MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020061	GGC	2	6	98026	98031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222552
2002	NC_020061	CGG	3	9	98154	98162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222552
2003	NC_020061	CAG	2	6	98191	98196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222552
2004	NC_020061	TCG	2	6	98228	98233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222552
2005	NC_020061	CAG	2	6	98347	98352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222552
2006	NC_020061	CAA	2	6	98449	98454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222552
2007	NC_020061	CAT	2	6	98488	98493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222552
2008	NC_020061	CAG	2	6	98539	98544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222552
2009	NC_020061	GGC	2	6	98599	98604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222552
2010	NC_020061	AGC	2	6	98616	98621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222552
2011	NC_020061	ATC	2	6	98626	98631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222552
2012	NC_020061	GGC	2	6	98659	98664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222552
2013	NC_020061	CGA	2	6	98913	98918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_020061	GCA	2	6	98921	98926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_020061	ATC	2	6	98930	98935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_020061	GCG	2	6	99004	99009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222553
2017	NC_020061	GCC	2	6	99021	99026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222553
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2020	NC_020061	CCG	2	6	99068	99073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222553
2021	NC_020061	CGAC	2	8	99159	99166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2042	NC_020061	GACC	2	8	99912	99919	25 %	0 %	25 %	50 %	440222556
2043	NC_020061	GGTG	2	8	100130	100137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2053	NC_020061	GGA	2	6	100630	100635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2056	NC_020061	CCGG	2	8	100696	100703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2057	NC_020061	GCC	2	6	100724	100729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2058	NC_020061	GCACG	2	10	100888	100897	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2060	NC_020061	AAGGCG	2	12	101144	101155	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440222557
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2099	NC_020061	CTT	2	6	103115	103120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2101	NC_020061	AT	3	6	103187	103192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2104	NC_020061	TGCGA	2	10	103374	103383	20 %	20 %	40 %	20 %	440222558
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2111	NC_020061	GAGC	2	8	103761	103768	25 %	0 %	50 %	25 %	440222558
2112	NC_020061	A	7	7	103864	103870	100 %	0 %	0 %	0 %	440222558
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2123	NC_020061	CAT	2	6	104396	104401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222559
2124	NC_020061	A	6	6	104463	104468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_020061	GAT	2	6	104488	104493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_020061	CAG	2	6	104517	104522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_020061	GAA	2	6	104551	104556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_020061	TGC	2	6	104653	104658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_020061	TCG	2	6	104743	104748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2131	NC_020061	TGC	2	6	104800	104805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2143	NC_020061	TCGC	2	8	105567	105574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2144	NC_020061	CAT	3	9	105684	105692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2236	NC_020061	ATCT	2	8	110250	110257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2237	NC_020061	A	6	6	110265	110270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2239	NC_020061	ACC	2	6	110412	110417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2240	NC_020061	CGA	2	6	110424	110429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222564
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2247	NC_020061	GCCGC	2	10	110685	110694	0 %	0 %	40 %	60 %	440222564
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2252	NC_020061	ACCT	2	8	110905	110912	25 %	25 %	0 %	50 %	440222564
2253	NC_020061	GGT	2	6	110926	110931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222564
2254	NC_020061	ATC	2	6	110953	110958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222564
2255	NC_020061	CCGAGG	2	12	111017	111028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440222564
2256	NC_020061	TTC	2	6	111044	111049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222564
2257	NC_020061	GCG	2	6	111074	111079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222564
2258	NC_020061	TCG	2	6	111086	111091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222564
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2261	NC_020061	GTC	2	6	111451	111456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222564
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2269	NC_020061	TCG	2	6	111767	111772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2271	NC_020061	AAG	2	6	111782	111787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2272	NC_020061	GCC	2	6	111802	111807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2273	NC_020061	TC	3	6	111842	111847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2274	NC_020061	GAA	2	6	111860	111865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_020061	TGTCCA	2	12	111891	111902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2276	NC_020061	CAA	2	6	111937	111942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2277	NC_020061	AACA	2	8	111965	111972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2278	NC_020061	ACC	2	6	111996	112001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222565
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2281	NC_020061	CTTT	2	8	112114	112121	0 %	75 %	0 %	25 %	440222565
2282	NC_020061	A	6	6	112150	112155	100 %	0 %	0 %	0 %	440222565
2283	NC_020061	ACTC	2	8	112157	112164	25 %	25 %	0 %	50 %	440222565
2284	NC_020061	GTT	2	6	112265	112270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222565
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2287	NC_020061	CAA	2	6	112467	112472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2288	NC_020061	TGT	2	6	112486	112491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2291	NC_020061	T	6	6	112697	112702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2292	NC_020061	GTC	2	6	112709	112714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2352	NC_020061	GAG	2	6	115519	115524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2479	NC_020061	CAT	2	6	121282	121287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2481	NC_020061	TGG	2	6	121361	121366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2483	NC_020061	CCT	2	6	121428	121433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2484	NC_020061	GCC	3	9	121447	121455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2486	NC_020061	GTGC	2	8	121543	121550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2487	NC_020061	GAA	2	6	121552	121557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2499	NC_020061	GAC	2	6	121982	121987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2500	NC_020061	GGCG	2	8	121991	121998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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