MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
88001	NC_021012	A	6	6	4277427	4277432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88002	NC_021012	TGC	2	6	4277437	4277442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88003	NC_021012	GGAA	2	8	4277504	4277511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88004	NC_021012	AAAT	2	8	4277585	4277592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88005	NC_021012	CCATCA	2	12	4277629	4277640	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88006	NC_021012	ATG	2	6	4277788	4277793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88007	NC_021012	N	1832	1832	4277795	4279626	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88008	NC_021012	AAG	2	6	4279755	4279760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88009	NC_021012	AGG	2	6	4279841	4279846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88010	NC_021012	GAA	2	6	4279847	4279852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88011	NC_021012	CTG	2	6	4279907	4279912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479149825
88012	NC_021012	GAG	2	6	4279985	4279990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479149825
88013	NC_021012	GGA	2	6	4279996	4280001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479149825
88014	NC_021012	A	6	6	4280015	4280020	100 %	0 %	0 %	0 %	479149825
88015	NC_021012	AAC	2	6	4280065	4280070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479149825
88016	NC_021012	GAG	2	6	4280078	4280083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479149825
88017	NC_021012	CTG	2	6	4280114	4280119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479149825
88018	NC_021012	AGC	2	6	4280131	4280136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479149825
88019	NC_021012	TAT	2	6	4280275	4280280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149825
88020	NC_021012	GGA	2	6	4280323	4280328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479149825
88021	NC_021012	CCG	2	6	4280348	4280353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479149825
88022	NC_021012	GGA	2	6	4280422	4280427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479149825
88023	NC_021012	ATG	2	6	4280448	4280453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149825
88024	NC_021012	CCTG	2	8	4280484	4280491	0 %	25 %	25 %	50 %	479149825
88025	NC_021012	ACA	2	6	4280510	4280515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479149825
88026	NC_021012	GTG	2	6	4280528	4280533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479149825
88027	NC_021012	TGG	2	6	4280610	4280615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479149825
88028	NC_021012	GGGA	2	8	4280788	4280795	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88029	NC_021012	CTG	2	6	4280854	4280859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88030	NC_021012	GAT	2	6	4280901	4280906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88031	NC_021012	GAA	2	6	4280916	4280921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88032	NC_021012	AGAAA	2	10	4280922	4280931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88033	NC_021012	A	7	7	4281007	4281013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88034	NC_021012	CTA	2	6	4281177	4281182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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88036	NC_021012	N	1800	1800	4281244	4283043	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88037	NC_021012	AGA	2	6	4283053	4283058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88038	NC_021012	GCC	2	6	4283074	4283079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88039	NC_021012	CCG	2	6	4283120	4283125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88040	NC_021012	GAG	2	6	4283132	4283137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88041	NC_021012	GGAT	2	8	4283225	4283232	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88042	NC_021012	TGT	2	6	4283327	4283332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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88045	NC_021012	TA	3	6	4283428	4283433	50 %	50 %	0 %	0 %	479149826
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88048	NC_021012	GAT	2	6	4283544	4283549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149826
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88053	NC_021012	A	6	6	4283721	4283726	100 %	0 %	0 %	0 %	479149826
88054	NC_021012	TAT	2	6	4283759	4283764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149826
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88059	NC_021012	A	6	6	4283970	4283975	100 %	0 %	0 %	0 %	479149826
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88065	NC_021012	T	7	7	4284157	4284163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88071	NC_021012	A	7	7	4284527	4284533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88072	NC_021012	AGG	2	6	4284540	4284545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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88081	NC_021012	AGGA	2	8	4284840	4284847	50 %	0 %	50 %	0 %	479149827
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88106	NC_021012	A	6	6	4285812	4285817	100 %	0 %	0 %	0 %	479149829
88107	NC_021012	GGA	2	6	4285842	4285847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479149829
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88110	NC_021012	AGG	2	6	4286043	4286048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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88112	NC_021012	CCGG	2	8	4286171	4286178	0 %	0 %	50 %	50 %	479149830
88113	NC_021012	ATT	2	6	4286244	4286249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149830
88114	NC_021012	TGTT	2	8	4286266	4286273	0 %	75 %	25 %	0 %	479149830

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.