MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_020062	GCC	2	6	2069719	2069724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224859
44502	NC_020062	TTG	2	6	2069735	2069740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224859
44503	NC_020062	TTG	2	6	2069858	2069863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224859
44504	NC_020062	GCC	2	6	2069888	2069893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224859
44505	NC_020062	AG	3	6	2069919	2069924	50 %	0 %	50 %	0 %	440224859
44506	NC_020062	TCG	2	6	2069942	2069947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224859
44507	NC_020062	GCT	2	6	2069967	2069972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224859
44508	NC_020062	CGA	2	6	2070036	2070041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224859
44509	NC_020062	CAT	2	6	2070073	2070078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224859
44510	NC_020062	AAGC	2	8	2070125	2070132	50 %	0 %	25 %	25 %	440224859
44511	NC_020062	TCA	2	6	2070327	2070332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224859
44512	NC_020062	AAACCG	2	12	2070395	2070406	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440224859
44513	NC_020062	GCC	2	6	2070448	2070453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224859
44514	NC_020062	TGAA	2	8	2070566	2070573	50 %	25 %	25 %	0 %	440224859
44515	NC_020062	GTC	2	6	2070709	2070714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224859
44516	NC_020062	GTTTTG	2	12	2071078	2071089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44517	NC_020062	GCG	2	6	2071201	2071206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44518	NC_020062	GCG	2	6	2071266	2071271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44519	NC_020062	GGC	2	6	2071293	2071298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44520	NC_020062	GAG	2	6	2071310	2071315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44521	NC_020062	GCCG	3	12	2071328	2071339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44522	NC_020062	TTGC	2	8	2071607	2071614	0 %	50 %	25 %	25 %	440224860
44523	NC_020062	CTT	2	6	2071667	2071672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224860
44524	NC_020062	TCG	2	6	2071716	2071721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224860
44525	NC_020062	GCG	2	6	2071723	2071728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224860
44526	NC_020062	CCT	2	6	2071732	2071737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224860
44527	NC_020062	CGG	2	6	2071811	2071816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224860
44528	NC_020062	CCTG	2	8	2071909	2071916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44529	NC_020062	AGA	2	6	2071931	2071936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44530	NC_020062	CGC	2	6	2071938	2071943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44531	NC_020062	GCT	2	6	2072017	2072022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44532	NC_020062	TCGC	2	8	2072178	2072185	0 %	25 %	25 %	50 %	440224861
44533	NC_020062	AG	3	6	2072187	2072192	50 %	0 %	50 %	0 %	440224861
44534	NC_020062	CAT	3	9	2072294	2072302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224861
44535	NC_020062	GCC	2	6	2072463	2072468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224861
44536	NC_020062	CGC	2	6	2072509	2072514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224861
44537	NC_020062	TGC	3	9	2072515	2072523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224861
44538	NC_020062	CTG	2	6	2072601	2072606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224861
44539	NC_020062	CGG	2	6	2072630	2072635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224861
44540	NC_020062	AGC	2	6	2072653	2072658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224861
44541	NC_020062	CAT	2	6	2072822	2072827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224861
44542	NC_020062	ACG	2	6	2072833	2072838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224861
44543	NC_020062	CGA	2	6	2072860	2072865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224862
44544	NC_020062	ATG	2	6	2072898	2072903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224862
44545	NC_020062	CGCC	2	8	2072929	2072936	0 %	0 %	25 %	75 %	440224862
44546	NC_020062	AGG	2	6	2072979	2072984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224862
44547	NC_020062	GCG	2	6	2072989	2072994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224862
44548	NC_020062	GC	3	6	2073027	2073032	0 %	0 %	50 %	50 %	440224862
44549	NC_020062	GTC	2	6	2073036	2073041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224862
44550	NC_020062	CACCGA	2	12	2073146	2073157	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440224862
44551	NC_020062	CTG	2	6	2073161	2073166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224862
44552	NC_020062	GCGCTC	2	12	2073185	2073196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440224862
44553	NC_020062	CAGG	2	8	2073206	2073213	25 %	0 %	50 %	25 %	440224862
44554	NC_020062	GGAC	2	8	2073275	2073282	25 %	0 %	50 %	25 %	440224862
44555	NC_020062	CTC	2	6	2073341	2073346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224862
44556	NC_020062	GAC	2	6	2073407	2073412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224862
44557	NC_020062	CAT	2	6	2073505	2073510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224862
44558	NC_020062	TTC	2	6	2073642	2073647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44559	NC_020062	CA	3	6	2073655	2073660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44560	NC_020062	CCA	2	6	2073763	2073768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44561	NC_020062	TGTCA	2	10	2073783	2073792	20 %	40 %	20 %	20 %	440224863
44562	NC_020062	TTG	2	6	2073850	2073855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224863
44563	NC_020062	CTG	2	6	2073877	2073882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44564	NC_020062	CTG	2	6	2073907	2073912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44565	NC_020062	CGAA	2	8	2073956	2073963	50 %	0 %	25 %	25 %	440224863
44566	NC_020062	CTT	3	9	2073979	2073987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224863
44567	NC_020062	AT	3	6	2074008	2074013	50 %	50 %	0 %	0 %	440224863
44568	NC_020062	CGAC	2	8	2074100	2074107	25 %	0 %	25 %	50 %	440224863
44569	NC_020062	GAT	2	6	2074170	2074175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224863
44570	NC_020062	GCAG	2	8	2074215	2074222	25 %	0 %	50 %	25 %	440224863
44571	NC_020062	CG	3	6	2074223	2074228	0 %	0 %	50 %	50 %	440224863
44572	NC_020062	GC	3	6	2074243	2074248	0 %	0 %	50 %	50 %	440224863
44573	NC_020062	GGAA	2	8	2074251	2074258	50 %	0 %	50 %	0 %	440224863
44574	NC_020062	CCTC	2	8	2074265	2074272	0 %	25 %	0 %	75 %	440224863
44575	NC_020062	CAG	2	6	2074279	2074284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44576	NC_020062	TCG	2	6	2074337	2074342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44577	NC_020062	CAG	2	6	2074357	2074362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44578	NC_020062	GTC	2	6	2074408	2074413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44579	NC_020062	GCGCC	2	10	2074414	2074423	0 %	0 %	40 %	60 %	440224863
44580	NC_020062	GGCT	2	8	2074470	2074477	0 %	25 %	50 %	25 %	440224863
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44583	NC_020062	CAG	2	6	2074694	2074699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44584	NC_020062	GCAA	2	8	2074732	2074739	50 %	0 %	25 %	25 %	440224863
44585	NC_020062	GCC	2	6	2074806	2074811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224863
44586	NC_020062	CGC	2	6	2074823	2074828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224863
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44588	NC_020062	GGC	2	6	2074879	2074884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224863
44589	NC_020062	TCGA	2	8	2074888	2074895	25 %	25 %	25 %	25 %	440224863
44590	NC_020062	ACA	2	6	2074970	2074975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224863
44591	NC_020062	CGC	2	6	2075035	2075040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224863
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44599	NC_020062	TCGGC	2	10	2075234	2075243	0 %	20 %	40 %	40 %	440224863
44600	NC_020062	TGA	2	6	2075258	2075263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224863
44601	NC_020062	GCCGC	2	10	2075264	2075273	0 %	0 %	40 %	60 %	440224863
44602	NC_020062	TCGGT	2	10	2075303	2075312	0 %	40 %	40 %	20 %	440224863
44603	NC_020062	GC	3	6	2075334	2075339	0 %	0 %	50 %	50 %	440224863
44604	NC_020062	CGC	2	6	2075379	2075384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224863
44605	NC_020062	GAA	2	6	2075397	2075402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224863
44606	NC_020062	CCT	2	6	2075421	2075426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224863
44607	NC_020062	GGC	2	6	2075460	2075465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224863
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44609	NC_020062	CCGT	2	8	2075517	2075524	0 %	25 %	25 %	50 %	440224863
44610	NC_020062	GCAA	2	8	2075551	2075558	50 %	0 %	25 %	25 %	440224863
44611	NC_020062	CGA	2	6	2075598	2075603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44612	NC_020062	CA	3	6	2075634	2075639	50 %	0 %	0 %	50 %	440224863
44613	NC_020062	CAT	2	6	2075680	2075685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224863
44614	NC_020062	TCG	2	6	2075708	2075713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224863
44615	NC_020062	CGC	2	6	2075747	2075752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224863
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44617	NC_020062	CTC	2	6	2075806	2075811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224863
44618	NC_020062	GGC	2	6	2075859	2075864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224863
44619	NC_020062	TTGC	2	8	2075983	2075990	0 %	50 %	25 %	25 %	440224863
44620	NC_020062	TCT	2	6	2075991	2075996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224863
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44633	NC_020062	GC	3	6	2076552	2076557	0 %	0 %	50 %	50 %	440224864
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44656	NC_020062	ATT	2	6	2077738	2077743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44683	NC_020062	CA	3	6	2079228	2079233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44684	NC_020062	CGT	2	6	2079252	2079257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44689	NC_020062	CG	3	6	2079594	2079599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44690	NC_020062	ACTGT	2	10	2079607	2079616	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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44722	NC_020062	A	6	6	2081829	2081834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44725	NC_020062	GAA	2	6	2081966	2081971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44732	NC_020062	GAA	2	6	2082417	2082422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224870
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44734	NC_020062	CGG	2	6	2082468	2082473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224870
44735	NC_020062	GCG	2	6	2082522	2082527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224870
44736	NC_020062	GAA	2	6	2082567	2082572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224870
44737	NC_020062	CTC	2	6	2082585	2082590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224870
44738	NC_020062	ATC	2	6	2082666	2082671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224870
44739	NC_020062	CTG	2	6	2082675	2082680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224870
44740	NC_020062	CAG	2	6	2082687	2082692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224870
44741	NC_020062	ATG	2	6	2082715	2082720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224870
44742	NC_020062	GACG	2	8	2082815	2082822	25 %	0 %	50 %	25 %	440224870
44743	NC_020062	CGAT	2	8	2082954	2082961	25 %	25 %	25 %	25 %	440224870
44744	NC_020062	GCC	2	6	2083020	2083025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224870

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