MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 45010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2130	NC_021013	AT	3	6	102861	102866	50 %	50 %	0 %	0 %	479150172
2131	NC_021013	CCG	2	6	103060	103065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150172
2132	NC_021013	T	6	6	103188	103193	0 %	100 %	0 %	0 %	479150173
2133	NC_021013	ATC	3	9	103227	103235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150173
2134	NC_021013	TC	3	6	103245	103250	0 %	50 %	0 %	50 %	479150173
2135	NC_021013	CCT	2	6	103292	103297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2136	NC_021013	TGC	2	6	103416	103421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150174
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2143	NC_021013	CAT	2	6	103918	103923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150174
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2154	NC_021013	AAT	2	6	104486	104491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150174
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2159	NC_021013	GCT	2	6	104929	104934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150174
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2162	NC_021013	AAGCAA	2	12	105124	105135	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479150174
2163	NC_021013	CAT	2	6	105181	105186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150174
2164	NC_021013	CA	3	6	105266	105271	50 %	0 %	0 %	50 %	479150174
2165	NC_021013	TC	3	6	105346	105351	0 %	50 %	0 %	50 %	479150174
2166	NC_021013	CCA	2	6	105370	105375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150174
2167	NC_021013	CAG	2	6	105406	105411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150174
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2172	NC_021013	CT	3	6	105784	105789	0 %	50 %	0 %	50 %	479150174
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2184	NC_021013	GCA	2	6	106432	106437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150174
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2202	NC_021013	TTC	2	6	107375	107380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150174
2203	NC_021013	TCGGC	2	10	107385	107394	0 %	20 %	40 %	40 %	479150174
2204	NC_021013	CGG	2	6	107665	107670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150174
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2219	NC_021013	CTG	2	6	108647	108652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150174
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2229	NC_021013	GGCA	2	8	109405	109412	25 %	0 %	50 %	25 %	479150174
2230	NC_021013	CCT	2	6	109518	109523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2231	NC_021013	CAC	2	6	109563	109568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150175
2232	NC_021013	AAGAA	2	10	109573	109582	80 %	0 %	20 %	0 %	479150175
2233	NC_021013	TGA	2	6	109620	109625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150175
2234	NC_021013	AGAA	2	8	109657	109664	75 %	0 %	25 %	0 %	479150175
2235	NC_021013	TCC	2	6	109770	109775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2236	NC_021013	TTCT	2	8	109803	109810	0 %	75 %	0 %	25 %	479150176
2237	NC_021013	GCG	2	6	109811	109816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150176
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2239	NC_021013	GGTAT	2	10	109908	109917	20 %	40 %	40 %	0 %	479150176
2240	NC_021013	TCA	2	6	109918	109923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150176
2241	NC_021013	TC	3	6	109949	109954	0 %	50 %	0 %	50 %	479150176
2242	NC_021013	AAG	2	6	109958	109963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150176
2243	NC_021013	CCG	2	6	109981	109986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150176
2244	NC_021013	ATAGCA	2	12	110079	110090	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479150176
2245	NC_021013	TGG	2	6	110111	110116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150176
2246	NC_021013	TAA	2	6	110189	110194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150176
2247	NC_021013	TCATA	2	10	110225	110234	40 %	40 %	0 %	20 %	479150176
2248	NC_021013	TCC	2	6	110257	110262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150176
2249	NC_021013	TGA	2	6	110273	110278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150176
2250	NC_021013	GTG	2	6	110338	110343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150176
2251	NC_021013	CAC	2	6	110372	110377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150176
2252	NC_021013	TCTGT	2	10	110438	110447	0 %	60 %	20 %	20 %	479150176
2253	NC_021013	GTCTT	2	10	110459	110468	0 %	60 %	20 %	20 %	479150176
2254	NC_021013	GCT	2	6	110487	110492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_021013	CTTT	2	8	110494	110501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2256	NC_021013	ATTTT	2	10	110604	110613	20 %	80 %	0 %	0 %	479150177
2257	NC_021013	TCA	2	6	110625	110630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150177
2258	NC_021013	TTCA	2	8	110690	110697	25 %	50 %	0 %	25 %	479150177
2259	NC_021013	CAT	2	6	110710	110715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150177
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2262	NC_021013	GCC	2	6	110753	110758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150177
2263	NC_021013	AC	3	6	110771	110776	50 %	0 %	0 %	50 %	479150177
2264	NC_021013	TTC	2	6	110873	110878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150177
2265	NC_021013	CT	3	6	110891	110896	0 %	50 %	0 %	50 %	479150178
2266	NC_021013	T	6	6	110942	110947	0 %	100 %	0 %	0 %	479150178
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2272	NC_021013	AAAGG	2	10	111210	111219	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2273	NC_021013	GCC	2	6	111233	111238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2274	NC_021013	ACTT	2	8	111245	111252	25 %	50 %	0 %	25 %	479150179
2275	NC_021013	TTCT	2	8	111254	111261	0 %	75 %	0 %	25 %	479150179
2276	NC_021013	CCG	2	6	111282	111287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150179
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2281	NC_021013	AG	3	6	111722	111727	50 %	0 %	50 %	0 %	479150180
2282	NC_021013	TGC	2	6	111736	111741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150180
2283	NC_021013	CGC	2	6	111900	111905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150180
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2299	NC_021013	TAC	2	6	113092	113097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150180
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2333	NC_021013	TTTCT	2	10	115564	115573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2334	NC_021013	AGT	2	6	115589	115594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2346	NC_021013	AAT	2	6	116275	116280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2347	NC_021013	TCA	2	6	116285	116290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2349	NC_021013	CAA	2	6	116442	116447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2350	NC_021013	GTT	2	6	116448	116453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2351	NC_021013	GGT	2	6	116484	116489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2352	NC_021013	CGTC	2	8	116559	116566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2353	NC_021013	CCT	2	6	116632	116637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150181
2354	NC_021013	GA	3	6	116922	116927	50 %	0 %	50 %	0 %	479150181
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2356	NC_021013	CAAT	2	8	117006	117013	50 %	25 %	0 %	25 %	479150181
2357	NC_021013	CATTG	2	10	117077	117086	20 %	40 %	20 %	20 %	479150181
2358	NC_021013	CT	3	6	117143	117148	0 %	50 %	0 %	50 %	479150181
2359	NC_021013	ATA	2	6	117156	117161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150181
2360	NC_021013	ATG	2	6	117192	117197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150181
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2362	NC_021013	GTCTG	2	10	117233	117242	0 %	40 %	40 %	20 %	479150181
2363	NC_021013	ATCA	2	8	117284	117291	50 %	25 %	0 %	25 %	479150181
2364	NC_021013	T	6	6	117299	117304	0 %	100 %	0 %	0 %	479150181
2365	NC_021013	CTG	2	6	117308	117313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150181
2366	NC_021013	GTT	2	6	117345	117350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150181
2367	NC_021013	ACC	2	6	117359	117364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150181
2368	NC_021013	TCC	2	6	117411	117416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2369	NC_021013	A	6	6	117475	117480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_021013	GCC	2	6	117481	117486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2371	NC_021013	AATAAG	2	12	117500	117511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2372	NC_021013	T	6	6	117629	117634	0 %	100 %	0 %	0 %	479150182
2373	NC_021013	TTTC	2	8	117662	117669	0 %	75 %	0 %	25 %	479150182
2374	NC_021013	GAT	2	6	117687	117692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150182
2375	NC_021013	TC	4	8	117699	117706	0 %	50 %	0 %	50 %	479150182
2376	NC_021013	CTT	2	6	117722	117727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2377	NC_021013	TTC	2	6	117904	117909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150183
2378	NC_021013	CAT	2	6	117924	117929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150183
2379	NC_021013	TC	3	6	117947	117952	0 %	50 %	0 %	50 %	479150183
2380	NC_021013	AT	3	6	117965	117970	50 %	50 %	0 %	0 %	479150183
2381	NC_021013	CCCTCA	2	12	118091	118102	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479150183
2382	NC_021013	TAC	2	6	118156	118161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150183
2383	NC_021013	TG	3	6	118170	118175	0 %	50 %	50 %	0 %	479150183
2384	NC_021013	TG	3	6	118177	118182	0 %	50 %	50 %	0 %	479150183
2385	NC_021013	T	6	6	118206	118211	0 %	100 %	0 %	0 %	479150183
2386	NC_021013	TAGG	2	8	118237	118244	25 %	25 %	50 %	0 %	479150183
2387	NC_021013	ACA	2	6	118364	118369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150183
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2389	NC_021013	ATT	2	6	118447	118452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150183
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2392	NC_021013	CACAAG	2	12	118861	118872	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479150183
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2397	NC_021013	AC	3	6	119064	119069	50 %	0 %	0 %	50 %	479150183
2398	NC_021013	GCC	2	6	119105	119110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150183
2399	NC_021013	T	6	6	119154	119159	0 %	100 %	0 %	0 %	479150183
2400	NC_021013	TCT	2	6	119196	119201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150183
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2402	NC_021013	T	6	6	119257	119262	0 %	100 %	0 %	0 %	479150183
2403	NC_021013	ATA	2	6	119306	119311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150183
2404	NC_021013	TA	3	6	119335	119340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2405	NC_021013	TTTAT	2	10	119344	119353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2406	NC_021013	ATCA	2	8	119355	119362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2407	NC_021013	AAAC	2	8	119379	119386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2408	NC_021013	AGG	2	6	119409	119414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2409	NC_021013	ATT	2	6	119438	119443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2410	NC_021013	A	6	6	119457	119462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2411	NC_021013	ACA	2	6	119564	119569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150184
2412	NC_021013	TG	3	6	119625	119630	0 %	50 %	50 %	0 %	479150184
2413	NC_021013	GTTT	2	8	119662	119669	0 %	75 %	25 %	0 %	479150184
2414	NC_021013	TCA	2	6	119772	119777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150184
2415	NC_021013	CTT	2	6	119978	119983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150184
2416	NC_021013	CAT	2	6	120001	120006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150184
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2420	NC_021013	AAG	2	6	120142	120147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150184
2421	NC_021013	TGT	2	6	120154	120159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150184
2422	NC_021013	CT	3	6	120199	120204	0 %	50 %	0 %	50 %	479150184
2423	NC_021013	TC	3	6	120221	120226	0 %	50 %	0 %	50 %	479150184
2424	NC_021013	GCAA	2	8	120241	120248	50 %	0 %	25 %	25 %	479150184
2425	NC_021013	GCTT	2	8	120280	120287	0 %	50 %	25 %	25 %	479150184
2426	NC_021013	CTT	3	9	120330	120338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150184
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2433	NC_021013	CCTG	2	8	120806	120813	0 %	25 %	25 %	50 %	479150184
2434	NC_021013	CGC	2	6	120825	120830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150184
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2436	NC_021013	TTAT	2	8	120989	120996	25 %	75 %	0 %	0 %	479150185
2437	NC_021013	TTC	2	6	121052	121057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150185
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2442	NC_021013	TGC	2	6	121172	121177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150185
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2445	NC_021013	TCTT	2	8	121277	121284	0 %	75 %	0 %	25 %	479150185
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2449	NC_021013	CAA	2	6	121402	121407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150185
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2461	NC_021013	TGT	2	6	121879	121884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150185
2462	NC_021013	CCTGT	2	10	121945	121954	0 %	40 %	20 %	40 %	479150185
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2464	NC_021013	TGA	2	6	121972	121977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150185
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2470	NC_021013	TCA	2	6	122161	122166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150185
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2483	NC_021013	CTG	2	6	123080	123085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150185
2484	NC_021013	AT	4	8	123090	123097	50 %	50 %	0 %	0 %	479150185
2485	NC_021013	TG	3	6	123142	123147	0 %	50 %	50 %	0 %	479150185
2486	NC_021013	TG	3	6	123203	123208	0 %	50 %	50 %	0 %	479150185
2487	NC_021013	CTG	2	6	123258	123263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150185
2488	NC_021013	CCGATA	2	12	123300	123311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479150185
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2492	NC_021013	GTA	2	6	123422	123427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150185
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2494	NC_021013	GTC	2	6	123443	123448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150185
2495	NC_021013	GATT	2	8	123487	123494	25 %	50 %	25 %	0 %	479150185
2496	NC_021013	ATG	2	6	123527	123532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150185
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2499	NC_021013	TTG	2	6	123586	123591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150185
2500	NC_021013	CAA	2	6	123592	123597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150185

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