MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021014	A	6	6	191896	191901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021014	T	6	6	191938	191943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021014	A	6	6	191953	191958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021014	TAAAA	2	10	191971	191980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021014	A	6	6	191990	191995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021014	A	6	6	192040	192045	100 %	0 %	0 %	0 %	479152470
4007	NC_021014	TTATG	2	10	192046	192055	20 %	60 %	20 %	0 %	479152470
4008	NC_021014	T	7	7	192099	192105	0 %	100 %	0 %	0 %	479152470
4009	NC_021014	GT	3	6	192109	192114	0 %	50 %	50 %	0 %	479152470
4010	NC_021014	ATTA	2	8	192200	192207	50 %	50 %	0 %	0 %	479152470
4011	NC_021014	AGA	2	6	192247	192252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152470
4012	NC_021014	T	6	6	192255	192260	0 %	100 %	0 %	0 %	479152470
4013	NC_021014	AGA	2	6	192262	192267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152470
4014	NC_021014	AAC	2	6	192276	192281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152470
4015	NC_021014	AGAC	2	8	192300	192307	50 %	0 %	25 %	25 %	479152470
4016	NC_021014	GCT	2	6	192317	192322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152470
4017	NC_021014	TAC	2	6	192347	192352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152470
4018	NC_021014	AGG	2	6	192396	192401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152470
4019	NC_021014	GGT	2	6	192463	192468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152470
4020	NC_021014	GT	3	6	192507	192512	0 %	50 %	50 %	0 %	479152470
4021	NC_021014	TCT	2	6	192586	192591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152470
4022	NC_021014	GA	3	6	192606	192611	50 %	0 %	50 %	0 %	479152470
4023	NC_021014	AATC	2	8	192661	192668	50 %	25 %	0 %	25 %	479152470
4024	NC_021014	A	7	7	192687	192693	100 %	0 %	0 %	0 %	479152470
4025	NC_021014	AG	3	6	192775	192780	50 %	0 %	50 %	0 %	479152470
4026	NC_021014	AGA	2	6	192784	192789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152470
4027	NC_021014	AT	3	6	192805	192810	50 %	50 %	0 %	0 %	479152470
4028	NC_021014	GAT	2	6	192832	192837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152470
4029	NC_021014	CAG	2	6	192866	192871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152470
4030	NC_021014	TGC	2	6	192930	192935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152470
4031	NC_021014	TTG	2	6	192951	192956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152470
4032	NC_021014	AAT	2	6	192962	192967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152470
4033	NC_021014	AG	3	6	193028	193033	50 %	0 %	50 %	0 %	479152470
4034	NC_021014	GA	3	6	193063	193068	50 %	0 %	50 %	0 %	479152470
4035	NC_021014	AAG	2	6	193122	193127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152470
4036	NC_021014	ATG	2	6	193131	193136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152470
4037	NC_021014	CGG	2	6	193228	193233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152470
4038	NC_021014	A	7	7	193294	193300	100 %	0 %	0 %	0 %	479152470
4039	NC_021014	CAC	2	6	193380	193385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152470
4040	NC_021014	A	6	6	193488	193493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021014	AGA	2	6	193497	193502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021014	A	6	6	193515	193520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021014	TCT	2	6	193526	193531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_021014	TCT	2	6	193533	193538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021014	T	6	6	193588	193593	0 %	100 %	0 %	0 %	479152471
4046	NC_021014	ACC	2	6	193669	193674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152471
4047	NC_021014	CCG	2	6	193689	193694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152471
4048	NC_021014	AGC	2	6	193712	193717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152471
4049	NC_021014	GATA	2	8	193745	193752	50 %	25 %	25 %	0 %	479152471
4050	NC_021014	CAG	2	6	193898	193903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152471
4051	NC_021014	AATG	2	8	193937	193944	50 %	25 %	25 %	0 %	479152471
4052	NC_021014	GTT	2	6	194042	194047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152471
4053	NC_021014	GAA	2	6	194066	194071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152471
4054	NC_021014	A	6	6	194070	194075	100 %	0 %	0 %	0 %	479152471
4055	NC_021014	TGCAGT	2	12	194105	194116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479152471
4056	NC_021014	ATG	2	6	194178	194183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152471
4057	NC_021014	GAT	2	6	194216	194221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152471
4058	NC_021014	AC	3	6	194307	194312	50 %	0 %	0 %	50 %	479152471
4059	NC_021014	CAG	2	6	194332	194337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152471
4060	NC_021014	GAT	2	6	194396	194401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152471
4061	NC_021014	CTGG	2	8	194570	194577	0 %	25 %	50 %	25 %	479152471
4062	NC_021014	TAC	2	6	194591	194596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152471
4063	NC_021014	AGC	2	6	194645	194650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152471
4064	NC_021014	GCTG	2	8	194654	194661	0 %	25 %	50 %	25 %	479152471
4065	NC_021014	ATC	2	6	194862	194867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152471
4066	NC_021014	T	6	6	194947	194952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021014	TCC	2	6	194963	194968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_021014	TA	4	8	194998	195005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_021014	AAGAA	2	10	195030	195039	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021014	ATT	2	6	195052	195057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021014	ATGCT	2	10	195118	195127	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4072	NC_021014	AAGA	2	8	195147	195154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_021014	ATT	2	6	195169	195174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021014	ATTG	2	8	195252	195259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021014	AGT	2	6	195343	195348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021014	TA	3	6	195363	195368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021014	AT	3	6	195378	195383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021014	AAAAT	2	10	195438	195447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021014	GAA	2	6	195451	195456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021014	T	7	7	195493	195499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021014	AGT	2	6	195609	195614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152472
4082	NC_021014	AGAGGA	2	12	195640	195651	50 %	0 %	50 %	0 %	479152472
4083	NC_021014	GCA	2	6	195769	195774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152472
4084	NC_021014	AGC	2	6	195786	195791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152472
4085	NC_021014	GCAT	2	8	195792	195799	25 %	25 %	25 %	25 %	479152472
4086	NC_021014	GGA	2	6	195811	195816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152472
4087	NC_021014	GAGAT	2	10	195863	195872	40 %	20 %	40 %	0 %	479152472
4088	NC_021014	TTC	2	6	195875	195880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152472
4089	NC_021014	TAT	2	6	196060	196065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152472
4090	NC_021014	CTT	3	9	196255	196263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152472
4091	NC_021014	ATC	2	6	196300	196305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152472
4092	NC_021014	ACT	2	6	196318	196323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152472
4093	NC_021014	TCT	2	6	196335	196340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152472
4094	NC_021014	TCA	2	6	196398	196403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152472
4095	NC_021014	GGC	2	6	196450	196455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152472
4096	NC_021014	TAT	2	6	196456	196461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152472
4097	NC_021014	TTTTGA	2	12	196497	196508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479152472
4098	NC_021014	GA	3	6	196575	196580	50 %	0 %	50 %	0 %	479152472
4099	NC_021014	AT	3	6	196737	196742	50 %	50 %	0 %	0 %	479152472
4100	NC_021014	TCC	2	6	196851	196856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152472
4101	NC_021014	AT	3	6	196964	196969	50 %	50 %	0 %	0 %	479152472
4102	NC_021014	GTAAT	2	10	197149	197158	40 %	40 %	20 %	0 %	479152473
4103	NC_021014	ATTT	2	8	197177	197184	25 %	75 %	0 %	0 %	479152473
4104	NC_021014	AAG	2	6	197224	197229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152473
4105	NC_021014	CGG	2	6	197261	197266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152473
4106	NC_021014	GTA	2	6	197334	197339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152473
4107	NC_021014	AT	3	6	197423	197428	50 %	50 %	0 %	0 %	479152473
4108	NC_021014	CGC	2	6	197430	197435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152473
4109	NC_021014	AAAT	2	8	197441	197448	75 %	25 %	0 %	0 %	479152473
4110	NC_021014	TTA	2	6	197455	197460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152473
4111	NC_021014	ATT	2	6	197498	197503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152473
4112	NC_021014	CAG	2	6	197565	197570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152473
4113	NC_021014	CATGC	2	10	197598	197607	20 %	20 %	20 %	40 %	479152473
4114	NC_021014	TGC	2	6	197678	197683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152473
4115	NC_021014	A	6	6	197712	197717	100 %	0 %	0 %	0 %	479152473
4116	NC_021014	ATC	2	6	197719	197724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152473
4117	NC_021014	TACTA	2	10	197778	197787	40 %	40 %	0 %	20 %	479152473
4118	NC_021014	GGA	2	6	197828	197833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152473
4119	NC_021014	AGG	2	6	197842	197847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152473
4120	NC_021014	GGA	2	6	197849	197854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152473
4121	NC_021014	CAG	2	6	197900	197905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152474
4122	NC_021014	G	6	6	198176	198181	0 %	0 %	100 %	0 %	479152474
4123	NC_021014	GCT	2	6	198201	198206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152474
4124	NC_021014	ATT	2	6	198243	198248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152474
4125	NC_021014	GT	3	6	198308	198313	0 %	50 %	50 %	0 %	479152474
4126	NC_021014	AGA	2	6	198383	198388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152474
4127	NC_021014	GAA	2	6	198444	198449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152474
4128	NC_021014	AGG	2	6	198551	198556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152474
4129	NC_021014	GCT	2	6	198579	198584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152474
4130	NC_021014	GGT	2	6	198683	198688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152474
4131	NC_021014	CTG	3	9	198696	198704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152474
4132	NC_021014	A	6	6	198743	198748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021014	A	6	6	198755	198760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021014	GCG	2	6	198787	198792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152475
4135	NC_021014	AGCA	2	8	198857	198864	50 %	0 %	25 %	25 %	479152475
4136	NC_021014	GGAA	2	8	198902	198909	50 %	0 %	50 %	0 %	479152475
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4141	NC_021014	GAT	2	6	199103	199108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152476
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4147	NC_021014	AATC	2	8	199375	199382	50 %	25 %	0 %	25 %	479152476
4148	NC_021014	TCT	2	6	199498	199503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152476
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4151	NC_021014	CTA	2	6	199629	199634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152476
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4156	NC_021014	TGG	2	6	200010	200015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152476
4157	NC_021014	ACC	2	6	200040	200045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152477
4158	NC_021014	CGG	2	6	200058	200063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152477
4159	NC_021014	ATT	2	6	200065	200070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152477
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4187	NC_021014	ATA	2	6	201256	201261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4189	NC_021014	ATC	2	6	201369	201374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152478
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4222	NC_021014	A	6	6	202901	202906	100 %	0 %	0 %	0 %	479152481
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4225	NC_021014	TCATGT	2	12	203038	203049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479152481
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4229	NC_021014	TGAC	2	8	203268	203275	25 %	25 %	25 %	25 %	479152481
4230	NC_021014	ATG	2	6	203294	203299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152481
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4237	NC_021014	AGT	2	6	203744	203749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152481
4238	NC_021014	GAAG	2	8	203797	203804	50 %	0 %	50 %	0 %	479152481
4239	NC_021014	GT	4	8	203812	203819	0 %	50 %	50 %	0 %	479152481
4240	NC_021014	CAA	2	6	203853	203858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152481
4241	NC_021014	ATG	2	6	203919	203924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152481
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4244	NC_021014	CATG	2	8	204151	204158	25 %	25 %	25 %	25 %	479152482
4245	NC_021014	GGTA	2	8	204271	204278	25 %	25 %	50 %	0 %	479152482
4246	NC_021014	TTG	2	6	204279	204284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152482
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4248	NC_021014	TGG	2	6	204409	204414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152482
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4250	NC_021014	GCA	2	6	204560	204565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152482
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4346	NC_021014	TAT	2	6	208891	208896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4349	NC_021014	GGA	2	6	208972	208977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4351	NC_021014	ATT	2	6	209111	209116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4371	NC_021014	GTT	2	6	210119	210124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152490
4372	NC_021014	ATA	2	6	210159	210164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152490
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