MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 30267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020992	GTAT	2	8	112014	112021	25 %	50 %	25 %	0 %	478692526
3002	NC_020992	TA	3	6	112075	112080	50 %	50 %	0 %	0 %	478692526
3003	NC_020992	AAGC	2	8	112117	112124	50 %	0 %	25 %	25 %	478692526
3004	NC_020992	TTTGT	2	10	112135	112144	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_020992	ACA	2	6	112308	112313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_020992	AT	3	6	112334	112339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_020992	TA	3	6	112340	112345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_020992	GTT	2	6	112479	112484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478692527
3009	NC_020992	ATA	2	6	112521	112526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692527
3010	NC_020992	GAT	2	6	112535	112540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692527
3011	NC_020992	ATT	2	6	112571	112576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692527
3012	NC_020992	AGA	2	6	112624	112629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692527
3013	NC_020992	TTG	2	6	112748	112753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_020992	CTA	2	6	112791	112796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_020992	AAG	2	6	112808	112813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_020992	ATT	2	6	112837	112842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_020992	TTA	2	6	112900	112905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_020992	ATA	2	6	112922	112927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_020992	GCAA	2	8	112930	112937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_020992	ATT	2	6	112951	112956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_020992	GTA	2	6	112992	112997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_020992	CAT	2	6	113018	113023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_020992	TGC	2	6	113095	113100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_020992	TAGA	2	8	113127	113134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_020992	TAA	2	6	113171	113176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_020992	ATC	2	6	113229	113234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_020992	ATC	2	6	113282	113287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_020992	CTA	2	6	113291	113296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_020992	TCA	2	6	113357	113362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_020992	TAT	2	6	113386	113391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_020992	ATTT	2	8	113404	113411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_020992	CA	3	6	113437	113442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_020992	TAGTA	2	10	113455	113464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_020992	AT	3	6	113543	113548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_020992	ATT	2	6	113613	113618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_020992	AT	3	6	113645	113650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_020992	GA	3	6	113661	113666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_020992	ACA	2	6	113686	113691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_020992	ACA	2	6	113711	113716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_020992	TAT	2	6	113719	113724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_020992	TTTCA	2	10	113735	113744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_020992	TCT	2	6	113751	113756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_020992	TAT	2	6	113847	113852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_020992	A	6	6	113917	113922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_020992	ATTA	2	8	113936	113943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_020992	TTA	2	6	113953	113958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_020992	GAT	2	6	113989	113994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_020992	TAT	2	6	114008	114013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_020992	ATT	2	6	114027	114032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_020992	TAA	2	6	114045	114050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_020992	TA	3	6	114074	114079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_020992	AATAT	2	10	114080	114089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_020992	TAT	2	6	114093	114098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_020992	AT	3	6	114128	114133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_020992	TAATA	2	10	114137	114146	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_020992	TTC	2	6	114147	114152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_020992	T	8	8	114172	114179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_020992	ATT	2	6	114189	114194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_020992	AAT	2	6	114207	114212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_020992	AAT	2	6	114241	114246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_020992	T	7	7	114278	114284	0 %	100 %	0 %	0 %	478692528
3062	NC_020992	AT	4	8	114372	114379	50 %	50 %	0 %	0 %	478692528
3063	NC_020992	TCC	2	6	114437	114442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478692528
3064	NC_020992	ACT	2	6	114443	114448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692528
3065	NC_020992	CTC	2	6	114451	114456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478692528
3066	NC_020992	ATT	2	6	114519	114524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692528
3067	NC_020992	ATT	2	6	114551	114556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692528
3068	NC_020992	T	8	8	114617	114624	0 %	100 %	0 %	0 %	478692528
3069	NC_020992	T	7	7	114662	114668	0 %	100 %	0 %	0 %	478692528
3070	NC_020992	GCT	2	6	114696	114701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692528
3071	NC_020992	CTA	2	6	114751	114756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692528
3072	NC_020992	CT	3	6	114780	114785	0 %	50 %	0 %	50 %	478692528
3073	NC_020992	TAA	2	6	114799	114804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692528
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3075	NC_020992	TAAA	2	8	114918	114925	75 %	25 %	0 %	0 %	478692528
3076	NC_020992	ACT	2	6	115062	115067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692528
3077	NC_020992	T	6	6	115067	115072	0 %	100 %	0 %	0 %	478692528
3078	NC_020992	ATT	2	6	115090	115095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_020992	ATT	2	6	115158	115163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692529
3080	NC_020992	ATT	2	6	115165	115170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692529
3081	NC_020992	TTG	2	6	115193	115198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478692529
3082	NC_020992	ATA	3	9	115215	115223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692529
3083	NC_020992	TAA	2	6	115235	115240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692529
3084	NC_020992	TAAA	2	8	115248	115255	75 %	25 %	0 %	0 %	478692529
3085	NC_020992	ATTT	2	8	115257	115264	25 %	75 %	0 %	0 %	478692529
3086	NC_020992	A	6	6	115299	115304	100 %	0 %	0 %	0 %	478692529
3087	NC_020992	TAA	2	6	115310	115315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692529
3088	NC_020992	T	6	6	115338	115343	0 %	100 %	0 %	0 %	478692529
3089	NC_020992	AAT	2	6	115344	115349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692529
3090	NC_020992	A	9	9	115350	115358	100 %	0 %	0 %	0 %	478692529
3091	NC_020992	TAA	2	6	115399	115404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_020992	AT	3	6	115486	115491	50 %	50 %	0 %	0 %	478692530
3093	NC_020992	ATT	2	6	115530	115535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692530
3094	NC_020992	ATA	2	6	115552	115557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692530
3095	NC_020992	TCTA	2	8	115569	115576	25 %	50 %	0 %	25 %	478692530
3096	NC_020992	TAA	2	6	115683	115688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692530
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3098	NC_020992	T	8	8	115764	115771	0 %	100 %	0 %	0 %	478692530
3099	NC_020992	CAC	2	6	115778	115783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478692530
3100	NC_020992	CGC	2	6	115797	115802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478692530
3101	NC_020992	ATT	2	6	115822	115827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692530
3102	NC_020992	TTC	2	6	115866	115871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692530
3103	NC_020992	TTA	2	6	115882	115887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692530
3104	NC_020992	TTGA	2	8	115904	115911	25 %	50 %	25 %	0 %	478692530
3105	NC_020992	TAA	2	6	115979	115984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692530
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3107	NC_020992	AAT	2	6	116022	116027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692530
3108	NC_020992	ATA	3	9	116069	116077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692530
3109	NC_020992	TAT	2	6	116081	116086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692530
3110	NC_020992	T	6	6	116091	116096	0 %	100 %	0 %	0 %	478692530
3111	NC_020992	ATT	2	6	116152	116157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692530
3112	NC_020992	TTG	2	6	116181	116186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478692530
3113	NC_020992	TTTA	2	8	116187	116194	25 %	75 %	0 %	0 %	478692530
3114	NC_020992	T	6	6	116227	116232	0 %	100 %	0 %	0 %	478692530
3115	NC_020992	T	7	7	116286	116292	0 %	100 %	0 %	0 %	478692530
3116	NC_020992	ATC	3	9	116295	116303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692530
3117	NC_020992	T	8	8	116325	116332	0 %	100 %	0 %	0 %	478692530
3118	NC_020992	A	6	6	116422	116427	100 %	0 %	0 %	0 %	478692530
3119	NC_020992	ATA	2	6	116463	116468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692530
3120	NC_020992	AAT	2	6	116474	116479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692530
3121	NC_020992	TCA	2	6	116524	116529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692530
3122	NC_020992	TAA	2	6	116532	116537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692530
3123	NC_020992	T	6	6	116582	116587	0 %	100 %	0 %	0 %	478692530
3124	NC_020992	CCA	2	6	116590	116595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478692530
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3127	NC_020992	AGCA	2	8	116637	116644	50 %	0 %	25 %	25 %	478692530
3128	NC_020992	TCCA	2	8	116672	116679	25 %	25 %	0 %	50 %	478692530
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