MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021014	A	6	6	117576	117581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021014	GCA	2	6	117633	117638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_021014	GCG	2	6	117642	117647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_021014	CTT	2	6	117747	117752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_021014	AAAC	2	8	117757	117764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2506	NC_021014	ATT	2	6	117811	117816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_021014	AAG	2	6	117831	117836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_021014	TCCG	2	8	117988	117995	0 %	25 %	25 %	50 %	479152401
2509	NC_021014	TGA	2	6	118025	118030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152401
2510	NC_021014	ATA	2	6	118081	118086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152401
2511	NC_021014	AAG	2	6	118132	118137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152401
2512	NC_021014	AGG	2	6	118153	118158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152401
2513	NC_021014	TGG	2	6	118181	118186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152401
2514	NC_021014	GGA	2	6	118223	118228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152401
2515	NC_021014	GGA	2	6	118331	118336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152401
2516	NC_021014	GGT	2	6	118349	118354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152401
2517	NC_021014	GGA	2	6	118373	118378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152401
2518	NC_021014	GCTTT	2	10	118388	118397	0 %	60 %	20 %	20 %	479152401
2519	NC_021014	AAAGG	2	10	118464	118473	60 %	0 %	40 %	0 %	479152401
2520	NC_021014	AGC	2	6	118512	118517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152401
2521	NC_021014	GGT	2	6	118520	118525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152401
2522	NC_021014	GAG	2	6	118593	118598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152401
2523	NC_021014	AT	3	6	118659	118664	50 %	50 %	0 %	0 %	479152401
2524	NC_021014	GAG	2	6	118680	118685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152401
2525	NC_021014	GT	3	6	118689	118694	0 %	50 %	50 %	0 %	479152401
2526	NC_021014	TGA	2	6	118771	118776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152401
2527	NC_021014	TGA	2	6	118837	118842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152401
2528	NC_021014	GCT	2	6	118853	118858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152401
2529	NC_021014	AT	4	8	118902	118909	50 %	50 %	0 %	0 %	479152401
2530	NC_021014	TCT	2	6	118956	118961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_021014	T	7	7	118961	118967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_021014	CGC	2	6	118979	118984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2533	NC_021014	N	171	171	119000	119170	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_021014	A	6	6	119208	119213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_021014	GTC	2	6	119237	119242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_021014	GCGCT	2	10	119244	119253	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2537	NC_021014	GAC	2	6	119255	119260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_021014	GCGCT	2	10	119308	119317	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2539	NC_021014	TGC	2	6	119380	119385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_021014	TGCTG	2	10	119416	119425	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2541	NC_021014	TGCTG	2	10	119452	119461	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2542	NC_021014	TGCTG	2	10	119488	119497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2543	NC_021014	GTG	2	6	119512	119517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021014	TG	3	6	119516	119521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021014	GAT	2	6	119523	119528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_021014	A	6	6	119629	119634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_021014	TG	3	6	119670	119675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_021014	GAT	2	6	119680	119685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_021014	AAAT	2	8	119739	119746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_021014	TAT	2	6	119779	119784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152402
2551	NC_021014	ACA	2	6	119825	119830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152402
2552	NC_021014	ATG	2	6	119877	119882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152402
2553	NC_021014	CTG	2	6	119886	119891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152402
2554	NC_021014	ATC	2	6	119942	119947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152402
2555	NC_021014	TTC	2	6	119980	119985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152402
2556	NC_021014	CGAT	2	8	120054	120061	25 %	25 %	25 %	25 %	479152402
2557	NC_021014	GGTT	2	8	120124	120131	0 %	50 %	50 %	0 %	479152402
2558	NC_021014	AGA	2	6	120137	120142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152402
2559	NC_021014	CAG	2	6	120167	120172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152402
2560	NC_021014	ATC	2	6	120206	120211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152402
2561	NC_021014	GCC	2	6	120235	120240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152402
2562	NC_021014	AGA	2	6	120458	120463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152402
2563	NC_021014	CTT	2	6	120465	120470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152402
2564	NC_021014	AG	3	6	120483	120488	50 %	0 %	50 %	0 %	479152402
2565	NC_021014	GCT	2	6	120515	120520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152402
2566	NC_021014	TTC	3	9	120590	120598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152402
2567	NC_021014	GA	3	6	120602	120607	50 %	0 %	50 %	0 %	479152402
2568	NC_021014	GCA	2	6	120635	120640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152402
2569	NC_021014	ATG	2	6	120687	120692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152402
2570	NC_021014	GAG	2	6	120737	120742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152402
2571	NC_021014	AAT	2	6	120774	120779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152402
2572	NC_021014	TAAAG	2	10	120817	120826	60 %	20 %	20 %	0 %	479152403
2573	NC_021014	ATG	2	6	120855	120860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152403
2574	NC_021014	AAG	2	6	120977	120982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152403
2575	NC_021014	GTG	2	6	120996	121001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152403
2576	NC_021014	GAG	2	6	121052	121057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152403
2577	NC_021014	GCTT	2	8	121081	121088	0 %	50 %	25 %	25 %	479152403
2578	NC_021014	ATGA	2	8	121187	121194	50 %	25 %	25 %	0 %	479152403
2579	NC_021014	CAT	3	9	121277	121285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152403
2580	NC_021014	TGT	2	6	121294	121299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152403
2581	NC_021014	ATG	2	6	121325	121330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152403
2582	NC_021014	TCT	2	6	121357	121362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152403
2583	NC_021014	TCCG	2	8	121458	121465	0 %	25 %	25 %	50 %	479152403
2584	NC_021014	GTT	2	6	121469	121474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152403
2585	NC_021014	AAGA	2	8	121484	121491	75 %	0 %	25 %	0 %	479152403
2586	NC_021014	GATG	2	8	121544	121551	25 %	25 %	50 %	0 %	479152403
2587	NC_021014	AT	3	6	121603	121608	50 %	50 %	0 %	0 %	479152403
2588	NC_021014	GTT	2	6	121610	121615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152403
2589	NC_021014	GGCTAA	2	12	121633	121644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479152403
2590	NC_021014	AGT	2	6	121787	121792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_021014	T	6	6	121806	121811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_021014	AAG	2	6	121816	121821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_021014	ACAGG	2	10	121842	121851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2594	NC_021014	CTG	2	6	121887	121892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152404
2595	NC_021014	GCA	2	6	121971	121976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152404
2596	NC_021014	GAA	2	6	121977	121982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152404
2597	NC_021014	ATC	2	6	121995	122000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152404
2598	NC_021014	GAT	2	6	122054	122059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152404
2599	NC_021014	AGG	2	6	122074	122079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152404
2600	NC_021014	GAA	2	6	122193	122198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152404
2601	NC_021014	GAT	2	6	122328	122333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152404
2602	NC_021014	AG	3	6	122349	122354	50 %	0 %	50 %	0 %	479152404
2603	NC_021014	GCTT	2	8	122420	122427	0 %	50 %	25 %	25 %	479152404
2604	NC_021014	TTC	2	6	122473	122478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152404
2605	NC_021014	GGC	2	6	122481	122486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152404
2606	NC_021014	TC	3	6	122521	122526	0 %	50 %	0 %	50 %	479152404
2607	NC_021014	AT	3	6	122591	122596	50 %	50 %	0 %	0 %	479152404
2608	NC_021014	A	6	6	122726	122731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_021014	T	6	6	122778	122783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_021014	GA	3	6	122799	122804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_021014	CTGT	2	8	122826	122833	0 %	50 %	25 %	25 %	479152405
2612	NC_021014	GAA	2	6	122842	122847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152405
2613	NC_021014	GCG	2	6	122850	122855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152405
2614	NC_021014	AGC	2	6	122886	122891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152405
2615	NC_021014	A	6	6	122927	122932	100 %	0 %	0 %	0 %	479152405
2616	NC_021014	TGGAA	2	10	122956	122965	40 %	20 %	40 %	0 %	479152405
2617	NC_021014	TAT	2	6	122972	122977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152405
2618	NC_021014	GAG	2	6	123044	123049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152405
2619	NC_021014	A	7	7	123095	123101	100 %	0 %	0 %	0 %	479152405
2620	NC_021014	ATC	2	6	123110	123115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152405
2621	NC_021014	ATG	2	6	123159	123164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152405
2622	NC_021014	GA	3	6	123222	123227	50 %	0 %	50 %	0 %	479152405
2623	NC_021014	TGG	2	6	123231	123236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152405
2624	NC_021014	GGT	2	6	123319	123324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152405
2625	NC_021014	TCAATG	2	12	123327	123338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479152405
2626	NC_021014	ACAG	2	8	123339	123346	50 %	0 %	25 %	25 %	479152405
2627	NC_021014	TCA	2	6	123396	123401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152405
2628	NC_021014	TCT	2	6	123440	123445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152405
2629	NC_021014	CAGA	2	8	123467	123474	50 %	0 %	25 %	25 %	479152405
2630	NC_021014	AG	3	6	123520	123525	50 %	0 %	50 %	0 %	479152405
2631	NC_021014	ATC	2	6	123563	123568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152405
2632	NC_021014	GAAT	2	8	123633	123640	50 %	25 %	25 %	0 %	479152405
2633	NC_021014	GGAA	2	8	123700	123707	50 %	0 %	50 %	0 %	479152405
2634	NC_021014	GCA	2	6	123710	123715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152405
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2639	NC_021014	AG	3	6	123870	123875	50 %	0 %	50 %	0 %	479152405
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2657	NC_021014	T	6	6	124790	124795	0 %	100 %	0 %	0 %	479152406
2658	NC_021014	TTTC	2	8	124817	124824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2692	NC_021014	AAGGA	2	10	127188	127197	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2693	NC_021014	ATA	2	6	127198	127203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2732	NC_021014	TTTG	2	8	128937	128944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2750	NC_021014	GAA	2	6	130494	130499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152410
2751	NC_021014	CTG	2	6	130553	130558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2752	NC_021014	AG	3	6	130574	130579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2753	NC_021014	TCA	2	6	130664	130669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152411
2754	NC_021014	TCC	2	6	130766	130771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152411
2755	NC_021014	TTC	2	6	130780	130785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152411
2756	NC_021014	CTGAT	2	10	130802	130811	20 %	40 %	20 %	20 %	479152411
2757	NC_021014	TCA	2	6	130922	130927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152411
2758	NC_021014	TGC	2	6	130958	130963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152411
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2763	NC_021014	ATCG	2	8	131125	131132	25 %	25 %	25 %	25 %	479152411
2764	NC_021014	CTG	2	6	131183	131188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152411
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2767	NC_021014	TCC	2	6	131372	131377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2768	NC_021014	TTGTC	2	10	131378	131387	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2770	NC_021014	AGG	2	6	131468	131473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2771	NC_021014	TATT	2	8	131474	131481	25 %	75 %	0 %	0 %	479152412
2772	NC_021014	CAG	2	6	131489	131494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152412
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2775	NC_021014	ATGGA	2	10	131554	131563	40 %	20 %	40 %	0 %	479152412
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2779	NC_021014	ATT	2	6	131787	131792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2780	NC_021014	ATTT	2	8	131807	131814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2781	NC_021014	TAA	2	6	131817	131822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2782	NC_021014	ATA	2	6	131895	131900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2783	NC_021014	CCG	4	12	131944	131955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2784	NC_021014	AAG	2	6	132026	132031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2785	NC_021014	TTC	2	6	132078	132083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2787	NC_021014	GAT	2	6	132127	132132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2789	NC_021014	CAG	2	6	132178	132183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2791	NC_021014	AG	3	6	132263	132268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2792	NC_021014	GAA	2	6	132301	132306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2793	NC_021014	T	6	6	132384	132389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2795	NC_021014	A	6	6	132456	132461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2796	NC_021014	TTAA	2	8	132508	132515	50 %	50 %	0 %	0 %	479152413
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2825	NC_021014	TCA	2	6	133860	133865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2831	NC_021014	T	6	6	134005	134010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2832	NC_021014	ATA	2	6	134034	134039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2843	NC_021014	ACAT	2	8	134723	134730	50 %	25 %	0 %	25 %	479152414
2844	NC_021014	GGAT	2	8	134814	134821	25 %	25 %	50 %	0 %	479152414
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2848	NC_021014	AG	3	6	134992	134997	50 %	0 %	50 %	0 %	479152414
2849	NC_021014	TTTA	2	8	135000	135007	25 %	75 %	0 %	0 %	479152414
2850	NC_021014	TA	3	6	135063	135068	50 %	50 %	0 %	0 %	479152414
2851	NC_021014	ATG	2	6	135106	135111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152414
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2856	NC_021014	CTGC	2	8	135323	135330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2857	NC_021014	A	7	7	135391	135397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2858	NC_021014	AT	3	6	135405	135410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2859	NC_021014	GAG	2	6	135476	135481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2860	NC_021014	TGA	2	6	135530	135535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152415
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2862	NC_021014	GAA	2	6	135865	135870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152415
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2864	NC_021014	ATA	2	6	136019	136024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152415
2865	NC_021014	GA	3	6	136117	136122	50 %	0 %	50 %	0 %	479152415
2866	NC_021014	AAG	2	6	136201	136206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152415
2867	NC_021014	GGT	2	6	136267	136272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152415
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2874	NC_021014	TATGG	2	10	136510	136519	20 %	40 %	40 %	0 %	479152415
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3000	NC_021014	AGA	2	6	142996	143001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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