MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 45010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021013	ACC	2	6	47478	47483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150118
1002	NC_021013	GAAT	2	8	47579	47586	50 %	25 %	25 %	0 %	479150118
1003	NC_021013	AAT	2	6	47594	47599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150118
1004	NC_021013	GCT	2	6	47652	47657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021013	T	6	6	47659	47664	0 %	100 %	0 %	0 %	479150119
1006	NC_021013	TAA	2	6	47671	47676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150119
1007	NC_021013	CT	3	6	47740	47745	0 %	50 %	0 %	50 %	479150119
1008	NC_021013	GA	3	6	47765	47770	50 %	0 %	50 %	0 %	479150119
1009	NC_021013	GTT	2	6	47849	47854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150119
1010	NC_021013	GCA	2	6	47877	47882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150119
1011	NC_021013	TTC	2	6	48000	48005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150119
1012	NC_021013	TCC	2	6	48028	48033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_021013	TTC	2	6	48049	48054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150120
1014	NC_021013	CGG	2	6	48178	48183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150120
1015	NC_021013	TCC	2	6	48187	48192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150120
1016	NC_021013	AAG	2	6	48271	48276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150120
1017	NC_021013	TCA	2	6	48315	48320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150120
1018	NC_021013	TTG	2	6	48345	48350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150120
1019	NC_021013	CAA	2	6	48483	48488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150120
1020	NC_021013	GATACC	2	12	48548	48559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479150120
1021	NC_021013	TCA	2	6	48596	48601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150120
1022	NC_021013	CAGG	2	8	48648	48655	25 %	0 %	50 %	25 %	479150120
1023	NC_021013	CCG	2	6	48659	48664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150120
1024	NC_021013	A	6	6	48684	48689	100 %	0 %	0 %	0 %	479150120
1025	NC_021013	CTT	2	6	48775	48780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150120
1026	NC_021013	AGC	2	6	49028	49033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150120
1027	NC_021013	AGC	2	6	49103	49108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150120
1028	NC_021013	CGC	2	6	49114	49119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150120
1029	NC_021013	ATCGTT	2	12	49198	49209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479150120
1030	NC_021013	GCC	2	6	49408	49413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150120
1031	NC_021013	TTA	2	6	49487	49492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150120
1032	NC_021013	CTT	2	6	49516	49521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150120
1033	NC_021013	GCAA	2	8	49622	49629	50 %	0 %	25 %	25 %	479150120
1034	NC_021013	A	7	7	49628	49634	100 %	0 %	0 %	0 %	479150120
1035	NC_021013	CA	3	6	49659	49664	50 %	0 %	0 %	50 %	479150120
1036	NC_021013	ATT	2	6	49667	49672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150120
1037	NC_021013	CCG	2	6	49724	49729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150120
1038	NC_021013	CAG	2	6	49747	49752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150120
1039	NC_021013	CAGA	2	8	49781	49788	50 %	0 %	25 %	25 %	479150120
1040	NC_021013	T	6	6	49851	49856	0 %	100 %	0 %	0 %	479150121
1041	NC_021013	TCC	2	6	49911	49916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150121
1042	NC_021013	CTG	2	6	49922	49927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150121
1043	NC_021013	TGA	2	6	49951	49956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150121
1044	NC_021013	CT	3	6	50000	50005	0 %	50 %	0 %	50 %	479150121
1045	NC_021013	CT	3	6	50159	50164	0 %	50 %	0 %	50 %	479150122
1046	NC_021013	CCG	3	9	50287	50295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150122
1047	NC_021013	CTT	2	6	50299	50304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150122
1048	NC_021013	CTG	2	6	50360	50365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150122
1049	NC_021013	ATA	2	6	50375	50380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150122
1050	NC_021013	GGCA	2	8	50381	50388	25 %	0 %	50 %	25 %	479150122
1051	NC_021013	ATCA	2	8	50429	50436	50 %	25 %	0 %	25 %	479150122
1052	NC_021013	CTG	2	6	50477	50482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150122
1053	NC_021013	ATA	2	6	50586	50591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150122
1054	NC_021013	GTTGC	2	10	50653	50662	0 %	40 %	40 %	20 %	479150122
1055	NC_021013	CGC	2	6	50752	50757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150122
1056	NC_021013	CAT	2	6	50762	50767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150122
1057	NC_021013	CTT	2	6	50800	50805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150122
1058	NC_021013	GCC	2	6	50858	50863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150122
1059	NC_021013	TTTCTT	2	12	50918	50929	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479150123
1060	NC_021013	CT	3	6	51062	51067	0 %	50 %	0 %	50 %	479150123
1061	NC_021013	TAG	2	6	51091	51096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150123
1062	NC_021013	GCT	2	6	51118	51123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150123
1063	NC_021013	TCC	2	6	51186	51191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150123
1064	NC_021013	AGC	2	6	51222	51227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150123
1065	NC_021013	TCTGGC	2	12	51261	51272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150123
1066	NC_021013	T	6	6	51423	51428	0 %	100 %	0 %	0 %	479150123
1067	NC_021013	T	7	7	51461	51467	0 %	100 %	0 %	0 %	479150123
1068	NC_021013	CGC	2	6	51493	51498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150123
1069	NC_021013	TTTTC	2	10	51568	51577	0 %	80 %	0 %	20 %	479150123
1070	NC_021013	ACA	2	6	51595	51600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150123
1071	NC_021013	TTC	2	6	51612	51617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150123
1072	NC_021013	GCACCT	2	12	51618	51629	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479150123
1073	NC_021013	CGC	2	6	51691	51696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150123
1074	NC_021013	TTC	2	6	51706	51711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150123
1075	NC_021013	TTC	2	6	51722	51727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150124
1076	NC_021013	CCT	2	6	51812	51817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150124
1077	NC_021013	GCC	2	6	51833	51838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150124
1078	NC_021013	CGC	2	6	51881	51886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150124
1079	NC_021013	AG	3	6	51952	51957	50 %	0 %	50 %	0 %	479150124
1080	NC_021013	GCT	2	6	51974	51979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150124
1081	NC_021013	CCG	2	6	51980	51985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150124
1082	NC_021013	AGC	2	6	52006	52011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150124
1083	NC_021013	TG	3	6	52021	52026	0 %	50 %	50 %	0 %	479150124
1084	NC_021013	GTC	2	6	52047	52052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150124
1085	NC_021013	TTC	2	6	52165	52170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150124
1086	NC_021013	CTGTGG	2	12	52200	52211	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479150124
1087	NC_021013	AGC	2	6	52582	52587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150124
1088	NC_021013	TGT	2	6	52601	52606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150124
1089	NC_021013	GCAG	2	8	52661	52668	25 %	0 %	50 %	25 %	479150124
1090	NC_021013	ATC	2	6	52840	52845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150124
1091	NC_021013	GGT	2	6	52860	52865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150124
1092	NC_021013	GCT	2	6	52898	52903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150124
1093	NC_021013	TCTTAT	2	12	52907	52918	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479150124
1094	NC_021013	GGT	2	6	53015	53020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150124
1095	NC_021013	TGAT	2	8	53187	53194	25 %	50 %	25 %	0 %	479150125
1096	NC_021013	CAT	2	6	53222	53227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150125
1097	NC_021013	CTT	2	6	53293	53298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150125
1098	NC_021013	TCC	2	6	53343	53348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150125
1099	NC_021013	TCAG	2	8	53349	53356	25 %	25 %	25 %	25 %	479150125
1100	NC_021013	TC	3	6	53403	53408	0 %	50 %	0 %	50 %	479150126
1101	NC_021013	AGC	2	6	53429	53434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150126
1102	NC_021013	AC	3	6	53439	53444	50 %	0 %	0 %	50 %	479150126
1103	NC_021013	CCG	2	6	53458	53463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150126
1104	NC_021013	ACTC	2	8	53492	53499	25 %	25 %	0 %	50 %	479150126
1105	NC_021013	GTC	2	6	53606	53611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_021013	CATA	2	8	53614	53621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_021013	GT	3	6	53680	53685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021013	CGCA	2	8	53689	53696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_021013	CGC	2	6	53737	53742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_021013	ATC	3	9	53750	53758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021013	T	6	6	53800	53805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021013	CAT	2	6	53872	53877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021013	A	6	6	53945	53950	100 %	0 %	0 %	0 %	479150127
1114	NC_021013	ACA	2	6	54018	54023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021013	A	6	6	54023	54028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021013	ATC	2	6	54058	54063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_021013	A	6	6	54176	54181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021013	TCTT	2	8	54218	54225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_021013	GGC	2	6	54319	54324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021013	AAAT	2	8	54328	54335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021013	CT	3	6	54352	54357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_021013	TGC	2	6	54414	54419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021013	GCA	2	6	54437	54442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021013	GGC	2	6	54602	54607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021013	TCTT	2	8	54629	54636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_021013	GGC	2	6	54647	54652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_021013	TGA	2	6	54720	54725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021013	GCC	2	6	54745	54750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_021013	ACC	2	6	54762	54767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1258	NC_021013	AAC	2	6	61867	61872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150134
1259	NC_021013	TGA	2	6	61984	61989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150134
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1262	NC_021013	GAT	2	6	62072	62077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150134
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1266	NC_021013	AT	3	6	62214	62219	50 %	50 %	0 %	0 %	479150134
1267	NC_021013	CTT	2	6	62239	62244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150134
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1271	NC_021013	TTTG	2	8	62537	62544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_021013	A	6	6	62596	62601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_021013	A	6	6	62661	62666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_021013	T	6	6	62685	62690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_021013	GTT	2	6	62691	62696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_021013	T	6	6	62759	62764	0 %	100 %	0 %	0 %	479150135
1277	NC_021013	TTC	2	6	62779	62784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150135
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1280	NC_021013	TAT	2	6	62976	62981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150135
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1301	NC_021013	CTT	2	6	63807	63812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1309	NC_021013	CTT	2	6	63992	63997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1317	NC_021013	CTT	2	6	64267	64272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1318	NC_021013	GTA	2	6	64273	64278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1330	NC_021013	TTC	2	6	64639	64644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1331	NC_021013	TTC	2	6	64666	64671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1332	NC_021013	TTC	2	6	64873	64878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1336	NC_021013	CTTG	2	8	65082	65089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1342	NC_021013	ATAG	2	8	65328	65335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1343	NC_021013	TTTC	2	8	65386	65393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1352	NC_021013	AAT	2	6	66119	66124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1356	NC_021013	T	7	7	66264	66270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1374	NC_021013	ATTCC	2	10	67134	67143	20 %	40 %	0 %	40 %	479150137
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1384	NC_021013	AGG	2	6	67632	67637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1385	NC_021013	A	6	6	67647	67652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1386	NC_021013	GGCGC	2	10	67682	67691	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1387	NC_021013	GAA	2	6	67855	67860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1388	NC_021013	ACA	2	6	67863	67868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1389	NC_021013	A	6	6	67882	67887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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