MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Breinl

Total Repeats: 2820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020993	AT	3	6	231	236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020993	TC	3	6	616	621	0 %	50 %	0 %	50 %	478693375
3	NC_020993	AT	3	6	884	889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020993	CA	3	6	959	964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020993	TA	3	6	1349	1354	50 %	50 %	0 %	0 %	478693378
6	NC_020993	TC	3	6	2808	2813	0 %	50 %	0 %	50 %	478693380
7	NC_020993	AG	3	6	3548	3553	50 %	0 %	50 %	0 %	478693381
8	NC_020993	TA	3	6	4241	4246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020993	AT	3	6	5175	5180	50 %	50 %	0 %	0 %	478693383
10	NC_020993	TA	3	6	5383	5388	50 %	50 %	0 %	0 %	478693383
11	NC_020993	TA	5	10	5879	5888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020993	AT	3	6	6279	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020993	AT	5	10	6290	6299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020993	CA	3	6	6591	6596	50 %	0 %	0 %	50 %	478693384
15	NC_020993	TA	3	6	6907	6912	50 %	50 %	0 %	0 %	478693384
16	NC_020993	AT	3	6	6918	6923	50 %	50 %	0 %	0 %	478693384
17	NC_020993	TA	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	478693384
18	NC_020993	TA	3	6	7655	7660	50 %	50 %	0 %	0 %	478693384
19	NC_020993	TA	3	6	7792	7797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020993	AT	3	6	7995	8000	50 %	50 %	0 %	0 %	478693385
21	NC_020993	TG	3	6	8012	8017	0 %	50 %	50 %	0 %	478693385
22	NC_020993	AT	3	6	8437	8442	50 %	50 %	0 %	0 %	478693385
23	NC_020993	AT	3	6	8767	8772	50 %	50 %	0 %	0 %	478693385
24	NC_020993	TG	3	6	8788	8793	0 %	50 %	50 %	0 %	478693385
25	NC_020993	TC	3	6	9306	9311	0 %	50 %	0 %	50 %	478693385
26	NC_020993	AT	3	6	9516	9521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020993	AT	3	6	9541	9546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020993	TA	3	6	10095	10100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020993	AT	3	6	10171	10176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020993	AT	3	6	10270	10275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020993	AT	3	6	10358	10363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020993	TA	3	6	10674	10679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020993	GA	3	6	10688	10693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020993	TA	4	8	10732	10739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020993	TA	3	6	10777	10782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020993	TA	3	6	10838	10843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020993	AT	3	6	11004	11009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020993	CA	3	6	12245	12250	50 %	0 %	0 %	50 %	478693386
39	NC_020993	TA	3	6	13056	13061	50 %	50 %	0 %	0 %	478693388
40	NC_020993	TA	3	6	13371	13376	50 %	50 %	0 %	0 %	478693389
41	NC_020993	AT	3	6	14229	14234	50 %	50 %	0 %	0 %	478693389
42	NC_020993	AT	3	6	15780	15785	50 %	50 %	0 %	0 %	478693389
43	NC_020993	TA	3	6	16260	16265	50 %	50 %	0 %	0 %	478693389
44	NC_020993	TA	3	6	17057	17062	50 %	50 %	0 %	0 %	478693390
45	NC_020993	AT	3	6	17570	17575	50 %	50 %	0 %	0 %	478693390
46	NC_020993	AG	3	6	17862	17867	50 %	0 %	50 %	0 %	478693390
47	NC_020993	TA	3	6	18212	18217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020993	TA	3	6	18556	18561	50 %	50 %	0 %	0 %	478693391
49	NC_020993	GA	3	6	18565	18570	50 %	0 %	50 %	0 %	478693391
50	NC_020993	AT	4	8	18994	19001	50 %	50 %	0 %	0 %	478693391
51	NC_020993	TA	3	6	19042	19047	50 %	50 %	0 %	0 %	478693391
52	NC_020993	AT	3	6	19168	19173	50 %	50 %	0 %	0 %	478693391
53	NC_020993	TA	3	6	19419	19424	50 %	50 %	0 %	0 %	478693391
54	NC_020993	AT	3	6	19472	19477	50 %	50 %	0 %	0 %	478693391
55	NC_020993	TC	3	6	19665	19670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020993	TA	3	6	19761	19766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020993	TA	3	6	19805	19810	50 %	50 %	0 %	0 %	478693392
58	NC_020993	AT	3	6	20091	20096	50 %	50 %	0 %	0 %	478693392
59	NC_020993	TA	3	6	20232	20237	50 %	50 %	0 %	0 %	478693392
60	NC_020993	AT	3	6	20493	20498	50 %	50 %	0 %	0 %	478693392
61	NC_020993	CT	3	6	20850	20855	0 %	50 %	0 %	50 %	478693392
62	NC_020993	AT	3	6	20962	20967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020993	AT	4	8	21493	21500	50 %	50 %	0 %	0 %	478693393
64	NC_020993	TA	3	6	22280	22285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020993	TA	3	6	22325	22330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020993	TA	3	6	22361	22366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020993	AT	3	6	22709	22714	50 %	50 %	0 %	0 %	478693395
68	NC_020993	AT	3	6	23201	23206	50 %	50 %	0 %	0 %	478693395
69	NC_020993	AT	3	6	23512	23517	50 %	50 %	0 %	0 %	478693395
70	NC_020993	AG	3	6	23520	23525	50 %	0 %	50 %	0 %	478693395
71	NC_020993	AT	3	6	23851	23856	50 %	50 %	0 %	0 %	478693395
72	NC_020993	TA	3	6	23910	23915	50 %	50 %	0 %	0 %	478693395
73	NC_020993	AT	3	6	24128	24133	50 %	50 %	0 %	0 %	478693395
74	NC_020993	AG	3	6	24204	24209	50 %	0 %	50 %	0 %	478693395
75	NC_020993	AT	4	8	24274	24281	50 %	50 %	0 %	0 %	478693395
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79	NC_020993	AG	3	6	25925	25930	50 %	0 %	50 %	0 %	478693397
80	NC_020993	TA	3	6	26222	26227	50 %	50 %	0 %	0 %	478693397
81	NC_020993	TA	3	6	26682	26687	50 %	50 %	0 %	0 %	478693398
82	NC_020993	TA	3	6	27075	27080	50 %	50 %	0 %	0 %	478693398
83	NC_020993	AT	3	6	27145	27150	50 %	50 %	0 %	0 %	478693398
84	NC_020993	TA	3	6	27409	27414	50 %	50 %	0 %	0 %	478693398
85	NC_020993	AT	3	6	27988	27993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020993	AT	3	6	29218	29223	50 %	50 %	0 %	0 %	478693401
87	NC_020993	AT	3	6	29392	29397	50 %	50 %	0 %	0 %	478693401
88	NC_020993	AT	3	6	29519	29524	50 %	50 %	0 %	0 %	478693401
89	NC_020993	TC	3	6	29591	29596	0 %	50 %	0 %	50 %	478693401
90	NC_020993	AT	3	6	30065	30070	50 %	50 %	0 %	0 %	478693402
91	NC_020993	AT	3	6	30301	30306	50 %	50 %	0 %	0 %	478693402
92	NC_020993	TC	3	6	30453	30458	0 %	50 %	0 %	50 %	478693402
93	NC_020993	TA	3	6	30777	30782	50 %	50 %	0 %	0 %	478693402
94	NC_020993	AT	3	6	30911	30916	50 %	50 %	0 %	0 %	478693402
95	NC_020993	AT	3	6	30959	30964	50 %	50 %	0 %	0 %	478693402
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97	NC_020993	TA	3	6	32354	32359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020993	TA	3	6	32384	32389	50 %	50 %	0 %	0 %	478693404
99	NC_020993	AT	3	6	33435	33440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020993	TA	3	6	33493	33498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020993	AT	3	6	33535	33540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020993	TA	3	6	33562	33567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_020993	AT	3	6	36830	36835	50 %	50 %	0 %	0 %	478693406
108	NC_020993	CT	3	6	36867	36872	0 %	50 %	0 %	50 %	478693406
109	NC_020993	AT	3	6	37969	37974	50 %	50 %	0 %	0 %	478693407
110	NC_020993	TA	4	8	38868	38875	50 %	50 %	0 %	0 %	478693407
111	NC_020993	AT	3	6	39363	39368	50 %	50 %	0 %	0 %	478693407
112	NC_020993	GA	3	6	39495	39500	50 %	0 %	50 %	0 %	478693407
113	NC_020993	AC	3	6	39984	39989	50 %	0 %	0 %	50 %	478693408
114	NC_020993	AT	3	6	40218	40223	50 %	50 %	0 %	0 %	478693408
115	NC_020993	CA	3	6	40254	40259	50 %	0 %	0 %	50 %	478693408
116	NC_020993	AT	3	6	40966	40971	50 %	50 %	0 %	0 %	478693408
117	NC_020993	AT	4	8	41640	41647	50 %	50 %	0 %	0 %	478693410
118	NC_020993	AT	3	6	42213	42218	50 %	50 %	0 %	0 %	478693411
119	NC_020993	AT	3	6	42241	42246	50 %	50 %	0 %	0 %	478693411
120	NC_020993	AG	3	6	42465	42470	50 %	0 %	50 %	0 %	478693411
121	NC_020993	TA	3	6	42647	42652	50 %	50 %	0 %	0 %	478693411
122	NC_020993	GA	3	6	43425	43430	50 %	0 %	50 %	0 %	478693412
123	NC_020993	AT	4	8	44384	44391	50 %	50 %	0 %	0 %	478693412
124	NC_020993	AT	4	8	45410	45417	50 %	50 %	0 %	0 %	478693412
125	NC_020993	AT	3	6	45468	45473	50 %	50 %	0 %	0 %	478693412
126	NC_020993	TA	3	6	45512	45517	50 %	50 %	0 %	0 %	478693412
127	NC_020993	TA	4	8	46193	46200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020993	GT	4	8	46249	46256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020993	TA	3	6	46408	46413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020993	TA	3	6	46479	46484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020993	AT	3	6	46599	46604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020993	TA	3	6	46663	46668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020993	TA	3	6	47208	47213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020993	AT	3	6	47337	47342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020993	AT	3	6	47356	47361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020993	TA	3	6	47988	47993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020993	AG	3	6	48216	48221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_020993	AT	3	6	49373	49378	50 %	50 %	0 %	0 %	478693414
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144	NC_020993	TG	3	6	51267	51272	0 %	50 %	50 %	0 %	478693415
145	NC_020993	TA	3	6	52470	52475	50 %	50 %	0 %	0 %	478693416
146	NC_020993	AT	3	6	52487	52492	50 %	50 %	0 %	0 %	478693416
147	NC_020993	TA	4	8	52762	52769	50 %	50 %	0 %	0 %	478693416
148	NC_020993	AT	3	6	52821	52826	50 %	50 %	0 %	0 %	478693416
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