MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020125	AAT	2	6	23808	23813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020125	ATT	2	6	23846	23851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020125	ATA	2	6	23885	23890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020125	TAT	2	6	23893	23898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020125	TA	3	6	23909	23914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020125	TAC	2	6	23946	23951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_020125	T	7	7	23980	23986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020125	T	6	6	24004	24009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020125	A	7	7	24018	24024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020125	TA	3	6	24101	24106	50 %	50 %	0 %	0 %	442313715
511	NC_020125	ATA	2	6	24108	24113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313715
512	NC_020125	CAG	2	6	24158	24163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313715
513	NC_020125	CAA	2	6	24215	24220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313715
514	NC_020125	TAG	2	6	24229	24234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313715
515	NC_020125	A	6	6	24285	24290	100 %	0 %	0 %	0 %	442313715
516	NC_020125	ACT	2	6	24304	24309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313715
517	NC_020125	TATC	2	8	24311	24318	25 %	50 %	0 %	25 %	442313715
518	NC_020125	TAAG	2	8	24373	24380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020125	T	6	6	24426	24431	0 %	100 %	0 %	0 %	442313716
520	NC_020125	CTT	2	6	24441	24446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313716
521	NC_020125	AGA	2	6	24457	24462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313716
522	NC_020125	TAA	2	6	24463	24468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313716
523	NC_020125	TCT	2	6	24554	24559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313716
524	NC_020125	ACT	2	6	24578	24583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313716
525	NC_020125	GTAA	2	8	24597	24604	50 %	25 %	25 %	0 %	442313716
526	NC_020125	ATCTAC	2	12	24676	24687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313716
527	NC_020125	CTG	2	6	24792	24797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313716
528	NC_020125	TATTT	2	10	24814	24823	20 %	80 %	0 %	0 %	442313716
529	NC_020125	TTC	2	6	24824	24829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313716
530	NC_020125	ATTAT	2	10	24842	24851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020125	CAAA	2	8	24877	24884	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_020125	TAT	2	6	24914	24919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313717
533	NC_020125	TTA	2	6	24920	24925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313717
534	NC_020125	GGT	2	6	24971	24976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313717
535	NC_020125	GCTT	2	8	24977	24984	0 %	50 %	25 %	25 %	442313717
536	NC_020125	TAA	2	6	25038	25043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313717
537	NC_020125	TCT	2	6	25130	25135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313717
538	NC_020125	ATA	2	6	25192	25197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313717
539	NC_020125	CTA	2	6	25203	25208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313717
540	NC_020125	TCT	2	6	25214	25219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313717
541	NC_020125	TCT	2	6	25316	25321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313718
542	NC_020125	TCT	2	6	25385	25390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313718
543	NC_020125	TCT	2	6	25508	25513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313718
544	NC_020125	T	8	8	25515	25522	0 %	100 %	0 %	0 %	442313718
545	NC_020125	T	7	7	25558	25564	0 %	100 %	0 %	0 %	442313718
546	NC_020125	TC	3	6	25611	25616	0 %	50 %	0 %	50 %	442313718
547	NC_020125	TCT	3	9	25634	25642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313718
548	NC_020125	GTC	2	6	25648	25653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313718
549	NC_020125	A	6	6	25682	25687	100 %	0 %	0 %	0 %	442313718
550	NC_020125	T	8	8	25715	25722	0 %	100 %	0 %	0 %	442313718
551	NC_020125	TTC	2	6	25726	25731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313718
552	NC_020125	TGA	2	6	25747	25752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313719
553	NC_020125	ATC	2	6	25788	25793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313719
554	NC_020125	TTC	2	6	25833	25838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313719
555	NC_020125	TCA	3	9	25873	25881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313719
556	NC_020125	T	6	6	25903	25908	0 %	100 %	0 %	0 %	442313719
557	NC_020125	CTACAT	2	12	25988	25999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313719
558	NC_020125	CTT	2	6	26078	26083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313719
559	NC_020125	GTT	2	6	26114	26119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313719
560	NC_020125	A	6	6	26137	26142	100 %	0 %	0 %	0 %	442313719
561	NC_020125	ATA	2	6	26278	26283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313719
562	NC_020125	TAT	2	6	26308	26313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020125	T	6	6	26346	26351	0 %	100 %	0 %	0 %	442313720
564	NC_020125	TCA	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313720
565	NC_020125	TAC	2	6	26371	26376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313720
566	NC_020125	T	6	6	26458	26463	0 %	100 %	0 %	0 %	442313720
567	NC_020125	GTA	2	6	26497	26502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313720
568	NC_020125	TTC	2	6	26530	26535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313720
569	NC_020125	TAA	2	6	26558	26563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313720
570	NC_020125	ATA	2	6	26696	26701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313720
571	NC_020125	T	7	7	26702	26708	0 %	100 %	0 %	0 %	442313720
572	NC_020125	TTC	2	6	26713	26718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313720
573	NC_020125	AAT	2	6	26777	26782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313720
574	NC_020125	CTT	2	6	26802	26807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313720
575	NC_020125	TCC	2	6	26816	26821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313720
576	NC_020125	ACC	2	6	26894	26899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313720
577	NC_020125	TTTA	2	8	26935	26942	25 %	75 %	0 %	0 %	442313720
578	NC_020125	CT	3	6	26954	26959	0 %	50 %	0 %	50 %	442313720
579	NC_020125	ACA	2	6	26983	26988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313720
580	NC_020125	ATT	2	6	27020	27025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313720
581	NC_020125	T	7	7	27024	27030	0 %	100 %	0 %	0 %	442313720
582	NC_020125	TA	3	6	27051	27056	50 %	50 %	0 %	0 %	442313720
583	NC_020125	T	7	7	27120	27126	0 %	100 %	0 %	0 %	442313720
584	NC_020125	ATA	2	6	27168	27173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020125	CTTA	2	8	27212	27219	25 %	50 %	0 %	25 %	442313721
586	NC_020125	A	6	6	27247	27252	100 %	0 %	0 %	0 %	442313721
587	NC_020125	GCA	2	6	27286	27291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313721
588	NC_020125	TTA	2	6	27349	27354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313721
589	NC_020125	T	7	7	27360	27366	0 %	100 %	0 %	0 %	442313721
590	NC_020125	TGA	2	6	27391	27396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313721
591	NC_020125	A	6	6	27446	27451	100 %	0 %	0 %	0 %	442313721
592	NC_020125	ACC	2	6	27457	27462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313721
593	NC_020125	CTT	2	6	27495	27500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313721
594	NC_020125	AGTA	2	8	27554	27561	50 %	25 %	25 %	0 %	442313721
595	NC_020125	T	6	6	27702	27707	0 %	100 %	0 %	0 %	442313721
596	NC_020125	TAA	2	6	27739	27744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313721
597	NC_020125	CCT	2	6	27803	27808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313721
598	NC_020125	TTA	2	6	27922	27927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313721
599	NC_020125	TGAT	2	8	27949	27956	25 %	50 %	25 %	0 %	442313721
600	NC_020125	AT	3	6	27955	27960	50 %	50 %	0 %	0 %	442313721
601	NC_020125	TAT	2	6	28024	28029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020125	A	7	7	28040	28046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020125	A	6	6	28059	28064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020125	TGTC	2	8	28186	28193	0 %	50 %	25 %	25 %	442313722
605	NC_020125	CTT	2	6	28261	28266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313722
606	NC_020125	CTA	2	6	28282	28287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313722
607	NC_020125	AGTA	2	8	28313	28320	50 %	25 %	25 %	0 %	442313722
608	NC_020125	AAT	2	6	28432	28437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313722
609	NC_020125	GCT	2	6	28461	28466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313722
610	NC_020125	AAT	2	6	28492	28497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313722
611	NC_020125	TAA	2	6	28543	28548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313722
612	NC_020125	GTG	2	6	28588	28593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313722
613	NC_020125	CTT	2	6	28606	28611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313722
614	NC_020125	ATA	2	6	28753	28758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313722
615	NC_020125	T	6	6	28806	28811	0 %	100 %	0 %	0 %	442313722
616	NC_020125	T	7	7	28838	28844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020125	AATA	2	8	28849	28856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020125	CTA	2	6	28911	28916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313723
619	NC_020125	CTG	2	6	28997	29002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313723
620	NC_020125	ACC	3	9	29007	29015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313723
621	NC_020125	TAA	2	6	29063	29068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313723
622	NC_020125	GAA	2	6	29163	29168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313723
623	NC_020125	TAAG	2	8	29180	29187	50 %	25 %	25 %	0 %	442313723
624	NC_020125	GTA	2	6	29248	29253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313723
625	NC_020125	CTC	2	6	29261	29266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313723
626	NC_020125	ACC	2	6	29388	29393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313723
627	NC_020125	CTT	2	6	29408	29413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313723
628	NC_020125	CTG	2	6	29444	29449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313723
629	NC_020125	T	6	6	29475	29480	0 %	100 %	0 %	0 %	442313723
630	NC_020125	TAT	2	6	29504	29509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020125	AAT	2	6	29519	29524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020125	CTT	2	6	29552	29557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313724
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764	NC_020125	TGC	2	6	35633	35638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313727
765	NC_020125	ATC	2	6	35667	35672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
766	NC_020125	CT	3	6	35716	35721	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
767	NC_020125	GAAC	2	8	35742	35749	50 %	0 %	25 %	25 %	442313727
768	NC_020125	TCT	2	6	35779	35784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
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770	NC_020125	AT	4	8	35846	35853	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
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772	NC_020125	TCA	2	6	35904	35909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
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774	NC_020125	CAT	2	6	36236	36241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
775	NC_020125	AT	3	6	36240	36245	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
776	NC_020125	ACC	2	6	36257	36262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313727
777	NC_020125	GGTC	2	8	36265	36272	0 %	25 %	50 %	25 %	442313727
778	NC_020125	ATCA	2	8	36326	36333	50 %	25 %	0 %	25 %	442313727
779	NC_020125	ATC	2	6	36389	36394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
780	NC_020125	CCG	2	6	36406	36411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313727
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785	NC_020125	TTC	2	6	36582	36587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
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793	NC_020125	TCTA	2	8	37166	37173	25 %	50 %	0 %	25 %	442313727
794	NC_020125	CT	3	6	37210	37215	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
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842	NC_020125	TCT	2	6	39388	39393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313728
843	NC_020125	ACTG	2	8	39394	39401	25 %	25 %	25 %	25 %	442313728
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849	NC_020125	GAA	2	6	39649	39654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313728
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853	NC_020125	AT	3	6	39845	39850	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
854	NC_020125	CTG	2	6	39860	39865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313728
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873	NC_020125	ATT	2	6	40683	40688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313728
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879	NC_020125	TTC	2	6	41075	41080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313728
880	NC_020125	GGT	2	6	41090	41095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313728
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882	NC_020125	ATG	2	6	41155	41160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313728
883	NC_020125	AGTA	2	8	41169	41176	50 %	25 %	25 %	0 %	442313728
884	NC_020125	ACCT	2	8	41229	41236	25 %	25 %	0 %	50 %	442313728
885	NC_020125	GAA	2	6	41262	41267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313728
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887	NC_020125	CTT	2	6	41348	41353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313728
888	NC_020125	ATG	2	6	41392	41397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313728
889	NC_020125	AAATC	2	10	41453	41462	60 %	20 %	0 %	20 %	442313728
890	NC_020125	TCTA	2	8	41490	41497	25 %	50 %	0 %	25 %	442313728
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