MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021012	GAAA	2	8	483315	483322	75 %	0 %	25 %	0 %	479146605
10003	NC_021012	A	6	6	483320	483325	100 %	0 %	0 %	0 %	479146605
10004	NC_021012	TTA	2	6	483330	483335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146605
10005	NC_021012	CAG	2	6	483411	483416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146605
10006	NC_021012	AGA	2	6	483444	483449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146605
10007	NC_021012	GA	3	6	483448	483453	50 %	0 %	50 %	0 %	479146605
10008	NC_021012	GAA	2	6	483499	483504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146605
10009	NC_021012	CAG	2	6	483537	483542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146605
10010	NC_021012	TAT	2	6	483582	483587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146605
10011	NC_021012	A	7	7	483633	483639	100 %	0 %	0 %	0 %	479146605
10012	NC_021012	CAG	2	6	483677	483682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146605
10013	NC_021012	CAG	2	6	483684	483689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146605
10014	NC_021012	CAGT	2	8	483693	483700	25 %	25 %	25 %	25 %	479146605
10015	NC_021012	AGA	2	6	483709	483714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146605
10016	NC_021012	CAG	2	6	483716	483721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146605
10017	NC_021012	TGA	2	6	483751	483756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146605
10018	NC_021012	TAT	2	6	483784	483789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146605
10019	NC_021012	TAC	2	6	483856	483861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146605
10020	NC_021012	AGA	2	6	484000	484005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146605
10021	NC_021012	TGG	2	6	484125	484130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146605
10022	NC_021012	GAA	2	6	484139	484144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146605
10023	NC_021012	GACA	2	8	484272	484279	50 %	0 %	25 %	25 %	479146605
10024	NC_021012	GGA	2	6	484286	484291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146605
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10030	NC_021012	AATT	2	8	484554	484561	50 %	50 %	0 %	0 %	479146605
10031	NC_021012	CAG	2	6	484592	484597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146605
10032	NC_021012	AGT	2	6	484701	484706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146605
10033	NC_021012	ATT	2	6	484748	484753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146606
10034	NC_021012	TAAA	2	8	484802	484809	75 %	25 %	0 %	0 %	479146606
10035	NC_021012	TCG	2	6	484826	484831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146606
10036	NC_021012	TCCGGT	2	12	484837	484848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146606
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10038	NC_021012	A	6	6	485022	485027	100 %	0 %	0 %	0 %	479146606
10039	NC_021012	GAA	2	6	485053	485058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146606
10040	NC_021012	TGG	2	6	485102	485107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146606
10041	NC_021012	GAA	2	6	485113	485118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146606
10042	NC_021012	TTGCAA	2	12	485168	485179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479146606
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10045	NC_021012	CAA	2	6	485447	485452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146607
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10050	NC_021012	ATG	2	6	485614	485619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146607
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10052	NC_021012	GAT	2	6	485763	485768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146607
10053	NC_021012	ATGC	2	8	485844	485851	25 %	25 %	25 %	25 %	479146607
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10057	NC_021012	TGT	2	6	485999	486004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146607
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10092	NC_021012	A	6	6	487299	487304	100 %	0 %	0 %	0 %	479146608
10093	NC_021012	AT	3	6	487377	487382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_021012	A	7	7	487404	487410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10099	NC_021012	CATG	2	8	487714	487721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10100	NC_021012	AAT	2	6	487751	487756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_021012	TGTT	2	8	487816	487823	0 %	75 %	25 %	0 %	479146610
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10104	NC_021012	A	7	7	487982	487988	100 %	0 %	0 %	0 %	479146610
10105	NC_021012	ATAAAA	2	12	488011	488022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479146610
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10118	NC_021012	TGA	2	6	488650	488655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_021012	GAA	2	6	488719	488724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_021012	TAAGGA	2	12	488752	488763	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10122	NC_021012	A	8	8	488838	488845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_021012	GAA	2	6	488910	488915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10134	NC_021012	GATC	2	8	489386	489393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10242	NC_021012	TAAA	2	8	494368	494375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_021012	A	6	6	494410	494415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10252	NC_021012	A	7	7	494869	494875	100 %	0 %	0 %	0 %	479146612
10253	NC_021012	TAT	2	6	494885	494890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146612
10254	NC_021012	TGA	2	6	494968	494973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146612
10255	NC_021012	GAA	2	6	495112	495117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146612
10256	NC_021012	ATTT	2	8	495162	495169	25 %	75 %	0 %	0 %	479146612
10257	NC_021012	GAA	2	6	495208	495213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146612
10258	NC_021012	TGA	2	6	495225	495230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146613
10259	NC_021012	AGAGGA	2	12	495265	495276	50 %	0 %	50 %	0 %	479146613
10260	NC_021012	CAGT	2	8	495343	495350	25 %	25 %	25 %	25 %	479146613
10261	NC_021012	AATG	2	8	495368	495375	50 %	25 %	25 %	0 %	479146613
10262	NC_021012	GAG	2	6	495416	495421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146613
10263	NC_021012	TGTATC	2	12	495429	495440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479146613
10264	NC_021012	GCA	2	6	495478	495483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146613
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10267	NC_021012	AGGATG	2	12	495642	495653	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479146613
10268	NC_021012	CGAT	2	8	495705	495712	25 %	25 %	25 %	25 %	479146613
10269	NC_021012	CAT	2	6	495782	495787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146613
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10273	NC_021012	AAG	2	6	496029	496034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146613
10274	NC_021012	TGA	2	6	496056	496061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146613
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10278	NC_021012	GCA	2	6	496319	496324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146613
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10280	NC_021012	A	6	6	496484	496489	100 %	0 %	0 %	0 %	479146613
10281	NC_021012	AAT	2	6	496535	496540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146613
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10283	NC_021012	CGG	2	6	496719	496724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10284	NC_021012	ATG	2	6	496756	496761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10285	NC_021012	C	6	6	496785	496790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10286	NC_021012	TGC	2	6	496802	496807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10287	NC_021012	CGC	2	6	496868	496873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10288	NC_021012	ATG	2	6	496906	496911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10289	NC_021012	GGA	2	6	496968	496973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10290	NC_021012	AAC	2	6	497020	497025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10291	NC_021012	AGG	2	6	497033	497038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10292	NC_021012	ACGGG	2	10	497075	497084	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10293	NC_021012	GAT	2	6	497103	497108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10294	NC_021012	TTAC	2	8	497116	497123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10295	NC_021012	A	6	6	497135	497140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10296	NC_021012	GGT	2	6	497203	497208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10297	NC_021012	TTGTT	2	10	497247	497256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10298	NC_021012	CCGT	2	8	497363	497370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10299	NC_021012	CAG	2	6	497462	497467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10300	NC_021012	ATCC	2	8	497563	497570	25 %	25 %	0 %	50 %	479146614
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10310	NC_021012	CGT	2	6	497853	497858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146614
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10312	NC_021012	CGG	2	6	497988	497993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146614
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10335	NC_021012	TAGA	2	8	498810	498817	50 %	25 %	25 %	0 %	479146616
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10352	NC_021012	CTG	2	6	500044	500049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146616
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10367	NC_021012	AACC	2	8	500984	500991	50 %	0 %	0 %	50 %	479146617
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10374	NC_021012	AAAT	2	8	501403	501410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10500	NC_021012	GCA	2	6	505793	505798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146624

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