MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021012	ATA	2	6	46893	46898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146243
1002	NC_021012	ATA	2	6	47022	47027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146243
1003	NC_021012	GCA	3	9	47051	47059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146243
1004	NC_021012	GTT	2	6	47087	47092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146243
1005	NC_021012	TCT	2	6	47102	47107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146243
1006	NC_021012	CAG	2	6	47208	47213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146243
1007	NC_021012	ATGG	2	8	47216	47223	25 %	25 %	50 %	0 %	479146243
1008	NC_021012	GGC	2	6	47276	47281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146243
1009	NC_021012	CAG	2	6	47286	47291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146243
1010	NC_021012	ATGG	2	8	47303	47310	25 %	25 %	50 %	0 %	479146243
1011	NC_021012	AAC	2	6	47327	47332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146243
1012	NC_021012	ACAG	2	8	47421	47428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_021012	ACAA	2	8	47431	47438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_021012	TTA	2	6	47457	47462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021012	GA	3	6	47485	47490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021012	ATAA	2	8	47513	47520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021012	AAT	2	6	47551	47556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146244
1018	NC_021012	TG	3	6	47636	47641	0 %	50 %	50 %	0 %	479146244
1019	NC_021012	AAT	2	6	47723	47728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146244
1020	NC_021012	AT	3	6	47727	47732	50 %	50 %	0 %	0 %	479146244
1021	NC_021012	GAT	2	6	47746	47751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146244
1022	NC_021012	GGA	2	6	47774	47779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146244
1023	NC_021012	GT	3	6	48027	48032	0 %	50 %	50 %	0 %	479146244
1024	NC_021012	GCACTT	2	12	48077	48088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479146244
1025	NC_021012	GA	3	6	48101	48106	50 %	0 %	50 %	0 %	479146244
1026	NC_021012	GCA	2	6	48131	48136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146244
1027	NC_021012	GCA	2	6	48152	48157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146244
1028	NC_021012	ATG	2	6	48203	48208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146244
1029	NC_021012	TCA	3	9	48357	48365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146244
1030	NC_021012	AGT	2	6	48419	48424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021012	AAG	2	6	48450	48455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021012	TGC	2	6	48492	48497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146245
1033	NC_021012	ATCA	2	8	48499	48506	50 %	25 %	0 %	25 %	479146245
1034	NC_021012	AAGAT	2	10	48518	48527	60 %	20 %	20 %	0 %	479146245
1035	NC_021012	TGC	2	6	48563	48568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146245
1036	NC_021012	GCA	2	6	48583	48588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146245
1037	NC_021012	TGG	2	6	48617	48622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146245
1038	NC_021012	GAT	2	6	48711	48716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146245
1039	NC_021012	AC	3	6	48719	48724	50 %	0 %	0 %	50 %	479146245
1040	NC_021012	ATCT	2	8	48781	48788	25 %	50 %	0 %	25 %	479146245
1041	NC_021012	A	6	6	48802	48807	100 %	0 %	0 %	0 %	479146245
1042	NC_021012	AAAC	2	8	48810	48817	75 %	0 %	0 %	25 %	479146245
1043	NC_021012	ATC	2	6	48826	48831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146245
1044	NC_021012	CGG	2	6	48839	48844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146245
1045	NC_021012	CAT	2	6	48867	48872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146245
1046	NC_021012	T	6	6	48895	48900	0 %	100 %	0 %	0 %	479146245
1047	NC_021012	ATG	2	6	48928	48933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146245
1048	NC_021012	TCA	2	6	48971	48976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146245
1049	NC_021012	ACG	2	6	48982	48987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146245
1050	NC_021012	CTT	2	6	48997	49002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146245
1051	NC_021012	ATTC	2	8	49013	49020	25 %	50 %	0 %	25 %	479146245
1052	NC_021012	TCG	2	6	49133	49138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146245
1053	NC_021012	GA	3	6	49139	49144	50 %	0 %	50 %	0 %	479146245
1054	NC_021012	CGG	2	6	49145	49150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146245
1055	NC_021012	T	6	6	49192	49197	0 %	100 %	0 %	0 %	479146245
1056	NC_021012	CGG	2	6	49274	49279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146245
1057	NC_021012	CTT	2	6	49285	49290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146245
1058	NC_021012	ATC	2	6	49303	49308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146245
1059	NC_021012	TCC	2	6	49318	49323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146245
1060	NC_021012	A	7	7	49332	49338	100 %	0 %	0 %	0 %	479146245
1061	NC_021012	A	8	8	49367	49374	100 %	0 %	0 %	0 %	479146246
1062	NC_021012	TAT	2	6	49410	49415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146246
1063	NC_021012	A	6	6	49433	49438	100 %	0 %	0 %	0 %	479146246
1064	NC_021012	TGGA	2	8	49576	49583	25 %	25 %	50 %	0 %	479146246
1065	NC_021012	AC	3	6	49701	49706	50 %	0 %	0 %	50 %	479146246
1066	NC_021012	GCG	2	6	49761	49766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146246
1067	NC_021012	A	7	7	49794	49800	100 %	0 %	0 %	0 %	479146246
1068	NC_021012	CAG	3	9	49824	49832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146246
1069	NC_021012	A	6	6	49950	49955	100 %	0 %	0 %	0 %	479146246
1070	NC_021012	ATA	2	6	49981	49986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146246
1071	NC_021012	GCA	2	6	49988	49993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146246
1072	NC_021012	GAT	2	6	50122	50127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146246
1073	NC_021012	A	6	6	50158	50163	100 %	0 %	0 %	0 %	479146247
1074	NC_021012	AAAG	2	8	50195	50202	75 %	0 %	25 %	0 %	479146247
1075	NC_021012	GACA	2	8	50234	50241	50 %	0 %	25 %	25 %	479146247
1076	NC_021012	ATTG	2	8	50263	50270	25 %	50 %	25 %	0 %	479146247
1077	NC_021012	TGA	2	6	50362	50367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146247
1078	NC_021012	GATC	2	8	50371	50378	25 %	25 %	25 %	25 %	479146247
1079	NC_021012	ATT	3	9	50413	50421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146247
1080	NC_021012	GCA	3	9	50422	50430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146247
1081	NC_021012	CAG	2	6	50460	50465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146247
1082	NC_021012	GCT	2	6	50546	50551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146247
1083	NC_021012	ACA	2	6	50606	50611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146247
1084	NC_021012	TCA	2	6	50673	50678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146247
1085	NC_021012	AAG	2	6	50679	50684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146247
1086	NC_021012	ATG	2	6	50685	50690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146247
1087	NC_021012	TGG	2	6	50691	50696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146247
1088	NC_021012	CAG	2	6	50720	50725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146247
1089	NC_021012	TCA	2	6	50727	50732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146247
1090	NC_021012	A	6	6	50752	50757	100 %	0 %	0 %	0 %	479146247
1091	NC_021012	AAAT	2	8	50886	50893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021012	TAAA	2	8	50990	50997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021012	A	7	7	51007	51013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021012	GAAT	2	8	51109	51116	50 %	25 %	25 %	0 %	479146248
1095	NC_021012	AGG	2	6	51146	51151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146248
1096	NC_021012	AGA	2	6	51160	51165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146248
1097	NC_021012	GTC	2	6	51236	51241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146248
1098	NC_021012	CGA	2	6	51247	51252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146248
1099	NC_021012	TGG	2	6	51259	51264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146248
1100	NC_021012	TAT	2	6	51284	51289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146248
1101	NC_021012	CAT	2	6	51311	51316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146248
1102	NC_021012	AAC	2	6	51335	51340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146248
1103	NC_021012	T	6	6	51387	51392	0 %	100 %	0 %	0 %	479146248
1104	NC_021012	TCC	2	6	51411	51416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146248
1105	NC_021012	A	6	6	51477	51482	100 %	0 %	0 %	0 %	479146248
1106	NC_021012	TACT	2	8	51634	51641	25 %	50 %	0 %	25 %	479146248
1107	NC_021012	TCGG	2	8	51666	51673	0 %	25 %	50 %	25 %	479146248
1108	NC_021012	CTGT	2	8	51687	51694	0 %	50 %	25 %	25 %	479146248
1109	NC_021012	ATC	2	6	51729	51734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146248
1110	NC_021012	TG	3	6	51756	51761	0 %	50 %	50 %	0 %	479146248
1111	NC_021012	AGC	2	6	51917	51922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146248
1112	NC_021012	TGTT	2	8	52057	52064	0 %	75 %	25 %	0 %	479146248
1113	NC_021012	GAC	2	6	52071	52076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146248
1114	NC_021012	AC	3	6	52146	52151	50 %	0 %	0 %	50 %	479146248
1115	NC_021012	GAA	2	6	52194	52199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146248
1116	NC_021012	ATG	2	6	52243	52248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146248
1117	NC_021012	AGC	2	6	52278	52283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146248
1118	NC_021012	GTG	2	6	52374	52379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146248
1119	NC_021012	CAG	2	6	52389	52394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146248
1120	NC_021012	GAA	2	6	52434	52439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146248
1121	NC_021012	ACAGC	2	10	52450	52459	40 %	0 %	20 %	40 %	479146248
1122	NC_021012	TGA	2	6	52505	52510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146248
1123	NC_021012	AGA	2	6	52538	52543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146248
1124	NC_021012	TGA	2	6	52550	52555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146248
1125	NC_021012	TA	3	6	52690	52695	50 %	50 %	0 %	0 %	479146248
1126	NC_021012	AGC	2	6	52741	52746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146248
1127	NC_021012	AT	3	6	52800	52805	50 %	50 %	0 %	0 %	479146248
1128	NC_021012	TA	3	6	52856	52861	50 %	50 %	0 %	0 %	479146249
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1132	NC_021012	A	7	7	52968	52974	100 %	0 %	0 %	0 %	479146249
1133	NC_021012	ATCCC	2	10	52976	52985	20 %	20 %	0 %	60 %	479146249
1134	NC_021012	GAT	2	6	53138	53143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146249
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1139	NC_021012	GA	3	6	53409	53414	50 %	0 %	50 %	0 %	479146249
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1142	NC_021012	T	6	6	53591	53596	0 %	100 %	0 %	0 %	479146250
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1242	NC_021012	T	7	7	58526	58532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1244	NC_021012	A	6	6	58665	58670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_021012	CAA	2	6	58767	58772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146252
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1247	NC_021012	GGA	2	6	58804	58809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146252
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1251	NC_021012	AAAG	2	8	59169	59176	75 %	0 %	25 %	0 %	479146252
1252	NC_021012	TGG	2	6	59187	59192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146252
1253	NC_021012	AGG	2	6	59267	59272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_021012	GAT	2	6	59289	59294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146253
1256	NC_021012	TGG	2	6	59315	59320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146253
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1386	NC_021012	CCGATC	2	12	65339	65350	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479146258
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1483	NC_021012	CTTTTT	2	12	70555	70566	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1484	NC_021012	T	6	6	70570	70575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1491	NC_021012	A	6	6	71429	71434	100 %	0 %	0 %	0 %	479146264
1492	NC_021012	CGGA	2	8	71444	71451	25 %	0 %	50 %	25 %	479146264
1493	NC_021012	ATA	2	6	71529	71534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146264
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1500	NC_021012	GCAA	2	8	71877	71884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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