MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2129	NC_021014	TTC	2	6	100575	100580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152387
2130	NC_021014	GAAA	2	8	100590	100597	75 %	0 %	25 %	0 %	479152387
2131	NC_021014	TTG	2	6	100614	100619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152387
2132	NC_021014	TGA	2	6	100675	100680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152387
2133	NC_021014	GGA	2	6	100721	100726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152387
2134	NC_021014	TGA	2	6	100744	100749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152387
2135	NC_021014	TGTT	2	8	100752	100759	0 %	75 %	25 %	0 %	479152387
2136	NC_021014	ATTCT	2	10	100806	100815	20 %	60 %	0 %	20 %	479152387
2137	NC_021014	TTC	2	6	100897	100902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152387
2138	NC_021014	GA	3	6	100914	100919	50 %	0 %	50 %	0 %	479152387
2139	NC_021014	GCA	2	6	101051	101056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152387
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2141	NC_021014	T	7	7	101141	101147	0 %	100 %	0 %	0 %	479152388
2142	NC_021014	TAT	2	6	101184	101189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152388
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2144	NC_021014	TCT	2	6	101273	101278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152388
2145	NC_021014	A	6	6	101291	101296	100 %	0 %	0 %	0 %	479152388
2146	NC_021014	ATC	2	6	101333	101338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2147	NC_021014	TCT	2	6	101344	101349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2148	NC_021014	TA	3	6	101427	101432	50 %	50 %	0 %	0 %	479152389
2149	NC_021014	TCT	2	6	101446	101451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152389
2150	NC_021014	TGT	2	6	101685	101690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152389
2151	NC_021014	T	7	7	101727	101733	0 %	100 %	0 %	0 %	479152389
2152	NC_021014	GCTGAT	2	12	101764	101775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479152389
2153	NC_021014	TAT	2	6	101798	101803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152389
2154	NC_021014	CTG	2	6	101813	101818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152389
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2156	NC_021014	TTCG	2	8	101877	101884	0 %	50 %	25 %	25 %	479152389
2157	NC_021014	AAG	2	6	101975	101980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152389
2158	NC_021014	AGT	2	6	102037	102042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152390
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2160	NC_021014	A	6	6	102178	102183	100 %	0 %	0 %	0 %	479152390
2161	NC_021014	GGT	2	6	102276	102281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2162	NC_021014	AAG	2	6	102388	102393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2163	NC_021014	TGA	2	6	102411	102416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2164	NC_021014	CTGAA	2	10	102431	102440	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2165	NC_021014	ATT	2	6	102467	102472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2166	NC_021014	ATCCTG	2	12	102529	102540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2167	NC_021014	AAAG	2	8	102588	102595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2168	NC_021014	TGA	2	6	102720	102725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2171	NC_021014	ATAA	2	8	102787	102794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2172	NC_021014	ATG	2	6	102849	102854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2173	NC_021014	TAT	2	6	102867	102872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2174	NC_021014	TTA	2	6	102874	102879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2175	NC_021014	GAA	2	6	102886	102891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2178	NC_021014	CT	3	6	102950	102955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2179	NC_021014	A	6	6	102980	102985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2180	NC_021014	GAA	2	6	102995	103000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2181	NC_021014	TAC	2	6	103021	103026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2183	NC_021014	TTC	2	6	103179	103184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2191	NC_021014	TG	3	6	103412	103417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2192	NC_021014	GGT	2	6	103460	103465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2223	NC_021014	CATAT	2	10	105019	105028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2226	NC_021014	TA	3	6	105102	105107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2227	NC_021014	TA	3	6	105112	105117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2228	NC_021014	ATT	2	6	105123	105128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2229	NC_021014	GAACA	2	10	105132	105141	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2230	NC_021014	AGGCAG	2	12	105160	105171	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2231	NC_021014	CAG	2	6	105198	105203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152392
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2234	NC_021014	AGAA	2	8	105325	105332	75 %	0 %	25 %	0 %	479152392
2235	NC_021014	GTG	2	6	105378	105383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152392
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2240	NC_021014	GAAGA	2	10	105612	105621	60 %	0 %	40 %	0 %	479152392
2241	NC_021014	AGT	2	6	105629	105634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152392
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2243	NC_021014	ATC	2	6	105759	105764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152392
2244	NC_021014	TGA	2	6	105872	105877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152392
2245	NC_021014	AGC	2	6	105878	105883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152392
2246	NC_021014	ATG	2	6	105912	105917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152392
2247	NC_021014	CAGG	2	8	105960	105967	25 %	0 %	50 %	25 %	479152392
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2249	NC_021014	GAA	2	6	106055	106060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152392
2250	NC_021014	GA	4	8	106158	106165	50 %	0 %	50 %	0 %	479152392
2251	NC_021014	CAAAA	2	10	106190	106199	80 %	0 %	0 %	20 %	479152392
2252	NC_021014	T	6	6	106267	106272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_021014	TAC	2	6	106295	106300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2254	NC_021014	AAC	2	6	106325	106330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_021014	ATA	2	6	106398	106403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_021014	AACAA	2	10	106413	106422	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2257	NC_021014	A	6	6	106450	106455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2265	NC_021014	CAAA	2	8	106594	106601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2374	NC_021014	ATGTAA	2	12	111692	111703	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_021014	CCGGA	2	10	111732	111741	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2376	NC_021014	T	6	6	111760	111765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2377	NC_021014	AAAAG	2	10	111786	111795	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2378	NC_021014	A	6	6	111815	111820	100 %	0 %	0 %	0 %	479152397
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