MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020125	GAC	2	6	176909	176914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313869
4002	NC_020125	ATAAA	2	10	176967	176976	80 %	20 %	0 %	0 %	442313870
4003	NC_020125	ATA	2	6	177000	177005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313870
4004	NC_020125	AGAA	2	8	177011	177018	75 %	0 %	25 %	0 %	442313870
4005	NC_020125	AG	3	6	177057	177062	50 %	0 %	50 %	0 %	442313870
4006	NC_020125	ATTAC	2	10	177147	177156	40 %	40 %	0 %	20 %	442313870
4007	NC_020125	AGATA	2	10	177157	177166	60 %	20 %	20 %	0 %	442313870
4008	NC_020125	A	6	6	177171	177176	100 %	0 %	0 %	0 %	442313870
4009	NC_020125	TCCG	2	8	177250	177257	0 %	25 %	25 %	50 %	442313870
4010	NC_020125	TCA	2	6	177270	177275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313870
4011	NC_020125	TCA	2	6	177393	177398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313870
4012	NC_020125	GTT	2	6	177411	177416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313870
4013	NC_020125	AAAACC	2	12	177542	177553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313870
4014	NC_020125	AGGCA	2	10	177601	177610	40 %	0 %	40 %	20 %	442313870
4015	NC_020125	GTT	2	6	177678	177683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313870
4016	NC_020125	TCA	2	6	177727	177732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313871
4017	NC_020125	CTC	2	6	178070	178075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313871
4018	NC_020125	TAT	2	6	178132	178137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313871
4019	NC_020125	GCA	2	6	178140	178145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313871
4020	NC_020125	AGT	2	6	178160	178165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313871
4021	NC_020125	T	7	7	178208	178214	0 %	100 %	0 %	0 %	442313871
4022	NC_020125	A	6	6	178285	178290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_020125	ATC	2	6	178341	178346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_020125	ATA	2	6	178413	178418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020125	A	7	7	178420	178426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020125	ACA	2	6	178463	178468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313872
4027	NC_020125	AAC	2	6	178471	178476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313872
4028	NC_020125	GTG	2	6	178544	178549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313872
4029	NC_020125	GAA	2	6	178611	178616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313872
4030	NC_020125	A	6	6	178638	178643	100 %	0 %	0 %	0 %	442313872
4031	NC_020125	TGG	2	6	178701	178706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313872
4032	NC_020125	CGC	2	6	178757	178762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313872
4033	NC_020125	AAC	2	6	178800	178805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313872
4034	NC_020125	CCG	2	6	178865	178870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313872
4035	NC_020125	CAAC	2	8	178901	178908	50 %	0 %	0 %	50 %	442313872
4036	NC_020125	GGT	2	6	178986	178991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313872
4037	NC_020125	AG	3	6	178992	178997	50 %	0 %	50 %	0 %	442313872
4038	NC_020125	AGC	2	6	179051	179056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313872
4039	NC_020125	GCA	2	6	179112	179117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313872
4040	NC_020125	TAC	2	6	179198	179203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313872
4041	NC_020125	GGA	2	6	179253	179258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313872
4042	NC_020125	ACGGAA	2	12	179278	179289	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	442313872
4043	NC_020125	GAC	2	6	179414	179419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313872
4044	NC_020125	AGG	2	6	179530	179535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313872
4045	NC_020125	ATG	2	6	179580	179585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313872
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4047	NC_020125	AC	3	6	179700	179705	50 %	0 %	0 %	50 %	442313872
4048	NC_020125	AAG	2	6	179752	179757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313872
4049	NC_020125	CAG	2	6	179782	179787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313872
4050	NC_020125	AC	3	6	179794	179799	50 %	0 %	0 %	50 %	442313872
4051	NC_020125	A	6	6	179830	179835	100 %	0 %	0 %	0 %	442313872
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4054	NC_020125	TAAA	2	8	179989	179996	75 %	25 %	0 %	0 %	442313872
4055	NC_020125	A	7	7	180036	180042	100 %	0 %	0 %	0 %	442313872
4056	NC_020125	AGG	2	6	180068	180073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313872
4057	NC_020125	TGC	2	6	180077	180082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313872
4058	NC_020125	AGC	2	6	180092	180097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313872
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4060	NC_020125	A	6	6	180225	180230	100 %	0 %	0 %	0 %	442313872
4061	NC_020125	AGA	2	6	180248	180253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313872
4062	NC_020125	TAG	2	6	180310	180315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313872
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4064	NC_020125	GT	3	6	180361	180366	0 %	50 %	50 %	0 %	442313872
4065	NC_020125	CAG	2	6	180439	180444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313872
4066	NC_020125	ACA	2	6	180457	180462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313872
4067	NC_020125	GAC	2	6	180567	180572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313872
4068	NC_020125	TTTGA	2	10	180636	180645	20 %	60 %	20 %	0 %	442313872
4069	NC_020125	AAT	2	6	180646	180651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313872
4070	NC_020125	T	7	7	180656	180662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_020125	TCA	2	6	180682	180687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_020125	T	7	7	180702	180708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_020125	GAT	2	6	180713	180718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_020125	A	7	7	180857	180863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_020125	TAT	2	6	180872	180877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_020125	A	7	7	180937	180943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_020125	A	6	6	181050	181055	100 %	0 %	0 %	0 %	442313873
4081	NC_020125	TGA	2	6	181106	181111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313873
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4083	NC_020125	TGT	2	6	181137	181142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313873
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4091	NC_020125	A	6	6	181447	181452	100 %	0 %	0 %	0 %	442313873
4092	NC_020125	TAT	2	6	181509	181514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_020125	ATT	2	6	181587	181592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313874
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4095	NC_020125	ATTTA	2	10	181641	181650	40 %	60 %	0 %	0 %	442313874
4096	NC_020125	A	7	7	181702	181708	100 %	0 %	0 %	0 %	442313874
4097	NC_020125	ATT	2	6	181741	181746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313874
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4101	NC_020125	ATTAA	2	10	181822	181831	60 %	40 %	0 %	0 %	442313874
4102	NC_020125	GT	3	6	181846	181851	0 %	50 %	50 %	0 %	442313874
4103	NC_020125	ATC	2	6	181860	181865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313874
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4106	NC_020125	ATT	2	6	181948	181953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313874
4107	NC_020125	CTTT	2	8	181964	181971	0 %	75 %	0 %	25 %	442313874
4108	NC_020125	GAT	2	6	182009	182014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313874
4109	NC_020125	T	6	6	182028	182033	0 %	100 %	0 %	0 %	442313874
4110	NC_020125	A	6	6	182035	182040	100 %	0 %	0 %	0 %	442313874
4111	NC_020125	TTC	2	6	182049	182054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313874
4112	NC_020125	TCAG	2	8	182080	182087	25 %	25 %	25 %	25 %	442313874
4113	NC_020125	ATT	2	6	182163	182168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313874
4114	NC_020125	AAT	2	6	182231	182236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313874
4115	NC_020125	AACT	2	8	182283	182290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_020125	GT	3	6	182291	182296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020125	TAA	3	9	182303	182311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020125	T	6	6	182343	182348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020125	TTC	2	6	182352	182357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_020125	TAA	2	6	182361	182366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020125	TAG	2	6	182369	182374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020125	TAGAA	2	10	182404	182413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020125	A	6	6	182415	182420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020125	A	6	6	182456	182461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020125	AAT	2	6	182504	182509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4127	NC_020125	TA	3	6	182571	182576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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