MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020061	CT	3	6	174277	174282	0 %	50 %	0 %	50 %	440222614
3502	NC_020061	GTG	2	6	174425	174430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020061	TTG	2	6	174467	174472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_020061	CTC	2	6	174513	174518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_020061	A	6	6	174560	174565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_020061	GGC	3	9	174600	174608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_020061	TG	3	6	174656	174661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020061	TCC	3	9	174680	174688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_020061	CGG	3	9	174696	174704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_020061	ATT	2	6	174712	174717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_020061	TCG	2	6	174823	174828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222615
3512	NC_020061	TTGC	2	8	174843	174850	0 %	50 %	25 %	25 %	440222615
3513	NC_020061	CTC	2	6	174885	174890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222615
3514	NC_020061	CT	4	8	174988	174995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_020061	CAGC	2	8	175193	175200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_020061	CG	3	6	175252	175257	0 %	0 %	50 %	50 %	440222616
3517	NC_020061	GCC	2	6	175329	175334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222616
3518	NC_020061	ACC	2	6	175352	175357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222616
3519	NC_020061	TGC	2	6	175435	175440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222616
3520	NC_020061	GCA	2	6	175468	175473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222616
3521	NC_020061	GAC	2	6	175494	175499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222616
3522	NC_020061	TGA	2	6	175666	175671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222616
3523	NC_020061	CCATT	2	10	175681	175690	20 %	40 %	0 %	40 %	440222616
3524	NC_020061	TCTT	2	8	175702	175709	0 %	75 %	0 %	25 %	440222616
3525	NC_020061	TCG	2	6	175879	175884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222616
3526	NC_020061	GCC	2	6	175903	175908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222616
3527	NC_020061	TCG	2	6	175951	175956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222616
3528	NC_020061	TTG	2	6	176031	176036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222616
3529	NC_020061	GAA	2	6	176070	176075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222616
3530	NC_020061	TTG	2	6	176076	176081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222616
3531	NC_020061	GAT	2	6	176102	176107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222616
3532	NC_020061	GC	3	6	176140	176145	0 %	0 %	50 %	50 %	440222616
3533	NC_020061	TGC	2	6	176169	176174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222616
3534	NC_020061	GAT	2	6	176180	176185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222616
3535	NC_020061	CGG	2	6	176200	176205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222616
3536	NC_020061	CGC	2	6	176264	176269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222616
3537	NC_020061	CGG	2	6	176304	176309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222616
3538	NC_020061	ATC	3	9	176313	176321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222616
3539	NC_020061	GGA	2	6	176327	176332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222616
3540	NC_020061	AAG	2	6	176365	176370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222616
3541	NC_020061	GGC	2	6	176391	176396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222616
3542	NC_020061	CAT	2	6	176478	176483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222617
3543	NC_020061	CG	3	6	176511	176516	0 %	0 %	50 %	50 %	440222617
3544	NC_020061	TGC	2	6	176589	176594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222617
3545	NC_020061	CGA	2	6	176733	176738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_020061	GCT	2	6	176757	176762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_020061	CAT	2	6	176772	176777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_020061	GTCT	2	8	176795	176802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_020061	GCT	2	6	176833	176838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_020061	GCAT	2	8	176877	176884	25 %	25 %	25 %	25 %	440222618
3551	NC_020061	CT	3	6	176960	176965	0 %	50 %	0 %	50 %	440222618
3552	NC_020061	GCC	3	9	176966	176974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222618
3553	NC_020061	CCT	2	6	176977	176982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222618
3554	NC_020061	GA	3	6	177007	177012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_020061	CTTG	2	8	177076	177083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_020061	GAAT	2	8	177095	177102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_020061	TTG	2	6	177147	177152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_020061	TTC	2	6	177225	177230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_020061	CGG	2	6	177232	177237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_020061	GTC	2	6	177284	177289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_020061	TGCA	2	8	177374	177381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_020061	CGCA	2	8	177398	177405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_020061	CAC	2	6	177448	177453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_020061	CCT	2	6	177508	177513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_020061	GAC	4	12	177517	177528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_020061	TAG	2	6	177553	177558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_020061	AT	3	6	177588	177593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_020061	TGG	2	6	177598	177603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_020061	TCA	2	6	177663	177668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_020061	GCG	2	6	177729	177734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_020061	GAT	2	6	177829	177834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222619
3572	NC_020061	TTG	2	6	177839	177844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222619
3573	NC_020061	GCCGC	2	10	177864	177873	0 %	0 %	40 %	60 %	440222619
3574	NC_020061	GTT	2	6	177943	177948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222619
3575	NC_020061	CG	3	6	177954	177959	0 %	0 %	50 %	50 %	440222619
3576	NC_020061	GTT	2	6	177970	177975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222619
3577	NC_020061	GCG	2	6	178061	178066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222619
3578	NC_020061	CGAG	2	8	178109	178116	25 %	0 %	50 %	25 %	440222619
3579	NC_020061	GCC	2	6	178134	178139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222619
3580	NC_020061	TCG	2	6	178156	178161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222619
3581	NC_020061	GGC	2	6	178230	178235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222619
3582	NC_020061	TCG	2	6	178267	178272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_020061	GCG	2	6	178411	178416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_020061	TC	3	6	178489	178494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_020061	GCG	2	6	178543	178548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222620
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3588	NC_020061	CTT	2	6	178716	178721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222620
3589	NC_020061	TTG	2	6	178861	178866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222620
3590	NC_020061	A	6	6	178886	178891	100 %	0 %	0 %	0 %	440222620
3591	NC_020061	TCG	2	6	178897	178902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3592	NC_020061	CTG	2	6	178947	178952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3593	NC_020061	GCC	2	6	178995	179000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222620
3594	NC_020061	CT	3	6	179030	179035	0 %	50 %	0 %	50 %	440222620
3595	NC_020061	GAG	2	6	179046	179051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222620
3596	NC_020061	ATG	2	6	179065	179070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222620
3597	NC_020061	GCAA	2	8	179074	179081	50 %	0 %	25 %	25 %	440222620
3598	NC_020061	TTCG	2	8	179087	179094	0 %	50 %	25 %	25 %	440222620
3599	NC_020061	CCG	2	6	179135	179140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222620
3600	NC_020061	GC	3	6	179200	179205	0 %	0 %	50 %	50 %	440222620
3601	NC_020061	CGA	2	6	179294	179299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3602	NC_020061	GC	3	6	179338	179343	0 %	0 %	50 %	50 %	440222620
3603	NC_020061	TCG	2	6	179467	179472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3604	NC_020061	GAG	2	6	179477	179482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222620
3605	NC_020061	TGCC	2	8	179587	179594	0 %	25 %	25 %	50 %	440222620
3606	NC_020061	CA	3	6	179603	179608	50 %	0 %	0 %	50 %	440222620
3607	NC_020061	GCA	2	6	179621	179626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3608	NC_020061	TGC	2	6	179713	179718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3609	NC_020061	TCG	2	6	179767	179772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3610	NC_020061	TCG	2	6	179811	179816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3611	NC_020061	CATAGG	2	12	179831	179842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440222620
3612	NC_020061	GCA	2	6	179864	179869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222620
3613	NC_020061	GGGA	2	8	179927	179934	25 %	0 %	75 %	0 %	440222620
3614	NC_020061	GA	3	6	179990	179995	50 %	0 %	50 %	0 %	440222620
3615	NC_020061	TC	3	6	180020	180025	0 %	50 %	0 %	50 %	440222620
3616	NC_020061	CGC	2	6	180104	180109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222620
3617	NC_020061	TTG	2	6	180118	180123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222620
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3619	NC_020061	GCCTT	2	10	180140	180149	0 %	40 %	20 %	40 %	440222620
3620	NC_020061	CTCA	2	8	180168	180175	25 %	25 %	0 %	50 %	440222620
3621	NC_020061	AGG	2	6	180196	180201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222620
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3623	NC_020061	TTG	2	6	180298	180303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222620
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3625	NC_020061	CTC	2	6	180444	180449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222620
3626	NC_020061	CCAA	2	8	180453	180460	50 %	0 %	0 %	50 %	440222620
3627	NC_020061	GC	3	6	180469	180474	0 %	0 %	50 %	50 %	440222620
3628	NC_020061	GGACT	2	10	180576	180585	20 %	20 %	40 %	20 %	440222620
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3631	NC_020061	ACG	2	6	180657	180662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3633	NC_020061	GC	3	6	180677	180682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_020061	GCC	2	6	180729	180734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3635	NC_020061	GCAG	2	8	180735	180742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3636	NC_020061	GCA	2	6	180835	180840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3645	NC_020061	TCG	2	6	181304	181309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222621
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3655	NC_020061	GTG	2	6	181814	181819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3656	NC_020061	GGT	2	6	181904	181909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3657	NC_020061	TCG	2	6	182025	182030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3659	NC_020061	TCCC	2	8	182126	182133	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3660	NC_020061	TGG	2	6	182136	182141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3745	NC_020061	TGAT	2	8	186635	186642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3746	NC_020061	ACG	2	6	186770	186775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222626
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3832	NC_020061	CCT	2	6	190977	190982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3863	NC_020061	TAG	2	6	192901	192906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3874	NC_020061	CT	3	6	193377	193382	0 %	50 %	0 %	50 %	440222635
3875	NC_020061	GAG	2	6	193399	193404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222635
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3877	NC_020061	GCG	2	6	193424	193429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222635
3878	NC_020061	CTG	2	6	193482	193487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222635
3879	NC_020061	TCT	2	6	193495	193500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222635
3880	NC_020061	GTG	2	6	193562	193567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222635
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3887	NC_020061	GGA	2	6	193882	193887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222635
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3896	NC_020061	AT	3	6	194392	194397	50 %	50 %	0 %	0 %	440222635
3897	NC_020061	AT	3	6	194446	194451	50 %	50 %	0 %	0 %	440222635
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3900	NC_020061	GTGGTT	2	12	194507	194518	0 %	50 %	50 %	0 %	440222635
3901	NC_020061	CTC	2	6	194520	194525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222635
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3904	NC_020061	CGT	2	6	194921	194926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3994	NC_020061	TTG	2	6	199229	199234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222639
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3996	NC_020061	GAC	2	6	199327	199332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222639
3997	NC_020061	ATC	2	6	199523	199528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222639
3998	NC_020061	GCC	2	6	199579	199584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222639
3999	NC_020061	GTTC	2	8	199604	199611	0 %	50 %	25 %	25 %	440222639
4000	NC_020061	ACG	2	6	199619	199624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222639

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