MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020062	GGC	2	6	68166	68171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223022
1502	NC_020062	CAA	2	6	68178	68183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223022
1503	NC_020062	CGG	2	6	68229	68234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223022
1504	NC_020062	GC	3	6	68252	68257	0 %	0 %	50 %	50 %	440223022
1505	NC_020062	GCGATG	2	12	68296	68307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223022
1506	NC_020062	TGGA	2	8	68376	68383	25 %	25 %	50 %	0 %	440223022
1507	NC_020062	GCC	2	6	68457	68462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223022
1508	NC_020062	CTC	2	6	68635	68640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223022
1509	NC_020062	TTC	2	6	68659	68664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223022
1510	NC_020062	CGGAG	2	10	68690	68699	20 %	0 %	60 %	20 %	440223022
1511	NC_020062	TCT	2	6	68717	68722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223022
1512	NC_020062	TTGCCG	2	12	68735	68746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223022
1513	NC_020062	TGC	2	6	68859	68864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223022
1514	NC_020062	CGA	2	6	68868	68873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223022
1515	NC_020062	GAGCG	2	10	68925	68934	20 %	0 %	60 %	20 %	440223022
1516	NC_020062	GGC	2	6	68941	68946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223022
1517	NC_020062	GGC	2	6	69024	69029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223022
1518	NC_020062	GGC	2	6	69034	69039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223022
1519	NC_020062	CGCT	2	8	69050	69057	0 %	25 %	25 %	50 %	440223022
1520	NC_020062	AGGCC	2	10	69114	69123	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1521	NC_020062	CAT	2	6	69153	69158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223023
1522	NC_020062	TGC	2	6	69218	69223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223023
1523	NC_020062	GCA	2	6	69283	69288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223023
1524	NC_020062	AGAA	2	8	69307	69314	75 %	0 %	25 %	0 %	440223023
1525	NC_020062	GGT	2	6	69348	69353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223023
1526	NC_020062	CGG	2	6	69363	69368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223023
1527	NC_020062	CGA	2	6	69417	69422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223023
1528	NC_020062	CCG	2	6	69435	69440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223023
1529	NC_020062	GGC	2	6	69450	69455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223023
1530	NC_020062	TGA	2	6	69476	69481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223023
1531	NC_020062	GGC	2	6	69537	69542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223023
1532	NC_020062	CTG	2	6	69560	69565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223023
1533	NC_020062	ATCG	2	8	69572	69579	25 %	25 %	25 %	25 %	440223023
1534	NC_020062	GAT	2	6	69639	69644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223023
1535	NC_020062	CCG	2	6	69718	69723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223023
1536	NC_020062	CCA	2	6	69746	69751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223023
1537	NC_020062	CGG	2	6	69800	69805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223023
1538	NC_020062	CAA	2	6	69858	69863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223024
1539	NC_020062	GC	3	6	69928	69933	0 %	0 %	50 %	50 %	440223024
1540	NC_020062	ACAGA	2	10	70129	70138	60 %	0 %	20 %	20 %	440223024
1541	NC_020062	CGA	2	6	70146	70151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223024
1542	NC_020062	GGAT	2	8	70205	70212	25 %	25 %	50 %	0 %	440223024
1543	NC_020062	GC	3	6	70270	70275	0 %	0 %	50 %	50 %	440223024
1544	NC_020062	ACT	2	6	70294	70299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223024
1545	NC_020062	GGC	2	6	70416	70421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_020062	GCG	2	6	70423	70428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_020062	GC	3	6	70469	70474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_020062	GC	3	6	70478	70483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_020062	TTGA	2	8	70491	70498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020062	CG	3	6	70532	70537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_020062	CGAT	2	8	70605	70612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_020062	CGT	2	6	70647	70652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223025
1553	NC_020062	GCT	2	6	70692	70697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223025
1554	NC_020062	GCA	2	6	70791	70796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223025
1555	NC_020062	GTC	2	6	70831	70836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223025
1556	NC_020062	GC	3	6	70929	70934	0 %	0 %	50 %	50 %	440223025
1557	NC_020062	CGA	2	6	70965	70970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223025
1558	NC_020062	GCC	2	6	70999	71004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223025
1559	NC_020062	CAC	2	6	71015	71020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223025
1560	NC_020062	TGA	2	6	71054	71059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223025
1561	NC_020062	ACG	2	6	71087	71092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223025
1562	NC_020062	GC	3	6	71133	71138	0 %	0 %	50 %	50 %	440223025
1563	NC_020062	CAT	2	6	71143	71148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223025
1564	NC_020062	CAGA	2	8	71154	71161	50 %	0 %	25 %	25 %	440223025
1565	NC_020062	ACG	2	6	71171	71176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223025
1566	NC_020062	CAG	2	6	71179	71184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223025
1567	NC_020062	TGG	2	6	71234	71239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223025
1568	NC_020062	GC	3	6	71271	71276	0 %	0 %	50 %	50 %	440223025
1569	NC_020062	CG	3	6	71475	71480	0 %	0 %	50 %	50 %	440223026
1570	NC_020062	CGA	2	6	71489	71494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223026
1571	NC_020062	GC	3	6	71535	71540	0 %	0 %	50 %	50 %	440223026
1572	NC_020062	CTG	2	6	71547	71552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223026
1573	NC_020062	CGG	2	6	71603	71608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223026
1574	NC_020062	ACGGCG	2	12	71689	71700	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223026
1575	NC_020062	GTC	2	6	71706	71711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223026
1576	NC_020062	TGGA	2	8	71712	71719	25 %	25 %	50 %	0 %	440223026
1577	NC_020062	GCA	2	6	71753	71758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223026
1578	NC_020062	GCC	2	6	71812	71817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223026
1579	NC_020062	CGC	2	6	71832	71837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223026
1580	NC_020062	CGC	2	6	71861	71866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223026
1581	NC_020062	GTGC	2	8	71867	71874	0 %	25 %	50 %	25 %	440223026
1582	NC_020062	AG	3	6	71913	71918	50 %	0 %	50 %	0 %	440223026
1583	NC_020062	GC	3	6	71946	71951	0 %	0 %	50 %	50 %	440223026
1584	NC_020062	GTCA	2	8	71994	72001	25 %	25 %	25 %	25 %	440223026
1585	NC_020062	CGAA	2	8	72121	72128	50 %	0 %	25 %	25 %	440223026
1586	NC_020062	GCT	2	6	72221	72226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223027
1587	NC_020062	TCA	2	6	72292	72297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223027
1588	NC_020062	AGG	2	6	72308	72313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223027
1589	NC_020062	ACA	2	6	72342	72347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223027
1590	NC_020062	TGC	2	6	72478	72483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223027
1591	NC_020062	CGA	2	6	72601	72606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223027
1592	NC_020062	C	6	6	72641	72646	0 %	0 %	0 %	100 %	440223027
1593	NC_020062	CGT	3	9	72665	72673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223027
1594	NC_020062	TC	3	6	72738	72743	0 %	50 %	0 %	50 %	440223027
1595	NC_020062	CCT	2	6	72883	72888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223027
1596	NC_020062	GCC	2	6	72951	72956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223027
1597	NC_020062	GCC	2	6	72971	72976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223027
1598	NC_020062	GAG	2	6	72980	72985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223027
1599	NC_020062	GTT	2	6	73030	73035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223027
1600	NC_020062	T	6	6	73153	73158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020062	TTGC	2	8	73192	73199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_020062	GCC	2	6	73220	73225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_020062	CTG	2	6	73241	73246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_020062	CGC	2	6	73282	73287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223028
1605	NC_020062	GCG	2	6	73302	73307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223028
1606	NC_020062	TGACCG	2	12	73387	73398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223028
1607	NC_020062	TTCGCG	2	12	73463	73474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223028
1608	NC_020062	GAC	2	6	73511	73516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223028
1609	NC_020062	CGC	2	6	73535	73540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223028
1610	NC_020062	AGC	2	6	73572	73577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223028
1611	NC_020062	GAT	2	6	73670	73675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223028
1612	NC_020062	CAG	2	6	73697	73702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223028
1613	NC_020062	ATG	2	6	73703	73708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223028
1614	NC_020062	AGC	2	6	73756	73761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223028
1615	NC_020062	CTT	2	6	73792	73797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223028
1616	NC_020062	CGAAG	2	10	73802	73811	40 %	0 %	40 %	20 %	440223028
1617	NC_020062	CCG	2	6	73828	73833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223028
1618	NC_020062	TCA	2	6	73875	73880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223028
1619	NC_020062	GAT	2	6	73883	73888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223028
1620	NC_020062	TGC	2	6	73917	73922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223028
1621	NC_020062	CGA	2	6	74009	74014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223029
1622	NC_020062	A	6	6	74043	74048	100 %	0 %	0 %	0 %	440223029
1623	NC_020062	CCAT	2	8	74050	74057	25 %	25 %	0 %	50 %	440223029
1624	NC_020062	GGC	2	6	74090	74095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223029
1625	NC_020062	TTG	2	6	74131	74136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223029
1626	NC_020062	GCAA	2	8	74214	74221	50 %	0 %	25 %	25 %	440223029
1627	NC_020062	CAG	2	6	74245	74250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223029
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1679	NC_020062	ATCG	2	8	76135	76142	25 %	25 %	25 %	25 %	440223031
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1685	NC_020062	CT	3	6	76284	76289	0 %	50 %	0 %	50 %	440223031
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1752	NC_020062	GGC	3	9	79445	79453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1753	NC_020062	CGG	2	6	79468	79473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1754	NC_020062	CGG	2	6	79480	79485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1755	NC_020062	GCC	2	6	79490	79495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223032
1756	NC_020062	GA	3	6	79515	79520	50 %	0 %	50 %	0 %	440223032
1757	NC_020062	GAT	2	6	79568	79573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1758	NC_020062	AACG	2	8	79661	79668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1759	NC_020062	ATAGC	2	10	79774	79783	40 %	20 %	20 %	20 %	440223033
1760	NC_020062	GCC	2	6	79791	79796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223033
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1763	NC_020062	CAT	2	6	80008	80013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1764	NC_020062	CAGA	2	8	80018	80025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1765	NC_020062	CGA	2	6	80104	80109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223034
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1783	NC_020062	CGC	2	6	80929	80934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223034
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1786	NC_020062	AAC	2	6	81103	81108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1787	NC_020062	TCA	2	6	81153	81158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223035
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1790	NC_020062	GCC	3	9	81227	81235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223035
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1875	NC_020062	TCG	2	6	85322	85327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1876	NC_020062	GGC	2	6	85397	85402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1999	NC_020062	CGA	2	6	91252	91257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223043
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