MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021014	CTG	2	6	69695	69700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_021014	GCG	2	6	69750	69755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021014	TCG	2	6	69813	69818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021014	CTT	2	6	69872	69877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_021014	ATTG	2	8	69973	69980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021014	GAA	2	6	70003	70008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021014	CTG	2	6	70059	70064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_021014	T	6	6	70184	70189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021014	TTC	2	6	70229	70234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_021014	CTG	2	6	70241	70246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_021014	TTC	2	6	70254	70259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021014	AAT	2	6	70262	70267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021014	TGTAG	2	10	70343	70352	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021014	TTG	2	6	70401	70406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021014	TG	3	6	70415	70420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021014	GCA	2	6	70470	70475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_021014	GAT	2	6	70547	70552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021014	TGA	2	6	70620	70625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021014	CAC	2	6	70636	70641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_021014	CGG	2	6	70647	70652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021014	CTG	2	6	70684	70689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021014	CAG	2	6	70764	70769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021014	ATGA	2	8	70777	70784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021014	TC	3	6	70841	70846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_021014	TGA	2	6	71017	71022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152361
1526	NC_021014	AAG	2	6	71042	71047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152361
1527	NC_021014	GCA	2	6	71249	71254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152362
1528	NC_021014	GCC	2	6	71266	71271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152362
1529	NC_021014	ATTTAT	2	12	71299	71310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152362
1530	NC_021014	ACG	2	6	71318	71323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152362
1531	NC_021014	TAAC	2	8	71340	71347	50 %	25 %	0 %	25 %	479152362
1532	NC_021014	GAT	2	6	71377	71382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152362
1533	NC_021014	CCG	2	6	71394	71399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152362
1534	NC_021014	A	6	6	71401	71406	100 %	0 %	0 %	0 %	479152362
1535	NC_021014	AATA	2	8	71428	71435	75 %	25 %	0 %	0 %	479152362
1536	NC_021014	ATTC	2	8	71454	71461	25 %	50 %	0 %	25 %	479152362
1537	NC_021014	GGC	2	6	71494	71499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_021014	CAG	2	6	71515	71520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_021014	TGA	2	6	71616	71621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152363
1540	NC_021014	AGT	2	6	71644	71649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152363
1541	NC_021014	AGC	2	6	71667	71672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152363
1542	NC_021014	ATC	2	6	71746	71751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152364
1543	NC_021014	CAG	2	6	71778	71783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152364
1544	NC_021014	CAT	2	6	71808	71813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152364
1545	NC_021014	TCT	2	6	71817	71822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152364
1546	NC_021014	AGGAT	2	10	71930	71939	40 %	20 %	40 %	0 %	479152364
1547	NC_021014	TTGCAT	2	12	71973	71984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479152364
1548	NC_021014	AAG	2	6	71990	71995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152364
1549	NC_021014	CTTCAC	2	12	72102	72113	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479152364
1550	NC_021014	AGC	2	6	72130	72135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152364
1551	NC_021014	CTCCAC	2	12	72242	72253	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479152364
1552	NC_021014	CTTG	2	8	72299	72306	0 %	50 %	25 %	25 %	479152365
1553	NC_021014	AAG	2	6	72320	72325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152365
1554	NC_021014	AGC	2	6	72413	72418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152365
1555	NC_021014	CTC	2	6	72451	72456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152365
1556	NC_021014	CTG	2	6	72461	72466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152365
1557	NC_021014	AGC	2	6	72494	72499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152365
1558	NC_021014	GGC	2	6	72500	72505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152365
1559	NC_021014	TCC	2	6	72561	72566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_021014	TG	3	6	72581	72586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021014	GAT	2	6	72591	72596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021014	TTC	2	6	72604	72609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021014	TCG	2	6	72681	72686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021014	ATG	2	6	72757	72762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021014	CAG	2	6	72780	72785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_021014	GAT	2	6	72786	72791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021014	CTT	2	6	72875	72880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_021014	AGG	2	6	72901	72906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021014	GTG	2	6	72929	72934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021014	TGG	2	6	73046	73051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021014	A	6	6	73144	73149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021014	GAA	2	6	73176	73181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021014	TAT	2	6	73201	73206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021014	TGC	2	6	73220	73225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_021014	GAA	2	6	73233	73238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021014	TGA	2	6	73262	73267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021014	GAA	2	6	73326	73331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021014	GAA	2	6	73335	73340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_021014	TA	3	6	73426	73431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021014	ATTT	2	8	73572	73579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021014	TCT	2	6	73599	73604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_021014	TGA	2	6	73730	73735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021014	CAC	2	6	73744	73749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_021014	GCA	2	6	73752	73757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_021014	ATG	2	6	73795	73800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021014	TA	3	6	73801	73806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021014	AGA	2	6	73849	73854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021014	ATT	2	6	73860	73865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021014	GAT	3	9	73938	73946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021014	ATT	2	6	73975	73980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021014	ATG	2	6	73995	74000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021014	TTGAA	2	10	74026	74035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021014	ATT	2	6	74089	74094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021014	TGA	2	6	74105	74110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021014	ATG	2	6	74247	74252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021014	CTG	2	6	74257	74262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_021014	GAT	2	6	74276	74281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021014	TCG	3	9	74294	74302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_021014	CTT	2	6	74309	74314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_021014	TTA	2	6	74347	74352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021014	AGGA	2	8	74359	74366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021014	AGA	2	6	74498	74503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021014	TGA	2	6	74561	74566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021014	AAT	2	6	74642	74647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152366
1605	NC_021014	CTG	2	6	74738	74743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152366
1606	NC_021014	TA	3	6	74790	74795	50 %	50 %	0 %	0 %	479152366
1607	NC_021014	GTC	2	6	74808	74813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152366
1608	NC_021014	GAA	2	6	74816	74821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152366
1609	NC_021014	AAAT	2	8	74841	74848	75 %	25 %	0 %	0 %	479152366
1610	NC_021014	TACT	2	8	74889	74896	25 %	50 %	0 %	25 %	479152366
1611	NC_021014	TGA	2	6	74905	74910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152366
1612	NC_021014	ATTTT	2	10	74939	74948	20 %	80 %	0 %	0 %	479152366
1613	NC_021014	AGA	2	6	75049	75054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152367
1614	NC_021014	TGG	2	6	75069	75074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152367
1615	NC_021014	TTGC	2	8	75085	75092	0 %	50 %	25 %	25 %	479152367
1616	NC_021014	GCT	2	6	75104	75109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152367
1617	NC_021014	CAT	2	6	75157	75162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152367
1618	NC_021014	GAT	2	6	75190	75195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152367
1619	NC_021014	GAA	2	6	75300	75305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152367
1620	NC_021014	TAT	2	6	75378	75383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152368
1621	NC_021014	GAT	2	6	75393	75398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152368
1622	NC_021014	ATT	2	6	75428	75433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152368
1623	NC_021014	GTT	2	6	75525	75530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152368
1624	NC_021014	TTG	2	6	75631	75636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152368
1625	NC_021014	GAT	2	6	75687	75692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152368
1626	NC_021014	AAG	2	6	75738	75743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152368
1627	NC_021014	CTT	2	6	75854	75859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152368
1628	NC_021014	TAA	3	9	75866	75874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152368
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1630	NC_021014	TAT	2	6	75935	75940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152368
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