MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021014	TCC	2	6	46093	46098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_021014	AGA	2	6	46108	46113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021014	AAG	2	6	46116	46121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021014	TGC	2	6	46195	46200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021014	T	6	6	46220	46225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021014	GGCA	2	8	46311	46318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_021014	TA	3	6	46400	46405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021014	CATT	2	8	46408	46415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_021014	ATT	2	6	46455	46460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021014	ACA	2	6	46485	46490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021014	CAG	2	6	46495	46500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021014	GGAG	2	8	46519	46526	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021014	TGC	2	6	46604	46609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_021014	GGT	2	6	46654	46659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021014	GACT	2	8	46692	46699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_021014	ATG	2	6	46722	46727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021014	GCA	2	6	46799	46804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_021014	CAGA	2	8	46811	46818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_021014	CAA	2	6	46864	46869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021014	AAT	2	6	46882	46887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021014	AAG	3	9	46913	46921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021014	GTA	2	6	46926	46931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021014	CAG	2	6	46935	46940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021014	AGTGA	2	10	46985	46994	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021014	T	6	6	47038	47043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021014	AGG	2	6	47090	47095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021014	GAC	2	6	47108	47113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152343
1028	NC_021014	GAAA	2	8	47135	47142	75 %	0 %	25 %	0 %	479152343
1029	NC_021014	TAT	2	6	47213	47218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152343
1030	NC_021014	GAA	2	6	47221	47226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152343
1031	NC_021014	CAG	2	6	47234	47239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152343
1032	NC_021014	TTG	2	6	47251	47256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152343
1033	NC_021014	GGAA	2	8	47264	47271	50 %	0 %	50 %	0 %	479152343
1034	NC_021014	ATCC	2	8	47290	47297	25 %	25 %	0 %	50 %	479152343
1035	NC_021014	CAGA	2	8	47376	47383	50 %	0 %	25 %	25 %	479152343
1036	NC_021014	GACA	2	8	47403	47410	50 %	0 %	25 %	25 %	479152343
1037	NC_021014	TC	3	6	47427	47432	0 %	50 %	0 %	50 %	479152343
1038	NC_021014	GCA	2	6	47434	47439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152343
1039	NC_021014	TTC	2	6	47488	47493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152343
1040	NC_021014	GCG	2	6	47592	47597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152343
1041	NC_021014	TGA	2	6	47696	47701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152343
1042	NC_021014	ATA	2	6	47737	47742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152343
1043	NC_021014	TC	3	6	47748	47753	0 %	50 %	0 %	50 %	479152343
1044	NC_021014	AATA	2	8	47811	47818	75 %	25 %	0 %	0 %	479152343
1045	NC_021014	GGA	2	6	47844	47849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021014	TGGC	2	8	47995	48002	0 %	25 %	50 %	25 %	479152344
1047	NC_021014	GCA	2	6	48041	48046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152344
1048	NC_021014	GAT	2	6	48128	48133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152344
1049	NC_021014	GAA	2	6	48142	48147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152344
1050	NC_021014	GCAAGA	2	12	48173	48184	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479152344
1051	NC_021014	TCA	2	6	48200	48205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152344
1052	NC_021014	ATTTC	2	10	48213	48222	20 %	60 %	0 %	20 %	479152344
1053	NC_021014	AG	4	8	48264	48271	50 %	0 %	50 %	0 %	479152344
1054	NC_021014	AGG	2	6	48306	48311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152344
1055	NC_021014	AGA	2	6	48330	48335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152344
1056	NC_021014	A	6	6	48335	48340	100 %	0 %	0 %	0 %	479152344
1057	NC_021014	GCC	2	6	48429	48434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152344
1058	NC_021014	TGA	2	6	48448	48453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152344
1059	NC_021014	GAA	2	6	48497	48502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152344
1060	NC_021014	AG	3	6	48507	48512	50 %	0 %	50 %	0 %	479152344
1061	NC_021014	ATC	2	6	48530	48535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152344
1062	NC_021014	GGAC	2	8	48574	48581	25 %	0 %	50 %	25 %	479152344
1063	NC_021014	CAG	2	6	48605	48610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152344
1064	NC_021014	GA	4	8	48719	48726	50 %	0 %	50 %	0 %	479152344
1065	NC_021014	AT	3	6	48757	48762	50 %	50 %	0 %	0 %	479152344
1066	NC_021014	AGA	2	6	48826	48831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152344
1067	NC_021014	AG	3	6	48834	48839	50 %	0 %	50 %	0 %	479152344
1068	NC_021014	TTC	2	6	48884	48889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152344
1069	NC_021014	ATA	2	6	48900	48905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152344
1070	NC_021014	GC	3	6	48910	48915	0 %	0 %	50 %	50 %	479152344
1071	NC_021014	AT	3	6	48934	48939	50 %	50 %	0 %	0 %	479152344
1072	NC_021014	TGA	2	6	48964	48969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152344
1073	NC_021014	TAA	2	6	48988	48993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152344
1074	NC_021014	CCA	2	6	49033	49038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152344
1075	NC_021014	ATGC	2	8	49046	49053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_021014	A	6	6	49086	49091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021014	A	6	6	49119	49124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021014	TAAAAA	2	12	49166	49177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021014	CG	3	6	49251	49256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_021014	AT	3	6	49320	49325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021014	T	6	6	49354	49359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021014	T	6	6	49364	49369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021014	TA	3	6	49375	49380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021014	GGT	2	6	49438	49443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021014	ATC	2	6	49537	49542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152345
1086	NC_021014	TCA	2	6	49544	49549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152345
1087	NC_021014	TG	3	6	49553	49558	0 %	50 %	50 %	0 %	479152345
1088	NC_021014	CCG	2	6	49559	49564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152345
1089	NC_021014	CA	3	6	49604	49609	50 %	0 %	0 %	50 %	479152345
1090	NC_021014	TTC	2	6	49621	49626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152345
1091	NC_021014	AAG	2	6	49764	49769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152345
1092	NC_021014	GCT	2	6	49788	49793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152345
1093	NC_021014	CAT	2	6	49864	49869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152345
1094	NC_021014	CATAT	2	10	49900	49909	40 %	40 %	0 %	20 %	479152345
1095	NC_021014	TGC	2	6	49912	49917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152345
1096	NC_021014	TCC	2	6	49973	49978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152345
1097	NC_021014	TGCC	2	8	49979	49986	0 %	25 %	25 %	50 %	479152345
1098	NC_021014	CAG	2	6	50026	50031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152345
1099	NC_021014	TCT	2	6	50052	50057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152345
1100	NC_021014	CTG	2	6	50068	50073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152345
1101	NC_021014	T	6	6	50095	50100	0 %	100 %	0 %	0 %	479152345
1102	NC_021014	GGTT	2	8	50107	50114	0 %	50 %	50 %	0 %	479152345
1103	NC_021014	A	6	6	50172	50177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021014	AGG	2	6	50281	50286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021014	A	6	6	50301	50306	100 %	0 %	0 %	0 %	479152346
1106	NC_021014	CAG	2	6	50357	50362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152346
1107	NC_021014	A	7	7	50407	50413	100 %	0 %	0 %	0 %	479152346
1108	NC_021014	CAG	2	6	50419	50424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152346
1109	NC_021014	GAT	2	6	50434	50439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152346
1110	NC_021014	AAAG	2	8	50619	50626	75 %	0 %	25 %	0 %	479152346
1111	NC_021014	ATC	2	6	50638	50643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152346
1112	NC_021014	TAAA	2	8	50684	50691	75 %	25 %	0 %	0 %	479152346
1113	NC_021014	AAG	2	6	50746	50751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152346
1114	NC_021014	GAT	2	6	50782	50787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152346
1115	NC_021014	GGT	2	6	51013	51018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152346
1116	NC_021014	ATT	2	6	51113	51118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152346
1117	NC_021014	CTG	2	6	51132	51137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152346
1118	NC_021014	AGT	2	6	51234	51239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152346
1119	NC_021014	GGA	2	6	51274	51279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152346
1120	NC_021014	AC	3	6	51316	51321	50 %	0 %	0 %	50 %	479152346
1121	NC_021014	AGCAG	2	10	51327	51336	40 %	0 %	40 %	20 %	479152346
1122	NC_021014	CTG	2	6	51387	51392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021014	GCA	2	6	51412	51417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021014	T	6	6	51419	51424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021014	A	6	6	51429	51434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021014	CAG	2	6	51442	51447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_021014	A	6	6	51469	51474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021014	A	6	6	51605	51610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021014	A	7	7	51612	51618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021014	A	7	7	51649	51655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021014	GCA	2	6	51688	51693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152347
1132	NC_021014	AGAT	2	8	51694	51701	50 %	25 %	25 %	0 %	479152347
1133	NC_021014	T	6	6	51701	51706	0 %	100 %	0 %	0 %	479152347
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1251	NC_021014	GCA	2	6	57421	57426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_021014	TGCAA	2	10	57427	57436	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1253	NC_021014	AT	3	6	57438	57443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_021014	TA	3	6	57461	57466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_021014	TGA	2	6	57837	57842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_021014	TGT	2	6	57858	57863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_021014	AC	3	6	57864	57869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1267	NC_021014	TAT	2	6	57949	57954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1496	NC_021014	TGTT	2	8	69442	69449	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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