MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021014	TGA	2	6	143013	143018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021014	A	6	6	143047	143052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021014	TGG	2	6	143099	143104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021014	ATCA	2	8	143119	143126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_021014	GCA	2	6	143155	143160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021014	TGG	2	6	143180	143185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021014	GAT	3	9	143188	143196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021014	TCTA	2	8	143200	143207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_021014	ATCA	2	8	143335	143342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_021014	A	6	6	143362	143367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021014	AT	3	6	143433	143438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021014	CTG	2	6	143452	143457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_021014	GAA	2	6	143470	143475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021014	ATA	2	6	143480	143485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021014	GCT	2	6	143499	143504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_021014	A	7	7	143723	143729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021014	ACAAAG	2	12	143759	143770	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3018	NC_021014	TG	3	6	143777	143782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021014	GAA	2	6	143875	143880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021014	TAAAA	2	10	143907	143916	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021014	GAA	2	6	143980	143985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021014	GAA	2	6	144022	144027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021014	GAA	2	6	144033	144038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021014	GTG	2	6	144061	144066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021014	TA	3	6	144110	144115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_021014	GGA	2	6	144174	144179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_021014	AGA	2	6	144218	144223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021014	TAT	2	6	144235	144240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_021014	CAG	2	6	144247	144252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_021014	GAG	2	6	144286	144291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021014	ATT	2	6	144309	144314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152421
3032	NC_021014	TAT	2	6	144315	144320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152421
3033	NC_021014	GCTT	2	8	144416	144423	0 %	50 %	25 %	25 %	479152421
3034	NC_021014	T	6	6	144459	144464	0 %	100 %	0 %	0 %	479152421
3035	NC_021014	CA	3	6	144494	144499	50 %	0 %	0 %	50 %	479152421
3036	NC_021014	ATGTG	2	10	144511	144520	20 %	40 %	40 %	0 %	479152421
3037	NC_021014	AAG	2	6	144564	144569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152421
3038	NC_021014	GAT	2	6	144636	144641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152421
3039	NC_021014	T	6	6	144654	144659	0 %	100 %	0 %	0 %	479152421
3040	NC_021014	GA	3	6	144674	144679	50 %	0 %	50 %	0 %	479152421
3041	NC_021014	AT	3	6	144683	144688	50 %	50 %	0 %	0 %	479152421
3042	NC_021014	GCTGGA	2	12	144758	144769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479152421
3043	NC_021014	GTG	2	6	144781	144786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152421
3044	NC_021014	CAT	2	6	144833	144838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152421
3045	NC_021014	ATGAA	2	10	144861	144870	60 %	20 %	20 %	0 %	479152422
3046	NC_021014	GTT	2	6	144920	144925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152422
3047	NC_021014	TGTGC	2	10	144928	144937	0 %	40 %	40 %	20 %	479152422
3048	NC_021014	T	6	6	144946	144951	0 %	100 %	0 %	0 %	479152422
3049	NC_021014	TGC	2	6	145015	145020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152422
3050	NC_021014	GA	3	6	145093	145098	50 %	0 %	50 %	0 %	479152422
3051	NC_021014	GAA	2	6	145138	145143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152422
3052	NC_021014	GCT	2	6	145153	145158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152422
3053	NC_021014	A	6	6	145162	145167	100 %	0 %	0 %	0 %	479152422
3054	NC_021014	GCA	2	6	145251	145256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152422
3055	NC_021014	CA	3	6	145255	145260	50 %	0 %	0 %	50 %	479152422
3056	NC_021014	TTA	2	6	145308	145313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152422
3057	NC_021014	AAG	2	6	145314	145319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152422
3058	NC_021014	GGA	2	6	145346	145351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152422
3059	NC_021014	TTA	2	6	145376	145381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152422
3060	NC_021014	TCC	2	6	145388	145393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152422
3061	NC_021014	ATG	2	6	145455	145460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152422
3062	NC_021014	AGTC	2	8	145492	145499	25 %	25 %	25 %	25 %	479152422
3063	NC_021014	GA	3	6	145513	145518	50 %	0 %	50 %	0 %	479152422
3064	NC_021014	TGTA	2	8	145548	145555	25 %	50 %	25 %	0 %	479152422
3065	NC_021014	GCT	2	6	145557	145562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152422
3066	NC_021014	ATT	2	6	145677	145682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152422
3067	NC_021014	CCA	2	6	145683	145688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152422
3068	NC_021014	TC	3	6	145737	145742	0 %	50 %	0 %	50 %	479152422
3069	NC_021014	TGTA	2	8	145800	145807	25 %	50 %	25 %	0 %	479152422
3070	NC_021014	GTG	2	6	145859	145864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152422
3071	NC_021014	TCC	2	6	145919	145924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152422
3072	NC_021014	GAA	3	9	145982	145990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152422
3073	NC_021014	T	7	7	145995	146001	0 %	100 %	0 %	0 %	479152422
3074	NC_021014	A	6	6	146016	146021	100 %	0 %	0 %	0 %	479152422
3075	NC_021014	GA	3	6	146023	146028	50 %	0 %	50 %	0 %	479152422
3076	NC_021014	A	6	6	146034	146039	100 %	0 %	0 %	0 %	479152422
3077	NC_021014	ACA	2	6	146041	146046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152422
3078	NC_021014	AT	3	6	146071	146076	50 %	50 %	0 %	0 %	479152422
3079	NC_021014	TGG	2	6	146150	146155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152423
3080	NC_021014	ATG	2	6	146225	146230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152423
3081	NC_021014	TCC	2	6	146243	146248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152423
3082	NC_021014	GGA	2	6	146283	146288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152423
3083	NC_021014	AT	3	6	146439	146444	50 %	50 %	0 %	0 %	479152423
3084	NC_021014	AGA	2	6	146490	146495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152423
3085	NC_021014	TGC	2	6	146498	146503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152423
3086	NC_021014	AT	3	6	146505	146510	50 %	50 %	0 %	0 %	479152423
3087	NC_021014	AG	3	6	146518	146523	50 %	0 %	50 %	0 %	479152423
3088	NC_021014	CTT	2	6	146575	146580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152423
3089	NC_021014	ATC	2	6	146587	146592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152423
3090	NC_021014	ATGG	2	8	146606	146613	25 %	25 %	50 %	0 %	479152423
3091	NC_021014	AGT	2	6	146640	146645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152423
3092	NC_021014	AGA	3	9	146805	146813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152423
3093	NC_021014	GTC	2	6	146849	146854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152423
3094	NC_021014	GAA	2	6	146884	146889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152423
3095	NC_021014	AT	3	6	146943	146948	50 %	50 %	0 %	0 %	479152423
3096	NC_021014	GGAA	2	8	146982	146989	50 %	0 %	50 %	0 %	479152423
3097	NC_021014	ATG	2	6	146993	146998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152423
3098	NC_021014	GGC	2	6	147047	147052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152424
3099	NC_021014	AGC	2	6	147191	147196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152424
3100	NC_021014	GAA	2	6	147199	147204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152424
3101	NC_021014	AG	3	6	147219	147224	50 %	0 %	50 %	0 %	479152424
3102	NC_021014	TCA	2	6	147229	147234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152424
3103	NC_021014	A	6	6	147268	147273	100 %	0 %	0 %	0 %	479152424
3104	NC_021014	A	7	7	147313	147319	100 %	0 %	0 %	0 %	479152424
3105	NC_021014	T	7	7	147348	147354	0 %	100 %	0 %	0 %	479152424
3106	NC_021014	AAT	2	6	147420	147425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152424
3107	NC_021014	GAAA	2	8	147466	147473	75 %	0 %	25 %	0 %	479152424
3108	NC_021014	A	6	6	147471	147476	100 %	0 %	0 %	0 %	479152424
3109	NC_021014	CTG	2	6	147507	147512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152424
3110	NC_021014	AGT	2	6	147549	147554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021014	AGA	2	6	147572	147577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021014	AGG	2	6	147580	147585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021014	TTCT	2	8	147644	147651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_021014	GGA	2	6	147675	147680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021014	CTT	2	6	147709	147714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_021014	CAG	2	6	147766	147771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021014	GGGA	2	8	147787	147794	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021014	TTCTG	2	10	147819	147828	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3119	NC_021014	TTC	2	6	147842	147847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_021014	TTC	2	6	147854	147859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_021014	GA	3	6	147964	147969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021014	TAC	2	6	148005	148010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_021014	GAT	2	6	148020	148025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021014	TCC	2	6	148081	148086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_021014	TTC	2	6	148145	148150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_021014	CTT	2	6	148267	148272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152425
3127	NC_021014	CGG	2	6	148273	148278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152425
3128	NC_021014	AAC	2	6	148279	148284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152425
3129	NC_021014	CAGAT	2	10	148291	148300	40 %	20 %	20 %	20 %	479152425
3130	NC_021014	AGATG	2	10	148328	148337	40 %	20 %	40 %	0 %	479152425
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3132	NC_021014	TGT	2	6	148381	148386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152425
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3135	NC_021014	GTT	2	6	148481	148486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152425
3136	NC_021014	CTG	2	6	148491	148496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152425
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3138	NC_021014	TCT	2	6	148577	148582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152425
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3141	NC_021014	GCT	2	6	148725	148730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152425
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3143	NC_021014	TA	3	6	148807	148812	50 %	50 %	0 %	0 %	479152425
3144	NC_021014	TTC	2	6	148813	148818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152425
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3151	NC_021014	GGC	2	6	149171	149176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152425
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3157	NC_021014	TACT	2	8	149373	149380	25 %	50 %	0 %	25 %	479152426
3158	NC_021014	TA	3	6	149423	149428	50 %	50 %	0 %	0 %	479152426
3159	NC_021014	GAA	2	6	149498	149503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152426
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3165	NC_021014	GGATG	2	10	149809	149818	20 %	20 %	60 %	0 %	479152426
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3222	NC_021014	TAT	2	6	152853	152858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_021014	TAAA	2	8	152879	152886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_021014	ATGAA	2	10	152903	152912	60 %	20 %	20 %	0 %	479152430
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3235	NC_021014	AAGA	2	8	153321	153328	75 %	0 %	25 %	0 %	479152430
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3243	NC_021014	GAA	2	6	153714	153719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152431
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3252	NC_021014	AT	3	6	154522	154527	50 %	50 %	0 %	0 %	479152432
3253	NC_021014	CT	3	6	154713	154718	0 %	50 %	0 %	50 %	479152433
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3268	NC_021014	CAT	2	6	155271	155276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3362	NC_021014	AC	3	6	159834	159839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3363	NC_021014	AGA	2	6	159887	159892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3364	NC_021014	CCA	2	6	159963	159968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3365	NC_021014	ATC	2	6	160031	160036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3366	NC_021014	TGGAC	2	10	160259	160268	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3367	NC_021014	GAA	2	6	160361	160366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3368	NC_021014	TAA	2	6	160409	160414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3369	NC_021014	CTGA	2	8	160419	160426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3370	NC_021014	ATCG	2	8	160505	160512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3371	NC_021014	ATG	2	6	160651	160656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3372	NC_021014	CAG	2	6	160727	160732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3373	NC_021014	GCA	2	6	160874	160879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3374	NC_021014	CAG	2	6	160948	160953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3375	NC_021014	CAGT	2	8	161002	161009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3376	NC_021014	ATCT	2	8	161010	161017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3377	NC_021014	GAC	2	6	161018	161023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3378	NC_021014	GCT	2	6	161049	161054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3379	NC_021014	AGTA	2	8	161076	161083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3380	NC_021014	TCC	2	6	161119	161124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3381	NC_021014	CAC	2	6	161136	161141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3382	NC_021014	ACC	2	6	161157	161162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3383	NC_021014	AGTA	2	8	161171	161178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3454	NC_021014	CCTTT	2	10	164769	164778	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3487	NC_021014	A	6	6	166393	166398	100 %	0 %	0 %	0 %	479152443
3488	NC_021014	AGGA	2	8	166459	166466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3489	NC_021014	AAAG	2	8	166487	166494	75 %	0 %	25 %	0 %	479152444
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3492	NC_021014	GAG	2	6	166572	166577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152444
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3496	NC_021014	ATGA	2	8	166661	166668	50 %	25 %	25 %	0 %	479152444
3497	NC_021014	AGA	2	6	166694	166699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152445
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3500	NC_021014	GAA	2	6	166752	166757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152445

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