MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 3505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020992	CAAA	2	8	330	337	75 %	0 %	0 %	25 %	478692435
2	NC_020992	ATTT	2	8	1712	1719	25 %	75 %	0 %	0 %	478692436
3	NC_020992	TAAT	2	8	1932	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020992	TAAA	2	8	2245	2252	75 %	25 %	0 %	0 %	478692437
5	NC_020992	ATAA	2	8	2301	2308	75 %	25 %	0 %	0 %	478692437
6	NC_020992	AATG	2	8	3093	3100	50 %	25 %	25 %	0 %	478692437
7	NC_020992	TCTT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	478692438
8	NC_020992	TAAA	2	8	3861	3868	75 %	25 %	0 %	0 %	478692438
9	NC_020992	TAAT	2	8	4326	4333	50 %	50 %	0 %	0 %	478692438
10	NC_020992	ATTA	3	12	5310	5321	50 %	50 %	0 %	0 %	478692440
11	NC_020992	TGCT	2	8	5564	5571	0 %	50 %	25 %	25 %	478692440
12	NC_020992	TAAA	2	8	5741	5748	75 %	25 %	0 %	0 %	478692440
13	NC_020992	GAAT	2	8	6276	6283	50 %	25 %	25 %	0 %	478692441
14	NC_020992	CTTT	2	8	6384	6391	0 %	75 %	0 %	25 %	478692441
15	NC_020992	TCTT	2	8	6535	6542	0 %	75 %	0 %	25 %	478692441
16	NC_020992	TGTA	2	8	7575	7582	25 %	50 %	25 %	0 %	478692442
17	NC_020992	TCAA	2	8	7834	7841	50 %	25 %	0 %	25 %	478692442
18	NC_020992	AAAG	2	8	8005	8012	75 %	0 %	25 %	0 %	478692442
19	NC_020992	AAGA	2	8	8382	8389	75 %	0 %	25 %	0 %	478692442
20	NC_020992	TAAA	2	8	8794	8801	75 %	25 %	0 %	0 %	478692443
21	NC_020992	AACA	2	8	8862	8869	75 %	0 %	0 %	25 %	478692444
22	NC_020992	CAAA	2	8	8880	8887	75 %	0 %	0 %	25 %	478692444
23	NC_020992	TATT	2	8	8988	8995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020992	TTGT	2	8	9114	9121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020992	ACAA	2	8	9550	9557	75 %	0 %	0 %	25 %	478692445
26	NC_020992	AGTG	2	8	9574	9581	25 %	25 %	50 %	0 %	478692445
27	NC_020992	TAAA	2	8	10221	10228	75 %	25 %	0 %	0 %	478692445
28	NC_020992	TTTC	2	8	11020	11027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020992	CCTG	2	8	11288	11295	0 %	25 %	25 %	50 %	478692446
30	NC_020992	ATTC	2	8	11338	11345	25 %	50 %	0 %	25 %	478692446
31	NC_020992	TTTA	2	8	11838	11845	25 %	75 %	0 %	0 %	478692447
32	NC_020992	ATCA	2	8	12090	12097	50 %	25 %	0 %	25 %	478692447
33	NC_020992	TATT	2	8	12143	12150	25 %	75 %	0 %	0 %	478692447
34	NC_020992	TTTA	2	8	12390	12397	25 %	75 %	0 %	0 %	478692447
35	NC_020992	ATTA	2	8	12498	12505	50 %	50 %	0 %	0 %	478692448
36	NC_020992	TTCT	2	8	13389	13396	0 %	75 %	0 %	25 %	478692448
37	NC_020992	AATT	2	8	13468	13475	50 %	50 %	0 %	0 %	478692448
38	NC_020992	AATT	2	8	13876	13883	50 %	50 %	0 %	0 %	478692448
39	NC_020992	TTTA	2	8	14034	14041	25 %	75 %	0 %	0 %	478692449
40	NC_020992	TTCT	2	8	14497	14504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020992	TTAT	2	8	14584	14591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020992	TTTA	2	8	14642	14649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020992	TAAT	2	8	14888	14895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020992	AAAT	2	8	15174	15181	75 %	25 %	0 %	0 %	478692450
45	NC_020992	ATTT	2	8	15268	15275	25 %	75 %	0 %	0 %	478692450
46	NC_020992	CTAT	2	8	15290	15297	25 %	50 %	0 %	25 %	478692450
47	NC_020992	GTAA	2	8	15831	15838	50 %	25 %	25 %	0 %	478692450
48	NC_020992	CCTT	2	8	16832	16839	0 %	50 %	0 %	50 %	478692450
49	NC_020992	ATTT	2	8	16969	16976	25 %	75 %	0 %	0 %	478692450
50	NC_020992	AGCA	2	8	17217	17224	50 %	0 %	25 %	25 %	478692450
51	NC_020992	AATA	2	8	17964	17971	75 %	25 %	0 %	0 %	478692450
52	NC_020992	ATTA	2	8	18289	18296	50 %	50 %	0 %	0 %	478692450
53	NC_020992	GAAG	2	8	18749	18756	50 %	0 %	50 %	0 %	478692450
54	NC_020992	TAAT	2	8	18977	18984	50 %	50 %	0 %	0 %	478692450
55	NC_020992	CATT	2	8	19191	19198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020992	TTTA	2	8	19266	19273	25 %	75 %	0 %	0 %	478692451
57	NC_020992	AATT	2	8	19666	19673	50 %	50 %	0 %	0 %	478692451
58	NC_020992	TACT	2	8	19773	19780	25 %	50 %	0 %	25 %	478692451
59	NC_020992	TAAT	2	8	19826	19833	50 %	50 %	0 %	0 %	478692451
60	NC_020992	AATA	2	8	20140	20147	75 %	25 %	0 %	0 %	478692451
61	NC_020992	TCAT	2	8	20273	20280	25 %	50 %	0 %	25 %	478692451
62	NC_020992	GACC	2	8	21018	21025	25 %	0 %	25 %	50 %	478692451
63	NC_020992	TTAA	2	8	21257	21264	50 %	50 %	0 %	0 %	478692451
64	NC_020992	TTGC	2	8	21483	21490	0 %	50 %	25 %	25 %	478692451
65	NC_020992	TTTA	2	8	21592	21599	25 %	75 %	0 %	0 %	478692451
66	NC_020992	TTTG	2	8	21785	21792	0 %	75 %	25 %	0 %	478692451
67	NC_020992	GATT	2	8	22320	22327	25 %	50 %	25 %	0 %	478692451
68	NC_020992	AGAT	2	8	22444	22451	50 %	25 %	25 %	0 %	478692451
69	NC_020992	ATAA	2	8	22762	22769	75 %	25 %	0 %	0 %	478692451
70	NC_020992	TCAA	2	8	23282	23289	50 %	25 %	0 %	25 %	478692451
71	NC_020992	TTCT	2	8	23327	23334	0 %	75 %	0 %	25 %	478692451
72	NC_020992	GATA	2	8	23647	23654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020992	TAAA	2	8	23980	23987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020992	AAAG	2	8	24092	24099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020992	ATAA	2	8	24201	24208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020992	ACTT	2	8	24280	24287	25 %	50 %	0 %	25 %	478692452
77	NC_020992	ATTA	2	8	24674	24681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020992	AAAT	2	8	25099	25106	75 %	25 %	0 %	0 %	478692453
79	NC_020992	TACA	2	8	25758	25765	50 %	25 %	0 %	25 %	478692454
80	NC_020992	AATT	2	8	25770	25777	50 %	50 %	0 %	0 %	478692454
81	NC_020992	TAAT	2	8	26124	26131	50 %	50 %	0 %	0 %	478692454
82	NC_020992	ACCA	2	8	26262	26269	50 %	0 %	0 %	50 %	478692455
83	NC_020992	TTTA	2	8	26669	26676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020992	ATTA	2	8	27822	27829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020992	ATCA	2	8	28244	28251	50 %	25 %	0 %	25 %	478692458
86	NC_020992	TTCT	2	8	28753	28760	0 %	75 %	0 %	25 %	478692458
87	NC_020992	GCAT	2	8	28875	28882	25 %	25 %	25 %	25 %	478692458
88	NC_020992	TCAT	2	8	28998	29005	25 %	50 %	0 %	25 %	478692458
89	NC_020992	TACT	2	8	29071	29078	25 %	50 %	0 %	25 %	478692458
90	NC_020992	CTGC	2	8	29584	29591	0 %	25 %	25 %	50 %	478692458
91	NC_020992	ATTA	2	8	29720	29727	50 %	50 %	0 %	0 %	478692458
92	NC_020992	TCCA	2	8	29793	29800	25 %	25 %	0 %	50 %	478692458
93	NC_020992	TTTA	2	8	29936	29943	25 %	75 %	0 %	0 %	478692458
94	NC_020992	ATCA	2	8	30094	30101	50 %	25 %	0 %	25 %	478692459
95	NC_020992	CTTT	2	8	30339	30346	0 %	75 %	0 %	25 %	478692459
96	NC_020992	ATTT	2	8	30446	30453	25 %	75 %	0 %	0 %	478692459
97	NC_020992	CTAA	2	8	30467	30474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020992	ATTT	2	8	30479	30486	25 %	75 %	0 %	0 %	478692460
99	NC_020992	CTTA	2	8	30890	30897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020992	TTAA	2	8	31032	31039	50 %	50 %	0 %	0 %	478692461
101	NC_020992	AAAT	2	8	31462	31469	75 %	25 %	0 %	0 %	478692461
102	NC_020992	ATAA	2	8	31781	31788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020992	ATTA	2	8	31803	31810	50 %	50 %	0 %	0 %	478692462
104	NC_020992	CTTT	2	8	31983	31990	0 %	75 %	0 %	25 %	478692462
105	NC_020992	CATA	2	8	33376	33383	50 %	25 %	0 %	25 %	478692462
106	NC_020992	AATT	2	8	33601	33608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020992	TAAT	2	8	33893	33900	50 %	50 %	0 %	0 %	478692463
108	NC_020992	CTAT	2	8	34780	34787	25 %	50 %	0 %	25 %	478692465
109	NC_020992	ATTT	2	8	35290	35297	25 %	75 %	0 %	0 %	478692465
110	NC_020992	TAGC	2	8	35397	35404	25 %	25 %	25 %	25 %	478692465
111	NC_020992	TCAT	2	8	35516	35523	25 %	50 %	0 %	25 %	478692465
112	NC_020992	AAGT	2	8	35603	35610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020992	ATTA	2	8	35814	35821	50 %	50 %	0 %	0 %	478692466
114	NC_020992	ATAG	2	8	35908	35915	50 %	25 %	25 %	0 %	478692466
115	NC_020992	ATCT	2	8	36110	36117	25 %	50 %	0 %	25 %	478692466
116	NC_020992	TACT	2	8	36275	36282	25 %	50 %	0 %	25 %	478692466
117	NC_020992	CTAT	2	8	36640	36647	25 %	50 %	0 %	25 %	478692466
118	NC_020992	ATTC	2	8	37058	37065	25 %	50 %	0 %	25 %	478692466
119	NC_020992	CTTT	2	8	37265	37272	0 %	75 %	0 %	25 %	478692467
120	NC_020992	CTTT	2	8	37423	37430	0 %	75 %	0 %	25 %	478692467
121	NC_020992	TAAA	2	8	39542	39549	75 %	25 %	0 %	0 %	478692469
122	NC_020992	TGCT	2	8	41083	41090	0 %	50 %	25 %	25 %	478692470
123	NC_020992	AGTA	2	8	41625	41632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020992	TAAT	2	8	41716	41723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020992	TATT	2	8	41818	41825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020992	TATT	2	8	41888	41895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020992	TAAA	2	8	42469	42476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020992	TACC	2	8	42809	42816	25 %	25 %	0 %	50 %	478692471
129	NC_020992	CCCA	2	8	43047	43054	25 %	0 %	0 %	75 %	478692471
130	NC_020992	ATGC	2	8	43225	43232	25 %	25 %	25 %	25 %	478692472
131	NC_020992	AACA	2	8	43238	43245	75 %	0 %	0 %	25 %	478692472
132	NC_020992	TGTT	2	8	44134	44141	0 %	75 %	25 %	0 %	478692473
133	NC_020992	TAAA	2	8	44556	44563	75 %	25 %	0 %	0 %	478692473
134	NC_020992	TAAT	2	8	44571	44578	50 %	50 %	0 %	0 %	478692473
135	NC_020992	AAAT	2	8	44873	44880	75 %	25 %	0 %	0 %	478692474
136	NC_020992	TATC	2	8	45010	45017	25 %	50 %	0 %	25 %	478692474
137	NC_020992	CAAT	2	8	45179	45186	50 %	25 %	0 %	25 %	478692474
138	NC_020992	TCAC	2	8	45627	45634	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020992	TTTC	2	8	45822	45829	0 %	75 %	0 %	25 %	478692475
140	NC_020992	ATAA	2	8	45982	45989	75 %	25 %	0 %	0 %	478692475
141	NC_020992	TCAA	2	8	46172	46179	50 %	25 %	0 %	25 %	478692475
142	NC_020992	TAAA	2	8	46483	46490	75 %	25 %	0 %	0 %	478692475
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144	NC_020992	AAGA	2	8	47616	47623	75 %	0 %	25 %	0 %	478692476
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