MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021012	ATA	2	6	269437	269442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146433
5502	NC_021012	GAT	2	6	269495	269500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_021012	ATG	2	6	269553	269558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_021012	AGA	2	6	269566	269571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021012	TTG	2	6	269578	269583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021012	TAT	2	6	269639	269644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021012	CAGG	2	8	269654	269661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_021012	ACA	2	6	269677	269682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_021012	GGAA	2	8	269699	269706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021012	GAA	2	6	269775	269780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_021012	TGA	2	6	269783	269788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_021012	GAA	2	6	269901	269906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_021012	CAA	2	6	269939	269944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_021012	TAT	2	6	269955	269960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021012	CTT	2	6	270024	270029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_021012	AT	3	6	270110	270115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021012	GAA	2	6	270144	270149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021012	ATA	2	6	270160	270165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_021012	AAAGA	2	10	270228	270237	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_021012	TTC	2	6	270278	270283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_021012	GCC	2	6	270494	270499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_021012	A	6	6	270549	270554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021012	TGA	2	6	270584	270589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021012	TGC	2	6	270685	270690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_021012	TGA	2	6	270692	270697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_021012	AGC	2	6	270711	270716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_021012	GCAGA	2	10	270762	270771	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5528	NC_021012	TCTG	2	8	270812	270819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5529	NC_021012	AGC	2	6	270900	270905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_021012	TGC	2	6	270946	270951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_021012	AG	3	6	271169	271174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021012	CGG	2	6	271244	271249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_021012	TGA	2	6	271324	271329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021012	CAGG	2	8	271341	271348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_021012	GAA	2	6	271374	271379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021012	T	6	6	271398	271403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021012	CATATC	2	12	271419	271430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_021012	CA	3	6	271502	271507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_021012	GA	3	6	271540	271545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021012	TGG	2	6	271574	271579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021012	AAAAG	2	10	271583	271592	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021012	GAA	2	6	271604	271609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021012	GAA	2	6	271637	271642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_021012	GGA	2	6	271658	271663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_021012	A	6	6	271680	271685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021012	A	6	6	271708	271713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021012	TAA	2	6	271761	271766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146434
5548	NC_021012	A	6	6	271765	271770	100 %	0 %	0 %	0 %	479146434
5549	NC_021012	ATC	2	6	271864	271869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146434
5550	NC_021012	TGA	2	6	271884	271889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146434
5551	NC_021012	TCTT	2	8	272082	272089	0 %	75 %	0 %	25 %	479146434
5552	NC_021012	ATG	2	6	272129	272134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146434
5553	NC_021012	ATT	2	6	272171	272176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146434
5554	NC_021012	TGC	2	6	272334	272339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146434
5555	NC_021012	GAA	2	6	272345	272350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146434
5556	NC_021012	AAT	2	6	272475	272480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021012	GGA	2	6	272504	272509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_021012	GAAAAA	2	12	272517	272528	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479146435
5559	NC_021012	A	7	7	272524	272530	100 %	0 %	0 %	0 %	479146435
5560	NC_021012	CAA	2	6	272588	272593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146435
5561	NC_021012	GAT	2	6	272629	272634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146435
5562	NC_021012	AC	3	6	272650	272655	50 %	0 %	0 %	50 %	479146435
5563	NC_021012	AATG	2	8	272691	272698	50 %	25 %	25 %	0 %	479146435
5564	NC_021012	AT	3	6	272766	272771	50 %	50 %	0 %	0 %	479146435
5565	NC_021012	GCT	2	6	272805	272810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146435
5566	NC_021012	GTT	2	6	272854	272859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146435
5567	NC_021012	ATG	2	6	272870	272875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146435
5568	NC_021012	TGA	2	6	272912	272917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146435
5569	NC_021012	AGA	3	9	272919	272927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146435
5570	NC_021012	A	6	6	272944	272949	100 %	0 %	0 %	0 %	479146435
5571	NC_021012	CAG	2	6	272963	272968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146435
5572	NC_021012	AGG	2	6	272973	272978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146435
5573	NC_021012	CCG	2	6	272982	272987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146435
5574	NC_021012	GCA	2	6	272995	273000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146435
5575	NC_021012	GTT	3	9	273061	273069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146435
5576	NC_021012	GCG	4	12	273074	273085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146435
5577	NC_021012	GCA	2	6	273151	273156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146435
5578	NC_021012	ATGT	2	8	273215	273222	25 %	50 %	25 %	0 %	479146435
5579	NC_021012	GAA	2	6	273292	273297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146435
5580	NC_021012	TGC	2	6	273320	273325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146435
5581	NC_021012	GGC	2	6	273336	273341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146435
5582	NC_021012	TCCGT	2	10	273368	273377	0 %	40 %	20 %	40 %	479146435
5583	NC_021012	TTA	2	6	273380	273385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146435
5584	NC_021012	GAT	2	6	273432	273437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146435
5585	NC_021012	TAA	3	9	273464	273472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021012	T	7	7	273498	273504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_021012	A	6	6	273511	273516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_021012	TTGT	2	8	273537	273544	0 %	75 %	25 %	0 %	479146436
5589	NC_021012	AAGG	2	8	273566	273573	50 %	0 %	50 %	0 %	479146436
5590	NC_021012	GAG	2	6	273641	273646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146436
5591	NC_021012	GCA	2	6	273704	273709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146436
5592	NC_021012	GA	3	6	273742	273747	50 %	0 %	50 %	0 %	479146436
5593	NC_021012	ACGG	2	8	273752	273759	25 %	0 %	50 %	25 %	479146436
5594	NC_021012	GGA	2	6	273856	273861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146436
5595	NC_021012	GAT	2	6	273890	273895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146436
5596	NC_021012	ATC	2	6	273977	273982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146436
5597	NC_021012	AT	3	6	274057	274062	50 %	50 %	0 %	0 %	479146436
5598	NC_021012	ATGATT	2	12	274104	274115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479146436
5599	NC_021012	TGC	2	6	274120	274125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146436
5600	NC_021012	GAT	2	6	274145	274150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146436
5601	NC_021012	GGC	2	6	274184	274189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146436
5602	NC_021012	ATATCA	2	12	274194	274205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479146436
5603	NC_021012	GTG	2	6	274284	274289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146436
5604	NC_021012	AGA	2	6	274332	274337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146436
5605	NC_021012	A	6	6	274346	274351	100 %	0 %	0 %	0 %	479146436
5606	NC_021012	AAG	2	6	274367	274372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146436
5607	NC_021012	ATG	2	6	274403	274408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146436
5608	NC_021012	CAGAG	2	10	274426	274435	40 %	0 %	40 %	20 %	479146436
5609	NC_021012	ACG	2	6	274461	274466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146436
5610	NC_021012	GA	3	6	274491	274496	50 %	0 %	50 %	0 %	479146436
5611	NC_021012	GTAT	2	8	274506	274513	25 %	50 %	25 %	0 %	479146436
5612	NC_021012	TTAC	2	8	274573	274580	25 %	50 %	0 %	25 %	479146436
5613	NC_021012	GCA	2	6	274673	274678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146436
5614	NC_021012	ATC	2	6	274679	274684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146436
5615	NC_021012	CCGC	2	8	274707	274714	0 %	0 %	25 %	75 %	479146436
5616	NC_021012	GGA	2	6	274751	274756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146436
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5618	NC_021012	GCA	2	6	274865	274870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146436
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5620	NC_021012	TGT	3	9	274900	274908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146436
5621	NC_021012	AGA	2	6	275010	275015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146436
5622	NC_021012	GAA	2	6	275045	275050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146436
5623	NC_021012	CAT	2	6	275077	275082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146436
5624	NC_021012	ATG	2	6	275108	275113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146436
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5626	NC_021012	CAA	2	6	275301	275306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5893	NC_021012	ATCA	2	8	289454	289461	50 %	25 %	0 %	25 %	479146444
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5903	NC_021012	A	6	6	289776	289781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5904	NC_021012	AG	3	6	289822	289827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5908	NC_021012	T	7	7	290076	290082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5909	NC_021012	CTAT	2	8	290120	290127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5910	NC_021012	A	6	6	290135	290140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5911	NC_021012	A	6	6	290222	290227	100 %	0 %	0 %	0 %	479146445
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