MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021012	TAA	2	6	247201	247206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146419
5002	NC_021012	TGC	2	6	247259	247264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146419
5003	NC_021012	TGC	2	6	247271	247276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146419
5004	NC_021012	TAA	2	6	247297	247302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146419
5005	NC_021012	CTCA	2	8	247361	247368	25 %	25 %	0 %	50 %	479146419
5006	NC_021012	GTT	2	6	247410	247415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146419
5007	NC_021012	ATC	3	9	247421	247429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146419
5008	NC_021012	ATATCC	2	12	247439	247450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146419
5009	NC_021012	CCA	2	6	247458	247463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146419
5010	NC_021012	CAT	2	6	247588	247593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146419
5011	NC_021012	AT	3	6	247597	247602	50 %	50 %	0 %	0 %	479146419
5012	NC_021012	TTC	2	6	247653	247658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146419
5013	NC_021012	TTC	2	6	247679	247684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146419
5014	NC_021012	CCT	2	6	247711	247716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146419
5015	NC_021012	TAACT	2	10	247809	247818	40 %	40 %	0 %	20 %	479146419
5016	NC_021012	TTA	2	6	247872	247877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146419
5017	NC_021012	TA	3	6	247882	247887	50 %	50 %	0 %	0 %	479146419
5018	NC_021012	TCT	2	6	247909	247914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146419
5019	NC_021012	CT	3	6	247948	247953	0 %	50 %	0 %	50 %	479146419
5020	NC_021012	C	6	6	247961	247966	0 %	0 %	0 %	100 %	479146419
5021	NC_021012	CTT	2	6	247969	247974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146419
5022	NC_021012	TTA	2	6	247996	248001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146419
5023	NC_021012	TTAT	2	8	248075	248082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021012	GCG	2	6	248100	248105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021012	GCC	2	6	248108	248113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_021012	AG	3	6	248221	248226	50 %	0 %	50 %	0 %	479146420
5027	NC_021012	TGGA	2	8	248232	248239	25 %	25 %	50 %	0 %	479146420
5028	NC_021012	TTG	2	6	248326	248331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146420
5029	NC_021012	GAT	2	6	248372	248377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146420
5030	NC_021012	GAG	2	6	248437	248442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146420
5031	NC_021012	TAC	2	6	248464	248469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146420
5032	NC_021012	CTT	2	6	248482	248487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146420
5033	NC_021012	TAA	2	6	248536	248541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146420
5034	NC_021012	GTA	2	6	248569	248574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146420
5035	NC_021012	TGC	2	6	248734	248739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146420
5036	NC_021012	CAA	2	6	248823	248828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146420
5037	NC_021012	CTTC	2	8	248856	248863	0 %	50 %	0 %	50 %	479146420
5038	NC_021012	ATC	2	6	248872	248877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146420
5039	NC_021012	TTG	2	6	249198	249203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021012	TTCCA	2	10	249292	249301	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5041	NC_021012	AGT	2	6	249470	249475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021012	TTC	2	6	249576	249581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_021012	CTG	2	6	249601	249606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_021012	ATG	2	6	249787	249792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021012	CTG	2	6	249872	249877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_021012	TCAT	2	8	249967	249974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_021012	TC	3	6	250040	250045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_021012	GTA	2	6	250161	250166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021012	CTC	2	6	250212	250217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_021012	TTG	2	6	250243	250248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021012	CTC	2	6	250335	250340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_021012	ATTT	2	8	250383	250390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021012	CCT	2	6	250517	250522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_021012	GT	3	6	250544	250549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021012	AT	3	6	250568	250573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021012	TGG	2	6	250635	250640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021012	AG	3	6	250666	250671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021012	AAT	2	6	250678	250683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021012	A	6	6	250695	250700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021012	AT	3	6	250716	250721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021012	TA	3	6	250722	250727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021012	AAT	2	6	250730	250735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146421
5063	NC_021012	AGA	2	6	250742	250747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146421
5064	NC_021012	TGT	2	6	250833	250838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146421
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5066	NC_021012	TA	4	8	250901	250908	50 %	50 %	0 %	0 %	479146421
5067	NC_021012	TAA	2	6	250936	250941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146421
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5069	NC_021012	GTT	2	6	251082	251087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146421
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5072	NC_021012	T	6	6	251149	251154	0 %	100 %	0 %	0 %	479146421
5073	NC_021012	TTA	2	6	251164	251169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146421
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5076	NC_021012	CAGA	2	8	251213	251220	50 %	0 %	25 %	25 %	479146421
5077	NC_021012	TTA	2	6	251250	251255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146421
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5079	NC_021012	GGA	2	6	251270	251275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146421
5080	NC_021012	TA	3	6	251286	251291	50 %	50 %	0 %	0 %	479146421
5081	NC_021012	A	6	6	251291	251296	100 %	0 %	0 %	0 %	479146421
5082	NC_021012	ACT	2	6	251325	251330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146421
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5089	NC_021012	AGA	2	6	251465	251470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146421
5090	NC_021012	A	6	6	251479	251484	100 %	0 %	0 %	0 %	479146421
5091	NC_021012	TA	3	6	251485	251490	50 %	50 %	0 %	0 %	479146421
5092	NC_021012	TAT	2	6	251493	251498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146421
5093	NC_021012	AAAAT	2	10	251517	251526	80 %	20 %	0 %	0 %	479146421
5094	NC_021012	GAA	2	6	251555	251560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146421
5095	NC_021012	AG	3	6	251605	251610	50 %	0 %	50 %	0 %	479146421
5096	NC_021012	CTT	2	6	251670	251675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021012	ATC	2	6	251713	251718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_021012	ATT	2	6	251851	251856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146422
5099	NC_021012	A	6	6	251866	251871	100 %	0 %	0 %	0 %	479146422
5100	NC_021012	CA	4	8	251900	251907	50 %	0 %	0 %	50 %	479146422
5101	NC_021012	AGG	2	6	251909	251914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146422
5102	NC_021012	GAA	2	6	251927	251932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146422
5103	NC_021012	GT	3	6	251942	251947	0 %	50 %	50 %	0 %	479146422
5104	NC_021012	ATT	2	6	251969	251974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021012	TAT	2	6	252014	252019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021012	ATGCC	2	10	252212	252221	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5107	NC_021012	TAA	3	9	252267	252275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021012	CAGCA	2	10	252299	252308	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5109	NC_021012	AGAC	2	8	252353	252360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_021012	GTC	2	6	252373	252378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_021012	CTA	2	6	252390	252395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_021012	ATTT	2	8	252542	252549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021012	AAT	2	6	252577	252582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021012	A	6	6	252595	252600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021012	GATT	2	8	252681	252688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021012	TGC	2	6	252690	252695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_021012	AGG	2	6	252704	252709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021012	GAG	2	6	252736	252741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021012	GCAG	2	8	252873	252880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_021012	TAA	2	6	252974	252979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021012	A	6	6	253032	253037	100 %	0 %	0 %	0 %	479146423
5122	NC_021012	ATA	2	6	253083	253088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146423
5123	NC_021012	ATGG	2	8	253148	253155	25 %	25 %	50 %	0 %	479146423
5124	NC_021012	AT	3	6	253171	253176	50 %	50 %	0 %	0 %	479146423
5125	NC_021012	AAGAT	2	10	253194	253203	60 %	20 %	20 %	0 %	479146423
5126	NC_021012	GAA	2	6	253220	253225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146423
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5128	NC_021012	AT	3	6	253262	253267	50 %	50 %	0 %	0 %	479146423
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5256	NC_021012	A	6	6	258580	258585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5258	NC_021012	ATT	2	6	258651	258656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_021012	CTG	2	6	258693	258698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_021012	CTA	2	6	258886	258891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_021012	A	6	6	258950	258955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_021012	ATT	2	6	258957	258962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_021012	GAA	2	6	258968	258973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_021012	CGC	2	6	258975	258980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5267	NC_021012	AGCAG	2	10	259057	259066	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5270	NC_021012	TGA	2	6	259141	259146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5272	NC_021012	TGATC	2	10	259243	259252	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5277	NC_021012	TAAA	2	8	259590	259597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_021012	ATG	2	6	259620	259625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5388	NC_021012	GTA	2	6	264941	264946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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