MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020992	ATTGAT	2	12	3824	3835	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478692438
2	NC_020992	TGGAGA	2	12	7720	7731	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478692442
3	NC_020992	TATACA	2	12	11032	11043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020992	TCTTGC	2	12	11303	11314	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478692446
5	NC_020992	TCTAAA	2	12	11998	12009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478692447
6	NC_020992	ACAATA	2	12	14916	14927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020992	CAATAG	2	12	20496	20507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478692451
8	NC_020992	TTTTAA	2	12	22344	22355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692451
9	NC_020992	TACCAG	2	12	25890	25901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478692454
10	NC_020992	TGAAAC	2	12	26757	26768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478692456
11	NC_020992	TAAAAA	2	12	27362	27373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478692457
12	NC_020992	TTTTAT	2	12	28366	28377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478692458
13	NC_020992	GTAGTT	2	12	29874	29885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478692458
14	NC_020992	CTCTAA	2	12	33287	33298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692462
15	NC_020992	GCTTGA	2	12	38463	38474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478692468
16	NC_020992	TTTCTT	2	12	38479	38490	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478692468
17	NC_020992	AATATT	2	12	41393	41404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020992	CAAAAG	2	12	45473	45484	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478692474
19	NC_020992	AATATA	2	12	46600	46611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692475
20	NC_020992	AAAATC	2	12	48020	48031	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478692476
21	NC_020992	TATTAA	2	12	52551	52562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020992	CCTATA	2	12	53653	53664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692482
23	NC_020992	CTTTTA	2	12	53975	53986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478692482
24	NC_020992	ATTAGC	2	12	61907	61918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478692484
25	NC_020992	TAGATG	2	12	63919	63930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692486
26	NC_020992	GTATTA	2	12	64420	64431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478692487
27	NC_020992	TATTTT	2	12	64454	64465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478692487
28	NC_020992	ACTAAA	2	12	66054	66065	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478692487
29	NC_020992	TCTATC	2	12	66876	66887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478692487
30	NC_020992	TAGCAA	2	12	67043	67054	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478692487
31	NC_020992	AACACC	2	12	72706	72717	50 %	0 %	0 %	50 %	478692492
32	NC_020992	AGAGTT	2	12	74598	74609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692493
33	NC_020992	AATTTT	2	12	75403	75414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692494
34	NC_020992	AAATCA	2	12	79160	79171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478692498
35	NC_020992	ACTAAA	2	12	81968	81979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478692500
36	NC_020992	AAAAAG	2	12	83554	83565	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478692502
37	NC_020992	TGAAGA	2	12	83779	83790	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478692502
38	NC_020992	CCGCTA	2	12	83913	83924	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478692502
39	NC_020992	TAGCAC	2	12	85195	85206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478692503
40	NC_020992	TAATTT	2	12	85607	85618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692504
41	NC_020992	ATAAAT	2	12	95877	95888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020992	TAAAAA	2	12	103756	103767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478692521
43	NC_020992	CCTTTA	2	12	106662	106673	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478692523
44	NC_020992	GCTTGA	2	12	108554	108565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478692524
45	NC_020992	TGCTTC	2	12	108700	108711	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478692524
46	NC_020992	GCAAGA	2	12	109306	109317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	478692525
47	NC_020992	AATTTC	2	12	109500	109511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478692525
48	NC_020992	AAATCA	2	12	109675	109686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478692525
49	NC_020992	AATATT	2	12	110604	110615	50 %	50 %	0 %	0 %	478692525
50	NC_020992	TGTAGT	2	12	118822	118833	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478692532
51	NC_020992	TCTATT	2	12	119101	119112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478692533
52	NC_020992	TACTCC	2	12	122002	122013	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478692536
53	NC_020992	ATTTTA	2	12	123149	123160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692536
54	NC_020992	CTTTTT	2	12	127075	127086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478692540
55	NC_020992	CAAGTG	2	12	127240	127251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478692540
56	NC_020992	CTTTTT	2	12	128490	128501	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478692542
57	NC_020992	TCACTA	2	12	129317	129328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692542
58	NC_020992	AGCTGC	2	12	130550	130561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	478692543
59	NC_020992	ATAAAT	2	12	141923	141934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692553
60	NC_020992	TAAGAA	2	12	143860	143871	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478692554
61	NC_020992	ACGCTC	2	12	143998	144009	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478692554
62	NC_020992	AATTAA	2	12	146519	146530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020992	TAAAAA	2	12	147754	147765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020992	TAAAAA	2	12	149002	149013	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478692556
65	NC_020992	CTTATT	2	12	151454	151465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020992	ATATAA	2	12	152359	152370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020992	AACATA	2	12	154025	154036	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020992	GTTTCT	2	12	154220	154231	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020992	GACGTA	2	12	154271	154282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020992	CTAGTA	2	12	154461	154472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020992	TATATG	2	12	158289	158300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478692563
72	NC_020992	ATTTTT	2	12	159785	159796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478692565
73	NC_020992	TTCTAA	2	12	160691	160702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478692566
74	NC_020992	TACAAA	2	12	162544	162555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478692570
75	NC_020992	TCAAAA	2	12	162683	162694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478692570
76	NC_020992	ATTTAG	2	12	164634	164645	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020992	ATAATT	2	12	165495	165506	50 %	50 %	0 %	0 %	478692572
78	NC_020992	TATGAT	2	12	165530	165541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478692572
79	NC_020992	TATATT	2	12	166961	166972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692573
80	NC_020992	CATCTT	2	12	167683	167694	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478692573
81	NC_020992	GATATA	2	12	169875	169886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478692575
82	NC_020992	CCAAAA	2	12	171681	171692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692576
83	NC_020992	TTTTCT	2	12	173100	173111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478692578
84	NC_020992	ATTTTT	2	12	173226	173237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478692578
85	NC_020992	AGATAT	2	12	175441	175452	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478692581
86	NC_020992	TTTATT	2	12	178489	178500	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478692584
87	NC_020992	CAATAA	2	12	180294	180305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478692584
88	NC_020992	TAGCAT	2	12	182378	182389	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478692586
89	NC_020992	GAGAAA	2	12	182611	182622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692586
90	NC_020992	TACTTT	2	12	182904	182915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478692587
91	NC_020992	TATAAT	2	12	183706	183717	50 %	50 %	0 %	0 %	478692588
92	NC_020992	AAGGAA	2	12	184869	184880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692589
93	NC_020992	TAAAAG	2	12	185094	185105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478692589
94	NC_020992	ATATTG	2	12	185866	185877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478692590
95	NC_020992	TTTATA	2	12	187081	187092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020992	TAAGAA	2	12	189710	189721	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020992	AACGTT	2	12	190008	190019	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020992	AAAAAT	2	12	192689	192700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478692596
99	NC_020992	AAAATA	2	12	195353	195364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020992	TTATAT	2	12	195719	195730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020992	ATGTAG	2	12	196055	196066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692600
102	NC_020992	TAGCAA	2	12	200754	200765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478692605
103	NC_020992	ATTAAT	2	12	201131	201142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020992	TAGATA	2	12	201741	201752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020992	TATTGA	2	12	202657	202668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478692607
106	NC_020992	TTTCTT	2	12	202912	202923	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478692608
107	NC_020992	TCAATT	2	12	204325	204336	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478692609
108	NC_020992	ATCATA	2	12	205256	205267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478692610
109	NC_020992	TTAATT	2	12	208272	208283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692614
110	NC_020992	TTAAAT	2	12	209971	209982	50 %	50 %	0 %	0 %	478692615
111	NC_020992	AGCAAT	2	12	210373	210384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478692616
112	NC_020992	TAAAAA	2	12	211347	211358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478692616
113	NC_020992	CTTTAA	2	12	213592	213603	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020992	TCCACC	2	12	215073	215084	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	478692619
115	NC_020992	AAATAT	2	12	218965	218976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692620
116	NC_020992	TATAAA	2	12	219955	219966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692621
117	NC_020992	GAAAAA	2	12	220562	220573	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478692622
118	NC_020992	ATAATG	2	12	220950	220961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478692622
119	NC_020992	TTTAGA	2	12	223748	223759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478692625
120	NC_020992	ATCAGA	2	12	230177	230188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478692629
121	NC_020992	AGCTAA	2	12	232590	232601	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478692631
122	NC_020992	ATTTTT	2	12	233159	233170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020992	TTCATT	2	12	234871	234882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478692633
124	NC_020992	CTTTTT	2	12	236221	236232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020992	ATTAAA	2	12	237849	237860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020992	AGTGAA	2	12	246897	246908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_020992	AAATTT	2	12	260508	260519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020992	CAGTAA	2	12	260797	260808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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240	NC_020992	CCAATG	2	12	497424	497435	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478692861
241	NC_020992	AATATC	2	12	499519	499530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478692863
242	NC_020992	TTAAAA	2	12	499839	499850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_020992	GATTTT	2	12	500727	500738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478692864
244	NC_020992	ATTGAA	2	12	501504	501515	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
245	NC_020992	TTAATT	2	12	504007	504018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692867
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270	NC_020992	TTTGCT	2	12	554800	554811	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478692903
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356	NC_020992	TTTGCT	2	12	715328	715339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
357	NC_020992	TTTTCT	2	12	717492	717503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478693035
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362	NC_020992	CTTTAT	2	12	730691	730702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
363	NC_020992	TAGTTT	2	12	730772	730783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_020992	TAAATC	2	12	958031	958042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478693245
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498	NC_020992	TTATAA	2	12	992103	992114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_020992	ATTTTT	2	12	993861	993872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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