MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020125	GTA	2	6	246759	246764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313949
5502	NC_020125	CCA	2	6	246765	246770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313949
5503	NC_020125	AAT	2	6	246779	246784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313949
5504	NC_020125	GCC	2	6	246831	246836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313949
5505	NC_020125	CTT	2	6	246859	246864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313949
5506	NC_020125	CT	3	6	246898	246903	0 %	50 %	0 %	50 %	442313949
5507	NC_020125	TAA	2	6	246991	246996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313949
5508	NC_020125	TTA	2	6	247179	247184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313949
5509	NC_020125	GT	3	6	247195	247200	0 %	50 %	50 %	0 %	442313949
5510	NC_020125	TAAA	2	8	247234	247241	75 %	25 %	0 %	0 %	442313949
5511	NC_020125	ATT	2	6	247280	247285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_020125	ATC	2	6	247322	247327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_020125	A	8	8	247335	247342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_020125	CA	3	6	247359	247364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_020125	TAA	2	6	247381	247386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_020125	TAT	2	6	247400	247405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_020125	ATTTT	2	10	247413	247422	20 %	80 %	0 %	0 %	442313950
5518	NC_020125	CA	3	6	247566	247571	50 %	0 %	0 %	50 %	442313950
5519	NC_020125	TTTAAT	2	12	247575	247586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313950
5520	NC_020125	GGC	2	6	247609	247614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313950
5521	NC_020125	T	7	7	247778	247784	0 %	100 %	0 %	0 %	442313950
5522	NC_020125	ATT	2	6	247788	247793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313950
5523	NC_020125	TC	3	6	247801	247806	0 %	50 %	0 %	50 %	442313950
5524	NC_020125	TTTC	2	8	247817	247824	0 %	75 %	0 %	25 %	442313950
5525	NC_020125	CCA	2	6	247826	247831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313950
5526	NC_020125	TTA	2	6	247840	247845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313950
5527	NC_020125	CCG	2	6	248030	248035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313950
5528	NC_020125	TTG	2	6	248093	248098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313950
5529	NC_020125	TAA	2	6	248136	248141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313950
5530	NC_020125	GTT	2	6	248227	248232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313950
5531	NC_020125	CCA	2	6	248243	248248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313950
5532	NC_020125	AGA	2	6	248286	248291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313950
5533	NC_020125	GT	3	6	248294	248299	0 %	50 %	50 %	0 %	442313950
5534	NC_020125	TTC	2	6	248343	248348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313950
5535	NC_020125	TAC	2	6	248370	248375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313950
5536	NC_020125	TTA	2	6	248389	248394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313950
5537	NC_020125	CTT	2	6	248398	248403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313950
5538	NC_020125	CTT	2	6	248441	248446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313950
5539	NC_020125	ATA	2	6	248464	248469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313950
5540	NC_020125	TGA	2	6	248500	248505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313950
5541	NC_020125	TTC	2	6	248511	248516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313950
5542	NC_020125	ATC	2	6	248526	248531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313950
5543	NC_020125	CAT	2	6	248540	248545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313950
5544	NC_020125	TCC	2	6	248547	248552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313950
5545	NC_020125	CTA	2	6	248633	248638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313950
5546	NC_020125	TC	3	6	248644	248649	0 %	50 %	0 %	50 %	442313950
5547	NC_020125	A	6	6	248727	248732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020125	A	6	6	248741	248746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020125	TTA	2	6	248747	248752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020125	T	6	6	248781	248786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020125	ATA	2	6	248808	248813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020125	ATGG	2	8	248814	248821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020125	AAT	2	6	248825	248830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_020125	CCAT	2	8	248834	248841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_020125	GTA	2	6	248857	248862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020125	TTTAC	2	10	248941	248950	20 %	60 %	0 %	20 %	442313951
5557	NC_020125	TC	3	6	248973	248978	0 %	50 %	0 %	50 %	442313951
5558	NC_020125	TTG	2	6	248990	248995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313951
5559	NC_020125	ATA	2	6	249035	249040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313951
5560	NC_020125	GAGAA	2	10	249053	249062	60 %	0 %	40 %	0 %	442313951
5561	NC_020125	TTC	2	6	249177	249182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313951
5562	NC_020125	TTA	2	6	249190	249195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313951
5563	NC_020125	TTC	2	6	249302	249307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313951
5564	NC_020125	ACTCC	2	10	249385	249394	20 %	20 %	0 %	60 %	442313951
5565	NC_020125	CAT	2	6	249453	249458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313951
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5567	NC_020125	TAG	2	6	249589	249594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313951
5568	NC_020125	ATC	2	6	249693	249698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313951
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5570	NC_020125	CCT	2	6	249781	249786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313951
5571	NC_020125	AGG	2	6	249847	249852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_020125	ATTTT	2	10	249864	249873	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_020125	T	7	7	249870	249876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_020125	AATTAA	2	12	249921	249932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_020125	AT	3	6	250019	250024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_020125	TA	3	6	250064	250069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_020125	A	6	6	250088	250093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020125	ATC	2	6	250195	250200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313952
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5580	NC_020125	AAG	2	6	250213	250218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313952
5581	NC_020125	ATC	2	6	250246	250251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313952
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5583	NC_020125	T	6	6	250286	250291	0 %	100 %	0 %	0 %	442313952
5584	NC_020125	A	7	7	250359	250365	100 %	0 %	0 %	0 %	442313952
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5588	NC_020125	ATT	2	6	250532	250537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_020125	TGG	2	6	250541	250546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_020125	A	6	6	250651	250656	100 %	0 %	0 %	0 %	442313953
5593	NC_020125	AGC	2	6	250694	250699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313953
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5595	NC_020125	TAC	2	6	250849	250854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313953
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5597	NC_020125	ATC	2	6	250891	250896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313953
5598	NC_020125	TAT	2	6	250996	251001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313953
5599	NC_020125	TAT	2	6	251078	251083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313953
5600	NC_020125	A	6	6	251108	251113	100 %	0 %	0 %	0 %	442313953
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5605	NC_020125	A	6	6	251356	251361	100 %	0 %	0 %	0 %	442313953
5606	NC_020125	ACA	2	6	251377	251382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313953
5607	NC_020125	AAATT	2	10	251433	251442	60 %	40 %	0 %	0 %	442313953
5608	NC_020125	AAC	2	6	251484	251489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313953
5609	NC_020125	TCT	2	6	251690	251695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313953
5610	NC_020125	CTTT	2	8	251710	251717	0 %	75 %	0 %	25 %	442313953
5611	NC_020125	T	6	6	251801	251806	0 %	100 %	0 %	0 %	442313953
5612	NC_020125	GTA	2	6	251821	251826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313953
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5614	NC_020125	GCTG	2	8	251873	251880	0 %	25 %	50 %	25 %	442313953
5615	NC_020125	ATGT	2	8	251940	251947	25 %	50 %	25 %	0 %	442313953
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5617	NC_020125	T	6	6	251974	251979	0 %	100 %	0 %	0 %	442313953
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5621	NC_020125	AT	3	6	252095	252100	50 %	50 %	0 %	0 %	442313953
5622	NC_020125	T	6	6	252133	252138	0 %	100 %	0 %	0 %	442313953
5623	NC_020125	TAT	2	6	252149	252154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313953
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5625	NC_020125	ATC	2	6	252218	252223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313953
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5627	NC_020125	TCC	2	6	252299	252304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313953
5628	NC_020125	CTG	2	6	252370	252375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313953
5629	NC_020125	CA	3	6	252389	252394	50 %	0 %	0 %	50 %	442313953
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5631	NC_020125	CTA	2	6	252479	252484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313953
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