MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020125	CCG	2	6	267353	267358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313970
6003	NC_020125	CT	4	8	267405	267412	0 %	50 %	0 %	50 %	442313970
6004	NC_020125	AAAGAT	2	12	267424	267435	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442313970
6005	NC_020125	CTT	2	6	267446	267451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313970
6006	NC_020125	CAT	2	6	267476	267481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313970
6007	NC_020125	TACCA	2	10	267495	267504	40 %	20 %	0 %	40 %	442313970
6008	NC_020125	TAAAG	2	10	267535	267544	60 %	20 %	20 %	0 %	442313970
6009	NC_020125	CCG	2	6	267557	267562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313970
6010	NC_020125	T	6	6	267631	267636	0 %	100 %	0 %	0 %	442313970
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6015	NC_020125	T	6	6	267824	267829	0 %	100 %	0 %	0 %	442313970
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6018	NC_020125	CAT	2	6	267914	267919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313970
6019	NC_020125	TAAGTT	2	12	267923	267934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442313970
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6021	NC_020125	AAAT	2	8	268050	268057	75 %	25 %	0 %	0 %	442313970
6022	NC_020125	GCC	2	6	268108	268113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313970
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6024	NC_020125	A	6	6	268584	268589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6060	NC_020125	TATCA	2	10	270107	270116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6061	NC_020125	GAC	2	6	270149	270154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6127	NC_020125	AGA	2	6	273454	273459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313975
6128	NC_020125	A	6	6	273538	273543	100 %	0 %	0 %	0 %	442313975
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6133	NC_020125	TGT	2	6	273688	273693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313975
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6141	NC_020125	CAAAG	2	10	274205	274214	60 %	0 %	20 %	20 %	442313975
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6148	NC_020125	T	8	8	274548	274555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6155	NC_020125	AAACT	2	10	274824	274833	60 %	20 %	0 %	20 %	442313976
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6158	NC_020125	T	6	6	274961	274966	0 %	100 %	0 %	0 %	442313976
6159	NC_020125	TGA	2	6	275017	275022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313976
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6168	NC_020125	AT	3	6	275483	275488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6170	NC_020125	A	6	6	275542	275547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6171	NC_020125	AAAAT	2	10	275590	275599	80 %	20 %	0 %	0 %	442313977
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6248	NC_020125	CT	3	6	278686	278691	0 %	50 %	0 %	50 %	442313980
6249	NC_020125	AACT	2	8	278726	278733	50 %	25 %	0 %	25 %	442313980
6250	NC_020125	GCT	2	6	278771	278776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313980
6251	NC_020125	TCC	2	6	278953	278958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313980
6252	NC_020125	TTA	2	6	278998	279003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313980
6253	NC_020125	T	6	6	279047	279052	0 %	100 %	0 %	0 %	442313980
6254	NC_020125	CTC	2	6	279090	279095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313980
6255	NC_020125	TCA	2	6	279124	279129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313980
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6258	NC_020125	TTC	2	6	279318	279323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313980
6259	NC_020125	CTT	2	6	279402	279407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313980
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6262	NC_020125	ATG	2	6	279637	279642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313980
6263	NC_020125	TCA	2	6	279670	279675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313980
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6267	NC_020125	CT	3	6	279761	279766	0 %	50 %	0 %	50 %	442313980
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6271	NC_020125	TTTA	2	8	279897	279904	25 %	75 %	0 %	0 %	442313980
6272	NC_020125	GAAA	2	8	279942	279949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6273	NC_020125	AGA	2	6	280022	280027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313981
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6282	NC_020125	CTT	2	6	280505	280510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313981
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6298	NC_020125	TAAAA	2	10	281185	281194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6299	NC_020125	TCA	2	6	281235	281240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6301	NC_020125	A	7	7	281270	281276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6302	NC_020125	TC	3	6	281390	281395	0 %	50 %	0 %	50 %	442313982
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6307	NC_020125	TATC	2	8	281616	281623	25 %	50 %	0 %	25 %	442313982
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6310	NC_020125	ATGC	2	8	281838	281845	25 %	25 %	25 %	25 %	442313982
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6330	NC_020125	TATC	2	8	282933	282940	25 %	50 %	0 %	25 %	442313982
6331	NC_020125	AAT	2	6	282944	282949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313982
6332	NC_020125	CAA	2	6	283064	283069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313983
6333	NC_020125	A	6	6	283219	283224	100 %	0 %	0 %	0 %	442313983
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6337	NC_020125	CTAT	2	8	283383	283390	25 %	50 %	0 %	25 %	442313983
6338	NC_020125	A	6	6	283472	283477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6339	NC_020125	T	6	6	283558	283563	0 %	100 %	0 %	0 %	442313984
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6343	NC_020125	AGG	2	6	283799	283804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313984
6344	NC_020125	CAT	2	6	283831	283836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313984
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6356	NC_020125	AATT	2	8	284319	284326	50 %	50 %	0 %	0 %	442313984
6357	NC_020125	TAAAA	2	10	284328	284337	80 %	20 %	0 %	0 %	442313984
6358	NC_020125	TTA	2	6	284393	284398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313985
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6360	NC_020125	CTTA	2	8	284452	284459	25 %	50 %	0 %	25 %	442313985
6361	NC_020125	A	7	7	284550	284556	100 %	0 %	0 %	0 %	442313985
6362	NC_020125	ATC	2	6	284568	284573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313985
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6365	NC_020125	TAAAA	2	10	284648	284657	80 %	20 %	0 %	0 %	442313985
6366	NC_020125	AC	3	6	284663	284668	50 %	0 %	0 %	50 %	442313985
6367	NC_020125	TGA	2	6	284708	284713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313985
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6369	NC_020125	AAG	2	6	284809	284814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313985
6370	NC_020125	ACA	2	6	284845	284850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313985
6371	NC_020125	ATG	2	6	284922	284927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313985
6372	NC_020125	GGAC	2	8	285017	285024	25 %	0 %	50 %	25 %	442313985
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6374	NC_020125	GAAT	2	8	285049	285056	50 %	25 %	25 %	0 %	442313985
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6459	NC_020125	TAC	2	6	288721	288726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313991
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6462	NC_020125	TA	3	6	288976	288981	50 %	50 %	0 %	0 %	442313991
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6497	NC_020125	TTCTG	2	10	290880	290889	0 %	60 %	20 %	20 %	442313992
6498	NC_020125	AAAG	2	8	290903	290910	75 %	0 %	25 %	0 %	442313992
6499	NC_020125	TCTG	2	8	290916	290923	0 %	50 %	25 %	25 %	442313992
6500	NC_020125	TCA	2	6	290943	290948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313992

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