MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020125	AT	3	6	110244	110249	50 %	50 %	0 %	0 %	442313796
2502	NC_020125	TCT	3	9	110365	110373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313797
2503	NC_020125	TCC	2	6	110389	110394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313797
2504	NC_020125	TCA	2	6	110438	110443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313797
2505	NC_020125	AGT	2	6	110476	110481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020125	TGT	2	6	110503	110508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020125	ATTT	2	8	110539	110546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020125	CCCAT	2	10	110578	110587	20 %	20 %	0 %	60 %	442313798
2509	NC_020125	TTCCA	2	10	110605	110614	20 %	40 %	0 %	40 %	442313798
2510	NC_020125	AG	3	6	110628	110633	50 %	0 %	50 %	0 %	442313798
2511	NC_020125	TGA	2	6	110678	110683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313798
2512	NC_020125	TA	3	6	110725	110730	50 %	50 %	0 %	0 %	442313798
2513	NC_020125	C	6	6	110771	110776	0 %	0 %	0 %	100 %	442313798
2514	NC_020125	ATT	2	6	110855	110860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313798
2515	NC_020125	CTC	2	6	110861	110866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313798
2516	NC_020125	GT	3	6	110909	110914	0 %	50 %	50 %	0 %	442313798
2517	NC_020125	CT	3	6	110923	110928	0 %	50 %	0 %	50 %	442313798
2518	NC_020125	TGC	2	6	110978	110983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313798
2519	NC_020125	T	6	6	111007	111012	0 %	100 %	0 %	0 %	442313798
2520	NC_020125	T	6	6	111020	111025	0 %	100 %	0 %	0 %	442313798
2521	NC_020125	CTT	2	6	111034	111039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2522	NC_020125	TCT	2	6	111087	111092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2523	NC_020125	AGC	2	6	111107	111112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313798
2524	NC_020125	GCT	2	6	111135	111140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313798
2525	NC_020125	TCT	2	6	111168	111173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2526	NC_020125	CAT	2	6	111202	111207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313798
2527	NC_020125	CTT	2	6	111212	111217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2528	NC_020125	AGC	2	6	111239	111244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313798
2529	NC_020125	T	7	7	111257	111263	0 %	100 %	0 %	0 %	442313798
2530	NC_020125	CTTTCT	2	12	111264	111275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2531	NC_020125	CT	3	6	111335	111340	0 %	50 %	0 %	50 %	442313798
2532	NC_020125	CTT	3	9	111379	111387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2533	NC_020125	AGC	2	6	111395	111400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313798
2534	NC_020125	TTC	2	6	111407	111412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2535	NC_020125	TAT	2	6	111416	111421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313798
2536	NC_020125	TGCT	2	8	111455	111462	0 %	50 %	25 %	25 %	442313798
2537	NC_020125	TCT	2	6	111507	111512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2538	NC_020125	AAT	2	6	111513	111518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313798
2539	NC_020125	TTTC	2	8	111583	111590	0 %	75 %	0 %	25 %	442313798
2540	NC_020125	CTG	2	6	111634	111639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313798
2541	NC_020125	T	6	6	111662	111667	0 %	100 %	0 %	0 %	442313798
2542	NC_020125	CTT	2	6	111705	111710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2543	NC_020125	T	6	6	111804	111809	0 %	100 %	0 %	0 %	442313798
2544	NC_020125	CAGC	2	8	111817	111824	25 %	0 %	25 %	50 %	442313798
2545	NC_020125	T	6	6	111827	111832	0 %	100 %	0 %	0 %	442313798
2546	NC_020125	TTA	2	6	111837	111842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313798
2547	NC_020125	ATC	2	6	111866	111871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313798
2548	NC_020125	TTTC	2	8	111886	111893	0 %	75 %	0 %	25 %	442313798
2549	NC_020125	TC	3	6	111913	111918	0 %	50 %	0 %	50 %	442313798
2550	NC_020125	T	7	7	111928	111934	0 %	100 %	0 %	0 %	442313798
2551	NC_020125	CCT	2	6	111970	111975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313798
2552	NC_020125	T	6	6	112016	112021	0 %	100 %	0 %	0 %	442313798
2553	NC_020125	TC	3	6	112035	112040	0 %	50 %	0 %	50 %	442313798
2554	NC_020125	GCT	2	6	112045	112050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313798
2555	NC_020125	TCT	2	6	112054	112059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313798
2556	NC_020125	A	7	7	112063	112069	100 %	0 %	0 %	0 %	442313798
2557	NC_020125	A	6	6	112095	112100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020125	CTT	2	6	112129	112134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313799
2559	NC_020125	ATT	2	6	112141	112146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313799
2560	NC_020125	T	8	8	112215	112222	0 %	100 %	0 %	0 %	442313799
2561	NC_020125	TAA	2	6	112230	112235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313799
2562	NC_020125	AAT	2	6	112254	112259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313799
2563	NC_020125	A	6	6	112287	112292	100 %	0 %	0 %	0 %	442313799
2564	NC_020125	CTA	2	6	112334	112339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313799
2565	NC_020125	CTTAC	2	10	112382	112391	20 %	40 %	0 %	40 %	442313799
2566	NC_020125	CTA	2	6	112395	112400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313799
2567	NC_020125	T	6	6	112404	112409	0 %	100 %	0 %	0 %	442313799
2568	NC_020125	GT	3	6	112440	112445	0 %	50 %	50 %	0 %	442313799
2569	NC_020125	AATCA	2	10	112450	112459	60 %	20 %	0 %	20 %	442313799
2570	NC_020125	TCC	2	6	112488	112493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313799
2571	NC_020125	TAAGA	2	10	112551	112560	60 %	20 %	20 %	0 %	442313799
2572	NC_020125	TAT	2	6	112584	112589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313799
2573	NC_020125	AAC	2	6	112646	112651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313799
2574	NC_020125	CTTT	2	8	112671	112678	0 %	75 %	0 %	25 %	442313799
2575	NC_020125	TA	3	6	112687	112692	50 %	50 %	0 %	0 %	442313799
2576	NC_020125	GAT	2	6	112769	112774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313799
2577	NC_020125	ATT	2	6	112786	112791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313799
2578	NC_020125	A	7	7	112793	112799	100 %	0 %	0 %	0 %	442313799
2579	NC_020125	GGT	2	6	112835	112840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313799
2580	NC_020125	CGGA	2	8	112842	112849	25 %	0 %	50 %	25 %	442313799
2581	NC_020125	TGC	2	6	112856	112861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313799
2582	NC_020125	TAA	2	6	112897	112902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313799
2583	NC_020125	ATA	2	6	112916	112921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313799
2584	NC_020125	A	6	6	112949	112954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_020125	AGAA	2	8	112980	112987	75 %	0 %	25 %	0 %	442313800
2586	NC_020125	T	6	6	113093	113098	0 %	100 %	0 %	0 %	442313800
2587	NC_020125	TAT	2	6	113141	113146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313800
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2589	NC_020125	GGA	2	6	113212	113217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313800
2590	NC_020125	ATA	2	6	113218	113223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313800
2591	NC_020125	CTT	2	6	113267	113272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313800
2592	NC_020125	TTG	2	6	113317	113322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313800
2593	NC_020125	ATCC	2	8	113328	113335	25 %	25 %	0 %	50 %	442313800
2594	NC_020125	TACCT	2	10	113343	113352	20 %	40 %	0 %	40 %	442313800
2595	NC_020125	TGT	2	6	113394	113399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313800
2596	NC_020125	ATTAT	2	10	113422	113431	40 %	60 %	0 %	0 %	442313800
2597	NC_020125	ATA	2	6	113437	113442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313800
2598	NC_020125	TAAT	2	8	113443	113450	50 %	50 %	0 %	0 %	442313800
2599	NC_020125	CTC	2	6	113451	113456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313800
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2601	NC_020125	TAA	2	6	113482	113487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313800
2602	NC_020125	TAA	2	6	113543	113548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313800
2603	NC_020125	ATC	2	6	113556	113561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313800
2604	NC_020125	TAACT	2	10	113562	113571	40 %	40 %	0 %	20 %	442313800
2605	NC_020125	TCT	2	6	113590	113595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313800
2606	NC_020125	T	6	6	113598	113603	0 %	100 %	0 %	0 %	442313800
2607	NC_020125	CTA	2	6	113672	113677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313800
2608	NC_020125	TCA	2	6	113806	113811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313800
2609	NC_020125	AAT	2	6	113823	113828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313800
2610	NC_020125	TCT	2	6	113872	113877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313800
2611	NC_020125	TAT	2	6	113979	113984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313800
2612	NC_020125	TCC	2	6	114044	114049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2613	NC_020125	TTC	2	6	114115	114120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313801
2614	NC_020125	A	6	6	114125	114130	100 %	0 %	0 %	0 %	442313801
2615	NC_020125	CAT	2	6	114300	114305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313801
2616	NC_020125	CAA	2	6	114318	114323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313801
2617	NC_020125	CGC	2	6	114390	114395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313801
2618	NC_020125	CAA	2	6	114419	114424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313801
2619	NC_020125	TAA	2	6	114463	114468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313801
2620	NC_020125	CAC	2	6	114489	114494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313801
2621	NC_020125	AAT	2	6	114495	114500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313801
2622	NC_020125	TAA	2	6	114539	114544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313801
2623	NC_020125	TAC	2	6	114570	114575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313801
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2752	NC_020125	GGA	2	6	119520	119525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313806
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2755	NC_020125	TAA	2	6	119636	119641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313806
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2763	NC_020125	GAAA	2	8	120073	120080	75 %	0 %	25 %	0 %	442313806
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2860	NC_020125	A	6	6	123539	123544	100 %	0 %	0 %	0 %	442313810
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2862	NC_020125	T	9	9	123665	123673	0 %	100 %	0 %	0 %	442313810
2863	NC_020125	TAT	2	6	123688	123693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313810
2864	NC_020125	A	6	6	123696	123701	100 %	0 %	0 %	0 %	442313810
2865	NC_020125	ATA	2	6	123731	123736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313810
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2870	NC_020125	T	7	7	123925	123931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2871	NC_020125	TGA	2	6	123935	123940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2873	NC_020125	TAACC	2	10	123970	123979	40 %	20 %	0 %	40 %	442313811
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2875	NC_020125	T	6	6	124012	124017	0 %	100 %	0 %	0 %	442313811
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