MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020062	CGA	4	12	168624	168635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223106
3502	NC_020062	AGC	2	6	168636	168641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223106
3503	NC_020062	ATAGA	2	10	168655	168664	60 %	20 %	20 %	0 %	440223106
3504	NC_020062	TAG	2	6	168674	168679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223106
3505	NC_020062	CCA	2	6	168686	168691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223106
3506	NC_020062	CGA	2	6	168714	168719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223106
3507	NC_020062	AG	3	6	168749	168754	50 %	0 %	50 %	0 %	440223106
3508	NC_020062	TCCA	2	8	168960	168967	25 %	25 %	0 %	50 %	440223106
3509	NC_020062	GGCG	2	8	168981	168988	0 %	0 %	75 %	25 %	440223106
3510	NC_020062	CAA	2	6	169059	169064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223106
3511	NC_020062	AT	3	6	169112	169117	50 %	50 %	0 %	0 %	440223106
3512	NC_020062	GGCG	2	8	169218	169225	0 %	0 %	75 %	25 %	440223106
3513	NC_020062	GCC	2	6	169283	169288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223106
3514	NC_020062	GAGCC	2	10	169291	169300	20 %	0 %	40 %	40 %	440223106
3515	NC_020062	TAAC	2	8	169340	169347	50 %	25 %	0 %	25 %	440223106
3516	NC_020062	GTC	2	6	169367	169372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223106
3517	NC_020062	GTC	2	6	169375	169380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223106
3518	NC_020062	TTCAT	2	10	169410	169419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3519	NC_020062	GCCGAG	2	12	169424	169435	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_020062	CT	3	6	169494	169499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_020062	CAT	2	6	169503	169508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_020062	TTG	2	6	169522	169527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020062	GTC	2	6	169538	169543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_020062	CTG	2	6	169607	169612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3525	NC_020062	CGGC	2	8	169622	169629	0 %	0 %	50 %	50 %	440223107
3526	NC_020062	GGC	2	6	169635	169640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3527	NC_020062	GAC	2	6	169768	169773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3528	NC_020062	TGAG	2	8	169790	169797	25 %	25 %	50 %	0 %	440223107
3529	NC_020062	GCG	2	6	169931	169936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3530	NC_020062	GGCA	2	8	170036	170043	25 %	0 %	50 %	25 %	440223107
3531	NC_020062	AGA	2	6	170070	170075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223107
3532	NC_020062	GAC	2	6	170142	170147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3533	NC_020062	ACG	2	6	170165	170170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3534	NC_020062	GGC	2	6	170189	170194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3535	NC_020062	GAC	2	6	170227	170232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3536	NC_020062	GGC	2	6	170238	170243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3537	NC_020062	CGA	2	6	170274	170279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3538	NC_020062	CGCA	2	8	170304	170311	25 %	0 %	25 %	50 %	440223107
3539	NC_020062	CCA	2	6	170367	170372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223107
3540	NC_020062	CTGGC	2	10	170389	170398	0 %	20 %	40 %	40 %	440223107
3541	NC_020062	CAGGGC	2	12	170403	170414	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223107
3542	NC_020062	GC	4	8	170413	170420	0 %	0 %	50 %	50 %	440223107
3543	NC_020062	TGG	2	6	170423	170428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223107
3544	NC_020062	CCG	2	6	170447	170452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223107
3545	NC_020062	CGG	2	6	170475	170480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3546	NC_020062	GGCG	2	8	170501	170508	0 %	0 %	75 %	25 %	440223107
3547	NC_020062	ACC	2	6	170516	170521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223107
3548	NC_020062	CGG	2	6	170577	170582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3549	NC_020062	TAT	2	6	170590	170595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223107
3550	NC_020062	GCG	2	6	170596	170601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3551	NC_020062	GAA	2	6	170626	170631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223107
3552	NC_020062	AAGG	2	8	170638	170645	50 %	0 %	50 %	0 %	440223107
3553	NC_020062	GAGCG	2	10	170711	170720	20 %	0 %	60 %	20 %	440223107
3554	NC_020062	CAA	2	6	170793	170798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223107
3555	NC_020062	G	7	7	170933	170939	0 %	0 %	100 %	0 %	440223107
3556	NC_020062	AAAC	2	8	171098	171105	75 %	0 %	0 %	25 %	440223107
3557	NC_020062	GAA	2	6	171124	171129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223107
3558	NC_020062	GCT	2	6	171141	171146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3559	NC_020062	GCG	2	6	171166	171171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3560	NC_020062	CGA	2	6	171183	171188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3561	NC_020062	CTG	2	6	171214	171219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3562	NC_020062	GCG	2	6	171295	171300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3563	NC_020062	GCTC	2	8	171315	171322	0 %	25 %	25 %	50 %	440223107
3564	NC_020062	TCG	2	6	171461	171466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3565	NC_020062	GAG	2	6	171574	171579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223107
3566	NC_020062	TGGC	2	8	171589	171596	0 %	25 %	50 %	25 %	440223107
3567	NC_020062	CGG	2	6	171603	171608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223107
3568	NC_020062	GCA	2	6	171753	171758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223107
3569	NC_020062	TTATGA	2	12	171822	171833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440223107
3570	NC_020062	TCA	2	6	171875	171880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223107
3571	NC_020062	ACGG	2	8	171881	171888	25 %	0 %	50 %	25 %	440223107
3572	NC_020062	CTA	2	6	171960	171965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223107
3573	NC_020062	TTCG	2	8	172083	172090	0 %	50 %	25 %	25 %	440223107
3574	NC_020062	ATG	2	6	172105	172110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223107
3575	NC_020062	GCGA	2	8	172170	172177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_020062	GCG	2	6	172228	172233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_020062	TCCG	2	8	172289	172296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_020062	GGC	2	6	172347	172352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223108
3579	NC_020062	ACC	2	6	172399	172404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223108
3580	NC_020062	ACG	2	6	172465	172470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223108
3581	NC_020062	CGAT	2	8	172476	172483	25 %	25 %	25 %	25 %	440223108
3582	NC_020062	CAA	2	6	172573	172578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223108
3583	NC_020062	AGT	2	6	172601	172606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223108
3584	NC_020062	GAC	2	6	172653	172658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223108
3585	NC_020062	GAT	2	6	172726	172731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223108
3586	NC_020062	ATG	2	6	172784	172789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_020062	CAG	2	6	172824	172829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_020062	ACC	2	6	172940	172945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223109
3589	NC_020062	CTTGAT	2	12	172966	172977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440223109
3590	NC_020062	GAT	2	6	172993	172998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223109
3591	NC_020062	T	6	6	173091	173096	0 %	100 %	0 %	0 %	440223109
3592	NC_020062	CGT	2	6	173193	173198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223109
3593	NC_020062	CGG	2	6	173287	173292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223109
3594	NC_020062	TGA	2	6	173373	173378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223109
3595	NC_020062	ATG	2	6	173384	173389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223109
3596	NC_020062	TCG	2	6	173474	173479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223110
3597	NC_020062	TTC	2	6	173634	173639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223110
3598	NC_020062	GAT	2	6	173642	173647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223110
3599	NC_020062	GAA	2	6	173658	173663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223110
3600	NC_020062	GCT	2	6	173670	173675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223110
3601	NC_020062	GC	3	6	173676	173681	0 %	0 %	50 %	50 %	440223110
3602	NC_020062	GTC	2	6	173685	173690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223110
3603	NC_020062	TCAC	2	8	173731	173738	25 %	25 %	0 %	50 %	440223110
3604	NC_020062	AGC	2	6	173743	173748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223110
3605	NC_020062	TCGA	2	8	173782	173789	25 %	25 %	25 %	25 %	440223110
3606	NC_020062	CGC	2	6	173819	173824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_020062	GTA	2	6	173836	173841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_020062	CTC	2	6	173905	173910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_020062	TCG	2	6	173957	173962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_020062	GCAA	2	8	173995	174002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_020062	GC	3	6	174022	174027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_020062	CTGTCG	2	12	174083	174094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_020062	GTCGAA	2	12	174119	174130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3614	NC_020062	CCT	2	6	174190	174195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223111
3615	NC_020062	GTTT	2	8	174273	174280	0 %	75 %	25 %	0 %	440223111
3616	NC_020062	CAA	2	6	174281	174286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223111
3617	NC_020062	CCAT	2	8	174427	174434	25 %	25 %	0 %	50 %	440223112
3618	NC_020062	GCAA	2	8	174454	174461	50 %	0 %	25 %	25 %	440223112
3619	NC_020062	A	6	6	174463	174468	100 %	0 %	0 %	0 %	440223112
3620	NC_020062	ACA	2	6	174503	174508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223112
3621	NC_020062	TTC	2	6	174511	174516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223112
3622	NC_020062	GAT	2	6	174569	174574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223112
3623	NC_020062	CGA	2	6	174642	174647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223112
3624	NC_020062	TCG	2	6	174745	174750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_020062	TGC	2	6	174774	174779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_020062	TGG	2	6	174916	174921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223113
3627	NC_020062	TCC	2	6	175052	175057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223113
3628	NC_020062	GGA	2	6	175076	175081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223113
3629	NC_020062	TCG	2	6	175161	175166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223113
3630	NC_020062	CGG	2	6	175207	175212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223113
3631	NC_020062	GCT	2	6	175213	175218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223113
3632	NC_020062	TTGT	2	8	175226	175233	0 %	75 %	25 %	0 %	440223113
3633	NC_020062	TCGGCA	2	12	175320	175331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223113
3634	NC_020062	TCT	2	6	175339	175344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223113
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3638	NC_020062	GGCTCT	2	12	175410	175421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223113
3639	NC_020062	CGCCC	2	10	175440	175449	0 %	0 %	20 %	80 %	440223113
3640	NC_020062	GAC	2	6	175495	175500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223113
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3642	NC_020062	TGC	2	6	175542	175547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223113
3643	NC_020062	GAC	2	6	175579	175584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223113
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3645	NC_020062	CGA	2	6	175611	175616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223113
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3647	NC_020062	TGCT	2	8	175679	175686	0 %	50 %	25 %	25 %	440223113
3648	NC_020062	GCTGG	2	10	175708	175717	0 %	20 %	60 %	20 %	440223113
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3651	NC_020062	CGT	2	6	175840	175845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3652	NC_020062	GAAG	2	8	175941	175948	50 %	0 %	50 %	0 %	440223114
3653	NC_020062	TC	3	6	175980	175985	0 %	50 %	0 %	50 %	440223114
3654	NC_020062	GC	3	6	176021	176026	0 %	0 %	50 %	50 %	440223114
3655	NC_020062	CAT	2	6	176041	176046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223114
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3658	NC_020062	AG	3	6	176236	176241	50 %	0 %	50 %	0 %	440223114
3659	NC_020062	GTG	2	6	176289	176294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223114
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3663	NC_020062	CGG	2	6	176415	176420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223114
3664	NC_020062	GCA	3	9	176444	176452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223114
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3668	NC_020062	AT	3	6	176794	176799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3669	NC_020062	AAT	2	6	176834	176839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3670	NC_020062	CGT	2	6	176900	176905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223115
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3689	NC_020062	CGA	2	6	177760	177765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223115
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3695	NC_020062	AGG	2	6	178090	178095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3730	NC_020062	CG	3	6	179688	179693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3731	NC_020062	TCG	2	6	179813	179818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3732	NC_020062	TGGG	2	8	179933	179940	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3733	NC_020062	CGT	2	6	180004	180009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223117
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3735	NC_020062	GAC	2	6	180214	180219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223117
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3738	NC_020062	ATC	2	6	180386	180391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223117
3739	NC_020062	TCG	2	6	180405	180410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223117
3740	NC_020062	GGC	2	6	180443	180448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223117
3741	NC_020062	TGT	2	6	180460	180465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223117
3742	NC_020062	GGT	2	6	180520	180525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223117
3743	NC_020062	GCG	2	6	180626	180631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223117
3744	NC_020062	TCG	2	6	180633	180638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223117
3745	NC_020062	TCCC	2	8	180667	180674	0 %	25 %	0 %	75 %	440223117
3746	NC_020062	AGG	2	6	180678	180683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223117
3747	NC_020062	GCG	2	6	180707	180712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223117
3748	NC_020062	GGCA	2	8	180724	180731	25 %	0 %	50 %	25 %	440223117
3749	NC_020062	CATGG	2	10	180784	180793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3750	NC_020062	GC	3	6	180846	180851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3751	NC_020062	TCC	3	9	180887	180895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3752	NC_020062	G	6	6	180931	180936	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3753	NC_020062	CGATG	2	10	180952	180961	20 %	20 %	40 %	20 %	440223118
3754	NC_020062	TGC	2	6	180966	180971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223118
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3761	NC_020062	TCG	2	6	181383	181388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223118
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3769	NC_020062	TCG	2	6	181919	181924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3854	NC_020062	TGA	2	6	187281	187286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3989	NC_020062	GTT	2	6	194126	194131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223133
3990	NC_020062	TTC	2	6	194334	194339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223133
3991	NC_020062	TGCTG	2	10	194354	194363	0 %	40 %	40 %	20 %	440223133
3992	NC_020062	T	6	6	194391	194396	0 %	100 %	0 %	0 %	440223133
3993	NC_020062	CA	3	6	194464	194469	50 %	0 %	0 %	50 %	440223133
3994	NC_020062	A	6	6	194496	194501	100 %	0 %	0 %	0 %	440223133
3995	NC_020062	TGCT	2	8	194616	194623	0 %	50 %	25 %	25 %	440223133
3996	NC_020062	C	6	6	194657	194662	0 %	0 %	0 %	100 %	440223133
3997	NC_020062	ATG	2	6	194836	194841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223134
3998	NC_020062	TGT	2	6	194842	194847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223134
3999	NC_020062	AG	3	6	194883	194888	50 %	0 %	50 %	0 %	440223134
4000	NC_020062	AGGA	2	8	194890	194897	50 %	0 %	50 %	0 %	440223134

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