MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 45010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021013	ATC	2	6	251868	251873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_021013	CAA	2	6	251879	251884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_021013	TAT	2	6	251888	251893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021013	T	7	7	251902	251908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021013	ATT	2	6	251952	251957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021013	TGT	2	6	251981	251986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021013	AAC	2	6	252006	252011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_021013	T	6	6	252027	252032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021013	TA	3	6	252065	252070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021013	TCA	2	6	252088	252093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021013	AAACTT	2	12	252350	252361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479150286
5012	NC_021013	CTT	2	6	252383	252388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150286
5013	NC_021013	AGG	2	6	252535	252540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150286
5014	NC_021013	GA	3	6	252553	252558	50 %	0 %	50 %	0 %	479150287
5015	NC_021013	ATC	2	6	252566	252571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150287
5016	NC_021013	TTGC	2	8	252620	252627	0 %	50 %	25 %	25 %	479150287
5017	NC_021013	ACA	2	6	252644	252649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150287
5018	NC_021013	TTC	2	6	252669	252674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150287
5019	NC_021013	GAA	2	6	252713	252718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150287
5020	NC_021013	CAGAG	2	10	252804	252813	40 %	0 %	40 %	20 %	479150288
5021	NC_021013	TTGAG	2	10	252830	252839	20 %	40 %	40 %	0 %	479150288
5022	NC_021013	A	6	6	252866	252871	100 %	0 %	0 %	0 %	479150288
5023	NC_021013	GAATCC	2	12	252940	252951	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479150288
5024	NC_021013	TG	3	6	252964	252969	0 %	50 %	50 %	0 %	479150288
5025	NC_021013	A	7	7	252990	252996	100 %	0 %	0 %	0 %	479150289
5026	NC_021013	A	6	6	253069	253074	100 %	0 %	0 %	0 %	479150289
5027	NC_021013	A	7	7	253090	253096	100 %	0 %	0 %	0 %	479150289
5028	NC_021013	TGAT	2	8	253216	253223	25 %	50 %	25 %	0 %	479150289
5029	NC_021013	A	7	7	253232	253238	100 %	0 %	0 %	0 %	479150289
5030	NC_021013	CAG	2	6	253272	253277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150289
5031	NC_021013	GAA	2	6	253350	253355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150289
5032	NC_021013	GCAGA	2	10	253365	253374	40 %	0 %	40 %	20 %	479150289
5033	NC_021013	TAAAAG	2	12	253539	253550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479150290
5034	NC_021013	AAAAGC	2	12	253656	253667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479150290
5035	NC_021013	A	7	7	253683	253689	100 %	0 %	0 %	0 %	479150290
5036	NC_021013	AAG	2	6	253695	253700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150290
5037	NC_021013	TTTGC	2	10	253715	253724	0 %	60 %	20 %	20 %	479150290
5038	NC_021013	ATG	2	6	253807	253812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150290
5039	NC_021013	AGAC	2	8	253913	253920	50 %	0 %	25 %	25 %	479150290
5040	NC_021013	ATT	2	6	253924	253929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150290
5041	NC_021013	A	6	6	253973	253978	100 %	0 %	0 %	0 %	479150290
5042	NC_021013	TAA	2	6	254024	254029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150290
5043	NC_021013	AT	3	6	254110	254115	50 %	50 %	0 %	0 %	479150290
5044	NC_021013	AAT	2	6	254125	254130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150290
5045	NC_021013	TTGA	2	8	254176	254183	25 %	50 %	25 %	0 %	479150290
5046	NC_021013	GAAA	2	8	254214	254221	75 %	0 %	25 %	0 %	479150290
5047	NC_021013	AGG	2	6	254252	254257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150290
5048	NC_021013	GAA	2	6	254320	254325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150290
5049	NC_021013	AAGC	2	8	254355	254362	50 %	0 %	25 %	25 %	479150290
5050	NC_021013	TACA	2	8	254412	254419	50 %	25 %	0 %	25 %	479150290
5051	NC_021013	A	6	6	254488	254493	100 %	0 %	0 %	0 %	479150290
5052	NC_021013	GAA	2	6	254509	254514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150290
5053	NC_021013	CAAA	2	8	254576	254583	75 %	0 %	0 %	25 %	479150290
5054	NC_021013	GAA	2	6	254584	254589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150290
5055	NC_021013	TGA	2	6	254633	254638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150290
5056	NC_021013	GAA	2	6	254677	254682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150290
5057	NC_021013	ATA	2	6	254683	254688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150290
5058	NC_021013	CGG	2	6	254718	254723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150290
5059	NC_021013	ATA	2	6	254755	254760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150290
5060	NC_021013	T	6	6	254797	254802	0 %	100 %	0 %	0 %	479150290
5061	NC_021013	AAT	2	6	254832	254837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150290
5062	NC_021013	GGA	2	6	254928	254933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150290
5063	NC_021013	A	6	6	254937	254942	100 %	0 %	0 %	0 %	479150290
5064	NC_021013	AGGC	2	8	254972	254979	25 %	0 %	50 %	25 %	479150290
5065	NC_021013	AGA	2	6	254994	254999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150291
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5067	NC_021013	ACA	2	6	255069	255074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150291
5068	NC_021013	ACT	2	6	255111	255116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150291
5069	NC_021013	AGGT	2	8	255126	255133	25 %	25 %	50 %	0 %	479150291
5070	NC_021013	TAT	2	6	255166	255171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150291
5071	NC_021013	AGTA	2	8	255214	255221	50 %	25 %	25 %	0 %	479150291
5072	NC_021013	AGG	2	6	255345	255350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150291
5073	NC_021013	AAGA	2	8	255395	255402	75 %	0 %	25 %	0 %	479150291
5074	NC_021013	CAG	2	6	255419	255424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150291
5075	NC_021013	AAAG	2	8	255437	255444	75 %	0 %	25 %	0 %	479150291
5076	NC_021013	GAA	3	9	255632	255640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150291
5077	NC_021013	CAA	2	6	255646	255651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150291
5078	NC_021013	A	6	6	255654	255659	100 %	0 %	0 %	0 %	479150291
5079	NC_021013	AGG	2	6	255690	255695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150291
5080	NC_021013	CAAA	2	8	255703	255710	75 %	0 %	0 %	25 %	479150291
5081	NC_021013	GAA	2	6	255722	255727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150291
5082	NC_021013	TCA	2	6	255758	255763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150291
5083	NC_021013	CA	3	6	255898	255903	50 %	0 %	0 %	50 %	479150291
5084	NC_021013	AAC	2	6	255925	255930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_021013	ATTT	2	8	255966	255973	25 %	75 %	0 %	0 %	479150292
5086	NC_021013	TGA	3	9	256033	256041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150292
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5088	NC_021013	CTA	2	6	256156	256161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150292
5089	NC_021013	CTT	2	6	256169	256174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150292
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5091	NC_021013	CAGA	2	8	256291	256298	50 %	0 %	25 %	25 %	479150292
5092	NC_021013	TTG	3	9	256350	256358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150292
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5094	NC_021013	TTG	2	6	256374	256379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150292
5095	NC_021013	GGA	2	6	256387	256392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150292
5096	NC_021013	ACC	2	6	256404	256409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150292
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5098	NC_021013	CT	3	6	256455	256460	0 %	50 %	0 %	50 %	479150292
5099	NC_021013	GAA	2	6	256472	256477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150292
5100	NC_021013	GAT	2	6	256535	256540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150293
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5102	NC_021013	AT	3	6	256778	256783	50 %	50 %	0 %	0 %	479150293
5103	NC_021013	CGG	2	6	256798	256803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150293
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5107	NC_021013	CA	3	6	256992	256997	50 %	0 %	0 %	50 %	479150293
5108	NC_021013	ATT	2	6	256998	257003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150293
5109	NC_021013	CAA	2	6	257326	257331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150293
5110	NC_021013	A	6	6	257330	257335	100 %	0 %	0 %	0 %	479150293
5111	NC_021013	GT	3	6	257360	257365	0 %	50 %	50 %	0 %	479150293
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5123	NC_021013	AG	3	6	258173	258178	50 %	0 %	50 %	0 %	479150294
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5125	NC_021013	CAG	2	6	258316	258321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150294
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5127	NC_021013	TGA	2	6	258405	258410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150294
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5137	NC_021013	ATTGCA	2	12	258792	258803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5139	NC_021013	GAT	2	6	258992	258997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5141	NC_021013	GGA	2	6	259061	259066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5158	NC_021013	A	6	6	259707	259712	100 %	0 %	0 %	0 %	479150296
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5220	NC_021013	TAT	2	6	263717	263722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_021013	A	7	7	263765	263771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5227	NC_021013	TGA	2	6	264052	264057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5231	NC_021013	CGG	2	6	264355	264360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5232	NC_021013	CAA	2	6	264369	264374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5233	NC_021013	GAA	2	6	264415	264420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_021013	CAG	2	6	264482	264487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5235	NC_021013	CAGAA	2	10	264570	264579	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5236	NC_021013	GAT	2	6	264599	264604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5239	NC_021013	GAA	2	6	264662	264667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_021013	GAG	2	6	264686	264691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_021013	TTTAAA	2	12	264740	264751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_021013	GAAA	2	8	264898	264905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_021013	GGC	2	6	264956	264961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5244	NC_021013	TGT	2	6	264976	264981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_021013	ATT	2	6	265109	265114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_021013	CAA	2	6	265132	265137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_021013	A	7	7	265136	265142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021013	TGATT	2	10	265195	265204	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_021013	CAGAA	2	10	265218	265227	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5250	NC_021013	CGGTT	2	10	265285	265294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5251	NC_021013	TGAT	2	8	265335	265342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_021013	AC	3	6	265344	265349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_021013	ACC	2	6	265440	265445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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