MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020062	CGGCG	2	10	23647	23656	0 %	0 %	60 %	40 %	440222987
502	NC_020062	GCT	2	6	23665	23670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
503	NC_020062	CCG	2	6	23737	23742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
504	NC_020062	TGC	2	6	23764	23769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
505	NC_020062	CGG	2	6	23788	23793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
506	NC_020062	CGT	2	6	23827	23832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
507	NC_020062	GCG	2	6	23850	23855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
508	NC_020062	GCC	2	6	23961	23966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
509	NC_020062	CG	4	8	24112	24119	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
510	NC_020062	GGTCG	2	10	24149	24158	0 %	20 %	60 %	20 %	440222987
511	NC_020062	GTT	2	6	24227	24232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222987
512	NC_020062	GCCA	2	8	24250	24257	25 %	0 %	25 %	50 %	440222987
513	NC_020062	AGC	2	6	24264	24269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
514	NC_020062	GC	3	6	24292	24297	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
515	NC_020062	GAC	2	6	24451	24456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
516	NC_020062	CGG	2	6	24563	24568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
517	NC_020062	CGC	2	6	24578	24583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
518	NC_020062	CCG	2	6	24586	24591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
519	NC_020062	GGCGAA	2	12	24593	24604	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440222987
520	NC_020062	CGTTA	2	10	24638	24647	20 %	40 %	20 %	20 %	440222987
521	NC_020062	CCGG	2	8	24648	24655	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
522	NC_020062	GTT	2	6	24699	24704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222987
523	NC_020062	GCG	2	6	24757	24762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
524	NC_020062	TGGC	2	8	24769	24776	0 %	25 %	50 %	25 %	440222987
525	NC_020062	GTC	2	6	24855	24860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
526	NC_020062	GCG	2	6	24951	24956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
527	NC_020062	CAGG	2	8	25005	25012	25 %	0 %	50 %	25 %	440222987
528	NC_020062	GCC	2	6	25041	25046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
529	NC_020062	CTC	2	6	25121	25126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222988
530	NC_020062	TCG	2	6	25130	25135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
531	NC_020062	CTG	2	6	25140	25145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
532	NC_020062	GCC	3	9	25227	25235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
533	NC_020062	GAG	2	6	25236	25241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222988
534	NC_020062	GCG	2	6	25242	25247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
535	NC_020062	TCGC	2	8	25294	25301	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
536	NC_020062	CGGA	2	8	25362	25369	25 %	0 %	50 %	25 %	440222988
537	NC_020062	CCG	2	6	25442	25447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
538	NC_020062	GGC	2	6	25463	25468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
539	NC_020062	CGA	2	6	25508	25513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
540	NC_020062	AGC	2	6	25528	25533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
541	NC_020062	GTGG	2	8	25536	25543	0 %	25 %	75 %	0 %	440222988
542	NC_020062	GATC	2	8	25556	25563	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
543	NC_020062	GCG	2	6	25583	25588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
544	NC_020062	CTC	2	6	25589	25594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222988
545	NC_020062	CGAT	2	8	25600	25607	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
546	NC_020062	CGAGC	2	10	25650	25659	20 %	0 %	40 %	40 %	440222988
547	NC_020062	CGA	2	6	25701	25706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
548	NC_020062	GC	3	6	25718	25723	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
549	NC_020062	CCG	2	6	25824	25829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
550	NC_020062	TGG	2	6	25857	25862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222988
551	NC_020062	GGGA	2	8	25895	25902	25 %	0 %	75 %	0 %	440222988
552	NC_020062	GTC	2	6	25935	25940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
553	NC_020062	ACC	2	6	25951	25956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222988
554	NC_020062	GCA	2	6	25967	25972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
555	NC_020062	GTC	2	6	26008	26013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
556	NC_020062	GCG	2	6	26023	26028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
557	NC_020062	ACG	2	6	26080	26085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
558	NC_020062	CACC	2	8	26168	26175	25 %	0 %	0 %	75 %	440222988
559	NC_020062	ACG	2	6	26275	26280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
560	NC_020062	CG	3	6	26330	26335	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
561	NC_020062	GGC	2	6	26377	26382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
562	NC_020062	CGC	2	6	26412	26417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
563	NC_020062	TCG	2	6	26423	26428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
564	NC_020062	GCC	2	6	26518	26523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
565	NC_020062	CGC	2	6	26529	26534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
566	NC_020062	CGG	2	6	26606	26611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
567	NC_020062	G	6	6	26643	26648	0 %	0 %	100 %	0 %	440222988
568	NC_020062	TCGGTG	2	12	26657	26668	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440222988
569	NC_020062	GCCGG	2	10	26727	26736	0 %	0 %	60 %	40 %	440222988
570	NC_020062	TCC	2	6	26743	26748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222988
571	NC_020062	CTTTT	2	10	26772	26781	0 %	80 %	0 %	20 %	440222988
572	NC_020062	CGATA	2	10	26816	26825	40 %	20 %	20 %	20 %	440222988
573	NC_020062	GCG	2	6	26826	26831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
574	NC_020062	TCG	2	6	26872	26877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
575	NC_020062	CGA	2	6	26954	26959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
576	NC_020062	CGG	2	6	26985	26990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
577	NC_020062	GGGA	2	8	27017	27024	25 %	0 %	75 %	0 %	440222988
578	NC_020062	CGA	3	9	27035	27043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
579	NC_020062	GCGT	2	8	27059	27066	0 %	25 %	50 %	25 %	440222988
580	NC_020062	TCGC	2	8	27067	27074	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
581	NC_020062	CGGT	2	8	27122	27129	0 %	25 %	50 %	25 %	440222988
582	NC_020062	GC	5	10	27136	27145	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
583	NC_020062	AGCC	2	8	27189	27196	25 %	0 %	25 %	50 %	440222988
584	NC_020062	CGG	2	6	27236	27241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
585	NC_020062	AGCGC	2	10	27262	27271	20 %	0 %	40 %	40 %	440222988
586	NC_020062	CGC	2	6	27290	27295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
587	NC_020062	CGGC	2	8	27335	27342	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
588	NC_020062	CGC	2	6	27366	27371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
589	NC_020062	GCC	2	6	27401	27406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
590	NC_020062	GCG	2	6	27485	27490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
591	NC_020062	CGA	2	6	27554	27559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
592	NC_020062	GCA	2	6	27572	27577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
593	NC_020062	TGC	2	6	27597	27602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
594	NC_020062	GGC	2	6	27627	27632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
595	NC_020062	CCTG	2	8	27647	27654	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
596	NC_020062	GGC	2	6	27667	27672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
597	NC_020062	TTG	2	6	27673	27678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222988
598	NC_020062	CGG	2	6	27707	27712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
599	NC_020062	GTC	2	6	27750	27755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
600	NC_020062	CCG	2	6	27842	27847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
601	NC_020062	CGT	2	6	27870	27875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
602	NC_020062	CGAT	2	8	27886	27893	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
603	NC_020062	CTG	2	6	27933	27938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
604	NC_020062	GCA	2	6	27950	27955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
605	NC_020062	CGG	3	9	27996	28004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
606	NC_020062	GCA	2	6	28022	28027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
607	NC_020062	ATG	2	6	28036	28041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222988
608	NC_020062	GCG	2	6	28153	28158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
609	NC_020062	GTC	2	6	28167	28172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
610	NC_020062	AGG	2	6	28178	28183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222988
611	NC_020062	CTG	2	6	28194	28199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
612	NC_020062	ATA	2	6	28209	28214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222988
613	NC_020062	CCG	2	6	28273	28278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
614	NC_020062	TCG	2	6	28330	28335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
615	NC_020062	GCCCG	2	10	28380	28389	0 %	0 %	40 %	60 %	440222988
616	NC_020062	GAG	2	6	28470	28475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222988
617	NC_020062	CCA	2	6	28494	28499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222988
618	NC_020062	GTT	2	6	28527	28532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222988
619	NC_020062	CCG	2	6	28566	28571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
620	NC_020062	GC	3	6	28659	28664	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
621	NC_020062	GTC	2	6	28671	28676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
622	NC_020062	CGA	3	9	28748	28756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
623	NC_020062	GAA	2	6	28767	28772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222988
624	NC_020062	GGCA	2	8	28780	28787	25 %	0 %	50 %	25 %	440222988
625	NC_020062	CG	3	6	28790	28795	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
626	NC_020062	ATC	2	6	28833	28838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222989
627	NC_020062	TTG	2	6	28920	28925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222989
628	NC_020062	GCTG	2	8	28966	28973	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
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