MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 4411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020060	GA	3	6	198146	198151	50 %	0 %	50 %	0 %	440228756
4002	NC_020060	GCGG	2	8	198192	198199	0 %	0 %	75 %	25 %	440228756
4003	NC_020060	GC	3	6	198235	198240	0 %	0 %	50 %	50 %	440228756
4004	NC_020060	GC	3	6	198293	198298	0 %	0 %	50 %	50 %	440228756
4005	NC_020060	GCG	2	6	198313	198318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228756
4006	NC_020060	T	6	6	198332	198337	0 %	100 %	0 %	0 %	440228756
4007	NC_020060	TCG	2	6	198448	198453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228756
4008	NC_020060	TGG	2	6	198468	198473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228756
4009	NC_020060	CATC	2	8	198484	198491	25 %	25 %	0 %	50 %	440228756
4010	NC_020060	GC	3	6	198503	198508	0 %	0 %	50 %	50 %	440228756
4011	NC_020060	GCCAA	2	10	198537	198546	40 %	0 %	20 %	40 %	440228756
4012	NC_020060	T	6	6	198550	198555	0 %	100 %	0 %	0 %	440228756
4013	NC_020060	CTT	2	6	198624	198629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228757
4014	NC_020060	TCG	2	6	198642	198647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228757
4015	NC_020060	CTG	2	6	198660	198665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228757
4016	NC_020060	CCGTCA	2	12	198687	198698	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440228757
4017	NC_020060	GGT	2	6	198704	198709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228757
4018	NC_020060	GGCGAT	2	12	198748	198759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440228757
4019	NC_020060	GGT	2	6	198784	198789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228757
4020	NC_020060	CCG	2	6	198813	198818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228757
4021	NC_020060	TCG	2	6	198858	198863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228757
4022	NC_020060	GGT	2	6	198927	198932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228757
4023	NC_020060	AGA	2	6	199138	199143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228757
4024	NC_020060	GCA	2	6	199225	199230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_020060	T	6	6	199281	199286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020060	AT	3	6	199289	199294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020060	CAG	2	6	199335	199340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228758
4028	NC_020060	AGA	2	6	199354	199359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228758
4029	NC_020060	GAA	2	6	199382	199387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228758
4030	NC_020060	TCTT	2	8	199396	199403	0 %	75 %	0 %	25 %	440228758
4031	NC_020060	GC	4	8	199445	199452	0 %	0 %	50 %	50 %	440228758
4032	NC_020060	CCGG	2	8	199531	199538	0 %	0 %	50 %	50 %	440228758
4033	NC_020060	CAGCG	2	10	199568	199577	20 %	0 %	40 %	40 %	440228758
4034	NC_020060	CAA	2	6	199589	199594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228758
4035	NC_020060	GGTCAA	2	12	199676	199687	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440228758
4036	NC_020060	GC	3	6	199689	199694	0 %	0 %	50 %	50 %	440228758
4037	NC_020060	CGG	2	6	199701	199706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228758
4038	NC_020060	CTT	2	6	199762	199767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228759
4039	NC_020060	CAG	2	6	199796	199801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228759
4040	NC_020060	TGG	2	6	199805	199810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228759
4041	NC_020060	TCGT	2	8	199826	199833	0 %	50 %	25 %	25 %	440228759
4042	NC_020060	CGG	2	6	199884	199889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228759
4043	NC_020060	CAT	2	6	199953	199958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228759
4044	NC_020060	GCG	2	6	199979	199984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228759
4045	NC_020060	GCG	2	6	200026	200031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228759
4046	NC_020060	AAGGCG	2	12	200114	200125	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440228759
4047	NC_020060	GCG	2	6	200227	200232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228759
4048	NC_020060	CAA	2	6	200237	200242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228759
4049	NC_020060	TGCG	2	8	200251	200258	0 %	25 %	50 %	25 %	440228759
4050	NC_020060	CGG	2	6	200273	200278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228759
4051	NC_020060	GCGCC	2	10	200298	200307	0 %	0 %	40 %	60 %	440228759
4052	NC_020060	TTTTGC	2	12	200310	200321	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	440228759
4053	NC_020060	GAA	2	6	200455	200460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228759
4054	NC_020060	GAT	2	6	200511	200516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228759
4055	NC_020060	GACTT	2	10	200582	200591	20 %	40 %	20 %	20 %	440228759
4056	NC_020060	CAG	2	6	200655	200660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_020060	GCTT	2	8	200672	200679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_020060	ACG	2	6	200695	200700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_020060	GC	3	6	200829	200834	0 %	0 %	50 %	50 %	440228760
4060	NC_020060	TTC	2	6	200859	200864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228760
4061	NC_020060	ACG	2	6	200892	200897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228760
4062	NC_020060	GGAA	2	8	201103	201110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020060	GGA	2	6	201143	201148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228761
4064	NC_020060	GCC	2	6	201209	201214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228761
4065	NC_020060	CGC	2	6	201238	201243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228761
4066	NC_020060	GAG	2	6	201260	201265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228761
4067	NC_020060	CG	3	6	201272	201277	0 %	0 %	50 %	50 %	440228761
4068	NC_020060	GC	3	6	201335	201340	0 %	0 %	50 %	50 %	440228761
4069	NC_020060	CAG	2	6	201359	201364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228761
4070	NC_020060	AGCT	2	8	201431	201438	25 %	25 %	25 %	25 %	440228761
4071	NC_020060	GCA	2	6	201444	201449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228762
4072	NC_020060	TGC	2	6	201527	201532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228762
4073	NC_020060	GCC	2	6	201590	201595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228762
4074	NC_020060	GGT	2	6	201646	201651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228762
4075	NC_020060	GCC	2	6	201655	201660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228762
4076	NC_020060	ATC	2	6	201662	201667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228762
4077	NC_020060	ATC	3	9	201683	201691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228762
4078	NC_020060	GGA	2	6	201748	201753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228762
4079	NC_020060	CAT	2	6	201766	201771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228762
4080	NC_020060	TCGA	2	8	201827	201834	25 %	25 %	25 %	25 %	440228762
4081	NC_020060	CG	3	6	201867	201872	0 %	0 %	50 %	50 %	440228762
4082	NC_020060	CCG	2	6	201885	201890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228762
4083	NC_020060	AGA	2	6	201894	201899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228762
4084	NC_020060	GA	3	6	201959	201964	50 %	0 %	50 %	0 %	440228762
4085	NC_020060	CCTT	2	8	202016	202023	0 %	50 %	0 %	50 %	440228762
4086	NC_020060	CG	3	6	202058	202063	0 %	0 %	50 %	50 %	440228762
4087	NC_020060	CGA	2	6	202119	202124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228762
4088	NC_020060	GCGA	2	8	202125	202132	25 %	0 %	50 %	25 %	440228762
4089	NC_020060	TCCA	2	8	202138	202145	25 %	25 %	0 %	50 %	440228762
4090	NC_020060	GGTC	2	8	202176	202183	0 %	25 %	50 %	25 %	440228762
4091	NC_020060	CGG	2	6	202225	202230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_020060	GC	3	6	202419	202424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_020060	GGC	2	6	202443	202448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_020060	GGA	2	6	202458	202463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_020060	CTG	2	6	202477	202482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228763
4096	NC_020060	ATA	2	6	202498	202503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440228763
4097	NC_020060	GCG	2	6	202620	202625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228763
4098	NC_020060	GCC	2	6	202764	202769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228763
4099	NC_020060	GCC	2	6	202797	202802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228763
4100	NC_020060	GGTC	2	8	202835	202842	0 %	25 %	50 %	25 %	440228763
4101	NC_020060	GAC	2	6	202845	202850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228763
4102	NC_020060	TGAC	2	8	202957	202964	25 %	25 %	25 %	25 %	440228763
4103	NC_020060	CCGG	2	8	202977	202984	0 %	0 %	50 %	50 %	440228763
4104	NC_020060	CAC	2	6	203064	203069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228763
4105	NC_020060	GAA	2	6	203109	203114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228763
4106	NC_020060	TCC	2	6	203116	203121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228763
4107	NC_020060	GCG	2	6	203179	203184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228763
4108	NC_020060	GGT	2	6	203235	203240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228763
4109	NC_020060	GGC	2	6	203244	203249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228763
4110	NC_020060	GC	3	6	203373	203378	0 %	0 %	50 %	50 %	440228763
4111	NC_020060	CTC	2	6	203415	203420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228763
4112	NC_020060	CGA	2	6	203441	203446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228763
4113	NC_020060	CGG	2	6	203447	203452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228763
4114	NC_020060	CGG	2	6	203477	203482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228763
4115	NC_020060	GTT	2	6	203504	203509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228763
4116	NC_020060	ATG	2	6	203521	203526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228763
4117	NC_020060	GTTG	2	8	203562	203569	0 %	50 %	50 %	0 %	440228763
4118	NC_020060	ACG	2	6	203644	203649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228763
4119	NC_020060	CGA	2	6	203651	203656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228763
4120	NC_020060	CGA	2	6	203663	203668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228763
4121	NC_020060	TGA	2	6	203669	203674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228763
4122	NC_020060	GAT	2	6	203682	203687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228763
4123	NC_020060	TCG	2	6	203722	203727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228763
4124	NC_020060	CTGG	2	8	203730	203737	0 %	25 %	50 %	25 %	440228763
4125	NC_020060	ATGCT	2	10	203764	203773	20 %	40 %	20 %	20 %	440228763
4126	NC_020060	CGAT	2	8	203860	203867	25 %	25 %	25 %	25 %	440228764
4127	NC_020060	TCGA	2	8	203907	203914	25 %	25 %	25 %	25 %	440228764
4128	NC_020060	TGA	2	6	204017	204022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228764
4129	NC_020060	GTC	2	6	204042	204047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228764
4130	NC_020060	GGT	2	6	204125	204130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228764
4131	NC_020060	GGT	2	6	204143	204148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228764
4132	NC_020060	GTCC	2	8	204151	204158	0 %	25 %	25 %	50 %	440228764
4133	NC_020060	CGG	2	6	204160	204165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228764
4134	NC_020060	GGC	3	9	204185	204193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228764
4135	NC_020060	GA	3	6	204198	204203	50 %	0 %	50 %	0 %	440228764
4136	NC_020060	TGA	2	6	204205	204210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228764
4137	NC_020060	CCG	2	6	204236	204241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228765
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4139	NC_020060	CGA	2	6	204307	204312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228765
4140	NC_020060	TCA	2	6	204313	204318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228765
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4142	NC_020060	GAC	2	6	204365	204370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228765
4143	NC_020060	GC	3	6	204463	204468	0 %	0 %	50 %	50 %	440228765
4144	NC_020060	ACC	2	6	204657	204662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228765
4145	NC_020060	TGACG	2	10	204665	204674	20 %	20 %	40 %	20 %	440228765
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4149	NC_020060	GAC	2	6	204836	204841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228765
4150	NC_020060	GTC	2	6	204891	204896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228765
4151	NC_020060	GTT	2	6	204950	204955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228765
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4153	NC_020060	TGCGG	2	10	205130	205139	0 %	20 %	60 %	20 %	440228766
4154	NC_020060	CCTTGC	2	12	205185	205196	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440228766
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4156	NC_020060	TCT	2	6	205329	205334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228766
4157	NC_020060	CGAT	2	8	205373	205380	25 %	25 %	25 %	25 %	440228766
4158	NC_020060	AT	3	6	205379	205384	50 %	50 %	0 %	0 %	440228766
4159	NC_020060	CG	3	6	205447	205452	0 %	0 %	50 %	50 %	440228766
4160	NC_020060	CAC	2	6	205453	205458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228766
4161	NC_020060	CGA	2	6	205527	205532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228766
4162	NC_020060	CGA	2	6	205614	205619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228766
4163	NC_020060	GCG	3	9	205628	205636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228766
4164	NC_020060	GC	3	6	205675	205680	0 %	0 %	50 %	50 %	440228766
4165	NC_020060	ATCG	2	8	205718	205725	25 %	25 %	25 %	25 %	440228766
4166	NC_020060	GC	3	6	205789	205794	0 %	0 %	50 %	50 %	440228767
4167	NC_020060	GATC	2	8	205825	205832	25 %	25 %	25 %	25 %	440228767
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4177	NC_020060	GACA	2	8	206377	206384	50 %	0 %	25 %	25 %	440228767
4178	NC_020060	CGA	2	6	206397	206402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228767
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4230	NC_020060	GAT	2	6	208217	208222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228770
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4232	NC_020060	GCA	2	6	208285	208290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228770
4233	NC_020060	AGGT	2	8	208407	208414	25 %	25 %	50 %	0 %	440228770
4234	NC_020060	TCA	2	6	208447	208452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228770
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4237	NC_020060	CGGC	2	8	208605	208612	0 %	0 %	50 %	50 %	440228770
4238	NC_020060	TCGC	2	8	208731	208738	0 %	25 %	25 %	50 %	440228770
4239	NC_020060	CCCTC	2	10	208768	208777	0 %	20 %	0 %	80 %	440228770
4240	NC_020060	CGC	2	6	208810	208815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228770
4241	NC_020060	CTGCG	2	10	208892	208901	0 %	20 %	40 %	40 %	440228770
4242	NC_020060	CGT	2	6	208963	208968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228770
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4244	NC_020060	CGG	2	6	209033	209038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228770
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4357	NC_020060	ACA	2	6	214278	214283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4366	NC_020060	GC	3	6	214621	214626	0 %	0 %	50 %	50 %	440228776
4367	NC_020060	CGA	2	6	214675	214680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228776
4368	NC_020060	AACG	2	8	214712	214719	50 %	0 %	25 %	25 %	440228776
4369	NC_020060	TGC	2	6	214795	214800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228776
4370	NC_020060	TCGA	2	8	214805	214812	25 %	25 %	25 %	25 %	440228776
4371	NC_020060	CCCTC	2	10	214851	214860	0 %	20 %	0 %	80 %	440228776
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4378	NC_020060	AGAGCA	2	12	215112	215123	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440228776
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4382	NC_020060	CGT	2	6	215275	215280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4383	NC_020060	CTG	2	6	215378	215383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4390	NC_020060	TGG	2	6	215717	215722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228777
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4393	NC_020060	TGCT	2	8	215828	215835	0 %	50 %	25 %	25 %	440228777
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4395	NC_020060	GCA	2	6	215950	215955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228777
4396	NC_020060	CG	3	6	216026	216031	0 %	0 %	50 %	50 %	440228777
4397	NC_020060	ACG	2	6	216049	216054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228777
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4403	NC_020060	G	6	6	216327	216332	0 %	0 %	100 %	0 %	440228777
4404	NC_020060	CTG	2	6	216359	216364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228777
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