MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 5093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021013	AATA	2	8	120	127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021013	TAAT	2	8	327	334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021013	AAAT	2	8	1058	1065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021013	GAAT	2	8	1432	1439	50 %	25 %	25 %	0 %	479150085
5	NC_021013	AATG	2	8	1445	1452	50 %	25 %	25 %	0 %	479150085
6	NC_021013	ATTC	2	8	2403	2410	25 %	50 %	0 %	25 %	479150086
7	NC_021013	CAGA	2	8	2487	2494	50 %	0 %	25 %	25 %	479150086
8	NC_021013	TTGT	2	8	2704	2711	0 %	75 %	25 %	0 %	479150086
9	NC_021013	AATC	2	8	3128	3135	50 %	25 %	0 %	25 %	479150087
10	NC_021013	GGTG	2	8	3299	3306	0 %	25 %	75 %	0 %	479150087
11	NC_021013	TTTG	2	8	3769	3776	0 %	75 %	25 %	0 %	479150087
12	NC_021013	TTTG	2	8	3981	3988	0 %	75 %	25 %	0 %	479150087
13	NC_021013	GGTG	2	8	4258	4265	0 %	25 %	75 %	0 %	479150087
14	NC_021013	GTCT	2	8	4516	4523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021013	TGAA	2	8	4895	4902	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
16	NC_021013	TTAT	2	8	5159	5166	25 %	75 %	0 %	0 %	479150089
17	NC_021013	AGAT	2	8	5239	5246	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
18	NC_021013	ATAC	2	8	5298	5305	50 %	25 %	0 %	25 %	479150089
19	NC_021013	AATG	2	8	6082	6089	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
20	NC_021013	CTTG	2	8	6872	6879	0 %	50 %	25 %	25 %	479150090
21	NC_021013	CATA	2	8	6975	6982	50 %	25 %	0 %	25 %	479150090
22	NC_021013	GAAA	2	8	7308	7315	75 %	0 %	25 %	0 %	479150090
23	NC_021013	CAAG	2	8	7658	7665	50 %	0 %	25 %	25 %	479150090
24	NC_021013	TGAT	2	8	7998	8005	25 %	50 %	25 %	0 %	479150091
25	NC_021013	ATAC	2	8	8295	8302	50 %	25 %	0 %	25 %	479150091
26	NC_021013	AAAT	2	8	8745	8752	75 %	25 %	0 %	0 %	479150091
27	NC_021013	AAGC	2	8	8832	8839	50 %	0 %	25 %	25 %	479150091
28	NC_021013	ATGA	2	8	8954	8961	50 %	25 %	25 %	0 %	479150091
29	NC_021013	CAAG	2	8	9099	9106	50 %	0 %	25 %	25 %	479150091
30	NC_021013	TCCC	2	8	9197	9204	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_021013	AATA	2	8	9484	9491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021013	GGCG	2	8	9633	9640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021013	AATC	2	8	10670	10677	50 %	25 %	0 %	25 %	479150092
34	NC_021013	GCAA	2	8	11338	11345	50 %	0 %	25 %	25 %	479150092
35	NC_021013	GAAA	2	8	11560	11567	75 %	0 %	25 %	0 %	479150092
36	NC_021013	ATGT	2	8	11863	11870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021013	CGGA	2	8	11982	11989	25 %	0 %	50 %	25 %	479150093
38	NC_021013	TGAG	2	8	13530	13537	25 %	25 %	50 %	0 %	479150093
39	NC_021013	CTTT	2	8	13622	13629	0 %	75 %	0 %	25 %	479150093
40	NC_021013	AAAG	2	8	14059	14066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021013	TGTT	2	8	14554	14561	0 %	75 %	25 %	0 %	479150094
42	NC_021013	CTTT	2	8	14584	14591	0 %	75 %	0 %	25 %	479150094
43	NC_021013	CGTT	2	8	15958	15965	0 %	50 %	25 %	25 %	479150094
44	NC_021013	CAGT	2	8	16246	16253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021013	AAAT	2	8	16281	16288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021013	GTTT	2	8	16341	16348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021013	TATG	2	8	17423	17430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021013	ATGA	2	8	17439	17446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021013	CGGA	2	8	19919	19926	25 %	0 %	50 %	25 %	479150097
50	NC_021013	AAAT	2	8	20184	20191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021013	GAAG	2	8	20294	20301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021013	CAAA	2	8	20664	20671	75 %	0 %	0 %	25 %	479150098
53	NC_021013	AATC	2	8	20757	20764	50 %	25 %	0 %	25 %	479150098
54	NC_021013	AGAA	2	8	21065	21072	75 %	0 %	25 %	0 %	479150098
55	NC_021013	GGCA	2	8	22136	22143	25 %	0 %	50 %	25 %	479150098
56	NC_021013	CCAA	2	8	22446	22453	50 %	0 %	0 %	50 %	479150099
57	NC_021013	TGCC	2	8	23269	23276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021013	TGAG	2	8	23689	23696	25 %	25 %	50 %	0 %	479150100
59	NC_021013	CGAC	2	8	24690	24697	25 %	0 %	25 %	50 %	479150100
60	NC_021013	GCTC	2	8	24709	24716	0 %	25 %	25 %	50 %	479150100
61	NC_021013	ATTT	2	8	25849	25856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021013	CGTT	2	8	26384	26391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021013	GAAA	2	8	26788	26795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021013	GTCC	2	8	26941	26948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021013	AAAT	2	8	27519	27526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021013	TAAA	2	8	28259	28266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021013	AAGA	2	8	28384	28391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021013	AGAC	2	8	28456	28463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021013	GGCA	2	8	28812	28819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021013	GTCC	2	8	29756	29763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021013	CTAA	2	8	30019	30026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021013	AATA	2	8	30094	30101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021013	CACT	2	8	31081	31088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021013	TTTC	2	8	31605	31612	0 %	75 %	0 %	25 %	479150104
75	NC_021013	ATCT	2	8	32681	32688	25 %	50 %	0 %	25 %	479150104
76	NC_021013	TACT	2	8	32866	32873	25 %	50 %	0 %	25 %	479150104
77	NC_021013	TTTC	2	8	32891	32898	0 %	75 %	0 %	25 %	479150104
78	NC_021013	TTTC	2	8	33574	33581	0 %	75 %	0 %	25 %	479150106
79	NC_021013	CAAA	2	8	33640	33647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021013	TCGC	2	8	33974	33981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021013	GTCT	2	8	34454	34461	0 %	50 %	25 %	25 %	479150107
82	NC_021013	AGCA	2	8	34806	34813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021013	AAAG	2	8	35034	35041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021013	GCTT	2	8	35304	35311	0 %	50 %	25 %	25 %	479150109
85	NC_021013	CTGC	2	8	35462	35469	0 %	25 %	25 %	50 %	479150109
86	NC_021013	ATAA	2	8	36092	36099	75 %	25 %	0 %	0 %	479150109
87	NC_021013	GACA	2	8	36311	36318	50 %	0 %	25 %	25 %	479150109
88	NC_021013	ACCA	2	8	36455	36462	50 %	0 %	0 %	50 %	479150109
89	NC_021013	GAAA	2	8	37194	37201	75 %	0 %	25 %	0 %	479150110
90	NC_021013	ACAA	2	8	37899	37906	75 %	0 %	0 %	25 %	479150111
91	NC_021013	GGTC	2	8	38126	38133	0 %	25 %	50 %	25 %	479150111
92	NC_021013	TTCA	2	8	38166	38173	25 %	50 %	0 %	25 %	479150111
93	NC_021013	CTTC	2	8	38254	38261	0 %	50 %	0 %	50 %	479150111
94	NC_021013	TACA	2	8	38374	38381	50 %	25 %	0 %	25 %	479150111
95	NC_021013	ATAC	2	8	38619	38626	50 %	25 %	0 %	25 %	479150111
96	NC_021013	TTTG	2	8	38954	38961	0 %	75 %	25 %	0 %	479150112
97	NC_021013	GCCT	2	8	40311	40318	0 %	25 %	25 %	50 %	479150114
98	NC_021013	CGCC	2	8	40924	40931	0 %	0 %	25 %	75 %	479150114
99	NC_021013	AAGC	2	8	42058	42065	50 %	0 %	25 %	25 %	479150115
100	NC_021013	CTGC	2	8	42187	42194	0 %	25 %	25 %	50 %	479150115
101	NC_021013	ATTG	2	8	42434	42441	25 %	50 %	25 %	0 %	479150115
102	NC_021013	AGAA	2	8	43091	43098	75 %	0 %	25 %	0 %	479150116
103	NC_021013	GTCT	2	8	43326	43333	0 %	50 %	25 %	25 %	479150117
104	NC_021013	AGAT	2	8	43511	43518	50 %	25 %	25 %	0 %	479150117
105	NC_021013	CCGT	2	8	43703	43710	0 %	25 %	25 %	50 %	479150117
106	NC_021013	GGTC	2	8	44094	44101	0 %	25 %	50 %	25 %	479150117
107	NC_021013	CTGC	2	8	44188	44195	0 %	25 %	25 %	50 %	479150117
108	NC_021013	ATCT	2	8	44323	44330	25 %	50 %	0 %	25 %	479150117
109	NC_021013	CTTT	2	8	44540	44547	0 %	75 %	0 %	25 %	479150117
110	NC_021013	CAGA	2	8	45062	45069	50 %	0 %	25 %	25 %	479150117
111	NC_021013	TTAT	2	8	45903	45910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021013	ATGA	2	8	46271	46278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021013	ATTT	2	8	47462	47469	25 %	75 %	0 %	0 %	479150118
114	NC_021013	GAAT	2	8	47579	47586	50 %	25 %	25 %	0 %	479150118
115	NC_021013	CAGG	2	8	48648	48655	25 %	0 %	50 %	25 %	479150120
116	NC_021013	GCAA	2	8	49622	49629	50 %	0 %	25 %	25 %	479150120
117	NC_021013	CAGA	2	8	49781	49788	50 %	0 %	25 %	25 %	479150120
118	NC_021013	GGCA	2	8	50381	50388	25 %	0 %	50 %	25 %	479150122
119	NC_021013	ATCA	2	8	50429	50436	50 %	25 %	0 %	25 %	479150122
120	NC_021013	GCAG	2	8	52661	52668	25 %	0 %	50 %	25 %	479150124
121	NC_021013	TGAT	2	8	53187	53194	25 %	50 %	25 %	0 %	479150125
122	NC_021013	TCAG	2	8	53349	53356	25 %	25 %	25 %	25 %	479150125
123	NC_021013	ACTC	2	8	53492	53499	25 %	25 %	0 %	50 %	479150126
124	NC_021013	CATA	2	8	53614	53621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021013	CGCA	2	8	53689	53696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021013	TCTT	2	8	54218	54225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021013	AAAT	2	8	54328	54335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021013	TCTT	2	8	54629	54636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021013	GTCT	2	8	55342	55349	0 %	50 %	25 %	25 %	479150128
130	NC_021013	ATCT	2	8	55595	55602	25 %	50 %	0 %	25 %	479150128
131	NC_021013	AAAT	2	8	55891	55898	75 %	25 %	0 %	0 %	479150128
132	NC_021013	TTTA	2	8	55985	55992	25 %	75 %	0 %	0 %	479150128
133	NC_021013	TTCT	2	8	56155	56162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021013	ATGA	2	8	56542	56549	50 %	25 %	25 %	0 %	479150129
135	NC_021013	TTTC	2	8	57937	57944	0 %	75 %	0 %	25 %	479150131
136	NC_021013	TGCT	2	8	58732	58739	0 %	50 %	25 %	25 %	479150131
137	NC_021013	TCCG	2	8	59258	59265	0 %	25 %	25 %	50 %	479150131
138	NC_021013	TTTC	2	8	60031	60038	0 %	75 %	0 %	25 %	479150133
139	NC_021013	TTCT	2	8	60483	60490	0 %	75 %	0 %	25 %	479150133
140	NC_021013	TTTC	2	8	60622	60629	0 %	75 %	0 %	25 %	479150133
141	NC_021013	ATCA	2	8	60842	60849	50 %	25 %	0 %	25 %	479150133
142	NC_021013	CGTT	2	8	61023	61030	0 %	50 %	25 %	25 %	479150133
143	NC_021013	CTTT	2	8	61345	61352	0 %	75 %	0 %	25 %	479150134
144	NC_021013	GCTT	2	8	62158	62165	0 %	50 %	25 %	25 %	479150134
145	NC_021013	TTTG	2	8	62537	62544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_021013	TTCT	2	8	64252	64259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021013	CTTG	2	8	64445	64452	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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