MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021014	T	6	6	289324	289329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_021014	AGTC	2	8	289398	289405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_021014	GCT	2	6	289539	289544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152566
6004	NC_021014	CAG	2	6	289560	289565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152566
6005	NC_021014	TAAAA	2	10	289574	289583	80 %	20 %	0 %	0 %	479152566
6006	NC_021014	A	6	6	289580	289585	100 %	0 %	0 %	0 %	479152566
6007	NC_021014	AGA	2	6	289592	289597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152566
6008	NC_021014	TTTC	2	8	289631	289638	0 %	75 %	0 %	25 %	479152566
6009	NC_021014	GT	3	6	289812	289817	0 %	50 %	50 %	0 %	479152566
6010	NC_021014	AATA	2	8	289824	289831	75 %	25 %	0 %	0 %	479152566
6011	NC_021014	GAA	2	6	289885	289890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_021014	GTT	2	6	289892	289897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021014	A	6	6	289904	289909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_021014	TGA	2	6	289930	289935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021014	T	6	6	289947	289952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_021014	ATT	2	6	289958	289963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152567
6017	NC_021014	T	7	7	289987	289993	0 %	100 %	0 %	0 %	479152567
6018	NC_021014	CTT	2	6	289994	289999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152567
6019	NC_021014	GAA	2	6	290052	290057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152567
6020	NC_021014	CCT	2	6	290171	290176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_021014	GCT	2	6	290185	290190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_021014	ATT	2	6	290314	290319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021014	GGA	2	6	290326	290331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_021014	AATCA	2	10	290367	290376	60 %	20 %	0 %	20 %	479152568
6025	NC_021014	A	6	6	290388	290393	100 %	0 %	0 %	0 %	479152568
6026	NC_021014	AG	4	8	290454	290461	50 %	0 %	50 %	0 %	479152568
6027	NC_021014	TTGCAA	2	12	290492	290503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479152568
6028	NC_021014	TGAT	2	8	290534	290541	25 %	50 %	25 %	0 %	479152568
6029	NC_021014	A	6	6	290617	290622	100 %	0 %	0 %	0 %	479152568
6030	NC_021014	ATT	2	6	290642	290647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_021014	CTT	2	6	290686	290691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_021014	T	8	8	290690	290697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021014	T	6	6	290701	290706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021014	ATA	2	6	290740	290745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_021014	TA	3	6	290790	290795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_021014	GGA	2	6	290798	290803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_021014	ATGA	2	8	290806	290813	50 %	25 %	25 %	0 %	479152569
6038	NC_021014	GA	4	8	290812	290819	50 %	0 %	50 %	0 %	479152569
6039	NC_021014	A	6	6	290842	290847	100 %	0 %	0 %	0 %	479152569
6040	NC_021014	ACA	2	6	290850	290855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152569
6041	NC_021014	AGA	2	6	290863	290868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152569
6042	NC_021014	GAA	2	6	290933	290938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152569
6043	NC_021014	GAA	2	6	290941	290946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152569
6044	NC_021014	GAA	2	6	290978	290983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152569
6045	NC_021014	AAAG	2	8	291034	291041	75 %	0 %	25 %	0 %	479152570
6046	NC_021014	AAGG	2	8	291120	291127	50 %	0 %	50 %	0 %	479152570
6047	NC_021014	GTA	2	6	291138	291143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152570
6048	NC_021014	GTA	2	6	291180	291185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152570
6049	NC_021014	CGA	2	6	291295	291300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152570
6050	NC_021014	ATG	2	6	291397	291402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152570
6051	NC_021014	AAT	2	6	291408	291413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152570
6052	NC_021014	TA	4	8	291430	291437	50 %	50 %	0 %	0 %	479152570
6053	NC_021014	AGA	2	6	291452	291457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152570
6054	NC_021014	AAT	2	6	291499	291504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021014	TGA	2	6	291570	291575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_021014	AAG	2	6	291576	291581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_021014	AAGA	2	8	291600	291607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_021014	AGT	2	6	291620	291625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021014	A	6	6	291630	291635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_021014	T	7	7	291646	291652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021014	AGG	2	6	291775	291780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152571
6062	NC_021014	GA	3	6	291843	291848	50 %	0 %	50 %	0 %	479152571
6063	NC_021014	AGC	2	6	291899	291904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152571
6064	NC_021014	A	6	6	291910	291915	100 %	0 %	0 %	0 %	479152571
6065	NC_021014	CAG	2	6	292070	292075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152571
6066	NC_021014	ATCA	2	8	292091	292098	50 %	25 %	0 %	25 %	479152571
6067	NC_021014	ATT	2	6	292121	292126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152571
6068	NC_021014	AGACAC	2	12	292149	292160	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479152571
6069	NC_021014	CAGA	2	8	292186	292193	50 %	0 %	25 %	25 %	479152571
6070	NC_021014	TAA	2	6	292222	292227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152571
6071	NC_021014	T	6	6	292253	292258	0 %	100 %	0 %	0 %	479152571
6072	NC_021014	A	6	6	292259	292264	100 %	0 %	0 %	0 %	479152571
6073	NC_021014	AAT	2	6	292362	292367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_021014	TAA	2	6	292447	292452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_021014	TGC	2	6	292453	292458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_021014	TG	3	6	292507	292512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_021014	TTA	2	6	292627	292632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_021014	CGAG	2	8	292688	292695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6079	NC_021014	TAA	2	6	292703	292708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_021014	A	7	7	292811	292817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_021014	GA	3	6	292823	292828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_021014	GTA	2	6	292922	292927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_021014	AAC	2	6	292931	292936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_021014	ATAC	2	8	292944	292951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_021014	AGT	2	6	292966	292971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_021014	AT	3	6	292988	292993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_021014	AAG	2	6	292994	292999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_021014	AGTA	2	8	293027	293034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_021014	TAT	2	6	293104	293109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_021014	CAG	2	6	293200	293205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152572
6091	NC_021014	AATGA	2	10	293253	293262	60 %	20 %	20 %	0 %	479152572
6092	NC_021014	GAT	2	6	293273	293278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152572
6093	NC_021014	ACAG	2	8	293282	293289	50 %	0 %	25 %	25 %	479152572
6094	NC_021014	AAAT	2	8	293290	293297	75 %	25 %	0 %	0 %	479152572
6095	NC_021014	GA	3	6	293311	293316	50 %	0 %	50 %	0 %	479152572
6096	NC_021014	TTA	2	6	293511	293516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021014	TAA	2	6	293533	293538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_021014	AGG	2	6	293540	293545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_021014	CAA	2	6	293566	293571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152573
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6101	NC_021014	AGA	2	6	293608	293613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152573
6102	NC_021014	A	6	6	293696	293701	100 %	0 %	0 %	0 %	479152573
6103	NC_021014	GTT	2	6	293711	293716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152573
6104	NC_021014	TGA	2	6	293728	293733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152573
6105	NC_021014	AT	3	6	293848	293853	50 %	50 %	0 %	0 %	479152573
6106	NC_021014	GA	3	6	293873	293878	50 %	0 %	50 %	0 %	479152573
6107	NC_021014	A	6	6	294047	294052	100 %	0 %	0 %	0 %	479152573
6108	NC_021014	AAGACA	2	12	294092	294103	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479152573
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6111	NC_021014	AGC	2	6	294248	294253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152573
6112	NC_021014	AGAA	2	8	294282	294289	75 %	0 %	25 %	0 %	479152573
6113	NC_021014	GTGA	2	8	294455	294462	25 %	25 %	50 %	0 %	479152573
6114	NC_021014	CTT	2	6	294488	294493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152573
6115	NC_021014	A	6	6	294607	294612	100 %	0 %	0 %	0 %	479152573
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6118	NC_021014	GAT	2	6	294855	294860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_021014	AGA	2	6	294897	294902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021014	GCA	2	6	294919	294924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_021014	AG	3	6	294951	294956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_021014	AGAA	2	8	294971	294978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_021014	CTGG	2	8	295017	295024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_021014	ATT	2	6	295025	295030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_021014	GAA	2	6	295051	295056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_021014	TGG	2	6	295070	295075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_021014	TTTTGA	2	12	295128	295139	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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