MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020061	GAA	2	6	301103	301108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222739
6002	NC_020061	TCC	2	6	301114	301119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222739
6003	NC_020061	ATT	2	6	301122	301127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222739
6004	NC_020061	T	6	6	301163	301168	0 %	100 %	0 %	0 %	440222739
6005	NC_020061	TC	3	6	301218	301223	0 %	50 %	0 %	50 %	440222739
6006	NC_020061	CTG	2	6	301251	301256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222739
6007	NC_020061	CAA	2	6	301313	301318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222739
6008	NC_020061	CTG	2	6	301339	301344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222739
6009	NC_020061	AG	3	6	301410	301415	50 %	0 %	50 %	0 %	440222739
6010	NC_020061	ATG	2	6	301476	301481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222739
6011	NC_020061	GTA	2	6	301551	301556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222739
6012	NC_020061	TTA	2	6	301582	301587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222739
6013	NC_020061	CTT	2	6	301590	301595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222739
6014	NC_020061	GTCC	2	8	301652	301659	0 %	25 %	25 %	50 %	440222739
6015	NC_020061	G	6	6	301716	301721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_020061	TTG	2	6	301856	301861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_020061	AGC	2	6	301991	301996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222740
6018	NC_020061	GTT	2	6	302068	302073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222740
6019	NC_020061	TCG	2	6	302103	302108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222740
6020	NC_020061	TC	3	6	302115	302120	0 %	50 %	0 %	50 %	440222740
6021	NC_020061	CGC	2	6	302121	302126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222740
6022	NC_020061	TTC	2	6	302150	302155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222740
6023	NC_020061	CCGT	2	8	302216	302223	0 %	25 %	25 %	50 %	440222740
6024	NC_020061	AAG	2	6	302225	302230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222740
6025	NC_020061	CAG	2	6	302274	302279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222740
6026	NC_020061	CG	4	8	302371	302378	0 %	0 %	50 %	50 %	440222740
6027	NC_020061	GCC	2	6	302464	302469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222740
6028	NC_020061	TGC	2	6	302535	302540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222740
6029	NC_020061	GC	3	6	302549	302554	0 %	0 %	50 %	50 %	440222740
6030	NC_020061	CG	3	6	302624	302629	0 %	0 %	50 %	50 %	440222740
6031	NC_020061	AC	3	6	302630	302635	50 %	0 %	0 %	50 %	440222740
6032	NC_020061	CTG	2	6	302645	302650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222740
6033	NC_020061	CGG	2	6	302674	302679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222740
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6035	NC_020061	GGT	2	6	302770	302775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222740
6036	NC_020061	CT	3	6	302792	302797	0 %	50 %	0 %	50 %	440222740
6037	NC_020061	CCAT	2	8	302859	302866	25 %	25 %	0 %	50 %	440222740
6038	NC_020061	AGAT	2	8	302906	302913	50 %	25 %	25 %	0 %	440222740
6039	NC_020061	CCT	2	6	302916	302921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222740
6040	NC_020061	GAT	2	6	303001	303006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222740
6041	NC_020061	GCA	2	6	303027	303032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222740
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6043	NC_020061	CGG	2	6	303091	303096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222740
6044	NC_020061	GTC	2	6	303157	303162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222740
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6048	NC_020061	TCG	2	6	303326	303331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222740
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6050	NC_020061	TCG	2	6	303419	303424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222740
6051	NC_020061	GAT	2	6	303493	303498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222740
6052	NC_020061	GTC	2	6	303520	303525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222740
6053	NC_020061	CGT	2	6	303620	303625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_020061	GGCGG	2	10	303658	303667	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6055	NC_020061	GACG	2	8	303720	303727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_020061	GCA	2	6	303731	303736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_020061	CAG	2	6	303749	303754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_020061	ATT	2	6	303770	303775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_020061	CCA	2	6	303805	303810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_020061	GC	3	6	303878	303883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_020061	ATA	2	6	303975	303980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_020061	CT	3	6	303989	303994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_020061	CGG	2	6	304098	304103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_020061	T	6	6	304128	304133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_020061	AGCG	2	8	304148	304155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_020061	GC	3	6	304183	304188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_020061	TTC	2	6	304212	304217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_020061	GCC	2	6	304224	304229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_020061	TGC	2	6	304300	304305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_020061	TTC	2	6	304377	304382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_020061	GGCT	2	8	304396	304403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_020061	GCC	2	6	304465	304470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_020061	CGAT	2	8	304500	304507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_020061	ACG	2	6	304520	304525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_020061	CTG	3	9	304553	304561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_020061	GTG	2	6	304673	304678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_020061	GC	3	6	304723	304728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_020061	CGC	3	9	304770	304778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_020061	GCA	2	6	304909	304914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_020061	TCT	2	6	304939	304944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_020061	CTCG	2	8	305097	305104	0 %	25 %	25 %	50 %	440222741
6082	NC_020061	AAGC	2	8	305119	305126	50 %	0 %	25 %	25 %	440222741
6083	NC_020061	GC	3	6	305136	305141	0 %	0 %	50 %	50 %	440222741
6084	NC_020061	CGCC	2	8	305177	305184	0 %	0 %	25 %	75 %	440222741
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6089	NC_020061	GC	3	6	305401	305406	0 %	0 %	50 %	50 %	440222741
6090	NC_020061	TTG	2	6	305458	305463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222741
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6095	NC_020061	GC	3	6	305823	305828	0 %	0 %	50 %	50 %	440222741
6096	NC_020061	TAC	2	6	305896	305901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222741
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6098	NC_020061	TCT	2	6	305919	305924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222741
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6104	NC_020061	TCGA	2	8	306145	306152	25 %	25 %	25 %	25 %	440222742
6105	NC_020061	CGA	2	6	306173	306178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222742
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6109	NC_020061	CCA	2	6	306248	306253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222742
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6113	NC_020061	CG	3	6	306414	306419	0 %	0 %	50 %	50 %	440222742
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6122	NC_020061	CA	3	6	306748	306753	50 %	0 %	0 %	50 %	440222742
6123	NC_020061	GCAC	2	8	306827	306834	25 %	0 %	25 %	50 %	440222742
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6125	NC_020061	GCC	2	6	306858	306863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222742
6126	NC_020061	GAT	2	6	306875	306880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222742
6127	NC_020061	CTG	2	6	306957	306962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222742
6128	NC_020061	GCC	2	6	307078	307083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_020061	CAG	2	6	307203	307208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222743
6130	NC_020061	GATC	2	8	307214	307221	25 %	25 %	25 %	25 %	440222743
6131	NC_020061	GTGTC	2	10	307238	307247	0 %	40 %	40 %	20 %	440222743
6132	NC_020061	GTCC	2	8	307269	307276	0 %	25 %	25 %	50 %	440222743
6133	NC_020061	GAACC	2	10	307331	307340	40 %	0 %	20 %	40 %	440222743
6134	NC_020061	CGC	2	6	307357	307362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222743
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6138	NC_020061	CCG	2	6	307505	307510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222743
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6140	NC_020061	ATG	3	9	307742	307750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222744
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6165	NC_020061	GGA	2	6	309033	309038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6169	NC_020061	ATA	2	6	309170	309175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6178	NC_020061	TGA	2	6	309731	309736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6185	NC_020061	TTG	2	6	310087	310092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6244	NC_020061	TGGCT	2	10	313057	313066	0 %	40 %	40 %	20 %	440222747
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6252	NC_020061	TGG	2	6	313417	313422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222747
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6257	NC_020061	CGA	2	6	313676	313681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6380	NC_020061	GAG	2	6	320029	320034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222752
6381	NC_020061	GGC	2	6	320103	320108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222752
6382	NC_020061	CTA	2	6	320354	320359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222752
6383	NC_020061	CTT	2	6	320381	320386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222752
6384	NC_020061	GAT	2	6	320421	320426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6385	NC_020061	CT	3	6	320449	320454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6386	NC_020061	TTC	2	6	320467	320472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6387	NC_020061	CGG	2	6	320496	320501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6388	NC_020061	AGT	2	6	320618	320623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6389	NC_020061	CAA	2	6	320705	320710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6390	NC_020061	GATCA	2	10	320769	320778	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6393	NC_020061	GCG	2	6	320910	320915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6394	NC_020061	TTC	2	6	320921	320926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6396	NC_020061	TCGT	2	8	320948	320955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6398	NC_020061	TGG	2	6	321047	321052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6402	NC_020061	CCG	2	6	321134	321139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6403	NC_020061	TGGC	2	8	321174	321181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6404	NC_020061	CGA	2	6	321337	321342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6423	NC_020061	GAG	2	6	322299	322304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6425	NC_020061	GCG	2	6	322320	322325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6426	NC_020061	GAC	2	6	322467	322472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6429	NC_020061	CG	3	6	322582	322587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6430	NC_020061	TGC	2	6	322632	322637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6433	NC_020061	CGT	2	6	322824	322829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6434	NC_020061	T	7	7	322829	322835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6435	NC_020061	CGC	2	6	322890	322895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6436	NC_020061	CCTT	2	8	322919	322926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6437	NC_020061	GCCA	2	8	323071	323078	25 %	0 %	25 %	50 %	440222755
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6452	NC_020061	TCA	2	6	323649	323654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222755
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6455	NC_020061	ATC	2	6	323969	323974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222755
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6459	NC_020061	ACC	2	6	324159	324164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6461	NC_020061	TGCC	2	8	324231	324238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6462	NC_020061	GCA	2	6	324308	324313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6463	NC_020061	CGC	2	6	324368	324373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6464	NC_020061	GATCG	2	10	324444	324453	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6465	NC_020061	TC	3	6	324465	324470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6466	NC_020061	CCA	2	6	324569	324574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6468	NC_020061	TGC	2	6	324629	324634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6471	NC_020061	CAAGG	2	10	324795	324804	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6472	NC_020061	GGC	2	6	324811	324816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6473	NC_020061	CCG	2	6	324820	324825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6478	NC_020061	ACA	2	6	325094	325099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6479	NC_020061	CTTG	2	8	325101	325108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6480	NC_020061	GAA	2	6	325136	325141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6481	NC_020061	CTG	2	6	325303	325308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6482	NC_020061	CCG	2	6	325336	325341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6483	NC_020061	ACG	2	6	325420	325425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6484	NC_020061	AAGGC	2	10	325442	325451	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6485	NC_020061	GGC	2	6	325514	325519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6486	NC_020061	CCATG	2	10	325531	325540	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6487	NC_020061	TAT	2	6	325558	325563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6488	NC_020061	CAT	2	6	325581	325586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6489	NC_020061	GGA	2	6	325596	325601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6490	NC_020061	CGA	2	6	325735	325740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6492	NC_020061	GGAT	2	8	325787	325794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6493	NC_020061	CTT	2	6	325859	325864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6494	NC_020061	GCG	2	6	325934	325939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6495	NC_020061	CGG	2	6	325983	325988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6496	NC_020061	TCA	2	6	325995	326000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6497	NC_020061	CAG	2	6	326087	326092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222756
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6500	NC_020061	GCCT	2	8	326331	326338	0 %	25 %	25 %	50 %	440222756

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