MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021014	ATA	2	6	216073	216078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152497
4502	NC_021014	TTTCC	2	10	216079	216088	0 %	60 %	0 %	40 %	479152497
4503	NC_021014	A	6	6	216132	216137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_021014	TAA	2	6	216191	216196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_021014	CAT	2	6	216215	216220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_021014	GAA	2	6	216256	216261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021014	A	6	6	216307	216312	100 %	0 %	0 %	0 %	479152498
4508	NC_021014	TTA	2	6	216390	216395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152498
4509	NC_021014	A	7	7	216448	216454	100 %	0 %	0 %	0 %	479152498
4510	NC_021014	ACC	2	6	216487	216492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_021014	ATG	2	6	216507	216512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021014	GGA	2	6	216564	216569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021014	ACA	2	6	216571	216576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_021014	T	7	7	216615	216621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021014	CAC	2	6	216631	216636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_021014	A	6	6	216653	216658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021014	A	6	6	216748	216753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021014	TCA	2	6	216770	216775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_021014	T	6	6	216779	216784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021014	ATTT	2	8	216786	216793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021014	CAG	2	6	216814	216819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_021014	CTG	2	6	216831	216836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_021014	T	6	6	216893	216898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_021014	TAT	2	6	216933	216938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_021014	GAA	2	6	216997	217002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_021014	AGA	2	6	217032	217037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_021014	TTAA	2	8	217038	217045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021014	TTTG	2	8	217055	217062	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_021014	AGT	2	6	217066	217071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_021014	ACT	2	6	217100	217105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_021014	T	6	6	217137	217142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_021014	A	6	6	217145	217150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_021014	GTA	2	6	217152	217157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021014	GAA	2	6	217163	217168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_021014	GAG	2	6	217231	217236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021014	A	6	6	217237	217242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021014	TGGA	2	8	217320	217327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021014	ATA	3	9	217384	217392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021014	TGAA	2	8	217441	217448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021014	TTA	2	6	217486	217491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_021014	GAT	2	6	217492	217497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021014	TAG	2	6	217573	217578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_021014	AAG	2	6	217614	217619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_021014	GTT	2	6	217626	217631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_021014	A	6	6	217654	217659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021014	ATA	2	6	217670	217675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_021014	N	285	285	217741	218025	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_021014	T	6	6	218052	218057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_021014	ATT	2	6	218081	218086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_021014	CAG	2	6	218095	218100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_021014	AGG	2	6	218114	218119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_021014	CTA	2	6	218174	218179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152499
4553	NC_021014	CAG	2	6	218186	218191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152499
4554	NC_021014	TTG	2	6	218210	218215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152499
4555	NC_021014	AAAAG	2	10	218247	218256	80 %	0 %	20 %	0 %	479152499
4556	NC_021014	ATT	2	6	218312	218317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152499
4557	NC_021014	AATTA	2	10	218354	218363	60 %	40 %	0 %	0 %	479152499
4558	NC_021014	T	6	6	218382	218387	0 %	100 %	0 %	0 %	479152499
4559	NC_021014	T	8	8	218484	218491	0 %	100 %	0 %	0 %	479152499
4560	NC_021014	TCA	2	6	218508	218513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152499
4561	NC_021014	TGG	2	6	218522	218527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152499
4562	NC_021014	GTT	2	6	218543	218548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152499
4563	NC_021014	CTG	2	6	218560	218565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152499
4564	NC_021014	TTC	2	6	218574	218579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152499
4565	NC_021014	C	6	6	218613	218618	0 %	0 %	0 %	100 %	479152499
4566	NC_021014	TAT	2	6	218652	218657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152499
4567	NC_021014	CTG	2	6	218728	218733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152499
4568	NC_021014	AC	3	6	218760	218765	50 %	0 %	0 %	50 %	479152499
4569	NC_021014	TA	3	6	218815	218820	50 %	50 %	0 %	0 %	479152499
4570	NC_021014	CAT	2	6	218827	218832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152499
4571	NC_021014	AGC	2	6	218852	218857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152499
4572	NC_021014	AGC	2	6	218878	218883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152499
4573	NC_021014	TCT	2	6	218970	218975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152499
4574	NC_021014	ATC	2	6	219127	219132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152500
4575	NC_021014	CAG	2	6	219204	219209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152500
4576	NC_021014	ACAG	2	8	219323	219330	50 %	0 %	25 %	25 %	479152500
4577	NC_021014	AAT	2	6	219366	219371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152500
4578	NC_021014	CAT	2	6	219377	219382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152500
4579	NC_021014	AAG	2	6	219392	219397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152500
4580	NC_021014	T	6	6	219496	219501	0 %	100 %	0 %	0 %	479152500
4581	NC_021014	AAG	2	6	219531	219536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152500
4582	NC_021014	TTG	2	6	219625	219630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152501
4583	NC_021014	CCAC	2	8	219652	219659	25 %	0 %	0 %	75 %	479152501
4584	NC_021014	TGA	2	6	219713	219718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152501
4585	NC_021014	T	7	7	219743	219749	0 %	100 %	0 %	0 %	479152501
4586	NC_021014	T	7	7	219760	219766	0 %	100 %	0 %	0 %	479152501
4587	NC_021014	GTA	2	6	219777	219782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152501
4588	NC_021014	CAG	2	6	219784	219789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152501
4589	NC_021014	CAGA	2	8	219797	219804	50 %	0 %	25 %	25 %	479152501
4590	NC_021014	A	6	6	219837	219842	100 %	0 %	0 %	0 %	479152501
4591	NC_021014	ATT	2	6	219964	219969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152501
4592	NC_021014	TGG	2	6	219981	219986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152501
4593	NC_021014	TCA	2	6	220026	220031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152501
4594	NC_021014	AAT	2	6	220058	220063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152501
4595	NC_021014	CAGA	2	8	220111	220118	50 %	0 %	25 %	25 %	479152501
4596	NC_021014	CAGA	2	8	220121	220128	50 %	0 %	25 %	25 %	479152501
4597	NC_021014	TCC	2	6	220198	220203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152501
4598	NC_021014	CTG	2	6	220260	220265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152501
4599	NC_021014	CAC	2	6	220294	220299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152501
4600	NC_021014	CTG	2	6	220324	220329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152501
4601	NC_021014	A	6	6	220357	220362	100 %	0 %	0 %	0 %	479152501
4602	NC_021014	TCG	2	6	220404	220409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152501
4603	NC_021014	CCT	2	6	220430	220435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_021014	TAC	2	6	220485	220490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_021014	T	6	6	220555	220560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_021014	ATG	2	6	220561	220566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021014	AAT	2	6	220586	220591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_021014	TGC	2	6	220602	220607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_021014	TAA	2	6	220622	220627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_021014	CCT	2	6	220630	220635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_021014	AATT	2	8	220642	220649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_021014	TAA	2	6	220674	220679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_021014	CAT	2	6	220720	220725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_021014	TGA	2	6	220765	220770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021014	TTAC	2	8	220834	220841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_021014	ACA	2	6	220948	220953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152502
4617	NC_021014	T	6	6	220999	221004	0 %	100 %	0 %	0 %	479152502
4618	NC_021014	A	6	6	221028	221033	100 %	0 %	0 %	0 %	479152502
4619	NC_021014	A	6	6	221035	221040	100 %	0 %	0 %	0 %	479152502
4620	NC_021014	TCA	2	6	221120	221125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_021014	ACA	2	6	221200	221205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_021014	AGAAAC	2	12	221209	221220	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4623	NC_021014	TCT	2	6	221457	221462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152503
4624	NC_021014	GAT	2	6	221487	221492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152503
4625	NC_021014	CGG	2	6	221516	221521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152503
4626	NC_021014	AT	3	6	221569	221574	50 %	50 %	0 %	0 %	479152503
4627	NC_021014	A	6	6	221597	221602	100 %	0 %	0 %	0 %	479152503
4628	NC_021014	ATGAA	2	10	221620	221629	60 %	20 %	20 %	0 %	479152503
4629	NC_021014	TGTT	2	8	221646	221653	0 %	75 %	25 %	0 %	479152503
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4645	NC_021014	AGA	2	6	222232	222237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4646	NC_021014	TAT	2	6	222243	222248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4748	NC_021014	GAT	2	6	227107	227112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4750	NC_021014	AAGCA	2	10	227204	227213	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4751	NC_021014	CGG	2	6	227219	227224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4753	NC_021014	GGC	2	6	227325	227330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4754	NC_021014	GAAG	2	8	227338	227345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_021014	CCG	2	6	227410	227415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4757	NC_021014	AGA	2	6	227479	227484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_021014	TCA	2	6	227582	227587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4759	NC_021014	GAT	2	6	227649	227654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4761	NC_021014	CGA	2	6	227723	227728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4762	NC_021014	GAA	2	6	227756	227761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4765	NC_021014	CTG	2	6	227825	227830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4767	NC_021014	TTG	2	6	227879	227884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4802	NC_021014	CGCAG	2	10	229462	229471	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4876	NC_021014	GA	4	8	233082	233089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4877	NC_021014	GAG	2	6	233242	233247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152513
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