MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020060	ATCG	2	8	147	154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020060	TAAA	2	8	803	810	75 %	25 %	0 %	0 %	440228567
3	NC_020060	TCGC	2	8	2226	2233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020060	TTCT	2	8	2466	2473	0 %	75 %	0 %	25 %	440228568
5	NC_020060	ATCG	2	8	2841	2848	25 %	25 %	25 %	25 %	440228568
6	NC_020060	TCGA	2	8	2931	2938	25 %	25 %	25 %	25 %	440228568
7	NC_020060	CGTC	2	8	3092	3099	0 %	25 %	25 %	50 %	440228568
8	NC_020060	GCCG	2	8	3445	3452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020060	GTTA	2	8	3616	3623	25 %	50 %	25 %	0 %	440228570
10	NC_020060	CTTC	2	8	4351	4358	0 %	50 %	0 %	50 %	440228571
11	NC_020060	CGAG	2	8	4429	4436	25 %	0 %	50 %	25 %	440228571
12	NC_020060	CTTC	2	8	4937	4944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020060	GCCG	2	8	5253	5260	0 %	0 %	50 %	50 %	440228572
14	NC_020060	CTGG	2	8	5511	5518	0 %	25 %	50 %	25 %	440228572
15	NC_020060	TGCC	2	8	5637	5644	0 %	25 %	25 %	50 %	440228572
16	NC_020060	AGCA	2	8	6508	6515	50 %	0 %	25 %	25 %	440228573
17	NC_020060	GAAC	2	8	6558	6565	50 %	0 %	25 %	25 %	440228573
18	NC_020060	CGAG	2	8	6848	6855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020060	TCCA	2	8	7060	7067	25 %	25 %	0 %	50 %	440228574
20	NC_020060	AACT	2	8	7086	7093	50 %	25 %	0 %	25 %	440228574
21	NC_020060	CTGG	2	8	7409	7416	0 %	25 %	50 %	25 %	440228574
22	NC_020060	CGAT	2	8	7846	7853	25 %	25 %	25 %	25 %	440228574
23	NC_020060	ATCA	2	8	7902	7909	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020060	TACA	2	8	8237	8244	50 %	25 %	0 %	25 %	440228575
25	NC_020060	GCTA	2	8	8465	8472	25 %	25 %	25 %	25 %	440228575
26	NC_020060	TTGA	2	8	9251	9258	25 %	50 %	25 %	0 %	440228576
27	NC_020060	CGAC	2	8	9689	9696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020060	CGAT	2	8	10412	10419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020060	TGCT	2	8	10952	10959	0 %	50 %	25 %	25 %	440228578
30	NC_020060	CGAT	2	8	11155	11162	25 %	25 %	25 %	25 %	440228578
31	NC_020060	TGAT	2	8	12175	12182	25 %	50 %	25 %	0 %	440228579
32	NC_020060	GCCG	2	8	12517	12524	0 %	0 %	50 %	50 %	440228579
33	NC_020060	CTTG	2	8	13014	13021	0 %	50 %	25 %	25 %	440228579
34	NC_020060	GTCG	2	8	13546	13553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020060	GAAG	2	8	13673	13680	50 %	0 %	50 %	0 %	440228580
36	NC_020060	TCCT	2	8	13989	13996	0 %	50 %	0 %	50 %	440228580
37	NC_020060	CGGC	2	8	15714	15721	0 %	0 %	50 %	50 %	440228581
38	NC_020060	GCCG	2	8	16082	16089	0 %	0 %	50 %	50 %	440228582
39	NC_020060	GCCG	2	8	16228	16235	0 %	0 %	50 %	50 %	440228582
40	NC_020060	GCTT	2	8	16819	16826	0 %	50 %	25 %	25 %	440228582
41	NC_020060	CGCT	2	8	16972	16979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020060	CGTC	2	8	17272	17279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020060	CGAC	2	8	17432	17439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020060	ATCG	2	8	17605	17612	25 %	25 %	25 %	25 %	440228584
45	NC_020060	GCCC	2	8	17768	17775	0 %	0 %	25 %	75 %	440228584
46	NC_020060	CGCT	2	8	18486	18493	0 %	25 %	25 %	50 %	440228585
47	NC_020060	CGGC	2	8	19069	19076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020060	TCCC	2	8	19395	19402	0 %	25 %	0 %	75 %	440228586
49	NC_020060	TACC	2	8	19666	19673	25 %	25 %	0 %	50 %	440228586
50	NC_020060	GCCT	2	8	20626	20633	0 %	25 %	25 %	50 %	440228587
51	NC_020060	GCCG	2	8	21059	21066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020060	AGGA	2	8	21083	21090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020060	CCGA	2	8	21202	21209	25 %	0 %	25 %	50 %	440228588
54	NC_020060	TCTG	2	8	21916	21923	0 %	50 %	25 %	25 %	440228589
55	NC_020060	GCCA	2	8	21976	21983	25 %	0 %	25 %	50 %	440228589
56	NC_020060	GCCA	2	8	22124	22131	25 %	0 %	25 %	50 %	440228589
57	NC_020060	CGAC	2	8	22361	22368	25 %	0 %	25 %	50 %	440228589
58	NC_020060	CCTT	2	8	22383	22390	0 %	50 %	0 %	50 %	440228589
59	NC_020060	TGAT	2	8	22900	22907	25 %	50 %	25 %	0 %	440228590
60	NC_020060	ACGA	2	8	23385	23392	50 %	0 %	25 %	25 %	440228591
61	NC_020060	ATGC	2	8	23581	23588	25 %	25 %	25 %	25 %	440228591
62	NC_020060	GCCC	2	8	24931	24938	0 %	0 %	25 %	75 %	440228593
63	NC_020060	GCAT	2	8	25230	25237	25 %	25 %	25 %	25 %	440228593
64	NC_020060	CGGC	2	8	25684	25691	0 %	0 %	50 %	50 %	440228593
65	NC_020060	CTAT	2	8	25763	25770	25 %	50 %	0 %	25 %	440228593
66	NC_020060	ATCG	2	8	25798	25805	25 %	25 %	25 %	25 %	440228593
67	NC_020060	GCGG	2	8	26414	26421	0 %	0 %	75 %	25 %	440228593
68	NC_020060	GGAT	2	8	27510	27517	25 %	25 %	50 %	0 %	440228594
69	NC_020060	GTCG	2	8	28126	28133	0 %	25 %	50 %	25 %	440228594
70	NC_020060	TCGA	2	8	28187	28194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020060	TCAG	2	8	28493	28500	25 %	25 %	25 %	25 %	440228595
72	NC_020060	TGGA	2	8	29088	29095	25 %	25 %	50 %	0 %	440228595
73	NC_020060	GGCC	2	8	29591	29598	0 %	0 %	50 %	50 %	440228596
74	NC_020060	TTCA	2	8	29649	29656	25 %	50 %	0 %	25 %	440228596
75	NC_020060	GCAC	2	8	29683	29690	25 %	0 %	25 %	50 %	440228596
76	NC_020060	GTCC	2	8	29932	29939	0 %	25 %	25 %	50 %	440228596
77	NC_020060	GACC	2	8	30009	30016	25 %	0 %	25 %	50 %	440228597
78	NC_020060	GCAA	2	8	30130	30137	50 %	0 %	25 %	25 %	440228597
79	NC_020060	TGCC	2	8	30450	30457	0 %	25 %	25 %	50 %	440228597
80	NC_020060	ATCG	2	8	30545	30552	25 %	25 %	25 %	25 %	440228597
81	NC_020060	CGTC	2	8	30679	30686	0 %	25 %	25 %	50 %	440228597
82	NC_020060	TCGC	2	8	30975	30982	0 %	25 %	25 %	50 %	440228597
83	NC_020060	CAAT	2	8	31162	31169	50 %	25 %	0 %	25 %	440228598
84	NC_020060	CCAT	2	8	31627	31634	25 %	25 %	0 %	50 %	440228598
85	NC_020060	TGCG	2	8	31731	31738	0 %	25 %	50 %	25 %	440228598
86	NC_020060	GACG	2	8	31932	31939	25 %	0 %	50 %	25 %	440228599
87	NC_020060	ATCA	2	8	32494	32501	50 %	25 %	0 %	25 %	440228599
88	NC_020060	GGCG	2	8	32541	32548	0 %	0 %	75 %	25 %	440228599
89	NC_020060	GGAT	2	8	32557	32564	25 %	25 %	50 %	0 %	440228599
90	NC_020060	CGGC	2	8	32770	32777	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
91	NC_020060	GATC	2	8	32905	32912	25 %	25 %	25 %	25 %	440228599
92	NC_020060	CGGC	2	8	32948	32955	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
93	NC_020060	GGCC	2	8	33174	33181	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
94	NC_020060	CGGG	2	8	33694	33701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020060	CGGC	2	8	34306	34313	0 %	0 %	50 %	50 %	440228600
96	NC_020060	AGCA	2	8	34802	34809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020060	GACG	2	8	34970	34977	25 %	0 %	50 %	25 %	440228601
98	NC_020060	GTGA	2	8	35546	35553	25 %	25 %	50 %	0 %	440228601
99	NC_020060	ATGA	2	8	35739	35746	50 %	25 %	25 %	0 %	440228602
100	NC_020060	GCAA	2	8	37324	37331	50 %	0 %	25 %	25 %	440228602
101	NC_020060	GCCA	2	8	37644	37651	25 %	0 %	25 %	50 %	440228603
102	NC_020060	TCGT	2	8	37658	37665	0 %	50 %	25 %	25 %	440228603
103	NC_020060	GGAC	2	8	37801	37808	25 %	0 %	50 %	25 %	440228603
104	NC_020060	AACG	2	8	38959	38966	50 %	0 %	25 %	25 %	440228604
105	NC_020060	GCTT	2	8	38977	38984	0 %	50 %	25 %	25 %	440228604
106	NC_020060	TCAC	2	8	39922	39929	25 %	25 %	0 %	50 %	440228606
107	NC_020060	TTTG	2	8	39933	39940	0 %	75 %	25 %	0 %	440228606
108	NC_020060	GGGC	2	8	40094	40101	0 %	0 %	75 %	25 %	440228606
109	NC_020060	ATAC	2	8	40300	40307	50 %	25 %	0 %	25 %	440228606
110	NC_020060	TCGA	2	8	40381	40388	25 %	25 %	25 %	25 %	440228606
111	NC_020060	GGCG	2	8	40521	40528	0 %	0 %	75 %	25 %	440228606
112	NC_020060	GACG	2	8	40988	40995	25 %	0 %	50 %	25 %	440228607
113	NC_020060	CCTG	2	8	41134	41141	0 %	25 %	25 %	50 %	440228607
114	NC_020060	TGGC	2	8	41257	41264	0 %	25 %	50 %	25 %	440228607
115	NC_020060	ACCT	2	8	42093	42100	25 %	25 %	0 %	50 %	440228608
116	NC_020060	CGCT	2	8	43458	43465	0 %	25 %	25 %	50 %	440228609
117	NC_020060	ACGC	2	8	43837	43844	25 %	0 %	25 %	50 %	440228609
118	NC_020060	TCTT	2	8	43965	43972	0 %	75 %	0 %	25 %	440228609
119	NC_020060	GATC	2	8	44058	44065	25 %	25 %	25 %	25 %	440228609
120	NC_020060	TTGC	2	8	44425	44432	0 %	50 %	25 %	25 %	440228610
121	NC_020060	CTGC	2	8	44583	44590	0 %	25 %	25 %	50 %	440228610
122	NC_020060	GCCG	2	8	45753	45760	0 %	0 %	50 %	50 %	440228610
123	NC_020060	TCAC	2	8	45974	45981	25 %	25 %	0 %	50 %	440228610
124	NC_020060	CGCA	2	8	46326	46333	25 %	0 %	25 %	50 %	440228611
125	NC_020060	GGTT	2	8	46748	46755	0 %	50 %	50 %	0 %	440228611
126	NC_020060	AGCC	2	8	47555	47562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020060	CCAT	2	8	47609	47616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020060	GTCG	2	8	47801	47808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020060	CTCG	2	8	48612	48619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020060	CTGT	2	8	49348	49355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020060	CCTT	2	8	49608	49615	0 %	50 %	0 %	50 %	440228613
132	NC_020060	GGCA	2	8	49703	49710	25 %	0 %	50 %	25 %	440228613
133	NC_020060	TCAA	2	8	49986	49993	50 %	25 %	0 %	25 %	440228613
134	NC_020060	CCGA	2	8	50053	50060	25 %	0 %	25 %	50 %	440228613
135	NC_020060	AGGG	2	8	50496	50503	25 %	0 %	75 %	0 %	440228613
136	NC_020060	CAGC	2	8	50636	50643	25 %	0 %	25 %	50 %	440228614
137	NC_020060	CAGC	2	8	50846	50853	25 %	0 %	25 %	50 %	440228614
138	NC_020060	CCAC	2	8	51016	51023	25 %	0 %	0 %	75 %	440228614
139	NC_020060	GCCT	2	8	51459	51466	0 %	25 %	25 %	50 %	440228615
140	NC_020060	GATC	2	8	52630	52637	25 %	25 %	25 %	25 %	440228616
141	NC_020060	AGCC	2	8	52912	52919	25 %	0 %	25 %	50 %	440228616
142	NC_020060	ATTG	2	8	53030	53037	25 %	50 %	25 %	0 %	440228616
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198	NC_020060	AGGC	2	8	73965	73972	25 %	0 %	50 %	25 %	440228639
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254	NC_020060	CGGA	2	8	91652	91659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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277	NC_020060	CGTT	2	8	99998	100005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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