MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020125	CCA	2	6	223731	223736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313925
5002	NC_020125	TAA	2	6	223738	223743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313925
5003	NC_020125	ACAA	2	8	223759	223766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_020125	TAGA	2	8	223783	223790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_020125	T	6	6	223823	223828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_020125	CATTAA	2	12	223843	223854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5007	NC_020125	A	7	7	223890	223896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_020125	TAA	2	6	223897	223902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_020125	TGT	2	6	223924	223929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313926
5010	NC_020125	AGTA	2	8	223972	223979	50 %	25 %	25 %	0 %	442313926
5011	NC_020125	CAT	2	6	224038	224043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313926
5012	NC_020125	CTA	2	6	224229	224234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313926
5013	NC_020125	ATTG	2	8	224383	224390	25 %	50 %	25 %	0 %	442313926
5014	NC_020125	ATT	3	9	224428	224436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313926
5015	NC_020125	TCT	2	6	224515	224520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313926
5016	NC_020125	CAC	2	6	224539	224544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313926
5017	NC_020125	ATC	2	6	224546	224551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313926
5018	NC_020125	CTA	2	6	224619	224624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313926
5019	NC_020125	TAC	2	6	224637	224642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313926
5020	NC_020125	ATAAA	2	10	224652	224661	80 %	20 %	0 %	0 %	442313926
5021	NC_020125	T	6	6	224758	224763	0 %	100 %	0 %	0 %	442313926
5022	NC_020125	GAAA	2	8	224779	224786	75 %	0 %	25 %	0 %	442313926
5023	NC_020125	ATT	2	6	224837	224842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313926
5024	NC_020125	TTA	2	6	224859	224864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313926
5025	NC_020125	TGA	2	6	224959	224964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313926
5026	NC_020125	ATC	2	6	225035	225040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313926
5027	NC_020125	ACA	2	6	225066	225071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313926
5028	NC_020125	A	6	6	225081	225086	100 %	0 %	0 %	0 %	442313926
5029	NC_020125	AGA	2	6	225094	225099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313926
5030	NC_020125	CCA	2	6	225119	225124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313926
5031	NC_020125	ATTTG	2	10	225127	225136	20 %	60 %	20 %	0 %	442313926
5032	NC_020125	GCT	2	6	225143	225148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313926
5033	NC_020125	TAG	2	6	225156	225161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313926
5034	NC_020125	CCA	2	6	225210	225215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313926
5035	NC_020125	TGG	2	6	225231	225236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313926
5036	NC_020125	TCT	2	6	225245	225250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313926
5037	NC_020125	AG	3	6	225272	225277	50 %	0 %	50 %	0 %	442313926
5038	NC_020125	TAT	2	6	225303	225308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313926
5039	NC_020125	GGTT	2	8	225320	225327	0 %	50 %	50 %	0 %	442313926
5040	NC_020125	CATT	2	8	225336	225343	25 %	50 %	0 %	25 %	442313926
5041	NC_020125	AT	4	8	225403	225410	50 %	50 %	0 %	0 %	442313926
5042	NC_020125	TAT	2	6	225433	225438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313926
5043	NC_020125	A	6	6	225461	225466	100 %	0 %	0 %	0 %	442313926
5044	NC_020125	A	8	8	225470	225477	100 %	0 %	0 %	0 %	442313926
5045	NC_020125	AGA	2	6	225487	225492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313926
5046	NC_020125	AGA	2	6	225514	225519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313926
5047	NC_020125	TAG	2	6	225528	225533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313926
5048	NC_020125	AGTG	2	8	225550	225557	25 %	25 %	50 %	0 %	442313926
5049	NC_020125	ATG	2	6	225585	225590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313926
5050	NC_020125	AGA	2	6	225661	225666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313926
5051	NC_020125	CAA	2	6	225673	225678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313926
5052	NC_020125	TAG	2	6	225754	225759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313926
5053	NC_020125	T	6	6	225813	225818	0 %	100 %	0 %	0 %	442313926
5054	NC_020125	AAC	2	6	225924	225929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313926
5055	NC_020125	A	8	8	225955	225962	100 %	0 %	0 %	0 %	442313926
5056	NC_020125	CAT	2	6	226015	226020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313926
5057	NC_020125	CAAG	2	8	226042	226049	50 %	0 %	25 %	25 %	442313926
5058	NC_020125	A	6	6	226139	226144	100 %	0 %	0 %	0 %	442313926
5059	NC_020125	T	6	6	226180	226185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_020125	T	6	6	226224	226229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_020125	TTA	2	6	226281	226286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_020125	CAA	2	6	226298	226303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_020125	A	6	6	226302	226307	100 %	0 %	0 %	0 %	442313927
5064	NC_020125	AAAAC	2	10	226310	226319	80 %	0 %	0 %	20 %	442313927
5065	NC_020125	ATAAA	2	10	226344	226353	80 %	20 %	0 %	0 %	442313927
5066	NC_020125	GTG	2	6	226383	226388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313927
5067	NC_020125	A	7	7	226406	226412	100 %	0 %	0 %	0 %	442313927
5068	NC_020125	AGG	2	6	226444	226449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313927
5069	NC_020125	T	8	8	226455	226462	0 %	100 %	0 %	0 %	442313927
5070	NC_020125	CAG	2	6	226464	226469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313927
5071	NC_020125	CTAT	2	8	226497	226504	25 %	50 %	0 %	25 %	442313927
5072	NC_020125	TGA	2	6	226557	226562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313927
5073	NC_020125	TCT	2	6	226589	226594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313927
5074	NC_020125	A	6	6	226597	226602	100 %	0 %	0 %	0 %	442313927
5075	NC_020125	TGG	2	6	226613	226618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313927
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5077	NC_020125	T	6	6	226660	226665	0 %	100 %	0 %	0 %	442313927
5078	NC_020125	CAT	3	9	226669	226677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313927
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5080	NC_020125	CAA	2	6	226763	226768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313927
5081	NC_020125	A	6	6	226817	226822	100 %	0 %	0 %	0 %	442313927
5082	NC_020125	A	6	6	226833	226838	100 %	0 %	0 %	0 %	442313927
5083	NC_020125	TCT	2	6	226904	226909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313927
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5086	NC_020125	GCG	2	6	227174	227179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313927
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5089	NC_020125	A	6	6	227307	227312	100 %	0 %	0 %	0 %	442313927
5090	NC_020125	A	6	6	227337	227342	100 %	0 %	0 %	0 %	442313927
5091	NC_020125	AAAG	2	8	227358	227365	75 %	0 %	25 %	0 %	442313927
5092	NC_020125	C	6	6	227401	227406	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5093	NC_020125	A	6	6	227464	227469	100 %	0 %	0 %	0 %	442313928
5094	NC_020125	TCT	2	6	227494	227499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313928
5095	NC_020125	CAT	2	6	227522	227527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313928
5096	NC_020125	TTATC	2	10	227753	227762	20 %	60 %	0 %	20 %	442313928
5097	NC_020125	GTT	2	6	227786	227791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313929
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5099	NC_020125	CAAA	2	8	227811	227818	75 %	0 %	0 %	25 %	442313929
5100	NC_020125	ATT	2	6	227846	227851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313929
5101	NC_020125	TTG	2	6	227906	227911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313929
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5103	NC_020125	TTC	2	6	228002	228007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313929
5104	NC_020125	TTTAAA	2	12	228089	228100	50 %	50 %	0 %	0 %	442313929
5105	NC_020125	TCT	2	6	228294	228299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313929
5106	NC_020125	TAA	2	6	228304	228309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313929
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5108	NC_020125	TTA	2	6	228327	228332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313929
5109	NC_020125	TGA	2	6	228363	228368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313929
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5111	NC_020125	TGA	2	6	228408	228413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313929
5112	NC_020125	TCT	3	9	228438	228446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313929
5113	NC_020125	ATT	2	6	228458	228463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313929
5114	NC_020125	A	6	6	228529	228534	100 %	0 %	0 %	0 %	442313929
5115	NC_020125	A	8	8	228539	228546	100 %	0 %	0 %	0 %	442313929
5116	NC_020125	AAT	2	6	228549	228554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313929
5117	NC_020125	AATGA	2	10	228593	228602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_020125	ACTA	2	8	228619	228626	50 %	25 %	0 %	25 %	442313930
5119	NC_020125	T	6	6	228672	228677	0 %	100 %	0 %	0 %	442313930
5120	NC_020125	ATTT	2	8	228713	228720	25 %	75 %	0 %	0 %	442313930
5121	NC_020125	TAA	2	6	228757	228762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313930
5122	NC_020125	ACA	2	6	228764	228769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313930
5123	NC_020125	TTA	2	6	228781	228786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313930
5124	NC_020125	ATT	2	6	228807	228812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313930
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5126	NC_020125	GTT	3	9	228899	228907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313930
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5248	NC_020125	A	6	6	234595	234600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_020125	TGC	2	6	234617	234622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313937
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5252	NC_020125	GAA	2	6	234705	234710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313937
5253	NC_020125	GAC	2	6	234715	234720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313937
5254	NC_020125	ACA	2	6	234746	234751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313937
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5256	NC_020125	TAA	2	6	234814	234819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313937
5257	NC_020125	CTAT	2	8	234856	234863	25 %	50 %	0 %	25 %	442313937
5258	NC_020125	TGA	3	9	234889	234897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313937
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5266	NC_020125	AAGTA	2	10	235185	235194	60 %	20 %	20 %	0 %	442313938
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5353	NC_020125	A	7	7	239530	239536	100 %	0 %	0 %	0 %	442313942
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5374	NC_020125	AAT	2	6	240596	240601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5488	NC_020125	A	7	7	246182	246188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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