MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 30267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020992	CTT	2	6	130015	130020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692543
3502	NC_020992	AT	4	8	130029	130036	50 %	50 %	0 %	0 %	478692543
3503	NC_020992	A	6	6	130080	130085	100 %	0 %	0 %	0 %	478692543
3504	NC_020992	T	6	6	130116	130121	0 %	100 %	0 %	0 %	478692543
3505	NC_020992	AT	3	6	130134	130139	50 %	50 %	0 %	0 %	478692543
3506	NC_020992	CTT	2	6	130174	130179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692543
3507	NC_020992	T	7	7	130226	130232	0 %	100 %	0 %	0 %	478692543
3508	NC_020992	TAC	2	6	130406	130411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692543
3509	NC_020992	T	6	6	130423	130428	0 %	100 %	0 %	0 %	478692543
3510	NC_020992	TAA	2	6	130474	130479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692543
3511	NC_020992	T	6	6	130480	130485	0 %	100 %	0 %	0 %	478692543
3512	NC_020992	AGT	2	6	130487	130492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692543
3513	NC_020992	AGCTGC	2	12	130550	130561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	478692543
3514	NC_020992	AT	4	8	130600	130607	50 %	50 %	0 %	0 %	478692543
3515	NC_020992	AAT	2	6	130640	130645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692543
3516	NC_020992	GTG	2	6	130672	130677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692543
3517	NC_020992	TTA	2	6	130701	130706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692543
3518	NC_020992	TAA	3	9	130739	130747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692543
3519	NC_020992	TA	3	6	130768	130773	50 %	50 %	0 %	0 %	478692543
3520	NC_020992	TAC	2	6	130778	130783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692543
3521	NC_020992	TAA	2	6	130865	130870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692543
3522	NC_020992	TAA	2	6	130877	130882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692543
3523	NC_020992	T	7	7	130901	130907	0 %	100 %	0 %	0 %	478692543
3524	NC_020992	ATC	2	6	130922	130927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692543
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3527	NC_020992	TTAA	2	8	130977	130984	50 %	50 %	0 %	0 %	478692543
3528	NC_020992	AACA	2	8	131015	131022	75 %	0 %	0 %	25 %	478692543
3529	NC_020992	ATA	2	6	131023	131028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692543
3530	NC_020992	TAT	5	15	131083	131097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020992	T	7	7	131111	131117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020992	ATT	2	6	131118	131123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020992	ATTTT	2	10	131131	131140	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020992	AAT	2	6	131145	131150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020992	AAC	2	6	131205	131210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_020992	A	6	6	131232	131237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_020992	ATTA	2	8	131242	131249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_020992	TTAT	2	8	131294	131301	25 %	75 %	0 %	0 %	478692544
3539	NC_020992	ATT	2	6	131324	131329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692544
3540	NC_020992	T	6	6	131328	131333	0 %	100 %	0 %	0 %	478692544
3541	NC_020992	GTA	2	6	131375	131380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692544
3542	NC_020992	A	6	6	131444	131449	100 %	0 %	0 %	0 %	478692544
3543	NC_020992	GAT	2	6	131456	131461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692544
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3545	NC_020992	TA	3	6	131520	131525	50 %	50 %	0 %	0 %	478692544
3546	NC_020992	GGC	2	6	131576	131581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478692544
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3549	NC_020992	GCT	2	6	131618	131623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692544
3550	NC_020992	TATT	2	8	131624	131631	25 %	75 %	0 %	0 %	478692544
3551	NC_020992	T	6	6	131653	131658	0 %	100 %	0 %	0 %	478692544
3552	NC_020992	ATA	2	6	131672	131677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692544
3553	NC_020992	ATT	2	6	131698	131703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692544
3554	NC_020992	TTA	2	6	131724	131729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692544
3555	NC_020992	T	7	7	131827	131833	0 %	100 %	0 %	0 %	478692544
3556	NC_020992	ATT	2	6	131845	131850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692544
3557	NC_020992	AT	3	6	131915	131920	50 %	50 %	0 %	0 %	478692544
3558	NC_020992	AAT	2	6	131944	131949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692544
3559	NC_020992	ATTT	2	8	131986	131993	25 %	75 %	0 %	0 %	478692544
3560	NC_020992	GTCG	2	8	132060	132067	0 %	25 %	50 %	25 %	478692544
3561	NC_020992	AATT	2	8	132083	132090	50 %	50 %	0 %	0 %	478692545
3562	NC_020992	TAT	2	6	132157	132162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692545
3563	NC_020992	CTAG	2	8	132178	132185	25 %	25 %	25 %	25 %	478692545
3564	NC_020992	ATT	2	6	132235	132240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692545
3565	NC_020992	AG	3	6	132256	132261	50 %	0 %	50 %	0 %	478692545
3566	NC_020992	TTAGT	2	10	132290	132299	20 %	60 %	20 %	0 %	478692545
3567	NC_020992	TAC	2	6	132338	132343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692545
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3573	NC_020992	AT	3	6	132546	132551	50 %	50 %	0 %	0 %	478692545
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3580	NC_020992	GATAT	2	10	132785	132794	40 %	40 %	20 %	0 %	478692545
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3582	NC_020992	TTA	2	6	133003	133008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692545
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3584	NC_020992	A	9	9	133133	133141	100 %	0 %	0 %	0 %	478692545
3585	NC_020992	T	6	6	133161	133166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_020992	AAT	2	6	133170	133175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_020992	TAC	2	6	133211	133216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_020992	CA	3	6	133251	133256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_020992	ACG	2	6	133292	133297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_020992	AT	3	6	133388	133393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_020992	T	6	6	133486	133491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_020992	TGT	2	6	133504	133509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_020992	TTC	2	6	133543	133548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_020992	ATC	2	6	133549	133554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_020992	AAT	2	6	133557	133562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_020992	T	6	6	133622	133627	0 %	100 %	0 %	0 %	478692546
3597	NC_020992	TCT	2	6	133718	133723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692546
3598	NC_020992	TAT	2	6	133746	133751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692546
3599	NC_020992	CCA	2	6	133822	133827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478692546
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3602	NC_020992	ATA	2	6	133860	133865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692546
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3605	NC_020992	AT	3	6	134058	134063	50 %	50 %	0 %	0 %	478692546
3606	NC_020992	ATCT	2	8	134227	134234	25 %	50 %	0 %	25 %	478692546
3607	NC_020992	TAG	2	6	134247	134252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692546
3608	NC_020992	TCA	2	6	134258	134263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692546
3609	NC_020992	TGT	2	6	134315	134320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478692546
3610	NC_020992	CT	3	6	134329	134334	0 %	50 %	0 %	50 %	478692546
3611	NC_020992	T	7	7	134338	134344	0 %	100 %	0 %	0 %	478692546
3612	NC_020992	ACT	2	6	134345	134350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692546
3613	NC_020992	CT	3	6	134387	134392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_020992	A	7	7	134426	134432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_020992	ATT	2	6	134512	134517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_020992	TAA	2	6	134549	134554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_020992	TTA	2	6	134555	134560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_020992	ATT	2	6	134561	134566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_020992	TAA	2	6	134603	134608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_020992	ATA	2	6	134631	134636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692547
3621	NC_020992	T	6	6	134642	134647	0 %	100 %	0 %	0 %	478692547
3622	NC_020992	TAA	2	6	134878	134883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692547
3623	NC_020992	CATA	2	8	134950	134957	50 %	25 %	0 %	25 %	478692547
3624	NC_020992	TCA	2	6	134958	134963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692547
3625	NC_020992	TGA	2	6	135056	135061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692547
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