MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_020061	GAA	2	6	528469	528474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222935
10502	NC_020061	GCTC	2	8	528480	528487	0 %	25 %	25 %	50 %	440222935
10503	NC_020061	GACGC	2	10	528521	528530	20 %	0 %	40 %	40 %	440222935
10504	NC_020061	CCG	2	6	528568	528573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
10505	NC_020061	AAC	2	6	528588	528593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222935
10506	NC_020061	CCA	2	6	528624	528629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222935
10507	NC_020061	CT	4	8	528683	528690	0 %	50 %	0 %	50 %	440222935
10508	NC_020061	GCC	2	6	528753	528758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
10509	NC_020061	AGGC	2	8	528771	528778	25 %	0 %	50 %	25 %	440222935
10510	NC_020061	ACG	2	6	528818	528823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
10511	NC_020061	CTTCG	2	10	528860	528869	0 %	40 %	20 %	40 %	440222935
10512	NC_020061	CGCA	2	8	528901	528908	25 %	0 %	25 %	50 %	440222935
10513	NC_020061	CGC	2	6	528958	528963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
10514	NC_020061	GGC	2	6	528979	528984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
10515	NC_020061	CCG	2	6	529008	529013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
10516	NC_020061	AGG	2	6	529047	529052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222935
10517	NC_020061	CAC	2	6	529075	529080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222935
10518	NC_020061	GTC	2	6	529103	529108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222935
10519	NC_020061	GAA	2	6	529138	529143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222935
10520	NC_020061	GGA	2	6	529150	529155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222935
10521	NC_020061	GC	3	6	529163	529168	0 %	0 %	50 %	50 %	440222935
10522	NC_020061	CGATG	2	10	529219	529228	20 %	20 %	40 %	20 %	440222935
10523	NC_020061	GCG	3	9	529241	529249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
10524	NC_020061	CGA	2	6	529254	529259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
10525	NC_020061	GCCG	2	8	529322	529329	0 %	0 %	50 %	50 %	440222935
10526	NC_020061	GAG	2	6	529439	529444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222935
10527	NC_020061	TC	4	8	529464	529471	0 %	50 %	0 %	50 %	440222935
10528	NC_020061	CGG	2	6	529491	529496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
10529	NC_020061	ATCG	2	8	529529	529536	25 %	25 %	25 %	25 %	440222935
10530	NC_020061	CGC	2	6	529654	529659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
10531	NC_020061	GCA	2	6	529759	529764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
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10533	NC_020061	CTG	2	6	529922	529927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222936
10534	NC_020061	CGAG	2	8	529988	529995	25 %	0 %	50 %	25 %	440222936
10535	NC_020061	GAC	2	6	530044	530049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222936
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10537	NC_020061	GC	3	6	530098	530103	0 %	0 %	50 %	50 %	440222936
10538	NC_020061	CGC	2	6	530141	530146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222936
10539	NC_020061	TCA	2	6	530147	530152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222936
10540	NC_020061	GGT	2	6	530157	530162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222936
10541	NC_020061	GCG	2	6	530282	530287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222936
10542	NC_020061	GCT	2	6	530431	530436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222937
10543	NC_020061	ATC	2	6	530438	530443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222937
10544	NC_020061	TCGG	2	8	530447	530454	0 %	25 %	50 %	25 %	440222937
10545	NC_020061	TGT	2	6	530487	530492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222937
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10548	NC_020061	TGC	2	6	530620	530625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222937
10549	NC_020061	CTG	3	9	530642	530650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222937
10550	NC_020061	TGGC	2	8	530651	530658	0 %	25 %	50 %	25 %	440222937
10551	NC_020061	AGG	2	6	530703	530708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222937
10552	NC_020061	GGC	2	6	530737	530742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222937
10553	NC_020061	TGG	2	6	530751	530756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222937
10554	NC_020061	GTT	2	6	530809	530814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222937
10555	NC_020061	GGGATG	2	12	530818	530829	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	440222937
10556	NC_020061	CCG	2	6	530925	530930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222937
10557	NC_020061	GGAC	2	8	530937	530944	25 %	0 %	50 %	25 %	440222937
10558	NC_020061	GTCG	2	8	530992	530999	0 %	25 %	50 %	25 %	440222937
10559	NC_020061	TCCT	2	8	531081	531088	0 %	50 %	0 %	50 %	440222937
10560	NC_020061	CG	3	6	531137	531142	0 %	0 %	50 %	50 %	440222937
10561	NC_020061	TGG	2	6	531210	531215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222937
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10564	NC_020061	GTC	2	6	531347	531352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222937
10565	NC_020061	CGGG	2	8	531364	531371	0 %	0 %	75 %	25 %	440222937
10566	NC_020061	TGG	2	6	531467	531472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222937
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10568	NC_020061	CCG	2	6	531513	531518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222937
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10570	NC_020061	GAG	2	6	531573	531578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_020061	CGC	2	6	531592	531597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222938
10572	NC_020061	TCG	2	6	531639	531644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222938
10573	NC_020061	TCG	2	6	531651	531656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222938
10574	NC_020061	CGG	3	9	531657	531665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222938
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10577	NC_020061	TTG	2	6	531915	531920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222938
10578	NC_020061	GT	3	6	532017	532022	0 %	50 %	50 %	0 %	440222938
10579	NC_020061	AAGCG	2	10	532066	532075	40 %	0 %	40 %	20 %	440222938
10580	NC_020061	GCCA	2	8	532093	532100	25 %	0 %	25 %	50 %	440222938
10581	NC_020061	GATC	2	8	532162	532169	25 %	25 %	25 %	25 %	440222938
10582	NC_020061	GCAT	2	8	532243	532250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10583	NC_020061	ATC	2	6	532252	532257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10584	NC_020061	TCG	2	6	532259	532264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10585	NC_020061	TCC	2	6	532365	532370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10586	NC_020061	CAG	2	6	532495	532500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222939
10587	NC_020061	TCGA	2	8	532594	532601	25 %	25 %	25 %	25 %	440222939
10588	NC_020061	TGCC	2	8	532602	532609	0 %	25 %	25 %	50 %	440222939
10589	NC_020061	CTT	2	6	532623	532628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222939
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10591	NC_020061	GA	3	6	532697	532702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_020061	CTT	2	6	532807	532812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_020061	AG	3	6	532978	532983	50 %	0 %	50 %	0 %	440222940
10594	NC_020061	CCG	2	6	533049	533054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222940
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10600	NC_020061	AAACC	2	10	533262	533271	60 %	0 %	0 %	40 %	440222941
10601	NC_020061	TCG	2	6	533304	533309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222941
10602	NC_020061	TGCG	2	8	533325	533332	0 %	25 %	50 %	25 %	440222941
10603	NC_020061	GCC	2	6	533408	533413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222941
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10606	NC_020061	TCG	2	6	533466	533471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222941
10607	NC_020061	ATCG	2	8	533701	533708	25 %	25 %	25 %	25 %	440222941
10608	NC_020061	GC	3	6	533817	533822	0 %	0 %	50 %	50 %	440222941
10609	NC_020061	GAAC	2	8	533877	533884	50 %	0 %	25 %	25 %	440222941
10610	NC_020061	ATC	2	6	533903	533908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222941
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10612	NC_020061	ACC	2	6	534005	534010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10613	NC_020061	CGA	2	6	534017	534022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222942
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10615	NC_020061	TGC	2	6	534070	534075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222942
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10618	NC_020061	GAA	2	6	534152	534157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222942
10619	NC_020061	CGGG	2	8	534210	534217	0 %	0 %	75 %	25 %	440222942
10620	NC_020061	GCCGC	2	10	534278	534287	0 %	0 %	40 %	60 %	440222942
10621	NC_020061	CGG	2	6	534307	534312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222942
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10850	NC_020061	TGGA	2	8	544875	544882	25 %	25 %	50 %	0 %	440222953
10851	NC_020061	TCGAA	2	10	545003	545012	40 %	20 %	20 %	20 %	440222953
10852	NC_020061	GAT	2	6	545062	545067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222953
10853	NC_020061	CCT	2	6	545105	545110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222953
10854	NC_020061	TCG	2	6	545223	545228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222953
10855	NC_020061	CCCAA	2	10	545352	545361	40 %	0 %	0 %	60 %	440222953
10856	NC_020061	GAT	2	6	545391	545396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222953
10857	NC_020061	CAA	2	6	545445	545450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222953
10858	NC_020061	CG	4	8	545550	545557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10859	NC_020061	CTGAT	2	10	545576	545585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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