MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021012	ACA	2	6	531626	531631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146639
11002	NC_021012	ATG	2	6	531664	531669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_021012	AAT	2	6	531705	531710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_021012	ATGGAG	2	12	531781	531792	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479146640
11005	NC_021012	ACGA	2	8	531821	531828	50 %	0 %	25 %	25 %	479146640
11006	NC_021012	ATC	2	6	531850	531855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146640
11007	NC_021012	CGA	2	6	531932	531937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146640
11008	NC_021012	GAA	2	6	531961	531966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146640
11009	NC_021012	ATC	2	6	532040	532045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146640
11010	NC_021012	GTGAA	2	10	532064	532073	40 %	20 %	40 %	0 %	479146640
11011	NC_021012	AC	3	6	532098	532103	50 %	0 %	0 %	50 %	479146640
11012	NC_021012	TGC	2	6	532121	532126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146640
11013	NC_021012	CGA	2	6	532166	532171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146640
11014	NC_021012	TAAAG	2	10	532200	532209	60 %	20 %	20 %	0 %	479146640
11015	NC_021012	ATGA	2	8	532228	532235	50 %	25 %	25 %	0 %	479146640
11016	NC_021012	ATT	2	6	532288	532293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146640
11017	NC_021012	ATC	2	6	532435	532440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146640
11018	NC_021012	GAG	2	6	532579	532584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146640
11019	NC_021012	CAG	2	6	532588	532593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146640
11020	NC_021012	GAT	3	9	532624	532632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146640
11021	NC_021012	TA	3	6	532651	532656	50 %	50 %	0 %	0 %	479146640
11022	NC_021012	GAA	2	6	532803	532808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146640
11023	NC_021012	GGT	2	6	532855	532860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_021012	GATG	2	8	532875	532882	25 %	25 %	50 %	0 %	479146641
11025	NC_021012	GAA	2	6	532966	532971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146641
11026	NC_021012	CAG	2	6	532982	532987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146641
11027	NC_021012	T	6	6	533046	533051	0 %	100 %	0 %	0 %	479146641
11028	NC_021012	AGA	2	6	533057	533062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146641
11029	NC_021012	GAG	2	6	533086	533091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146641
11030	NC_021012	AGAA	2	8	533150	533157	75 %	0 %	25 %	0 %	479146641
11031	NC_021012	GCA	2	6	533239	533244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146641
11032	NC_021012	AGA	2	6	533262	533267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146641
11033	NC_021012	TGT	2	6	533274	533279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146641
11034	NC_021012	CGGT	2	8	533348	533355	0 %	25 %	50 %	25 %	479146641
11035	NC_021012	CATG	2	8	533388	533395	25 %	25 %	25 %	25 %	479146641
11036	NC_021012	GGA	2	6	533397	533402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146641
11037	NC_021012	GA	3	6	533414	533419	50 %	0 %	50 %	0 %	479146641
11038	NC_021012	GTA	2	6	533422	533427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146641
11039	NC_021012	AGA	2	6	533430	533435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146641
11040	NC_021012	AT	3	6	533448	533453	50 %	50 %	0 %	0 %	479146641
11041	NC_021012	ATT	2	6	533502	533507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146641
11042	NC_021012	GAG	2	6	533523	533528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_021012	AAC	2	6	533639	533644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146642
11044	NC_021012	GA	3	6	533676	533681	50 %	0 %	50 %	0 %	479146642
11045	NC_021012	A	6	6	533725	533730	100 %	0 %	0 %	0 %	479146642
11046	NC_021012	TCT	2	6	533736	533741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146642
11047	NC_021012	CAG	2	6	533802	533807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11048	NC_021012	GA	3	6	533860	533865	50 %	0 %	50 %	0 %	479146642
11049	NC_021012	TTA	2	6	533881	533886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146642
11050	NC_021012	ATC	2	6	533967	533972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146642
11051	NC_021012	CAG	3	9	533983	533991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11052	NC_021012	AGA	2	6	534025	534030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146642
11053	NC_021012	TGG	3	9	534047	534055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146642
11054	NC_021012	CAT	2	6	534071	534076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146642
11055	NC_021012	TAT	2	6	534103	534108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146642
11056	NC_021012	TGG	2	6	534131	534136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146642
11057	NC_021012	TGA	2	6	534137	534142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146642
11058	NC_021012	CA	3	6	534158	534163	50 %	0 %	0 %	50 %	479146642
11059	NC_021012	GAT	2	6	534167	534172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146642
11060	NC_021012	AGC	2	6	534242	534247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11061	NC_021012	AAAG	2	8	534257	534264	75 %	0 %	25 %	0 %	479146642
11062	NC_021012	CAA	2	6	534277	534282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146642
11063	NC_021012	TCA	2	6	534304	534309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146642
11064	NC_021012	CTG	2	6	534316	534321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11065	NC_021012	CGA	2	6	534365	534370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11066	NC_021012	A	6	6	534391	534396	100 %	0 %	0 %	0 %	479146642
11067	NC_021012	GA	3	6	534422	534427	50 %	0 %	50 %	0 %	479146642
11068	NC_021012	TAT	2	6	534460	534465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146642
11069	NC_021012	TGG	2	6	534470	534475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146642
11070	NC_021012	GT	3	6	534557	534562	0 %	50 %	50 %	0 %	479146642
11071	NC_021012	GGT	2	6	534585	534590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146642
11072	NC_021012	TGCAGG	2	12	534605	534616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479146642
11073	NC_021012	CACTTT	2	12	534643	534654	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479146642
11074	NC_021012	GGT	2	6	534669	534674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146642
11075	NC_021012	CAA	2	6	534679	534684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146642
11076	NC_021012	GA	3	6	534693	534698	50 %	0 %	50 %	0 %	479146642
11077	NC_021012	AAG	2	6	534717	534722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146642
11078	NC_021012	TCT	2	6	534730	534735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146642
11079	NC_021012	GCA	2	6	534741	534746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11080	NC_021012	CAG	2	6	534757	534762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11081	NC_021012	GA	3	6	534786	534791	50 %	0 %	50 %	0 %	479146642
11082	NC_021012	CGT	2	6	534852	534857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11083	NC_021012	AGC	2	6	534943	534948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11084	NC_021012	ATCACA	2	12	534951	534962	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479146642
11085	NC_021012	TGA	3	9	534980	534988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146642
11086	NC_021012	GCT	2	6	535011	535016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11087	NC_021012	AAG	2	6	535035	535040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146642
11088	NC_021012	ATG	2	6	535066	535071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146642
11089	NC_021012	CAG	2	6	535095	535100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11090	NC_021012	CAG	2	6	535144	535149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11091	NC_021012	AGA	2	6	535202	535207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146642
11092	NC_021012	AG	3	6	535259	535264	50 %	0 %	50 %	0 %	479146642
11093	NC_021012	AGC	2	6	535316	535321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146642
11094	NC_021012	GGC	2	6	535350	535355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146642
11095	NC_021012	CAGG	2	8	535362	535369	25 %	0 %	50 %	25 %	479146642
11096	NC_021012	GAT	3	9	535383	535391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146642
11097	NC_021012	ATC	2	6	535421	535426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146642
11098	NC_021012	GA	3	6	535489	535494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_021012	AG	3	6	535515	535520	50 %	0 %	50 %	0 %	479146643
11100	NC_021012	ATT	2	6	535521	535526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146643
11101	NC_021012	A	6	6	535571	535576	100 %	0 %	0 %	0 %	479146643
11102	NC_021012	GCA	2	6	535721	535726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146643
11103	NC_021012	TGG	2	6	535732	535737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146643
11104	NC_021012	CGG	2	6	535741	535746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146643
11105	NC_021012	GATTT	2	10	535755	535764	20 %	60 %	20 %	0 %	479146643
11106	NC_021012	GGC	2	6	535817	535822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146643
11107	NC_021012	AGA	2	6	535829	535834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146643
11108	NC_021012	TGG	2	6	536011	536016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146643
11109	NC_021012	CAG	2	6	536039	536044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146643
11110	NC_021012	CTT	2	6	536047	536052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146643
11111	NC_021012	GGT	2	6	536090	536095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146643
11112	NC_021012	GAT	2	6	536104	536109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146643
11113	NC_021012	AT	3	6	536143	536148	50 %	50 %	0 %	0 %	479146643
11114	NC_021012	CGG	2	6	536242	536247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146643
11115	NC_021012	TAG	2	6	536265	536270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146643
11116	NC_021012	GGC	2	6	536350	536355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146643
11117	NC_021012	TGGA	2	8	536385	536392	25 %	25 %	50 %	0 %	479146643
11118	NC_021012	ACAG	2	8	536422	536429	50 %	0 %	25 %	25 %	479146643
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11120	NC_021012	TGG	2	6	536508	536513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146643
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11237	NC_021012	ATAA	2	8	541547	541554	75 %	25 %	0 %	0 %	479146650
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11359	NC_021012	CGATCA	2	12	547202	547213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479146654
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11366	NC_021012	TA	3	6	547499	547504	50 %	50 %	0 %	0 %	479146654
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11471	NC_021012	ATTT	2	8	552145	552152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11472	NC_021012	T	8	8	552150	552157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11478	NC_021012	A	6	6	552443	552448	100 %	0 %	0 %	0 %	479146659
11479	NC_021012	TGCC	2	8	552508	552515	0 %	25 %	25 %	50 %	479146659
11480	NC_021012	TGCA	2	8	552517	552524	25 %	25 %	25 %	25 %	479146659
11481	NC_021012	GGA	2	6	552559	552564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146659
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