MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 4411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020060	AGG	2	6	78473	78478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228645
1502	NC_020060	ACT	2	6	78480	78485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_020060	TTGC	2	8	78519	78526	0 %	50 %	25 %	25 %	440228646
1504	NC_020060	GGC	2	6	78578	78583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228646
1505	NC_020060	GCTG	2	8	78689	78696	0 %	25 %	50 %	25 %	440228646
1506	NC_020060	GCC	2	6	78743	78748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228646
1507	NC_020060	AT	4	8	78818	78825	50 %	50 %	0 %	0 %	440228646
1508	NC_020060	CGG	2	6	78826	78831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228646
1509	NC_020060	GCC	2	6	78857	78862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228646
1510	NC_020060	CCT	2	6	78947	78952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_020060	CGG	2	6	78988	78993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_020060	GCG	2	6	79018	79023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_020060	CAG	2	6	79076	79081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_020060	AGAT	2	8	79201	79208	50 %	25 %	25 %	0 %	440228647
1515	NC_020060	GCC	2	6	79251	79256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228647
1516	NC_020060	AAG	2	6	79329	79334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228647
1517	NC_020060	GGC	2	6	79335	79340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228647
1518	NC_020060	TCG	2	6	79343	79348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1519	NC_020060	TCA	2	6	79349	79354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228647
1520	NC_020060	TCA	2	6	79414	79419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228647
1521	NC_020060	ATC	2	6	79495	79500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228647
1522	NC_020060	ATG	2	6	79621	79626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228647
1523	NC_020060	ACC	2	6	79630	79635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228647
1524	NC_020060	GGCG	2	8	79722	79729	0 %	0 %	75 %	25 %	440228647
1525	NC_020060	AC	3	6	79853	79858	50 %	0 %	0 %	50 %	440228647
1526	NC_020060	GTC	2	6	79864	79869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1527	NC_020060	TTGC	2	8	79906	79913	0 %	50 %	25 %	25 %	440228647
1528	NC_020060	TCTG	2	8	79990	79997	0 %	50 %	25 %	25 %	440228647
1529	NC_020060	AGG	2	6	80006	80011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228647
1530	NC_020060	TCG	2	6	80047	80052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1531	NC_020060	GCC	2	6	80083	80088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228647
1532	NC_020060	GAG	2	6	80155	80160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228647
1533	NC_020060	GTCT	2	8	80333	80340	0 %	50 %	25 %	25 %	440228647
1534	NC_020060	CTTG	2	8	80345	80352	0 %	50 %	25 %	25 %	440228647
1535	NC_020060	TGT	2	6	80390	80395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228647
1536	NC_020060	GCC	2	6	80427	80432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228647
1537	NC_020060	ATG	3	9	80473	80481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228647
1538	NC_020060	GAT	2	6	80595	80600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228647
1539	NC_020060	GAA	2	6	80709	80714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228647
1540	NC_020060	CG	3	6	80741	80746	0 %	0 %	50 %	50 %	440228647
1541	NC_020060	ACGA	2	8	80763	80770	50 %	0 %	25 %	25 %	440228647
1542	NC_020060	GCC	2	6	80776	80781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228647
1543	NC_020060	AG	3	6	80800	80805	50 %	0 %	50 %	0 %	440228647
1544	NC_020060	ACCG	2	8	80861	80868	25 %	0 %	25 %	50 %	440228647
1545	NC_020060	GCC	2	6	80874	80879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228647
1546	NC_020060	CGA	2	6	81035	81040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1547	NC_020060	CCA	2	6	81053	81058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228647
1548	NC_020060	GA	3	6	81073	81078	50 %	0 %	50 %	0 %	440228647
1549	NC_020060	GC	3	6	81163	81168	0 %	0 %	50 %	50 %	440228647
1550	NC_020060	CAC	2	6	81192	81197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228647
1551	NC_020060	TCG	2	6	81257	81262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1552	NC_020060	GGGC	2	8	81317	81324	0 %	0 %	75 %	25 %	440228647
1553	NC_020060	CGA	2	6	81344	81349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1554	NC_020060	ACC	2	6	81480	81485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228647
1555	NC_020060	CAT	2	6	81506	81511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228647
1556	NC_020060	GCT	2	6	81522	81527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1557	NC_020060	TCGT	2	8	81538	81545	0 %	50 %	25 %	25 %	440228647
1558	NC_020060	CTCAGA	2	12	81595	81606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440228647
1559	NC_020060	TCC	2	6	81628	81633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228647
1560	NC_020060	AGCC	2	8	81651	81658	25 %	0 %	25 %	50 %	440228647
1561	NC_020060	CGCGA	2	10	81672	81681	20 %	0 %	40 %	40 %	440228647
1562	NC_020060	AT	3	6	81763	81768	50 %	50 %	0 %	0 %	440228647
1563	NC_020060	AGAGTG	2	12	81784	81795	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	440228647
1564	NC_020060	CGG	2	6	81830	81835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228647
1565	NC_020060	CTCGC	2	10	81889	81898	0 %	20 %	20 %	60 %	440228647
1566	NC_020060	GCA	2	6	81922	81927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1567	NC_020060	GTC	2	6	81970	81975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1568	NC_020060	CGC	2	6	82053	82058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228647
1569	NC_020060	GGC	2	6	82089	82094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228647
1570	NC_020060	TCG	2	6	82103	82108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1571	NC_020060	CAG	2	6	82164	82169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228647
1572	NC_020060	GAA	2	6	82215	82220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228647
1573	NC_020060	GAA	2	6	82243	82248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228647
1574	NC_020060	GAC	2	6	82367	82372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1575	NC_020060	CT	3	6	82441	82446	0 %	50 %	0 %	50 %	440228648
1576	NC_020060	GAC	2	6	82469	82474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1577	NC_020060	GAC	3	9	82520	82528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1578	NC_020060	GATG	2	8	82615	82622	25 %	25 %	50 %	0 %	440228648
1579	NC_020060	GCT	2	6	82685	82690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1580	NC_020060	AACG	2	8	82769	82776	50 %	0 %	25 %	25 %	440228648
1581	NC_020060	TG	3	6	82797	82802	0 %	50 %	50 %	0 %	440228648
1582	NC_020060	GTC	2	6	82818	82823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1583	NC_020060	GAC	2	6	82835	82840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1584	NC_020060	CGA	2	6	82927	82932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1585	NC_020060	GC	4	8	83049	83056	0 %	0 %	50 %	50 %	440228648
1586	NC_020060	GCTT	2	8	83082	83089	0 %	50 %	25 %	25 %	440228648
1587	NC_020060	CCA	2	6	83158	83163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228648
1588	NC_020060	CGA	2	6	83188	83193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1589	NC_020060	CG	3	6	83206	83211	0 %	0 %	50 %	50 %	440228648
1590	NC_020060	G	6	6	83233	83238	0 %	0 %	100 %	0 %	440228648
1591	NC_020060	TCGA	2	8	83264	83271	25 %	25 %	25 %	25 %	440228648
1592	NC_020060	TG	4	8	83279	83286	0 %	50 %	50 %	0 %	440228648
1593	NC_020060	CGG	2	6	83362	83367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228648
1594	NC_020060	GCA	2	6	83387	83392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228648
1595	NC_020060	CTG	2	6	83428	83433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_020060	CG	3	6	83443	83448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_020060	CT	3	6	83490	83495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_020060	CGG	2	6	83520	83525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_020060	GAC	2	6	83557	83562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_020060	ATT	2	6	83645	83650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020060	GCT	2	6	83685	83690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228649
1602	NC_020060	TGAC	2	8	83692	83699	25 %	25 %	25 %	25 %	440228649
1603	NC_020060	GAT	2	6	83789	83794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228649
1604	NC_020060	AAC	2	6	83801	83806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228649
1605	NC_020060	AGA	2	6	83807	83812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228649
1606	NC_020060	TGC	2	6	83834	83839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228649
1607	NC_020060	TAGC	2	8	83931	83938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_020060	GCGGG	2	10	83997	84006	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1609	NC_020060	TGTC	2	8	84041	84048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_020060	ATGC	2	8	84096	84103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_020060	ATT	2	6	84143	84148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020060	GCC	2	6	84253	84258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_020060	CGT	2	6	84306	84311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_020060	CCG	2	6	84351	84356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228650
1615	NC_020060	GGA	2	6	84388	84393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228650
1616	NC_020060	CTT	2	6	84406	84411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228650
1617	NC_020060	GTG	2	6	84412	84417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228650
1618	NC_020060	GAT	2	6	84421	84426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228650
1619	NC_020060	GGC	2	6	84479	84484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228650
1620	NC_020060	TACA	2	8	84488	84495	50 %	25 %	0 %	25 %	440228650
1621	NC_020060	TCGA	2	8	84516	84523	25 %	25 %	25 %	25 %	440228650
1622	NC_020060	CCA	2	6	84579	84584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228650
1623	NC_020060	CAT	2	6	84716	84721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228650
1624	NC_020060	ACGC	2	8	84836	84843	25 %	0 %	25 %	50 %	440228650
1625	NC_020060	TCG	2	6	84871	84876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228650
1626	NC_020060	CG	3	6	84913	84918	0 %	0 %	50 %	50 %	440228650
1627	NC_020060	ATA	2	6	84924	84929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440228650
1628	NC_020060	ACC	2	6	84947	84952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228650
1629	NC_020060	GCGGTT	2	12	85141	85152	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440228651
1630	NC_020060	GC	3	6	85153	85158	0 %	0 %	50 %	50 %	440228651
1631	NC_020060	CGT	2	6	85194	85199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228651
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1641	NC_020060	GC	3	6	85580	85585	0 %	0 %	50 %	50 %	440228651
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1643	NC_020060	GTG	2	6	85662	85667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228651
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1647	NC_020060	TCA	2	6	85934	85939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228651
1648	NC_020060	ACC	2	6	86029	86034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228651
1649	NC_020060	TCG	2	6	86042	86047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228651
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1759	NC_020060	CAAA	2	8	91488	91495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1760	NC_020060	ATCG	2	8	91588	91595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1886	NC_020060	GGC	2	6	97914	97919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1887	NC_020060	GGTCG	2	10	97979	97988	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1888	NC_020060	CAG	2	6	98010	98015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1889	NC_020060	GCC	2	6	98019	98024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1890	NC_020060	CGGC	2	8	98096	98103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1891	NC_020060	TCG	2	6	98105	98110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1892	NC_020060	CGATG	2	10	98124	98133	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1893	NC_020060	CCGCA	2	10	98162	98171	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1894	NC_020060	CCCG	2	8	98175	98182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1895	NC_020060	GCA	2	6	98214	98219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1897	NC_020060	ATC	2	6	98285	98290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1902	NC_020060	CTG	2	6	98485	98490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1903	NC_020060	CGGGA	2	10	98510	98519	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1911	NC_020060	CG	3	6	98799	98804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1981	NC_020060	CGA	2	6	102511	102516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228666
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1983	NC_020060	GCT	2	6	102567	102572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228666
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1990	NC_020060	GGGCT	2	10	103044	103053	0 %	20 %	60 %	20 %	440228666
1991	NC_020060	CG	5	10	103060	103069	0 %	0 %	50 %	50 %	440228666
1992	NC_020060	GCG	2	6	103132	103137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228666
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1994	NC_020060	GGCC	2	8	103220	103227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1995	NC_020060	ATGC	2	8	103444	103451	25 %	25 %	25 %	25 %	440228667
1996	NC_020060	CGAGA	2	10	103471	103480	40 %	0 %	40 %	20 %	440228667
1997	NC_020060	CGG	2	6	103535	103540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228667
1998	NC_020060	TCC	2	6	103583	103588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228667
1999	NC_020060	TGG	2	6	103604	103609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228667
2000	NC_020060	ATG	2	6	103718	103723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228667

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