MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021014	CATG	2	8	383803	383810	25 %	25 %	25 %	25 %	479152644
8002	NC_021014	GAA	2	6	383857	383862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152644
8003	NC_021014	ATC	2	6	383865	383870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152644
8004	NC_021014	TCAT	2	8	383961	383968	25 %	50 %	0 %	25 %	479152644
8005	NC_021014	CT	3	6	383970	383975	0 %	50 %	0 %	50 %	479152644
8006	NC_021014	ATC	2	6	383984	383989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152644
8007	NC_021014	TCT	2	6	384031	384036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152644
8008	NC_021014	ATG	2	6	384039	384044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152644
8009	NC_021014	AGA	2	6	384049	384054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152644
8010	NC_021014	GAA	2	6	384071	384076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152644
8011	NC_021014	AAGA	2	8	384184	384191	75 %	0 %	25 %	0 %	479152644
8012	NC_021014	ATA	2	6	384252	384257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152644
8013	NC_021014	AT	3	6	384271	384276	50 %	50 %	0 %	0 %	479152644
8014	NC_021014	CAG	2	6	384290	384295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152644
8015	NC_021014	GAT	2	6	384374	384379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152644
8016	NC_021014	AGC	2	6	384489	384494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152644
8017	NC_021014	GGA	2	6	384499	384504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152644
8018	NC_021014	TTC	2	6	384545	384550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152644
8019	NC_021014	AAG	2	6	384560	384565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152644
8020	NC_021014	ACA	2	6	384749	384754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152644
8021	NC_021014	CA	3	6	385231	385236	50 %	0 %	0 %	50 %	479152644
8022	NC_021014	AAGA	2	8	385265	385272	75 %	0 %	25 %	0 %	479152644
8023	NC_021014	GAAG	2	8	385276	385283	50 %	0 %	50 %	0 %	479152644
8024	NC_021014	ATA	2	6	385284	385289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152644
8025	NC_021014	AT	3	6	385349	385354	50 %	50 %	0 %	0 %	479152644
8026	NC_021014	GGC	2	6	385436	385441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152644
8027	NC_021014	AAG	2	6	385446	385451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152644
8028	NC_021014	AAG	2	6	385496	385501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152644
8029	NC_021014	AAGAGT	2	12	385565	385576	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479152644
8030	NC_021014	GTA	2	6	385583	385588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152644
8031	NC_021014	ATG	2	6	385599	385604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152644
8032	NC_021014	GAGAT	2	10	385644	385653	40 %	20 %	40 %	0 %	479152644
8033	NC_021014	AAGAGG	2	12	385669	385680	50 %	0 %	50 %	0 %	479152644
8034	NC_021014	TG	3	6	385703	385708	0 %	50 %	50 %	0 %	479152644
8035	NC_021014	TGG	2	6	385839	385844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152644
8036	NC_021014	AG	3	6	385864	385869	50 %	0 %	50 %	0 %	479152644
8037	NC_021014	GATC	2	8	385873	385880	25 %	25 %	25 %	25 %	479152644
8038	NC_021014	CAA	2	6	385903	385908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152644
8039	NC_021014	GCA	2	6	385947	385952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152644
8040	NC_021014	AAC	2	6	386017	386022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152644
8041	NC_021014	GGA	2	6	386040	386045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_021014	GCA	2	6	386069	386074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152645
8043	NC_021014	GT	3	6	386075	386080	0 %	50 %	50 %	0 %	479152645
8044	NC_021014	CTG	2	6	386136	386141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152645
8045	NC_021014	TTC	2	6	386215	386220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152645
8046	NC_021014	CAT	2	6	386243	386248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152645
8047	NC_021014	ATGC	2	8	386290	386297	25 %	25 %	25 %	25 %	479152645
8048	NC_021014	GAA	2	6	386304	386309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152645
8049	NC_021014	CTG	2	6	386341	386346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152645
8050	NC_021014	TTC	2	6	386380	386385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152645
8051	NC_021014	TCCA	2	8	386421	386428	25 %	25 %	0 %	50 %	479152645
8052	NC_021014	CA	3	6	386436	386441	50 %	0 %	0 %	50 %	479152645
8053	NC_021014	GCT	3	9	386461	386469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152645
8054	NC_021014	GAA	2	6	386530	386535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152645
8055	NC_021014	CTG	2	6	386557	386562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152645
8056	NC_021014	AAG	2	6	386570	386575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152645
8057	NC_021014	GGA	2	6	386603	386608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152645
8058	NC_021014	ATG	2	6	386717	386722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_021014	GAT	2	6	386782	386787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_021014	TGA	2	6	386820	386825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_021014	ACA	2	6	386846	386851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_021014	A	7	7	386863	386869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021014	ATG	2	6	386936	386941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_021014	A	6	6	386958	386963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_021014	AT	3	6	387111	387116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_021014	GA	3	6	387117	387122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_021014	TCTG	2	8	387254	387261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8068	NC_021014	TTCA	2	8	387267	387274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8069	NC_021014	GA	3	6	387289	387294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_021014	GAT	2	6	387357	387362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_021014	CTT	2	6	387439	387444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_021014	GAG	2	6	387472	387477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_021014	GAA	2	6	387481	387486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_021014	CAATAT	2	12	387678	387689	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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8076	NC_021014	TTA	2	6	387915	387920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_021014	ACAG	2	8	387926	387933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8078	NC_021014	GGA	2	6	388011	388016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_021014	AGC	2	6	388019	388024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8082	NC_021014	TCC	2	6	388051	388056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_021014	TGT	2	6	388110	388115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_021014	GA	3	6	388147	388152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_021014	GA	3	6	388191	388196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_021014	AGA	2	6	388217	388222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_021014	ATG	2	6	388307	388312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_021014	CTTGGT	2	12	388324	388335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8090	NC_021014	GAA	2	6	388441	388446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_021014	ATC	2	6	388535	388540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_021014	ATG	2	6	388676	388681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_021014	TGA	2	6	388694	388699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_021014	AGG	2	6	388761	388766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_021014	A	6	6	388780	388785	100 %	0 %	0 %	0 %	479152646
8096	NC_021014	GGAAAT	2	12	388822	388833	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479152646
8097	NC_021014	TGA	2	6	388845	388850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152646
8098	NC_021014	AG	3	6	388859	388864	50 %	0 %	50 %	0 %	479152646
8099	NC_021014	AGCA	2	8	388931	388938	50 %	0 %	25 %	25 %	479152646
8100	NC_021014	TGAAAA	2	12	388945	388956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479152646
8101	NC_021014	AG	3	6	388977	388982	50 %	0 %	50 %	0 %	479152646
8102	NC_021014	GAAACT	2	12	388987	388998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479152646
8103	NC_021014	TGACC	2	10	389047	389056	20 %	20 %	20 %	40 %	479152646
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8106	NC_021014	AG	3	6	389154	389159	50 %	0 %	50 %	0 %	479152646
8107	NC_021014	GATATC	2	12	389186	389197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479152646
8108	NC_021014	ACA	2	6	389246	389251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152646
8109	NC_021014	CTT	2	6	389252	389257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152646
8110	NC_021014	AG	3	6	389344	389349	50 %	0 %	50 %	0 %	479152646
8111	NC_021014	TAT	2	6	389365	389370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152646
8112	NC_021014	AG	3	6	389440	389445	50 %	0 %	50 %	0 %	479152646
8113	NC_021014	ATC	2	6	389564	389569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152646
8114	NC_021014	CAG	2	6	389592	389597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152646
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8116	NC_021014	GATGA	2	10	389714	389723	40 %	20 %	40 %	0 %	479152646
8117	NC_021014	ATA	2	6	389742	389747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152646
8118	NC_021014	GA	3	6	389777	389782	50 %	0 %	50 %	0 %	479152646
8119	NC_021014	TGC	2	6	389790	389795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152646
8120	NC_021014	GA	3	6	389801	389806	50 %	0 %	50 %	0 %	479152646
8121	NC_021014	CCAA	2	8	389819	389826	50 %	0 %	0 %	50 %	479152646
8122	NC_021014	GAA	2	6	389854	389859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152646
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8124	NC_021014	A	6	6	389954	389959	100 %	0 %	0 %	0 %	479152646
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8126	NC_021014	A	6	6	390075	390080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8246	NC_021014	A	6	6	395274	395279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8247	NC_021014	ATGA	2	8	395356	395363	50 %	25 %	25 %	0 %	479152654
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8498	NC_021014	AT	3	6	408108	408113	50 %	50 %	0 %	0 %	479152664
8499	NC_021014	TCCT	2	8	408193	408200	0 %	50 %	0 %	50 %	479152664
8500	NC_021014	GCT	2	6	408204	408209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152664

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