MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020061	TC	3	6	122003	122008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_020061	TCG	2	6	122030	122035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_020061	CGA	2	6	122036	122041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_020061	ATG	2	6	122049	122054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020061	GC	3	6	122133	122138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_020061	GTGC	2	8	122151	122158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2507	NC_020061	AGCGGG	2	12	122170	122181	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2508	NC_020061	AAC	2	6	122263	122268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_020061	GC	3	6	122294	122299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_020061	GC	3	6	122313	122318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2511	NC_020061	GCG	2	6	122361	122366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_020061	AGC	2	6	122425	122430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_020061	TC	3	6	122437	122442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_020061	CCG	3	9	122452	122460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_020061	TCC	2	6	122493	122498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_020061	GAG	2	6	122508	122513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_020061	CGC	2	6	122517	122522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_020061	ATC	2	6	122628	122633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_020061	CGA	2	6	122642	122647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_020061	GGC	2	6	122774	122779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_020061	GAG	3	9	122874	122882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_020061	CAG	2	6	122894	122899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_020061	TCG	2	6	123169	123174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_020061	ACG	2	6	123226	123231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_020061	CTG	2	6	123421	123426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222573
2526	NC_020061	GTT	2	6	123462	123467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222573
2527	NC_020061	GGAA	2	8	123468	123475	50 %	0 %	50 %	0 %	440222573
2528	NC_020061	TCGG	2	8	123520	123527	0 %	25 %	50 %	25 %	440222573
2529	NC_020061	GGC	2	6	123601	123606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_020061	GGC	2	6	123860	123865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222574
2531	NC_020061	GCGG	2	8	123893	123900	0 %	0 %	75 %	25 %	440222574
2532	NC_020061	TCA	2	6	123931	123936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222574
2533	NC_020061	CGT	2	6	123947	123952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222574
2534	NC_020061	ACC	2	6	124125	124130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222574
2535	NC_020061	GCG	2	6	124139	124144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222574
2536	NC_020061	CCAG	2	8	124170	124177	25 %	0 %	25 %	50 %	440222574
2537	NC_020061	CGC	2	6	124215	124220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222574
2538	NC_020061	CAG	2	6	124280	124285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222574
2539	NC_020061	CGC	2	6	124315	124320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222574
2540	NC_020061	TGCAT	2	10	124350	124359	20 %	40 %	20 %	20 %	440222574
2541	NC_020061	AGA	2	6	124420	124425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222574
2542	NC_020061	TTTTG	2	10	124640	124649	0 %	80 %	20 %	0 %	440222574
2543	NC_020061	CCG	2	6	124716	124721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222575
2544	NC_020061	CGC	2	6	124743	124748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222575
2545	NC_020061	GGC	2	6	124752	124757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222575
2546	NC_020061	ACG	2	6	124780	124785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222575
2547	NC_020061	GC	3	6	124796	124801	0 %	0 %	50 %	50 %	440222575
2548	NC_020061	TCC	2	6	124833	124838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222575
2549	NC_020061	GAT	2	6	124875	124880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222575
2550	NC_020061	CCG	2	6	124897	124902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222575
2551	NC_020061	CGA	2	6	124940	124945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222575
2552	NC_020061	CGG	2	6	125063	125068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222575
2553	NC_020061	ACG	2	6	125098	125103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222575
2554	NC_020061	TGCT	2	8	125115	125122	0 %	50 %	25 %	25 %	440222575
2555	NC_020061	ACAG	2	8	125237	125244	50 %	0 %	25 %	25 %	440222575
2556	NC_020061	CTT	2	6	125363	125368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222575
2557	NC_020061	ATCG	2	8	125423	125430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2558	NC_020061	GC	4	8	125471	125478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2559	NC_020061	AG	3	6	125489	125494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020061	ACC	2	6	125526	125531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_020061	CGC	2	6	125577	125582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_020061	AGC	2	6	125583	125588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_020061	CGAT	2	8	125598	125605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2564	NC_020061	CAGG	2	8	125657	125664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2565	NC_020061	GCC	2	6	125778	125783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2566	NC_020061	GCTGC	2	10	125836	125845	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2567	NC_020061	AGA	2	6	125884	125889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_020061	AGC	2	6	125890	125895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_020061	TCG	2	6	125922	125927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_020061	GAT	2	6	125945	125950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_020061	CGG	2	6	126013	126018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_020061	GGC	2	6	126023	126028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_020061	CGA	2	6	126057	126062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_020061	CGC	2	6	126094	126099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_020061	GA	3	6	126155	126160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020061	CGG	2	6	126209	126214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222576
2577	NC_020061	CGT	2	6	126258	126263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222576
2578	NC_020061	GC	3	6	126358	126363	0 %	0 %	50 %	50 %	440222576
2579	NC_020061	CGT	2	6	126388	126393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222576
2580	NC_020061	GCAG	2	8	126402	126409	25 %	0 %	50 %	25 %	440222576
2581	NC_020061	CG	4	8	126438	126445	0 %	0 %	50 %	50 %	440222576
2582	NC_020061	CAT	2	6	126463	126468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222576
2583	NC_020061	CTT	2	6	126475	126480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222576
2584	NC_020061	CG	3	6	126523	126528	0 %	0 %	50 %	50 %	440222576
2585	NC_020061	GTC	2	6	126568	126573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222576
2586	NC_020061	TGC	2	6	126607	126612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222576
2587	NC_020061	CTC	2	6	126616	126621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222576
2588	NC_020061	CGA	2	6	126709	126714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222576
2589	NC_020061	GA	3	6	126734	126739	50 %	0 %	50 %	0 %	440222576
2590	NC_020061	CGC	2	6	126751	126756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222576
2591	NC_020061	TCA	2	6	126791	126796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222576
2592	NC_020061	CAA	2	6	126814	126819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222576
2593	NC_020061	GCGGGA	2	12	126830	126841	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	440222576
2594	NC_020061	GCC	2	6	126941	126946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222576
2595	NC_020061	CG	3	6	127060	127065	0 %	0 %	50 %	50 %	440222576
2596	NC_020061	GTG	2	6	127126	127131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222576
2597	NC_020061	TGG	3	9	127133	127141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222576
2598	NC_020061	CTGTGG	2	12	127142	127153	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440222576
2599	NC_020061	CTC	2	6	127171	127176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222576
2600	NC_020061	TGA	3	9	127208	127216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222576
2601	NC_020061	CAT	2	6	127320	127325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222576
2602	NC_020061	TG	3	6	127326	127331	0 %	50 %	50 %	0 %	440222576
2603	NC_020061	TC	3	6	127381	127386	0 %	50 %	0 %	50 %	440222576
2604	NC_020061	CGA	2	6	127428	127433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222576
2605	NC_020061	CCT	2	6	127488	127493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_020061	TGC	2	6	127507	127512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222577
2607	NC_020061	CGC	2	6	127575	127580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222577
2608	NC_020061	GTC	2	6	127641	127646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222577
2609	NC_020061	CCG	2	6	127720	127725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222577
2610	NC_020061	CAG	2	6	127824	127829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222577
2611	NC_020061	CAG	2	6	127869	127874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222577
2612	NC_020061	CTT	2	6	127893	127898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222577
2613	NC_020061	TCT	2	6	127946	127951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222577
2614	NC_020061	AGG	2	6	128002	128007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222577
2615	NC_020061	CGC	2	6	128012	128017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222577
2616	NC_020061	CTGCCT	2	12	128059	128070	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440222578
2617	NC_020061	CGG	2	6	128092	128097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222578
2618	NC_020061	GGC	3	9	128156	128164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222578
2619	NC_020061	GAC	2	6	128165	128170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222578
2620	NC_020061	AGC	2	6	128208	128213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222578
2621	NC_020061	GC	3	6	128251	128256	0 %	0 %	50 %	50 %	440222578
2622	NC_020061	TGA	2	6	128299	128304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222578
2623	NC_020061	TCGTC	2	10	128320	128329	0 %	40 %	20 %	40 %	440222578
2624	NC_020061	GC	3	6	128375	128380	0 %	0 %	50 %	50 %	440222578
2625	NC_020061	CGC	2	6	128397	128402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222578
2626	NC_020061	CCA	2	6	128482	128487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222578
2627	NC_020061	CTC	2	6	128498	128503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222578
2628	NC_020061	CG	3	6	128510	128515	0 %	0 %	50 %	50 %	440222578
2629	NC_020061	GC	3	6	128561	128566	0 %	0 %	50 %	50 %	440222578
2630	NC_020061	GGA	2	6	128603	128608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222578
2631	NC_020061	CCA	2	6	128677	128682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222578
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2633	NC_020061	CGC	2	6	128794	128799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222578
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2640	NC_020061	CGG	2	6	129004	129009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222578
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2642	NC_020061	CGA	2	6	129031	129036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222578
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2663	NC_020061	GCGCG	2	10	129925	129934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2664	NC_020061	ATT	2	6	129964	129969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2666	NC_020061	GCC	2	6	130087	130092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2745	NC_020061	AGT	2	6	133999	134004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2746	NC_020061	AGC	3	9	134007	134015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2748	NC_020061	ACG	2	6	134070	134075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2749	NC_020061	CGG	2	6	134105	134110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2750	NC_020061	ATG	2	6	134165	134170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2751	NC_020061	GCC	2	6	134185	134190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2752	NC_020061	CG	3	6	134196	134201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2753	NC_020061	CCA	2	6	134272	134277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2754	NC_020061	TGC	2	6	134329	134334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2773	NC_020061	GTAG	2	8	135551	135558	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2784	NC_020061	AGT	2	6	135872	135877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2996	NC_020061	GCT	2	6	146936	146941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2998	NC_020061	GCT	2	6	147291	147296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3000	NC_020061	CGC	2	6	147390	147395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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