MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021014	GGA	2	6	166860	166865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152445
3502	NC_021014	GGC	2	6	166892	166897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152445
3503	NC_021014	GAT	2	6	166904	166909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152445
3504	NC_021014	ATG	2	6	166930	166935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152445
3505	NC_021014	GAT	2	6	166956	166961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152445
3506	NC_021014	CA	3	6	166982	166987	50 %	0 %	0 %	50 %	479152445
3507	NC_021014	GCG	2	6	167020	167025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152445
3508	NC_021014	GCC	2	6	167100	167105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152445
3509	NC_021014	TGG	2	6	167147	167152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152445
3510	NC_021014	ATG	2	6	167173	167178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152445
3511	NC_021014	ATG	2	6	167250	167255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152445
3512	NC_021014	GTGCT	2	10	167260	167269	0 %	40 %	40 %	20 %	479152445
3513	NC_021014	GGCT	2	8	167326	167333	0 %	25 %	50 %	25 %	479152445
3514	NC_021014	GAT	2	6	167346	167351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152445
3515	NC_021014	AGG	2	6	167374	167379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152445
3516	NC_021014	TGA	2	6	167402	167407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152445
3517	NC_021014	A	7	7	167407	167413	100 %	0 %	0 %	0 %	479152445
3518	NC_021014	CAA	2	6	167414	167419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152445
3519	NC_021014	TTG	2	6	167437	167442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152445
3520	NC_021014	GCA	2	6	167451	167456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152445
3521	NC_021014	CAG	2	6	167459	167464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152445
3522	NC_021014	GAC	2	6	167502	167507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152445
3523	NC_021014	GAA	2	6	167516	167521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152445
3524	NC_021014	TCT	2	6	167534	167539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152445
3525	NC_021014	AGAA	2	8	167569	167576	75 %	0 %	25 %	0 %	479152445
3526	NC_021014	AAGG	2	8	167579	167586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021014	A	6	6	167603	167608	100 %	0 %	0 %	0 %	479152446
3528	NC_021014	GGA	2	6	167643	167648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152446
3529	NC_021014	GTG	2	6	167734	167739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152446
3530	NC_021014	GAA	2	6	167837	167842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152446
3531	NC_021014	AGG	2	6	167871	167876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152446
3532	NC_021014	GA	3	6	167990	167995	50 %	0 %	50 %	0 %	479152446
3533	NC_021014	GCTGA	2	10	168070	168079	20 %	20 %	40 %	20 %	479152446
3534	NC_021014	TAT	3	9	168090	168098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152446
3535	NC_021014	ATA	2	6	168107	168112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152446
3536	NC_021014	AGG	2	6	168135	168140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152446
3537	NC_021014	CCG	2	6	168239	168244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152446
3538	NC_021014	AGC	2	6	168271	168276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152446
3539	NC_021014	ATA	2	6	168350	168355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152446
3540	NC_021014	GAT	2	6	168363	168368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152446
3541	NC_021014	AG	3	6	168389	168394	50 %	0 %	50 %	0 %	479152446
3542	NC_021014	GTT	2	6	168406	168411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152446
3543	NC_021014	GCA	2	6	168517	168522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152446
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3545	NC_021014	AGT	2	6	168590	168595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152446
3546	NC_021014	GCT	2	6	168606	168611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021014	GAA	2	6	168644	168649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021014	T	6	6	168662	168667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021014	GAA	2	6	168683	168688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021014	GGCA	2	8	168706	168713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_021014	TTC	2	6	168751	168756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021014	AG	3	6	168765	168770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021014	GATC	2	8	168772	168779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_021014	ATGT	2	8	168792	168799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021014	CAT	2	6	168866	168871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_021014	GAG	2	6	168947	168952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021014	AGA	2	6	168970	168975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021014	GAA	2	6	169031	169036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021014	AAG	2	6	169052	169057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021014	GAA	2	6	169059	169064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021014	GCA	2	6	169110	169115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021014	TCTG	2	8	169121	169128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_021014	CTT	2	6	169217	169222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_021014	GGA	2	6	169261	169266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021014	TTC	2	6	169338	169343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3567	NC_021014	GGA	2	6	169552	169557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021014	A	7	7	169565	169571	100 %	0 %	0 %	0 %	479152447
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3572	NC_021014	GGCT	2	8	169678	169685	0 %	25 %	50 %	25 %	479152447
3573	NC_021014	CAG	2	6	169741	169746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152447
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3581	NC_021014	TCA	2	6	170091	170096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152447
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3589	NC_021014	ATT	2	6	170575	170580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152448
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3594	NC_021014	GAA	2	6	170785	170790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152448
3595	NC_021014	ATG	2	6	170876	170881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152448
3596	NC_021014	AT	3	6	170883	170888	50 %	50 %	0 %	0 %	479152448
3597	NC_021014	ATC	2	6	170911	170916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152448
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3599	NC_021014	ATA	2	6	171089	171094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152448
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3601	NC_021014	A	6	6	171291	171296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021014	GAA	2	6	171335	171340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021014	GCA	2	6	171344	171349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_021014	GCAG	2	8	171428	171435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_021014	GAA	2	6	171464	171469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021014	GGC	2	6	171583	171588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_021014	AGC	3	9	171589	171597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_021014	GAT	2	6	171644	171649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021014	TG	4	8	171657	171664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021014	AAAAT	2	10	171727	171736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021014	A	6	6	171796	171801	100 %	0 %	0 %	0 %	479152449
3612	NC_021014	TGG	2	6	171913	171918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152449
3613	NC_021014	AG	3	6	172001	172006	50 %	0 %	50 %	0 %	479152449
3614	NC_021014	GCG	2	6	172013	172018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152449
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3616	NC_021014	GA	3	6	172098	172103	50 %	0 %	50 %	0 %	479152449
3617	NC_021014	AGC	4	12	172126	172137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152449
3618	NC_021014	TCT	2	6	172141	172146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152449
3619	NC_021014	CTT	2	6	172178	172183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152449
3620	NC_021014	TCCT	2	8	172233	172240	0 %	50 %	0 %	50 %	479152449
3621	NC_021014	TG	3	6	172283	172288	0 %	50 %	50 %	0 %	479152449
3622	NC_021014	GAG	2	6	172370	172375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152449
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3624	NC_021014	GAA	2	6	172655	172660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152449
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3875	NC_021014	A	6	6	185389	185394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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