TG	3	6	28024	28029	0 %	50 %	50 %	0 %	479152327
55	NC_021014	AG	3	6	28700	28705	50 %	0 %	50 %	0 %	479152328
56	NC_021014	TG	3	6	30956	30961	0 %	50 %	50 %	0 %	479152330
57	NC_021014	CA	3	6	31583	31588	50 %	0 %	0 %	50 %	479152330
58	NC_021014	AG	3	6	31714	31719	50 %	0 %	50 %	0 %	479152330
59	NC_021014	AT	3	6	32687	32692	50 %	50 %	0 %	0 %	479152330
60	NC_021014	GA	3	6	34415	34420	50 %	0 %	50 %	0 %	479152331
61	NC_021014	AG	3	6	34936	34941	50 %	0 %	50 %	0 %	479152332
62	NC_021014	AG	3	6	35165	35170	50 %	0 %	50 %	0 %	479152332
63	NC_021014	CA	3	6	35235	35240	50 %	0 %	0 %	50 %	479152332
64	NC_021014	TC	3	6	35827	35832	0 %	50 %	0 %	50 %	479152333
65	NC_021014	AG	3	6	35942	35947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021014	GA	3	6	36231	36236	50 %	0 %	50 %	0 %	479152334
67	NC_021014	GA	3	6	36427	36432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021014	GA	3	6	36445	36450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021014	AG	3	6	36492	36497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021014	GA	3	6	36608	36613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021014	CA	3	6	36999	37004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021014	AG	3	6	37371	37376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021014	GA	3	6	39358	39363	50 %	0 %	50 %	0 %	479152336
74	NC_021014	GA	3	6	41077	41082	50 %	0 %	50 %	0 %	479152338
75	NC_021014	GA	3	6	41191	41196	50 %	0 %	50 %	0 %	479152338
76	NC_021014	AT	3	6	42842	42847	50 %	50 %	0 %	0 %	479152340
77	NC_021014	AG	3	6	43659	43664	50 %	0 %	50 %	0 %	479152340
78	NC_021014	CT	3	6	43932	43937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021014	TA	3	6	46400	46405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021014	TC	3	6	47427	47432	0 %	50 %	0 %	50 %	479152343
81	NC_021014	TC	3	6	47748	47753	0 %	50 %	0 %	50 %	479152343
82	NC_021014	AG	4	8	48264	48271	50 %	0 %	50 %	0 %	479152344
83	NC_021014	AG	3	6	48507	48512	50 %	0 %	50 %	0 %	479152344
84	NC_021014	GA	4	8	48719	48726	50 %	0 %	50 %	0 %	479152344
85	NC_021014	AT	3	6	48757	48762	50 %	50 %	0 %	0 %	479152344
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88	NC_021014	AT	3	6	48934	48939	50 %	50 %	0 %	0 %	479152344
89	NC_021014	CG	3	6	49251	49256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021014	AT	3	6	49320	49325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021014	TA	3	6	49375	49380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_021014	CA	3	6	52407	52412	50 %	0 %	0 %	50 %	479152347
98	NC_021014	CA	3	6	52507	52512	50 %	0 %	0 %	50 %	479152347
99	NC_021014	GA	3	6	52639	52644	50 %	0 %	50 %	0 %	479152347
100	NC_021014	GT	3	6	52809	52814	0 %	50 %	50 %	0 %	479152347
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102	NC_021014	TA	3	6	55374	55379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021014	TA	3	6	55409	55414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021014	GA	3	6	55699	55704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021014	TG	3	6	56500	56505	0 %	50 %	50 %	0 %	479152351
106	NC_021014	AT	3	6	57053	57058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021014	AT	3	6	57438	57443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021014	TA	3	6	57461	57466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021014	TA	3	6	57784	57789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021014	AC	3	6	57864	57869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021014	GA	3	6	58865	58870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021014	TG	3	6	59946	59951	0 %	50 %	50 %	0 %	479152353
113	NC_021014	GA	3	6	60431	60436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021014	TG	3	6	61485	61490	0 %	50 %	50 %	0 %	479152354
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117	NC_021014	GT	3	6	64478	64483	0 %	50 %	50 %	0 %	479152356
118	NC_021014	GT	3	6	64831	64836	0 %	50 %	50 %	0 %	479152356
119	NC_021014	AG	3	6	65540	65545	50 %	0 %	50 %	0 %	479152358
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123	NC_021014	TG	3	6	67505	67510	0 %	50 %	50 %	0 %	479152359
124	NC_021014	TG	3	6	67578	67583	0 %	50 %	50 %	0 %	479152359
125	NC_021014	GA	3	6	67722	67727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021014	AG	4	8	67930	67937	50 %	0 %	50 %	0 %	479152360
127	NC_021014	AT	3	6	67995	68000	50 %	50 %	0 %	0 %	479152360
128	NC_021014	AT	3	6	68265	68270	50 %	50 %	0 %	0 %	479152360
129	NC_021014	AG	3	6	68969	68974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021014	TG	3	6	70415	70420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021014	TC	3	6	70841	70846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021014	TG	3	6	72581	72586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021014	TA	3	6	73426	73431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021014	TA	3	6	73801	73806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021014	TA	3	6	74790	74795	50 %	50 %	0 %	0 %	479152366
136	NC_021014	AT	3	6	76185	76190	50 %	50 %	0 %	0 %	479152368
137	NC_021014	AT	5	10	76480	76489	50 %	50 %	0 %	0 %	479152368
138	NC_021014	AT	3	6	76764	76769	50 %	50 %	0 %	0 %	479152368
139	NC_021014	TA	3	6	77993	77998	50 %	50 %	0 %	0 %	479152371
140	NC_021014	AT	3	6	78370	78375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021014	AT	3	6	79090	79095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_021014	TA	3	6	79469	79474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021014	TG	3	6	79477	79482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021014	GA	3	6	79616	79621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021014	AT	3	6	79656	79661	50 %	50 %	0 %	0 %	479152373
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