MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020061	T	6	6	2661	2666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020061	T	6	6	7787	7792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020061	A	7	7	10554	10560	100 %	0 %	0 %	0 %	440222471
4	NC_020061	T	6	6	17282	17287	0 %	100 %	0 %	0 %	440222478
5	NC_020061	A	6	6	21752	21757	100 %	0 %	0 %	0 %	440222481
6	NC_020061	T	6	6	30099	30104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020061	T	7	7	32252	32258	0 %	100 %	0 %	0 %	440222489
8	NC_020061	C	6	6	33325	33330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_020061	G	7	7	33402	33408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020061	G	6	6	43433	43438	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020061	G	6	6	43577	43582	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020061	G	7	7	45532	45538	0 %	0 %	100 %	0 %	440222501
13	NC_020061	A	6	6	47148	47153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020061	A	7	7	47288	47294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020061	A	6	6	47313	47318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020061	T	6	6	50974	50979	0 %	100 %	0 %	0 %	440222505
17	NC_020061	T	7	7	59101	59107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020061	T	7	7	63901	63907	0 %	100 %	0 %	0 %	440222518
19	NC_020061	T	6	6	66565	66570	0 %	100 %	0 %	0 %	440222520
20	NC_020061	C	6	6	66965	66970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_020061	C	6	6	72327	72332	0 %	0 %	0 %	100 %	440222528
22	NC_020061	G	6	6	78812	78817	0 %	0 %	100 %	0 %	440222534
23	NC_020061	T	6	6	80656	80661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020061	A	6	6	84253	84258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020061	A	6	6	84750	84755	100 %	0 %	0 %	0 %	440222539
26	NC_020061	T	6	6	87291	87296	0 %	100 %	0 %	0 %	440222540
27	NC_020061	G	6	6	87547	87552	0 %	0 %	100 %	0 %	440222540
28	NC_020061	A	6	6	89366	89371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020061	A	6	6	90473	90478	100 %	0 %	0 %	0 %	440222543
30	NC_020061	A	7	7	90606	90612	100 %	0 %	0 %	0 %	440222544
31	NC_020061	C	6	6	94644	94649	0 %	0 %	0 %	100 %	440222549
32	NC_020061	T	6	6	94691	94696	0 %	100 %	0 %	0 %	440222549
33	NC_020061	A	7	7	103864	103870	100 %	0 %	0 %	0 %	440222558
34	NC_020061	A	6	6	104463	104468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020061	C	6	6	105747	105752	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_020061	T	6	6	109006	109011	0 %	100 %	0 %	0 %	440222562
37	NC_020061	A	6	6	110265	110270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020061	A	6	6	112150	112155	100 %	0 %	0 %	0 %	440222565
39	NC_020061	T	6	6	112697	112702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020061	C	6	6	114731	114736	0 %	0 %	0 %	100 %	440222567
41	NC_020061	T	7	7	121229	121235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020061	G	6	6	131194	131199	0 %	0 %	100 %	0 %	440222580
43	NC_020061	T	6	6	134753	134758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020061	C	6	6	134776	134781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_020061	G	6	6	139873	139878	0 %	0 %	100 %	0 %	440222585
46	NC_020061	T	6	6	141468	141473	0 %	100 %	0 %	0 %	440222586
47	NC_020061	C	6	6	143404	143409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_020061	C	6	6	153687	153692	0 %	0 %	0 %	100 %	440222597
49	NC_020061	A	7	7	154914	154920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020061	T	6	6	155447	155452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020061	A	6	6	155673	155678	100 %	0 %	0 %	0 %	440222598
52	NC_020061	C	6	6	158345	158350	0 %	0 %	0 %	100 %	440222601
53	NC_020061	C	7	7	158503	158509	0 %	0 %	0 %	100 %	440222601
54	NC_020061	T	6	6	164118	164123	0 %	100 %	0 %	0 %	440222607
55	NC_020061	A	6	6	164372	164377	100 %	0 %	0 %	0 %	440222607
56	NC_020061	C	6	6	166426	166431	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_020061	C	6	6	167980	167985	0 %	0 %	0 %	100 %	440222611
58	NC_020061	G	6	6	171405	171410	0 %	0 %	100 %	0 %	440222613
59	NC_020061	A	6	6	173153	173158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020061	A	7	7	174019	174025	100 %	0 %	0 %	0 %	440222614
61	NC_020061	A	6	6	174037	174042	100 %	0 %	0 %	0 %	440222614
62	NC_020061	A	6	6	174560	174565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020061	A	6	6	178886	178891	100 %	0 %	0 %	0 %	440222620
64	NC_020061	T	8	8	180906	180913	0 %	100 %	0 %	0 %	440222621
65	NC_020061	T	6	6	185360	185365	0 %	100 %	0 %	0 %	440222624
66	NC_020061	T	6	6	186076	186081	0 %	100 %	0 %	0 %	440222624
67	NC_020061	A	6	6	188395	188400	100 %	0 %	0 %	0 %	440222629
68	NC_020061	G	6	6	191163	191168	0 %	0 %	100 %	0 %	440222632
69	NC_020061	A	6	6	192137	192142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020061	T	6	6	198625	198630	0 %	100 %	0 %	0 %	440222639
71	NC_020061	C	6	6	199634	199639	0 %	0 %	0 %	100 %	440222639
72	NC_020061	A	7	7	201406	201412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020061	C	6	6	201525	201530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_020061	A	7	7	201862	201868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020061	T	6	6	202387	202392	0 %	100 %	0 %	0 %	440222641
76	NC_020061	A	6	6	203504	203509	100 %	0 %	0 %	0 %	440222642
77	NC_020061	A	6	6	204227	204232	100 %	0 %	0 %	0 %	440222642
78	NC_020061	G	6	6	204620	204625	0 %	0 %	100 %	0 %	440222642
79	NC_020061	T	6	6	205549	205554	0 %	100 %	0 %	0 %	440222644
80	NC_020061	G	6	6	205752	205757	0 %	0 %	100 %	0 %	440222644
81	NC_020061	A	6	6	207978	207983	100 %	0 %	0 %	0 %	440222646
82	NC_020061	C	6	6	209140	209145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_020061	A	6	6	210077	210082	100 %	0 %	0 %	0 %	440222648
84	NC_020061	T	6	6	211848	211853	0 %	100 %	0 %	0 %	440222650
85	NC_020061	A	6	6	216667	216672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020061	C	6	6	223353	223358	0 %	0 %	0 %	100 %	440222660
87	NC_020061	G	6	6	225378	225383	0 %	0 %	100 %	0 %	440222662
88	NC_020061	A	8	8	227493	227500	100 %	0 %	0 %	0 %	440222664
89	NC_020061	T	6	6	229429	229434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020061	T	6	6	229539	229544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020061	T	6	6	230991	230996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020061	A	7	7	231001	231007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020061	T	6	6	231034	231039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020061	A	7	7	231121	231127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020061	T	6	6	231389	231394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020061	T	6	6	232546	232551	0 %	100 %	0 %	0 %	440222669
97	NC_020061	T	7	7	241544	241550	0 %	100 %	0 %	0 %	440222678
98	NC_020061	T	7	7	250488	250494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020061	A	7	7	254591	254597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020061	C	6	6	263148	263153	0 %	0 %	0 %	100 %	440222702
101	NC_020061	A	6	6	263310	263315	100 %	0 %	0 %	0 %	440222702
102	NC_020061	T	6	6	265632	265637	0 %	100 %	0 %	0 %	440222705
103	NC_020061	A	6	6	266296	266301	100 %	0 %	0 %	0 %	440222706
104	NC_020061	A	6	6	272387	272392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020061	G	6	6	273454	273459	0 %	0 %	100 %	0 %	440222713
106	NC_020061	G	6	6	273826	273831	0 %	0 %	100 %	0 %	440222713
107	NC_020061	A	6	6	274089	274094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020061	C	7	7	274673	274679	0 %	0 %	0 %	100 %	440222714
109	NC_020061	A	6	6	287521	287526	100 %	0 %	0 %	0 %	440222724
110	NC_020061	A	6	6	287959	287964	100 %	0 %	0 %	0 %	440222725
111	NC_020061	A	6	6	292394	292399	100 %	0 %	0 %	0 %	440222727
112	NC_020061	T	7	7	294124	294130	0 %	100 %	0 %	0 %	440222732
113	NC_020061	A	6	6	295776	295781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020061	A	6	6	299166	299171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020061	T	6	6	301163	301168	0 %	100 %	0 %	0 %	440222739
116	NC_020061	G	6	6	301716	301721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020061	T	6	6	304128	304133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020061	T	6	6	308455	308460	0 %	100 %	0 %	0 %	440222745
119	NC_020061	T	6	6	309752	309757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020061	A	6	6	312793	312798	100 %	0 %	0 %	0 %	440222747
121	NC_020061	G	6	6	313144	313149	0 %	0 %	100 %	0 %	440222747
122	NC_020061	C	6	6	315437	315442	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_020061	T	7	7	322829	322835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020061	A	7	7	327219	327225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020061	T	6	6	327487	327492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020061	G	6	6	327908	327913	0 %	0 %	100 %	0 %	440222757
127	NC_020061	T	6	6	330011	330016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020061	A	6	6	330495	330500	100 %	0 %	0 %	0 %	440222759
129	NC_020061	A	7	7	331621	331627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020061	T	6	6	338744	338749	0 %	100 %	0 %	0 %	440222766
131	NC_020061	G	6	6	341975	341980	0 %	0 %	100 %	0 %	440222768
132	NC_020061	A	6	6	343749	343754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020061	G	6	6	344289	344294	0 %	0 %	100 %	0 %	440222770
134	NC_020061	C	7	7	344568	344574	0 %	0 %	0 %	100 %	440222770
135	NC_020061	G	6	6	347625	347630	0 %	0 %	100 %	0 %	440222773
136	NC_020061	A	7	7	348188	348194	100 %	0 %	0 %	0 %	440222774
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138	NC_020061	G	6	6	355755	355760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020061	G	6	6	360546	360551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020061	T	6	6	361671	361676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020061	T	7	7	361782	361788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020061	A	6	6	362188	362193	100 %	0 %	0 %	0 %	440222785
143	NC_020061	T	6	6	362242	362247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020061	A	7	7	363943	363949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.