MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020125	CAC	2	6	45937	45942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313730
1002	NC_020125	TAG	2	6	45990	45995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313730
1003	NC_020125	CAG	2	6	46002	46007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313730
1004	NC_020125	AT	4	8	46086	46093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020125	T	8	8	46107	46114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020125	T	6	6	46119	46124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020125	A	6	6	46160	46165	100 %	0 %	0 %	0 %	442313731
1008	NC_020125	GGA	3	9	46171	46179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313731
1009	NC_020125	AT	3	6	46187	46192	50 %	50 %	0 %	0 %	442313731
1010	NC_020125	ATTT	2	8	46202	46209	25 %	75 %	0 %	0 %	442313731
1011	NC_020125	TAA	2	6	46211	46216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313731
1012	NC_020125	A	6	6	46233	46238	100 %	0 %	0 %	0 %	442313731
1013	NC_020125	A	6	6	46294	46299	100 %	0 %	0 %	0 %	442313731
1014	NC_020125	A	6	6	46313	46318	100 %	0 %	0 %	0 %	442313731
1015	NC_020125	ATT	2	6	46359	46364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313731
1016	NC_020125	AAT	2	6	46385	46390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313731
1017	NC_020125	CTT	2	6	46405	46410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313731
1018	NC_020125	TGT	2	6	46412	46417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313731
1019	NC_020125	TCC	2	6	46450	46455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313731
1020	NC_020125	T	8	8	46469	46476	0 %	100 %	0 %	0 %	442313731
1021	NC_020125	AAT	2	6	46515	46520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313731
1022	NC_020125	ATT	2	6	46536	46541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313731
1023	NC_020125	CTC	2	6	46571	46576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313731
1024	NC_020125	ACC	2	6	46619	46624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313731
1025	NC_020125	TGG	2	6	46635	46640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313731
1026	NC_020125	ATTCT	2	10	46663	46672	20 %	60 %	0 %	20 %	442313731
1027	NC_020125	TTTTAA	2	12	46725	46736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020125	ATC	2	6	46813	46818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313732
1029	NC_020125	ACC	2	6	46823	46828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313732
1030	NC_020125	ACT	2	6	46927	46932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313732
1031	NC_020125	TAT	2	6	47013	47018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313732
1032	NC_020125	TAT	2	6	47046	47051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313732
1033	NC_020125	TAT	2	6	47115	47120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313732
1034	NC_020125	T	7	7	47171	47177	0 %	100 %	0 %	0 %	442313732
1035	NC_020125	ATT	2	6	47182	47187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313732
1036	NC_020125	TAA	2	6	47194	47199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313732
1037	NC_020125	TGA	2	6	47203	47208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313732
1038	NC_020125	TAT	2	6	47296	47301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313732
1039	NC_020125	T	7	7	47301	47307	0 %	100 %	0 %	0 %	442313732
1040	NC_020125	TC	3	6	47340	47345	0 %	50 %	0 %	50 %	442313733
1041	NC_020125	ACA	2	6	47387	47392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313733
1042	NC_020125	AGT	2	6	47437	47442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313733
1043	NC_020125	CAT	2	6	47452	47457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313733
1044	NC_020125	CCA	2	6	47549	47554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313733
1045	NC_020125	TGA	2	6	47638	47643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313733
1046	NC_020125	CAT	2	6	47691	47696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313733
1047	NC_020125	ATT	3	9	47704	47712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313733
1048	NC_020125	TTGAA	2	10	47755	47764	40 %	40 %	20 %	0 %	442313733
1049	NC_020125	GAA	3	9	47762	47770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313733
1050	NC_020125	GTA	2	6	47843	47848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313733
1051	NC_020125	CAA	2	6	47892	47897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313733
1052	NC_020125	GAATCT	2	12	47978	47989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442313733
1053	NC_020125	AAT	2	6	47997	48002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313733
1054	NC_020125	CCATCT	2	12	48011	48022	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	442313733
1055	NC_020125	CCT	2	6	48062	48067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313733
1056	NC_020125	TCCAT	2	10	48081	48090	20 %	40 %	0 %	40 %	442313733
1057	NC_020125	CTG	2	6	48157	48162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313733
1058	NC_020125	TA	3	6	48174	48179	50 %	50 %	0 %	0 %	442313733
1059	NC_020125	GCC	2	6	48215	48220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313733
1060	NC_020125	TCC	2	6	48227	48232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313733
1061	NC_020125	A	6	6	48233	48238	100 %	0 %	0 %	0 %	442313733
1062	NC_020125	A	6	6	48284	48289	100 %	0 %	0 %	0 %	442313733
1063	NC_020125	GCT	2	6	48419	48424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313733
1064	NC_020125	CCA	2	6	48425	48430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313733
1065	NC_020125	CAA	2	6	48486	48491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313733
1066	NC_020125	TAG	2	6	48519	48524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313733
1067	NC_020125	GTA	2	6	48572	48577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313733
1068	NC_020125	ACT	2	6	48646	48651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313733
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1070	NC_020125	CAT	2	6	48705	48710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313733
1071	NC_020125	AATCTA	2	12	48717	48728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442313733
1072	NC_020125	A	7	7	48771	48777	100 %	0 %	0 %	0 %	442313733
1073	NC_020125	AT	3	6	48814	48819	50 %	50 %	0 %	0 %	442313733
1074	NC_020125	T	7	7	48825	48831	0 %	100 %	0 %	0 %	442313733
1075	NC_020125	ATT	2	6	48879	48884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020125	AAG	2	6	48921	48926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020125	ACA	2	6	48930	48935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_020125	TGT	2	6	48939	48944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020125	CTT	2	6	48948	48953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_020125	TTTA	2	8	48959	48966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020125	ATT	2	6	48971	48976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313734
1082	NC_020125	CTT	2	6	49001	49006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313734
1083	NC_020125	CTT	2	6	49049	49054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313734
1084	NC_020125	GGAGCA	2	12	49060	49071	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	442313734
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1089	NC_020125	CAG	3	9	49214	49222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313734
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1093	NC_020125	TGT	2	6	49358	49363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020125	TAT	2	6	49375	49380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020125	T	6	6	49380	49385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020125	CTT	2	6	49428	49433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313735
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1098	NC_020125	TAAG	2	8	49582	49589	50 %	25 %	25 %	0 %	442313735
1099	NC_020125	T	6	6	49616	49621	0 %	100 %	0 %	0 %	442313735
1100	NC_020125	AAGTA	2	10	49747	49756	60 %	20 %	20 %	0 %	442313735
1101	NC_020125	T	6	6	49757	49762	0 %	100 %	0 %	0 %	442313735
1102	NC_020125	ACT	2	6	49763	49768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313735
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1107	NC_020125	GA	3	6	49981	49986	50 %	0 %	50 %	0 %	442313736
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1110	NC_020125	T	6	6	50074	50079	0 %	100 %	0 %	0 %	442313736
1111	NC_020125	AGC	2	6	50105	50110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313736
1112	NC_020125	CAG	2	6	50269	50274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313736
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1114	NC_020125	TCA	2	6	50331	50336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313736
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1116	NC_020125	AAC	2	6	50438	50443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313736
1117	NC_020125	CCT	2	6	50530	50535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313736
1118	NC_020125	CTT	2	6	50551	50556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313736
1119	NC_020125	T	7	7	50574	50580	0 %	100 %	0 %	0 %	442313736
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1122	NC_020125	TAG	2	6	50646	50651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313737
1123	NC_020125	ATCTT	2	10	50744	50753	20 %	60 %	0 %	20 %	442313737
1124	NC_020125	CTAC	2	8	50786	50793	25 %	25 %	0 %	50 %	442313737
1125	NC_020125	TC	3	6	50796	50801	0 %	50 %	0 %	50 %	442313737
1126	NC_020125	T	6	6	50821	50826	0 %	100 %	0 %	0 %	442313737
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1128	NC_020125	TAC	2	6	50911	50916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313737
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1136	NC_020125	A	6	6	51110	51115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1142	NC_020125	CA	3	6	51227	51232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1143	NC_020125	T	6	6	51245	51250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_020125	ACC	2	6	51261	51266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1253	NC_020125	TTA	2	6	55590	55595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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