MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 45010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021013	AACG	2	8	150304	150311	50 %	0 %	25 %	25 %	479150198
3002	NC_021013	GCC	2	6	150352	150357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150198
3003	NC_021013	TGA	2	6	150392	150397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150198
3004	NC_021013	CTT	2	6	150408	150413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150198
3005	NC_021013	TTG	2	6	150425	150430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150198
3006	NC_021013	ATG	2	6	150527	150532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150198
3007	NC_021013	TCT	2	6	150554	150559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150198
3008	NC_021013	GTTT	2	8	150592	150599	0 %	75 %	25 %	0 %	479150198
3009	NC_021013	GCC	2	6	150650	150655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150198
3010	NC_021013	CTT	2	6	150712	150717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150198
3011	NC_021013	AAT	2	6	150772	150777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150198
3012	NC_021013	TTC	2	6	150787	150792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150198
3013	NC_021013	TGT	2	6	150886	150891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150198
3014	NC_021013	AGC	2	6	150908	150913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150198
3015	NC_021013	TGT	2	6	151036	151041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150198
3016	NC_021013	TTC	2	6	151048	151053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150198
3017	NC_021013	T	7	7	151180	151186	0 %	100 %	0 %	0 %	479150198
3018	NC_021013	TC	3	6	151212	151217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_021013	GCAA	2	8	151235	151242	50 %	0 %	25 %	25 %	479150199
3020	NC_021013	ATTT	2	8	151246	151253	25 %	75 %	0 %	0 %	479150199
3021	NC_021013	T	6	6	151251	151256	0 %	100 %	0 %	0 %	479150199
3022	NC_021013	CA	3	6	151298	151303	50 %	0 %	0 %	50 %	479150199
3023	NC_021013	T	6	6	151338	151343	0 %	100 %	0 %	0 %	479150199
3024	NC_021013	CCG	2	6	151466	151471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150199
3025	NC_021013	T	6	6	151487	151492	0 %	100 %	0 %	0 %	479150199
3026	NC_021013	ATC	2	6	151531	151536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150199
3027	NC_021013	CTGT	2	8	151576	151583	0 %	50 %	25 %	25 %	479150199
3028	NC_021013	TGA	2	6	151590	151595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150199
3029	NC_021013	T	7	7	151630	151636	0 %	100 %	0 %	0 %	479150199
3030	NC_021013	CAT	2	6	151698	151703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150199
3031	NC_021013	TAA	2	6	151884	151889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150199
3032	NC_021013	CAA	2	6	151950	151955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150199
3033	NC_021013	GTA	2	6	152023	152028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150199
3034	NC_021013	TTC	2	6	152032	152037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150199
3035	NC_021013	GTT	2	6	152042	152047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150199
3036	NC_021013	T	6	6	152127	152132	0 %	100 %	0 %	0 %	479150199
3037	NC_021013	CCT	2	6	152134	152139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150200
3038	NC_021013	ACA	2	6	152192	152197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150200
3039	NC_021013	TTG	2	6	152277	152282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150200
3040	NC_021013	CTT	2	6	152305	152310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150200
3041	NC_021013	CTA	2	6	152449	152454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150200
3042	NC_021013	TA	3	6	152453	152458	50 %	50 %	0 %	0 %	479150200
3043	NC_021013	GT	3	6	152492	152497	0 %	50 %	50 %	0 %	479150200
3044	NC_021013	TTTGTA	2	12	152523	152534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479150200
3045	NC_021013	CAA	2	6	152542	152547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150200
3046	NC_021013	TGT	3	9	152555	152563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150200
3047	NC_021013	CCG	2	6	152709	152714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150200
3048	NC_021013	TCA	2	6	152739	152744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150200
3049	NC_021013	TCT	2	6	152759	152764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150200
3050	NC_021013	TTG	2	6	152767	152772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150200
3051	NC_021013	T	7	7	152820	152826	0 %	100 %	0 %	0 %	479150200
3052	NC_021013	T	7	7	152923	152929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021013	A	7	7	152951	152957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021013	A	7	7	152993	152999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_021013	ATTA	2	8	153089	153096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021013	TAC	2	6	153142	153147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_021013	A	7	7	153167	153173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_021013	T	6	6	153183	153188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021013	ACG	2	6	153200	153205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_021013	T	6	6	153222	153227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021013	T	6	6	153229	153234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021013	T	7	7	153238	153244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021013	AT	4	8	153249	153256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021013	TCAT	2	8	153326	153333	25 %	50 %	0 %	25 %	479150201
3065	NC_021013	T	6	6	153335	153340	0 %	100 %	0 %	0 %	479150201
3066	NC_021013	CAT	2	6	153349	153354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150201
3067	NC_021013	T	6	6	153419	153424	0 %	100 %	0 %	0 %	479150201
3068	NC_021013	A	7	7	153448	153454	100 %	0 %	0 %	0 %	479150201
3069	NC_021013	CTC	2	6	153467	153472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150201
3070	NC_021013	CTG	2	6	153478	153483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150201
3071	NC_021013	TG	3	6	153496	153501	0 %	50 %	50 %	0 %	479150201
3072	NC_021013	T	7	7	153510	153516	0 %	100 %	0 %	0 %	479150201
3073	NC_021013	T	6	6	153523	153528	0 %	100 %	0 %	0 %	479150201
3074	NC_021013	GTTT	2	8	153619	153626	0 %	75 %	25 %	0 %	479150201
3075	NC_021013	A	6	6	153639	153644	100 %	0 %	0 %	0 %	479150201
3076	NC_021013	TGT	2	6	153648	153653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150201
3077	NC_021013	AAT	2	6	153706	153711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150201
3078	NC_021013	CTT	2	6	153756	153761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150201
3079	NC_021013	ATG	2	6	153764	153769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150201
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3081	NC_021013	T	6	6	153871	153876	0 %	100 %	0 %	0 %	479150201
3082	NC_021013	TCT	2	6	153896	153901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150201
3083	NC_021013	TG	3	6	153923	153928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021013	T	6	6	153932	153937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_021013	ATAGT	2	10	153953	153962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021013	TTG	2	6	153974	153979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021013	ATT	2	6	154005	154010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021013	TTGCA	2	10	154023	154032	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3089	NC_021013	TTA	2	6	154057	154062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021013	T	6	6	154072	154077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021013	ATT	2	6	154085	154090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021013	ATTT	2	8	154096	154103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021013	T	7	7	154101	154107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021013	ATA	2	6	154156	154161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021013	ATT	2	6	154183	154188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150202
3096	NC_021013	AGA	3	9	154203	154211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150202
3097	NC_021013	A	6	6	154223	154228	100 %	0 %	0 %	0 %	479150202
3098	NC_021013	TTA	2	6	154229	154234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150202
3099	NC_021013	A	6	6	154243	154248	100 %	0 %	0 %	0 %	479150202
3100	NC_021013	CAA	2	6	154326	154331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150202
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3102	NC_021013	AAG	2	6	154413	154418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150202
3103	NC_021013	TCGC	2	8	154440	154447	0 %	25 %	25 %	50 %	479150202
3104	NC_021013	AAG	2	6	154599	154604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150202
3105	NC_021013	TTG	2	6	154625	154630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150202
3106	NC_021013	AAGG	2	8	154639	154646	50 %	0 %	50 %	0 %	479150202
3107	NC_021013	TAT	2	6	154647	154652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150202
3108	NC_021013	ATT	2	6	154804	154809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150202
3109	NC_021013	CGG	2	6	154833	154838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150202
3110	NC_021013	GAA	2	6	154921	154926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150202
3111	NC_021013	AGA	2	6	154944	154949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150202
3112	NC_021013	AAG	2	6	154985	154990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150202
3113	NC_021013	GTG	2	6	154997	155002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150202
3114	NC_021013	GTT	2	6	155023	155028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150202
3115	NC_021013	CAA	2	6	155039	155044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150202
3116	NC_021013	GAA	2	6	155131	155136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150202
3117	NC_021013	A	6	6	155163	155168	100 %	0 %	0 %	0 %	479150202
3118	NC_021013	GT	3	6	155177	155182	0 %	50 %	50 %	0 %	479150202
3119	NC_021013	TTAT	2	8	155207	155214	25 %	75 %	0 %	0 %	479150202
3120	NC_021013	GAG	2	6	155221	155226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150202
3121	NC_021013	ATAAC	2	10	155228	155237	60 %	20 %	0 %	20 %	479150202
3122	NC_021013	TGC	2	6	155271	155276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150202
3123	NC_021013	GA	3	6	155530	155535	50 %	0 %	50 %	0 %	479150202
3124	NC_021013	GCC	2	6	155599	155604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150202
3125	NC_021013	A	6	6	155818	155823	100 %	0 %	0 %	0 %	479150202
3126	NC_021013	CTC	2	6	155855	155860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150202
3127	NC_021013	TCATGT	2	12	155955	155966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479150202
3128	NC_021013	TATG	2	8	156120	156127	25 %	50 %	25 %	0 %	479150202
3129	NC_021013	ACT	2	6	156149	156154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150202
3130	NC_021013	TG	3	6	156210	156215	0 %	50 %	50 %	0 %	479150202
3131	NC_021013	AAG	2	6	156264	156269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150202
3132	NC_021013	AT	3	6	156279	156284	50 %	50 %	0 %	0 %	479150202
3133	NC_021013	TGA	2	6	156346	156351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150202
3134	NC_021013	CAT	2	6	156429	156434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150203
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3136	NC_021013	CGG	2	6	156557	156562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150203
3137	NC_021013	TCAAA	2	10	156579	156588	60 %	20 %	0 %	20 %	479150203
3138	NC_021013	TTTG	2	8	156662	156669	0 %	75 %	25 %	0 %	479150203
3139	NC_021013	CTT	2	6	156678	156683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150203
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3142	NC_021013	TTG	2	6	156742	156747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150203
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3144	NC_021013	AAAAT	2	10	156841	156850	80 %	20 %	0 %	0 %	479150203
3145	NC_021013	TAA	2	6	156882	156887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150203
3146	NC_021013	ATT	2	6	156923	156928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_021013	ATT	2	6	156931	156936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_021013	TGT	2	6	156945	156950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_021013	TA	3	6	157018	157023	50 %	50 %	0 %	0 %	479150204
3150	NC_021013	TACT	2	8	157073	157080	25 %	50 %	0 %	25 %	479150204
3151	NC_021013	TGC	2	6	157148	157153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150204
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3160	NC_021013	CAG	2	6	157425	157430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150204
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3164	NC_021013	TCGT	2	8	157744	157751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3165	NC_021013	GAA	2	6	157752	157757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_021013	T	7	7	157797	157803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_021013	TAT	3	9	157891	157899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_021013	CGC	2	6	157923	157928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3169	NC_021013	A	6	6	157933	157938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3170	NC_021013	A	6	6	157978	157983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_021013	ATC	2	6	158105	158110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150205
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3175	NC_021013	ATATT	2	10	158549	158558	40 %	60 %	0 %	0 %	479150205
3176	NC_021013	T	6	6	158557	158562	0 %	100 %	0 %	0 %	479150205
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3184	NC_021013	AAG	2	6	159010	159015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150205
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3214	NC_021013	TCTG	2	8	160318	160325	0 %	50 %	25 %	25 %	479150206
3215	NC_021013	TCT	2	6	160362	160367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150206
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3219	NC_021013	TTATT	2	10	160520	160529	20 %	80 %	0 %	0 %	479150207
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3222	NC_021013	TCC	2	6	160639	160644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150207
3223	NC_021013	TCC	2	6	160672	160677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150207
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3235	NC_021013	CTG	2	6	161235	161240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150207
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3243	NC_021013	TAA	2	6	161475	161480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150207
3244	NC_021013	CTG	2	6	161482	161487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150207
3245	NC_021013	CCG	2	6	161504	161509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150207
3246	NC_021013	GTA	2	6	161584	161589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150207
3247	NC_021013	GTT	2	6	161599	161604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150207
3248	NC_021013	TCA	2	6	161657	161662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150207
3249	NC_021013	TGA	2	6	161671	161676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150207
3250	NC_021013	CTT	2	6	161686	161691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150207
3251	NC_021013	ACA	3	9	161714	161722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150207
3252	NC_021013	TTGA	2	8	161726	161733	25 %	50 %	25 %	0 %	479150207
3253	NC_021013	T	7	7	161788	161794	0 %	100 %	0 %	0 %	479150207
3254	NC_021013	GAA	2	6	161798	161803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150207
3255	NC_021013	TTG	2	6	161841	161846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150207
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3271	NC_021013	AAC	2	6	163017	163022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3272	NC_021013	TA	3	6	163087	163092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_021013	AT	4	8	163098	163105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3274	NC_021013	ATT	2	6	163135	163140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3275	NC_021013	GAAAA	2	10	163150	163159	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3276	NC_021013	AAAT	2	8	163160	163167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3277	NC_021013	AT	3	6	163166	163171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3279	NC_021013	TTGG	2	8	163217	163224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3280	NC_021013	ATG	2	6	163237	163242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3284	NC_021013	ATG	2	6	163348	163353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150208
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3288	NC_021013	GAAAA	2	10	163589	163598	80 %	0 %	20 %	0 %	479150208
3289	NC_021013	TTC	2	6	163652	163657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3291	NC_021013	AAT	2	6	163752	163757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3292	NC_021013	TTTCTG	2	12	163772	163783	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3331	NC_021013	GAT	2	6	166332	166337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150211
3332	NC_021013	GTA	2	6	166347	166352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150211
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3335	NC_021013	GGA	2	6	166435	166440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3355	NC_021013	CAA	2	6	167436	167441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150212
3356	NC_021013	TCT	2	6	167458	167463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150212
3357	NC_021013	CCG	2	6	167525	167530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150212
3358	NC_021013	CAAC	2	8	167619	167626	50 %	0 %	0 %	50 %	479150212
3359	NC_021013	CTTGT	2	10	167649	167658	0 %	60 %	20 %	20 %	479150212
3360	NC_021013	A	6	6	167663	167668	100 %	0 %	0 %	0 %	479150212
3361	NC_021013	GAA	2	6	167701	167706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150213
3362	NC_021013	AT	3	6	167715	167720	50 %	50 %	0 %	0 %	479150213
3363	NC_021013	CTT	2	6	167725	167730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150213
3364	NC_021013	TTC	2	6	167736	167741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150213
3365	NC_021013	TTGAAA	2	12	167753	167764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479150213
3366	NC_021013	CAG	2	6	167809	167814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150213
3367	NC_021013	TCCTGC	2	12	167865	167876	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479150213
3368	NC_021013	GAAA	2	8	168008	168015	75 %	0 %	25 %	0 %	479150213
3369	NC_021013	GAC	2	6	168082	168087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150213
3370	NC_021013	TTG	2	6	168125	168130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150213
3371	NC_021013	GGA	2	6	168165	168170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3372	NC_021013	GAA	2	6	168184	168189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150214
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