MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 5564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020125	GATT	2	8	330	337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020125	GTAT	2	8	1399	1406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020125	TTGT	2	8	1604	1611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020125	CTAT	2	8	2313	2320	25 %	50 %	0 %	25 %	442313699
5	NC_020125	AAAG	2	8	2446	2453	75 %	0 %	25 %	0 %	442313699
6	NC_020125	TCCG	2	8	2871	2878	0 %	25 %	25 %	50 %	442313699
7	NC_020125	TATC	2	8	3014	3021	25 %	50 %	0 %	25 %	442313700
8	NC_020125	ATAG	2	8	3394	3401	50 %	25 %	25 %	0 %	442313700
9	NC_020125	AAAC	2	8	4434	4441	75 %	0 %	0 %	25 %	442313701
10	NC_020125	TCTT	2	8	5223	5230	0 %	75 %	0 %	25 %	442313701
11	NC_020125	TTAA	2	8	7586	7593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020125	GGCA	2	8	7868	7875	25 %	0 %	50 %	25 %	442313703
13	NC_020125	CATG	2	8	8313	8320	25 %	25 %	25 %	25 %	442313703
14	NC_020125	TTTC	2	8	9006	9013	0 %	75 %	0 %	25 %	442313703
15	NC_020125	GAGT	2	8	9760	9767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020125	GGTC	2	8	9811	9818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020125	CAAA	2	8	10136	10143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020125	ATAG	2	8	10668	10675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020125	CCTT	2	8	11415	11422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020125	AGTA	2	8	11735	11742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020125	TCCA	2	8	11796	11803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020125	TCGC	2	8	12913	12920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020125	TTTC	2	8	13145	13152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020125	CGCT	2	8	13237	13244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020125	AGGC	2	8	13353	13360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020125	TCTT	2	8	13555	13562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020125	TAAG	2	8	13630	13637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020125	TGTT	2	8	16181	16188	0 %	75 %	25 %	0 %	442313705
29	NC_020125	ATTT	2	8	17222	17229	25 %	75 %	0 %	0 %	442313706
30	NC_020125	CCTT	2	8	18014	18021	0 %	50 %	0 %	50 %	442313707
31	NC_020125	CTTT	2	8	18268	18275	0 %	75 %	0 %	25 %	442313708
32	NC_020125	TATT	2	8	18492	18499	25 %	75 %	0 %	0 %	442313708
33	NC_020125	TAAA	2	8	19914	19921	75 %	25 %	0 %	0 %	442313710
34	NC_020125	AATC	2	8	19976	19983	50 %	25 %	0 %	25 %	442313710
35	NC_020125	TTTC	2	8	20431	20438	0 %	75 %	0 %	25 %	442313710
36	NC_020125	TGGG	2	8	20527	20534	0 %	25 %	75 %	0 %	442313710
37	NC_020125	TCTT	2	8	21580	21587	0 %	75 %	0 %	25 %	442313711
38	NC_020125	TATT	2	8	22517	22524	25 %	75 %	0 %	0 %	442313711
39	NC_020125	CCAT	2	8	22593	22600	25 %	25 %	0 %	50 %	442313711
40	NC_020125	TAAA	2	8	22908	22915	75 %	25 %	0 %	0 %	442313712
41	NC_020125	TTTC	2	8	23019	23026	0 %	75 %	0 %	25 %	442313712
42	NC_020125	AGTT	2	8	23394	23401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020125	TATT	2	8	23402	23409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020125	TATC	2	8	24311	24318	25 %	50 %	0 %	25 %	442313715
45	NC_020125	TAAG	2	8	24373	24380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020125	GTAA	2	8	24597	24604	50 %	25 %	25 %	0 %	442313716
47	NC_020125	CAAA	2	8	24877	24884	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020125	GCTT	2	8	24977	24984	0 %	50 %	25 %	25 %	442313717
49	NC_020125	TTTA	2	8	26935	26942	25 %	75 %	0 %	0 %	442313720
50	NC_020125	CTTA	2	8	27212	27219	25 %	50 %	0 %	25 %	442313721
51	NC_020125	AGTA	2	8	27554	27561	50 %	25 %	25 %	0 %	442313721
52	NC_020125	TGAT	2	8	27949	27956	25 %	50 %	25 %	0 %	442313721
53	NC_020125	TGTC	2	8	28186	28193	0 %	50 %	25 %	25 %	442313722
54	NC_020125	AGTA	2	8	28313	28320	50 %	25 %	25 %	0 %	442313722
55	NC_020125	AATA	2	8	28849	28856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020125	TAAG	2	8	29180	29187	50 %	25 %	25 %	0 %	442313723
57	NC_020125	TCTT	2	8	29679	29686	0 %	75 %	0 %	25 %	442313724
58	NC_020125	TCTG	2	8	29776	29783	0 %	50 %	25 %	25 %	442313724
59	NC_020125	ATGT	2	8	30720	30727	25 %	50 %	25 %	0 %	442313724
60	NC_020125	TATC	2	8	30781	30788	25 %	50 %	0 %	25 %	442313724
61	NC_020125	TGGT	2	8	30865	30872	0 %	50 %	50 %	0 %	442313724
62	NC_020125	TTTA	2	8	31227	31234	25 %	75 %	0 %	0 %	442313724
63	NC_020125	ATTC	2	8	31413	31420	25 %	50 %	0 %	25 %	442313724
64	NC_020125	TTTA	2	8	31980	31987	25 %	75 %	0 %	0 %	442313725
65	NC_020125	TTGT	2	8	32382	32389	0 %	75 %	25 %	0 %	442313725
66	NC_020125	GATT	2	8	32810	32817	25 %	50 %	25 %	0 %	442313725
67	NC_020125	AAAC	2	8	33135	33142	75 %	0 %	0 %	25 %	442313725
68	NC_020125	CTTT	2	8	33549	33556	0 %	75 %	0 %	25 %	442313725
69	NC_020125	TCAA	2	8	33689	33696	50 %	25 %	0 %	25 %	442313725
70	NC_020125	TGAA	2	8	33933	33940	50 %	25 %	25 %	0 %	442313726
71	NC_020125	AAAC	2	8	33946	33953	75 %	0 %	0 %	25 %	442313726
72	NC_020125	AATT	2	8	34146	34153	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
73	NC_020125	TTAA	2	8	35046	35053	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
74	NC_020125	GGTA	2	8	35159	35166	25 %	25 %	50 %	0 %	442313727
75	NC_020125	CTGT	2	8	35212	35219	0 %	50 %	25 %	25 %	442313727
76	NC_020125	GAAC	2	8	35742	35749	50 %	0 %	25 %	25 %	442313727
77	NC_020125	GGTC	2	8	36265	36272	0 %	25 %	50 %	25 %	442313727
78	NC_020125	ATCA	2	8	36326	36333	50 %	25 %	0 %	25 %	442313727
79	NC_020125	TCTA	2	8	37166	37173	25 %	50 %	0 %	25 %	442313727
80	NC_020125	AAGT	2	8	37346	37353	50 %	25 %	25 %	0 %	442313727
81	NC_020125	AAGA	2	8	37792	37799	75 %	0 %	25 %	0 %	442313727
82	NC_020125	AACG	2	8	38079	38086	50 %	0 %	25 %	25 %	442313727
83	NC_020125	GCAT	2	8	38791	38798	25 %	25 %	25 %	25 %	442313728
84	NC_020125	CCAA	2	8	39006	39013	50 %	0 %	0 %	50 %	442313728
85	NC_020125	ACGA	2	8	39120	39127	50 %	0 %	25 %	25 %	442313728
86	NC_020125	GAAG	2	8	39232	39239	50 %	0 %	50 %	0 %	442313728
87	NC_020125	AATT	2	8	39318	39325	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
88	NC_020125	TTAA	2	8	39328	39335	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
89	NC_020125	ACTG	2	8	39394	39401	25 %	25 %	25 %	25 %	442313728
90	NC_020125	TTGG	2	8	40134	40141	0 %	50 %	50 %	0 %	442313728
91	NC_020125	CATT	2	8	40991	40998	25 %	50 %	0 %	25 %	442313728
92	NC_020125	AGTA	2	8	41169	41176	50 %	25 %	25 %	0 %	442313728
93	NC_020125	ACCT	2	8	41229	41236	25 %	25 %	0 %	50 %	442313728
94	NC_020125	TCTA	2	8	41490	41497	25 %	50 %	0 %	25 %	442313728
95	NC_020125	TTTC	2	8	41509	41516	0 %	75 %	0 %	25 %	442313728
96	NC_020125	TCCA	2	8	41770	41777	25 %	25 %	0 %	50 %	442313728
97	NC_020125	TAAG	2	8	42031	42038	50 %	25 %	25 %	0 %	442313728
98	NC_020125	AATT	2	8	42275	42282	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
99	NC_020125	CTGA	2	8	42974	42981	25 %	25 %	25 %	25 %	442313729
100	NC_020125	CCAC	2	8	42996	43003	25 %	0 %	0 %	75 %	442313729
101	NC_020125	ATTT	2	8	46202	46209	25 %	75 %	0 %	0 %	442313731
102	NC_020125	TTTA	2	8	48959	48966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020125	AGAA	2	8	49462	49469	75 %	0 %	25 %	0 %	442313735
104	NC_020125	TAAG	2	8	49582	49589	50 %	25 %	25 %	0 %	442313735
105	NC_020125	CATT	2	8	49824	49831	25 %	50 %	0 %	25 %	442313735
106	NC_020125	CTAC	2	8	50786	50793	25 %	25 %	0 %	50 %	442313737
107	NC_020125	CTTT	2	8	51069	51076	0 %	75 %	0 %	25 %	442313737
108	NC_020125	TGTT	2	8	51081	51088	0 %	75 %	25 %	0 %	442313737
109	NC_020125	ATCA	2	8	51441	51448	50 %	25 %	0 %	25 %	442313738
110	NC_020125	CATC	2	8	51509	51516	25 %	25 %	0 %	50 %	442313738
111	NC_020125	CTCA	2	8	51843	51850	25 %	25 %	0 %	50 %	442313738
112	NC_020125	ATTA	2	8	51870	51877	50 %	50 %	0 %	0 %	442313739
113	NC_020125	TATT	2	8	52222	52229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020125	CCAC	2	8	52876	52883	25 %	0 %	0 %	75 %	442313740
115	NC_020125	CCAT	2	8	53133	53140	25 %	25 %	0 %	50 %	442313740
116	NC_020125	CTTT	2	8	53259	53266	0 %	75 %	0 %	25 %	442313740
117	NC_020125	ATCA	2	8	53928	53935	50 %	25 %	0 %	25 %	442313741
118	NC_020125	TTCT	2	8	54048	54055	0 %	75 %	0 %	25 %	442313741
119	NC_020125	CTTC	2	8	54296	54303	0 %	50 %	0 %	50 %	442313741
120	NC_020125	TTTA	2	8	54955	54962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020125	GTCC	2	8	55050	55057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020125	TCTT	2	8	55290	55297	0 %	75 %	0 %	25 %	442313742
123	NC_020125	ATTT	2	8	55492	55499	25 %	75 %	0 %	0 %	442313742
124	NC_020125	TTTC	2	8	55601	55608	0 %	75 %	0 %	25 %	442313743
125	NC_020125	CTTT	3	12	55898	55909	0 %	75 %	0 %	25 %	442313743
126	NC_020125	TTTA	2	8	56084	56091	25 %	75 %	0 %	0 %	442313743
127	NC_020125	ATAA	2	8	56482	56489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020125	ATTT	2	8	56844	56851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020125	TATC	2	8	57151	57158	25 %	50 %	0 %	25 %	442313745
130	NC_020125	TTTA	2	8	57786	57793	25 %	75 %	0 %	0 %	442313746
131	NC_020125	CTAT	2	8	58474	58481	25 %	50 %	0 %	25 %	442313746
132	NC_020125	CTTT	2	8	58633	58640	0 %	75 %	0 %	25 %	442313746
133	NC_020125	GCTT	2	8	59157	59164	0 %	50 %	25 %	25 %	442313747
134	NC_020125	ATAA	2	8	59556	59563	75 %	25 %	0 %	0 %	442313747
135	NC_020125	ATTG	4	16	60241	60256	25 %	50 %	25 %	0 %	442313749
136	NC_020125	CTCC	2	8	61176	61183	0 %	25 %	0 %	75 %	442313750
137	NC_020125	AGAT	2	8	61558	61565	50 %	25 %	25 %	0 %	442313751
138	NC_020125	AAAG	2	8	61566	61573	75 %	0 %	25 %	0 %	442313751
139	NC_020125	TCAA	2	8	61639	61646	50 %	25 %	0 %	25 %	442313751
140	NC_020125	TAAA	2	8	61666	61673	75 %	25 %	0 %	0 %	442313751
141	NC_020125	CCCT	2	8	62080	62087	0 %	25 %	0 %	75 %	442313751
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143	NC_020125	CTTT	2	8	62143	62150	0 %	75 %	0 %	25 %	442313751
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