MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020062	GTC	2	6	115390	115395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2502	NC_020062	GGCT	2	8	115420	115427	0 %	25 %	50 %	25 %	440223066
2503	NC_020062	TCCA	2	8	115435	115442	25 %	25 %	0 %	50 %	440223066
2504	NC_020062	GCAGGC	2	12	115485	115496	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223066
2505	NC_020062	CGA	2	6	115526	115531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2506	NC_020062	CCG	2	6	115568	115573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223066
2507	NC_020062	ACGGCG	2	12	115693	115704	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223066
2508	NC_020062	CAATAC	2	12	115777	115788	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440223066
2509	NC_020062	CGG	2	6	115808	115813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223066
2510	NC_020062	AGC	2	6	115889	115894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2511	NC_020062	GATC	2	8	115965	115972	25 %	25 %	25 %	25 %	440223066
2512	NC_020062	CGA	2	6	116009	116014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2513	NC_020062	CGT	2	6	116040	116045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2514	NC_020062	CCA	2	6	116111	116116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223066
2515	NC_020062	ACG	2	6	116206	116211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2516	NC_020062	GGC	2	6	116268	116273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223066
2517	NC_020062	GCC	2	6	116284	116289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223066
2518	NC_020062	AGCC	2	8	116353	116360	25 %	0 %	25 %	50 %	440223066
2519	NC_020062	GCC	2	6	116374	116379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223066
2520	NC_020062	ATC	2	6	116440	116445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223066
2521	NC_020062	CTG	2	6	116476	116481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2522	NC_020062	CAT	2	6	116511	116516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223066
2523	NC_020062	GAT	2	6	116520	116525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223066
2524	NC_020062	CAT	2	6	116529	116534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223066
2525	NC_020062	AAG	2	6	116554	116559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223066
2526	NC_020062	ATG	2	6	116569	116574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223066
2527	NC_020062	TTG	2	6	116588	116593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223066
2528	NC_020062	CGAA	2	8	116595	116602	50 %	0 %	25 %	25 %	440223066
2529	NC_020062	TGC	2	6	116645	116650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2530	NC_020062	CAT	2	6	116661	116666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223066
2531	NC_020062	GAC	2	6	116670	116675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2532	NC_020062	TCG	2	6	116759	116764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223066
2533	NC_020062	CAC	2	6	116799	116804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223066
2534	NC_020062	ATCT	2	8	116812	116819	25 %	50 %	0 %	25 %	440223066
2535	NC_020062	GGC	2	6	116871	116876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223066
2536	NC_020062	CCA	2	6	116980	116985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_020062	GCTG	2	8	117039	117046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2538	NC_020062	CTC	2	6	117066	117071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_020062	GGA	2	6	117081	117086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_020062	CGTGC	2	10	117091	117100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2541	NC_020062	GAG	2	6	117131	117136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_020062	GCC	3	9	117194	117202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223067
2543	NC_020062	CGG	2	6	117216	117221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223067
2544	NC_020062	CAT	2	6	117244	117249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223067
2545	NC_020062	ATCT	2	8	117272	117279	25 %	50 %	0 %	25 %	440223067
2546	NC_020062	CGT	2	6	117400	117405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223067
2547	NC_020062	CGT	2	6	117460	117465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223067
2548	NC_020062	AAATC	2	10	117519	117528	60 %	20 %	0 %	20 %	440223067
2549	NC_020062	CCG	2	6	117531	117536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223067
2550	NC_020062	GGCC	2	8	117613	117620	0 %	0 %	50 %	50 %	440223067
2551	NC_020062	CGGT	2	8	117648	117655	0 %	25 %	50 %	25 %	440223067
2552	NC_020062	CGC	2	6	117673	117678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223067
2553	NC_020062	GCA	2	6	117682	117687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223067
2554	NC_020062	GAC	2	6	117709	117714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223067
2555	NC_020062	TCA	2	6	117909	117914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223067
2556	NC_020062	GCC	2	6	117926	117931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223067
2557	NC_020062	AAGG	2	8	117974	117981	50 %	0 %	50 %	0 %	440223067
2558	NC_020062	CGAT	2	8	118104	118111	25 %	25 %	25 %	25 %	440223067
2559	NC_020062	ACG	2	6	118127	118132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223067
2560	NC_020062	AAG	2	6	118142	118147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223067
2561	NC_020062	TAATT	2	10	118154	118163	40 %	60 %	0 %	0 %	440223067
2562	NC_020062	GGC	2	6	118193	118198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_020062	GGC	2	6	118274	118279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_020062	CGG	2	6	118291	118296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_020062	GAG	2	6	118346	118351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020062	AAC	2	6	118393	118398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_020062	GAA	2	6	118432	118437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_020062	AGG	2	6	118513	118518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_020062	CGT	2	6	118640	118645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2570	NC_020062	AGC	2	6	118695	118700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2571	NC_020062	TGC	2	6	118723	118728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2572	NC_020062	GC	4	8	118798	118805	0 %	0 %	50 %	50 %	440223068
2573	NC_020062	GCG	2	6	118905	118910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223068
2574	NC_020062	TCG	2	6	118959	118964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2575	NC_020062	TCG	2	6	119007	119012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2576	NC_020062	GATC	2	8	119032	119039	25 %	25 %	25 %	25 %	440223068
2577	NC_020062	GTG	2	6	119076	119081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223068
2578	NC_020062	TCG	2	6	119082	119087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2579	NC_020062	TTA	2	6	119091	119096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223068
2580	NC_020062	GTT	2	6	119162	119167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223068
2581	NC_020062	GCC	2	6	119192	119197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223068
2582	NC_020062	GGT	2	6	119387	119392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223068
2583	NC_020062	TGC	2	6	119401	119406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2584	NC_020062	TCG	2	6	119442	119447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2585	NC_020062	CCG	2	6	119511	119516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223068
2586	NC_020062	GTT	2	6	119543	119548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223068
2587	NC_020062	GCGT	2	8	119599	119606	0 %	25 %	50 %	25 %	440223068
2588	NC_020062	GCC	3	9	119651	119659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223068
2589	NC_020062	TCG	2	6	119673	119678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223068
2590	NC_020062	ATC	2	6	119765	119770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223068
2591	NC_020062	ATA	2	6	119771	119776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223068
2592	NC_020062	TGG	2	6	119845	119850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223068
2593	NC_020062	TCT	2	6	119878	119883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223068
2594	NC_020062	CAA	2	6	119963	119968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223068
2595	NC_020062	GCC	2	6	120006	120011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223068
2596	NC_020062	GGCAG	2	10	120013	120022	20 %	0 %	60 %	20 %	440223068
2597	NC_020062	CCT	2	6	120067	120072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_020062	TGA	2	6	120121	120126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_020062	ACT	2	6	120134	120139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_020062	AC	3	6	120150	120155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2601	NC_020062	TCG	2	6	120224	120229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_020062	GGA	2	6	120350	120355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_020062	GCC	2	6	120387	120392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_020062	CAT	2	6	120409	120414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_020062	AC	3	6	120466	120471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2606	NC_020062	CGA	2	6	120486	120491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_020062	CTG	2	6	120503	120508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_020062	TGCGG	2	10	120597	120606	0 %	20 %	60 %	20 %	440223069
2609	NC_020062	TCA	2	6	120654	120659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223069
2610	NC_020062	TTC	2	6	120736	120741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223069
2611	NC_020062	TGG	2	6	120759	120764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223069
2612	NC_020062	GT	3	6	120805	120810	0 %	50 %	50 %	0 %	440223069
2613	NC_020062	CGTGGA	2	12	120877	120888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223069
2614	NC_020062	CAG	2	6	120959	120964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223069
2615	NC_020062	GCCA	2	8	120980	120987	25 %	0 %	25 %	50 %	440223069
2616	NC_020062	TGT	2	6	121003	121008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223069
2617	NC_020062	CGG	2	6	121117	121122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223070
2618	NC_020062	CAG	2	6	121310	121315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223070
2619	NC_020062	CCA	2	6	121318	121323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223070
2620	NC_020062	ACG	2	6	121350	121355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223070
2621	NC_020062	GCC	2	6	121436	121441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223070
2622	NC_020062	CAG	2	6	121478	121483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223070
2623	NC_020062	GA	3	6	121489	121494	50 %	0 %	50 %	0 %	440223070
2624	NC_020062	CAG	2	6	121526	121531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223070
2625	NC_020062	GAT	2	6	121595	121600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223070
2626	NC_020062	TCA	2	6	121612	121617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223070
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2628	NC_020062	GCG	2	6	121698	121703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223070
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2630	NC_020062	CCAG	2	8	121756	121763	25 %	0 %	25 %	50 %	440223070
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2635	NC_020062	CTT	2	6	122000	122005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223070
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2637	NC_020062	CAG	2	6	122078	122083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223070
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2640	NC_020062	GGC	2	6	122328	122333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2641	NC_020062	GAC	2	6	122335	122340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2642	NC_020062	ATCC	2	8	122344	122351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2643	NC_020062	CAGA	2	8	122385	122392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2644	NC_020062	GTG	2	6	122421	122426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_020062	GGCA	2	8	122453	122460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2646	NC_020062	CGC	2	6	122530	122535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2647	NC_020062	ACG	2	6	122569	122574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223071
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2652	NC_020062	AGG	2	6	122876	122881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223071
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2655	NC_020062	GCG	2	6	123011	123016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223071
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2659	NC_020062	GAA	2	6	123158	123163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223072
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2700	NC_020062	ACG	2	6	125442	125447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2721	NC_020062	GAC	2	6	126360	126365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223075
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2726	NC_020062	GCCGA	2	10	126537	126546	20 %	0 %	40 %	40 %	440223075
2727	NC_020062	CTG	3	9	126556	126564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223075
2728	NC_020062	ACC	2	6	126574	126579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223075
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2730	NC_020062	GTC	2	6	126812	126817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223076
2731	NC_020062	TCCAT	2	10	126849	126858	20 %	40 %	0 %	40 %	440223076
2732	NC_020062	AAT	2	6	126863	126868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223076
2733	NC_020062	GTC	2	6	126978	126983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223076
2734	NC_020062	ATCG	2	8	126997	127004	25 %	25 %	25 %	25 %	440223076
2735	NC_020062	CGA	2	6	127174	127179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223076
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2740	NC_020062	TTC	3	9	127236	127244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223076
2741	NC_020062	GATG	2	8	127285	127292	25 %	25 %	50 %	0 %	440223076
2742	NC_020062	CGC	2	6	127297	127302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223076
2743	NC_020062	CG	3	6	127319	127324	0 %	0 %	50 %	50 %	440223076
2744	NC_020062	CGG	2	6	127361	127366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2745	NC_020062	AG	3	6	127410	127415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2746	NC_020062	CAT	2	6	127495	127500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223077
2747	NC_020062	ATC	2	6	127512	127517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223077
2748	NC_020062	CCG	2	6	127555	127560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223077
2749	NC_020062	GC	3	6	127613	127618	0 %	0 %	50 %	50 %	440223077
2750	NC_020062	TCG	2	6	127764	127769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223077
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2753	NC_020062	GCGATC	2	12	128054	128065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223077
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2758	NC_020062	CAT	2	6	128215	128220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223077
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2762	NC_020062	TAT	2	6	128347	128352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2763	NC_020062	ACG	2	6	128461	128466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223078
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2849	NC_020062	AAT	2	6	133062	133067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2850	NC_020062	GAA	2	6	133092	133097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2851	NC_020062	CGC	2	6	133101	133106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2852	NC_020062	TCG	2	6	133111	133116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2853	NC_020062	CGGCG	2	10	133210	133219	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2854	NC_020062	GAC	2	6	133272	133277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2855	NC_020062	GCA	2	6	133324	133329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2856	NC_020062	GCT	2	6	133445	133450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2857	NC_020062	A	7	7	133483	133489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2858	NC_020062	CGC	2	6	133496	133501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2859	NC_020062	CCA	2	6	133510	133515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2860	NC_020062	CCA	2	6	133547	133552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2861	NC_020062	TGG	2	6	133555	133560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2862	NC_020062	GA	3	6	133624	133629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2863	NC_020062	ATG	2	6	133693	133698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2864	NC_020062	GTC	2	6	133797	133802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2865	NC_020062	TG	3	6	133805	133810	0 %	50 %	50 %	0 %	440223082
2866	NC_020062	GCA	2	6	133817	133822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223082
2867	NC_020062	TCT	2	6	133873	133878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223082
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2869	NC_020062	TCAG	2	8	134068	134075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2870	NC_020062	GA	3	6	134136	134141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2992	NC_020062	CGA	2	6	141598	141603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223089
2993	NC_020062	TCC	2	6	141694	141699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2994	NC_020062	AAC	2	6	141703	141708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2995	NC_020062	TTG	2	6	141712	141717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_020062	AT	3	6	141723	141728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_020062	CAT	2	6	141743	141748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2998	NC_020062	ATC	2	6	141964	141969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223090
2999	NC_020062	AGA	2	6	142025	142030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223090
3000	NC_020062	CGA	2	6	142071	142076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223090

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