MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_021012	T	6	6	2531920	2531925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52502	NC_021012	GAT	2	6	2531931	2531936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52503	NC_021012	A	6	6	2531938	2531943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52504	NC_021012	T	8	8	2531964	2531971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52505	NC_021012	CAT	2	6	2532000	2532005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52506	NC_021012	TCC	2	6	2532164	2532169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52507	NC_021012	TCATA	2	10	2532183	2532192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52508	NC_021012	A	6	6	2532318	2532323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52509	NC_021012	T	6	6	2532359	2532364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52510	NC_021012	GTT	2	6	2532412	2532417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52511	NC_021012	ATA	2	6	2532449	2532454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52512	NC_021012	T	7	7	2532463	2532469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52513	NC_021012	ACAGAA	2	12	2532505	2532516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52514	NC_021012	AAT	2	6	2532546	2532551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52515	NC_021012	GAA	2	6	2532556	2532561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148324
52516	NC_021012	A	6	6	2532560	2532565	100 %	0 %	0 %	0 %	479148324
52517	NC_021012	TG	3	6	2532599	2532604	0 %	50 %	50 %	0 %	479148324
52518	NC_021012	A	7	7	2532628	2532634	100 %	0 %	0 %	0 %	479148324
52519	NC_021012	TGA	2	6	2532666	2532671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148324
52520	NC_021012	GC	3	6	2532684	2532689	0 %	0 %	50 %	50 %	479148324
52521	NC_021012	T	8	8	2532723	2532730	0 %	100 %	0 %	0 %	479148324
52522	NC_021012	T	7	7	2532732	2532738	0 %	100 %	0 %	0 %	479148324
52523	NC_021012	C	6	6	2532787	2532792	0 %	0 %	0 %	100 %	479148324
52524	NC_021012	GAA	2	6	2532919	2532924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148324
52525	NC_021012	CAA	2	6	2532961	2532966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148324
52526	NC_021012	TTTC	2	8	2533009	2533016	0 %	75 %	0 %	25 %	479148324
52527	NC_021012	CGG	2	6	2533017	2533022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148324
52528	NC_021012	T	6	6	2533025	2533030	0 %	100 %	0 %	0 %	479148324
52529	NC_021012	ATT	2	6	2533062	2533067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148324
52530	NC_021012	T	6	6	2533186	2533191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52531	NC_021012	T	6	6	2533215	2533220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52532	NC_021012	T	7	7	2533223	2533229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52533	NC_021012	AT	3	6	2533230	2533235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52534	NC_021012	A	7	7	2533287	2533293	100 %	0 %	0 %	0 %	479148325
52535	NC_021012	TGC	2	6	2533381	2533386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148325
52536	NC_021012	TCA	2	6	2533443	2533448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148325
52537	NC_021012	A	6	6	2533523	2533528	100 %	0 %	0 %	0 %	479148325
52538	NC_021012	CAG	2	6	2533529	2533534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148325
52539	NC_021012	GAT	2	6	2533568	2533573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148325
52540	NC_021012	CAA	2	6	2533581	2533586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148325
52541	NC_021012	GAT	2	6	2533618	2533623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148325
52542	NC_021012	CGG	2	6	2533630	2533635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148325
52543	NC_021012	GAA	2	6	2533682	2533687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148325
52544	NC_021012	GAT	2	6	2533721	2533726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148325
52545	NC_021012	ATC	2	6	2533746	2533751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148325
52546	NC_021012	GAT	2	6	2533766	2533771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148325
52547	NC_021012	GCT	2	6	2533848	2533853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148325
52548	NC_021012	CTG	2	6	2533913	2533918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148325
52549	NC_021012	ACT	2	6	2533920	2533925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148325
52550	NC_021012	ATTGG	2	10	2533927	2533936	20 %	40 %	40 %	0 %	479148325
52551	NC_021012	CTGC	2	8	2533948	2533955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52552	NC_021012	ATT	2	6	2533998	2534003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148326
52553	NC_021012	CAC	2	6	2534011	2534016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148326
52554	NC_021012	CAG	2	6	2534074	2534079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148326
52555	NC_021012	ATC	2	6	2534221	2534226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148326
52556	NC_021012	CTC	2	6	2534236	2534241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479148326
52557	NC_021012	TCC	2	6	2534330	2534335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479148326
52558	NC_021012	CAG	2	6	2534379	2534384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148326
52559	NC_021012	ATA	2	6	2534485	2534490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148326
52560	NC_021012	AAT	2	6	2534565	2534570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148326
52561	NC_021012	T	6	6	2534827	2534832	0 %	100 %	0 %	0 %	479148326
52562	NC_021012	TCA	2	6	2534969	2534974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148326
52563	NC_021012	ATA	2	6	2535031	2535036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148326
52564	NC_021012	CTCC	2	8	2535132	2535139	0 %	25 %	0 %	75 %	479148326
52565	NC_021012	CTG	2	6	2535159	2535164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148326
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52569	NC_021012	ATC	2	6	2535508	2535513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148326
52570	NC_021012	C	6	6	2535569	2535574	0 %	0 %	0 %	100 %	479148326
52571	NC_021012	CCATT	2	10	2535648	2535657	20 %	40 %	0 %	40 %	479148326
52572	NC_021012	TGA	2	6	2535679	2535684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148326
52573	NC_021012	AT	3	6	2535783	2535788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52574	NC_021012	AG	3	6	2536014	2536019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52575	NC_021012	AAAC	2	8	2536023	2536030	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52576	NC_021012	AC	3	6	2536070	2536075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52577	NC_021012	TA	3	6	2536358	2536363	50 %	50 %	0 %	0 %	479148327
52578	NC_021012	GAT	2	6	2536365	2536370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148327
52579	NC_021012	A	6	6	2536467	2536472	100 %	0 %	0 %	0 %	479148327
52580	NC_021012	CGG	2	6	2536505	2536510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148327
52581	NC_021012	GAT	2	6	2536518	2536523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148327
52582	NC_021012	ATC	2	6	2536621	2536626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148327
52583	NC_021012	ATG	2	6	2536708	2536713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148327
52584	NC_021012	AAT	2	6	2536783	2536788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148327
52585	NC_021012	ATT	2	6	2536797	2536802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148327
52586	NC_021012	TC	3	6	2536847	2536852	0 %	50 %	0 %	50 %	479148327
52587	NC_021012	CAC	2	6	2536973	2536978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148327
52588	NC_021012	T	7	7	2536979	2536985	0 %	100 %	0 %	0 %	479148327
52589	NC_021012	CTG	3	9	2536994	2537002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148327
52590	NC_021012	CTC	2	6	2537036	2537041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52591	NC_021012	ATA	2	6	2537106	2537111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52592	NC_021012	AAG	2	6	2537174	2537179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52593	NC_021012	GTCT	2	8	2537180	2537187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52594	NC_021012	GAAG	2	8	2537230	2537237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52595	NC_021012	TG	3	6	2537271	2537276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52596	NC_021012	AAAG	2	8	2537324	2537331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52597	NC_021012	TGC	2	6	2537360	2537365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52598	NC_021012	TACC	2	8	2537428	2537435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52599	NC_021012	TAA	2	6	2537443	2537448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52600	NC_021012	TAA	2	6	2537519	2537524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52601	NC_021012	CGGT	2	8	2537542	2537549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52602	NC_021012	CAG	2	6	2537570	2537575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52603	NC_021012	CCTTT	2	10	2537629	2537638	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52604	NC_021012	TGA	2	6	2537653	2537658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52605	NC_021012	TCT	2	6	2537776	2537781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52606	NC_021012	CCCA	2	8	2537796	2537803	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52607	NC_021012	ATA	2	6	2537809	2537814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52608	NC_021012	GAT	2	6	2537818	2537823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52609	NC_021012	AAAATT	2	12	2537886	2537897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52610	NC_021012	TA	3	6	2537926	2537931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52611	NC_021012	TCT	2	6	2537958	2537963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52612	NC_021012	GTT	2	6	2537969	2537974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52613	NC_021012	CT	3	6	2538029	2538034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52614	NC_021012	ACA	2	6	2538082	2538087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52615	NC_021012	TGA	2	6	2538095	2538100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52617	NC_021012	T	7	7	2538132	2538138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52618	NC_021012	CT	3	6	2538158	2538163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52619	NC_021012	GCA	2	6	2538178	2538183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52620	NC_021012	CTGA	2	8	2538202	2538209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52621	NC_021012	AT	3	6	2538222	2538227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52622	NC_021012	T	6	6	2538382	2538387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52623	NC_021012	CCT	2	6	2538414	2538419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52624	NC_021012	AGA	2	6	2538478	2538483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52625	NC_021012	TTG	2	6	2538514	2538519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52626	NC_021012	TCT	2	6	2538528	2538533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52627	NC_021012	CTG	2	6	2538541	2538546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52628	NC_021012	AGT	2	6	2538607	2538612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52629	NC_021012	TCA	2	6	2538684	2538689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52630	NC_021012	TTTGTA	2	12	2538705	2538716	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52631	NC_021012	TCATA	2	10	2538730	2538739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52632	NC_021012	TCC	2	6	2538866	2538871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52633	NC_021012	CTT	2	6	2538919	2538924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52640	NC_021012	ATC	3	9	2539220	2539228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52642	NC_021012	CAT	2	6	2539294	2539299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52643	NC_021012	GTAA	2	8	2539301	2539308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52644	NC_021012	TGT	2	6	2539334	2539339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52645	NC_021012	TCC	2	6	2539361	2539366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52646	NC_021012	AT	3	6	2539422	2539427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52647	NC_021012	AGCC	2	8	2539554	2539561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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52654	NC_021012	TTG	2	6	2539705	2539710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52655	NC_021012	TGT	2	6	2539714	2539719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52656	NC_021012	CTG	3	9	2539720	2539728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52663	NC_021012	CTTTT	2	10	2539841	2539850	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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52866	NC_021012	CAGA	2	8	2549401	2549408	50 %	0 %	25 %	25 %	479148334
52867	NC_021012	ATC	2	6	2549411	2549416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148334
52868	NC_021012	T	6	6	2549474	2549479	0 %	100 %	0 %	0 %	479148334
52869	NC_021012	ATA	2	6	2549552	2549557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148334
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52874	NC_021012	TCC	2	6	2550122	2550127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479148334
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52885	NC_021012	GCA	2	6	2550641	2550646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148336
52886	NC_021012	CA	3	6	2550645	2550650	50 %	0 %	0 %	50 %	479148336
52887	NC_021012	ATC	2	6	2550658	2550663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148336
52888	NC_021012	CGT	2	6	2550672	2550677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148336
52889	NC_021012	GC	4	8	2550695	2550702	0 %	0 %	50 %	50 %	479148336
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52938	NC_021012	CCAC	2	8	2553005	2553012	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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52940	NC_021012	CTGT	2	8	2553082	2553089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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52960	NC_021012	ATTA	2	8	2553931	2553938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52985	NC_021012	GAT	2	6	2554974	2554979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148339
52986	NC_021012	TTC	2	6	2554980	2554985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148339
52987	NC_021012	TCT	2	6	2555018	2555023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148339
52988	NC_021012	TATAT	2	10	2555093	2555102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52989	NC_021012	CTA	2	6	2555173	2555178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148340
52990	NC_021012	TCCA	2	8	2555201	2555208	25 %	25 %	0 %	50 %	479148340
52991	NC_021012	T	6	6	2555224	2555229	0 %	100 %	0 %	0 %	479148340
52992	NC_021012	CTG	2	6	2555237	2555242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148340
52993	NC_021012	TCC	2	6	2555259	2555264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479148340
52994	NC_021012	GCAA	2	8	2555276	2555283	50 %	0 %	25 %	25 %	479148340
52995	NC_021012	AAT	3	9	2555294	2555302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148340
52996	NC_021012	CA	3	6	2555312	2555317	50 %	0 %	0 %	50 %	479148340
52997	NC_021012	TTCA	2	8	2555321	2555328	25 %	50 %	0 %	25 %	479148340
52998	NC_021012	T	6	6	2555357	2555362	0 %	100 %	0 %	0 %	479148340
52999	NC_021012	TCA	2	6	2555373	2555378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148340
53000	NC_021012	TAA	2	6	2555414	2555419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148340

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